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Reestructuración de la GUI y de los algoritmos de correlación de curvas para un sistema CBIR
This thesis presents a system for recognizing individual elephants. This work has been done in collaboration with a group of researchers from the Department of Zoology of University La Sapienza, which deals with the study of the behavior of the specie. Being able to identify different specimens within a group is to study the characteristics (habits, movements, life expectancy etc.). To date, this recognition takes place by observing and comparing the photos taken in African parks in different periods. This stage is increasingly made more difficult by the fact that individuals differ among themselves for very few details. One of these is the presence of nicks on their ears. The shape and position of nicks appears to have been a distinctive feature almost like fingerprints for mankind. Figure 1 shows an example of two individuals distinguished by the different shape of the profile of the ear. The aim was to create a system that automates this process of recognition. The initial system was created by A. Ardovini. In this second version of the system a new algorithm has been implemented that allows for greater automation of the process. Consequently, some aspects of the GUI have changed, resulting in a more user-friendly interface. The system presented here extracts the profile of the ear identifying the nicks and, through a technique of edge-matching, profiles most similar to it are selected from the database. The process of recognition of an individual is composed of four basic steps. The first step consists in the extraction of the profile of the individual through a semi-automatic edge-detection operation, and the selection of nicks in the profile itself. The nicks selected become part of a vector query. In the next step all profiles in the database corresponding to the same side of the query are considered. These profiles must have at least one nick in a position similar to one of those of the profile input. The third step is to compare the query curves with the edge of the profiles previously selected. The last step allows the extraction of a final ranking of N individuals based on their similarity with the profile input. This thesis is organized as follows. In chapter 2 some existing methods in literature are introduced. In chapter 3 some existing systems are reviewed, and particularly the work whose approach is the closest to our system is presented in greater depth. In chapter 4 the architecture of the proposed system is described. Chapter 5 presents the database structure and methods of insertion. In chapter 6 the experimental results are presented and finally in chapter 7 an example of the use of our system is showed. _______________________________________________________________________________Esta tesis presenta un sistema para el reconocimiento de elefantes. Este trabajo ha sido realizado en colaboración con un grupo de investigadores del Departamento de Zoología de la Universidad La Sapienza, que trata del estudio del comportamiento de la especie. Ser capaz de identificar diferentes especímenes dentro de un grupo es estudiar las características (hábitos, movimientos, esperanza de vida, etc). Hasta la fecha, este reconocimiento se lleva a cabo mediante la observación y la comparación de las fotos tomadas en los parques africanos en diferentes períodos. Esta etapa es cada vez más difícil por el hecho de que los individuos difieren entre sí por muy pocos detalles. Una de ellas es la presencia de muescas en las orejas. La forma y posición de dichas muescas parece ser un rasgo distintivo casi como las huellas dactilares para los humanos. El objetivo era crear un sistema que automatizase este proceso de reconocimiento. El sistema inicial fue creado por A. Ardovini. En esta segunda versión del sistema se ha aplicado un nuevo algoritmo que permite una mayor automatización del proceso. En consecuencia, algunos aspectos de la interfaz gráfica de usuario han cambiado, resultando en una interfaz más eficaz y amigable. El sistema que se muestra aquí extrae el perfil de la oreja, identificando los cortes y, a través de una técnica de correlación de bordes son seleccionados los perfiles de la base de datos más similares a cada oreja. El proceso de reconocimiento de un individuo se compone de cuatro pasos básicos. El primer paso consiste en la extracción del perfil del individuo a través de un operación de detección de bordes semi-automática, y la selección de las muescas de dicho perfil. Las muescas seleccionadas pasan a formar parte de un vector de consulta. En el siguiente paso todos los perfiles de la base de datos correspondiente al mismo lado de la consulta se consideran. Estos perfiles deben tener al menos una muesca en una posición similar a una de las de la entrada del perfil. El tercer paso es comparar las curvas de consulta con el borde de los perfiles previamente seleccionados. El último paso permite la extracción de una clasificación final de N individuos sobre la base de su similitud con la entrada de perfil.Ingeniería en Informátic
La protección de la infancia frente a la pornografía infantil
La normativa internacional, con especial incidencia en Directiva 2011/92/UE, de 13 de diciembre de 2011, relativa a la lucha contra los abusos sexuales y la explotación sexual de los menores y la pornografía infantil; y la jurisprudencia del Tribunal Supremo, en el intento de definir conceptos y esclarecer los tipos penales. Otros aspectos que se examinarán son, el consentimiento sexual, su consideración en los supuestos de relaciones consentidas entre menores de edad; el estatuto de la víctima de pornografía infantil en el marco de la Directiva, con referencia al papel del Ministerio Fiscal; Grooming, su relación con las redes sociales, y el bloqueo de Internet, Blocking.International law, with special emphasis on 2011/92/UE Directive, of 13 December 2011, on combating the sexual abuse and sexual exploitation of children and child pornography; and the Supreme Courts jurisprudence, in the attempt to define concepts and clarify the criminal types. Other issues to be discussed are sexual consent, consideration in cases of relations between consenting minors; the standing of victims of child pornography under the Directive 2011, with reference to the Prosecutor´s role. Grooming, the relationship with social Networks, and Internet blocking
El estudio de caracteres objetivos para la estimación de la edad en individuos inmaduros de una colección osteológica documentada procedente de Granada (cementerio de San José, s. XIX-XXI)
Dissertação de mestrado em Evolução e Biología Humanas, apresentada ao Departamento de Ciências da Vida da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de CoimbraEl estudio de las poblaciones del pasado se ha visto condicionado históricamente por una serie de limitaciones de diversa índole, especialmente en aquellos individuos que no han completado su desarrollo osteológico, conocidos como inmaduros.
Este trabajo se centra en el estudio de los restos de los individuos de edades más tempranas, cuya edad de muerte se encuentra en torno al momento del nacimiento, denominados genéricamente perinatales. Su estudio puede aportar una importante cantidad de información, tanto en el ámbito de las poblaciones del pasado como en estudios de Antropología forense. Se ha realizado una revisión de algunos métodos empleados hasta hoy para el análisis de la edad de muerte de individuos perinatales, y se propone la utilización de caracteres objetivos que posibiliten una clasificación y estudio más precisos de estos individuos.
El presente trabajo parte de las conclusiones obtenidas en estudios anteriores (López, 2009) y se centra en el análisis de las medidas de la pars basilaris del hueso occipital, y su relación con el estado de desarrollo de los individuos inmaduros. Para ello, se ha utilizado la colección osteológica documentada procedente del cementerio de San José (Granada, S. XIX-XXI), ya que reúne los requisitos necesarios para realizar el estudio y comprobar la validez de estas estructuras como caracteres objetivos de determinación de la edad.
Han sido analizadas las tres medidas de la pars basilaris descritas hasta la fecha (longitud máxima, longitud sagital y anchura máxima) y se han propuesto diez nuevas medidas. Se ha realizado un análisis estadístico de las mismas, y se han obtenido las ecuaciones de regresión para cada una, comprobando su correlación con el estado de desarrollo de los individuos. Así mismo, se ha realizado un análisis complementario utilizando metodologías como la morfometría geométrica y el Análisis de Matrices de Distancias Euclídeas (EDMA), para comprobar los resultados obtenidos.The study of populations from the past has been historically conditioned by an amount of limitations, especially on those individuals who haven't completed their osteological development, known as immatures.
The present work focuses on the study of the most immature individuals, whose death has occurred near birth, also known as perinatals. Studying their remains can provide a lot of information about populations from the past, and forensic studies.
It has been done a revision of some methods used so far to analyze the age estimation from perinatal remains. Also, we purpose the use of objective characters to make a classification and study more accurate of this individuals.
This work assumes the results shown on previous studies (López, 2009). It focuses on the metric analysis of the pars basilaris from the occipital bone, and its relationship with developmental stage of immature individuals.
For analyzing this characters, it has been studied the perinatal remains of the osteological collection from the cemetery of San José (Granada, s. XX-XXI). This collection has the necessary requirements to do the study and prove the validity of these structures as objective characters.
We have analyzed the three measurements from the pars basilaris described on previous works (maximum length, sagital length, width), and we have purposed ten new measurements. It has been made a statistical analysis of the data, obtaining the regression equations for each measure, checking their relationship with developmental age of the individuals. Likewise, it has been done a complementary analysis using alternative methods, like Geometric Morphometrics and EDMA, in order to check the results
Is the corporate social responsibility-innovation link homogeneous?: looking for sustainable innovation in the Spanish context
This study examines if the relationship between corporate social responsibility (CSR) and innovation is homogeneous or depends on the type of CSR practice and/or thetype of innovation. The paper focuses on the three dimensions of the"three bottomline" of CSR (economic, social, and environmental) and on the so called"fateful triangle" of innovation, which together with studied product and process innovation typesalso considers organizational innovation. The theoretical framework is based on the resource-based view and the knowledge-based view approaches. In analysing sustainable innovation in the Spanish context, we look at a set of firms taking data forthe 2009-2014 Spanish Community Innovation Survey. The empirical study usesrandom effect probit panel data methodology. The results show that, although thepositive effect of CSR on innovation is confirmed for the majority of the cases, thereare differences depending on the innovation type and the CSR dimension
El estudio de las poblaciones del pasado a través de los restos óseos: estructura de la mortalidad en restos humanos perinatales
Proyecto fin de carrera en Biología Evolutiva y Biodiversida
Complementarity between CSR dimensions and innovation: behaviour, objective or both?
This research assesses the impact of combining the economic, social and environmental dimensions of the corporate social responsibility (CSR) on firm innovation. In particular, we test whether the three dimensions of CSR (economic, social and environmental) are interrelated (behavioural complementarity), and whether their joined adoption will generate super-additive innovation performance effects (objective complementarity). To that end, we draw on the Community Innovation Survey (CIS) for Spain during the period 2009-2014. The analyses confirm behavioural complementarity among the three dimensions of CSR, as well as differences on objective complementarities depending on the innovation performance measure considered. In particular, the combination of the social dimension with any of the two others (economic and environmental) is the one that gives the best results in terms of radical innovation, whereas both the economic and environmental dimensions of CSR seem to be fundamental to foster incremental innovation. These results have implications for academics and practitioners, since they provide useful guidelines for the design of CSR in order to enhance firm innovation
Publishing performance in economics: Spanish rankings (1990-1999)
This paper contributes to the growing literature that analyses the Spanish publishing performance in Economics throughout the 1990s. Several bibliometric indicators are used in order to provide Spanish rankings (of both institutions and individual authors) based on Econlit journals. Further, lists of the ten most influential authors and articles over that period, in terms of citations, are reported.Publicad
Usher syndrome : molecular analysis of USH2 genes and development of a next-generation sequencing platform
El síndrome de Usher (USH) es una enfermedad hereditaria autosómica recesiva, caracterizada por la asociación de hipoacusia neurosensorial, retinosis pigmentaria y, en ocasiones, alteración de la función vestibular. Clínicamente, el USH se puede clasificar en tres tipos (USH1, USH2 y USH3), principalmente en base a la gravedad y progresión de la hipoacusia y presencia o no de disfunción vestibular. El USH es heterogéneo tanto a nivel clínico como genético y, hasta la fecha, se han descrito 11 genes implicados en la enfermedad.
El USH2 es la forma más común y tres son los genes responsables conocidos: USH2A (72 exones), GPR98 (90 exones) y DFNB31 (12 exones). USH2A es responsable de más del 70% de los casos USH2, teniendo una menor implicación los otros dos genes. Hasta esta tesis, no se había realizado un análisis exhaustivo de estos tres genes en pacientes españoles con síndrome de Usher. Por ello, uno de los objetivos fue el análisis molecular de los tres genes USH2 en una cohorte inicial de 88 pacientes con síndrome de Usher. El estudio consintió en el análisis de los exones, más las regiones intrónicas flanqueantes, mediante amplificación por PCR y secuenciación directa por Sanger. El estudio no se limitó a la detección de mutaciones puntuales, las variantes detectadas fueron analizadas con varios programas bioinformáticos para predecir su posible patogenicidad y, cuando fue necesario, se realizaron estudios funcionales para comprobar los efectos predichos. Además también se realizaron análisis de CGH-array (comparative genome hibrydization array) para detectar posibles grandes inserciones/deleciones, que no identifican los típicos análisis por PCR. El estudio se inició con USH2A,y en los pacientes en los que no se encontraron mutaciones en este gen, se continuó con el análisis de GPR98 y DFNB31. Treinta y siete (23 nuevas) mutaciones diferentes se detectaron en USH2A y 7 (5 nuevas) en GPR98. No se detectaron mutaciones en DFNB31. Las mutaciones detectadas fueron de naturaleza muy diversa (cambios de aminoácido, isocodificantes, codones de parada prematuro directos, pequeñas deleciones e inserciones) y en la mayoría de casos las mutaciones fueron privadas, demostrando la elevada heterogeneidad alélica de esta enfermedad. Además, se identificaron dos grandes deleciones gracias al uso de la técnica de CGH-array. En el desarrollo de este estudio se describió por primera vez en el USH, la presencia de una mutación intrónica profunda en el gen USH2A que produce la activación de un pseudoexon. Esta variante fue detectada en 4 pacientes españoles, completando y mejorando de esta forma el diagnóstico molecular del USH. Esta parte del estudio nos permitió estimar la prevalencia de los genes USH2 en población española. USH2A está implicado en un 76% de los casos USH2, seguido de GPR98 con un 5,2%. DFNB31 tiene una menor implicación en nuestra población.
CLRN1,es el único gen responsable del USH3 conocido. Sin embargo, se ha publicado que este gen también puede estar implicado en pacientes con USH1 o USH2. El análisis de este gen en una cohorte de 17 pacientes con USH nos ha permitido identificar 2 nuevas mutaciones y confirmar la baja implicación de este gen en pacientes españoles.
Debido a la elevada heterogeneidad genética y alélica del USH y al gran tamaño de algunos de los genes implicados, el diagnóstico del USH mediante las técnicas de secuenciación tradicionales resulta una tarea muy laboriosa. En los últimos años, las técnicas de secuenciación de nueva generación se han desarrollado considerablemente y son muchas sus posibles aplicaciones. Nosotros hemos elegido el método de captura de regiones (Nimblegen, Roche) seguido de secuenciación masiva mediante la plataforma GS Junior (454, Roche) para el estudio de los genes Usher y su posible aplicación al diagnóstico. Un total de 19 genes fueron incluidos en el diseño (genes Usher, candidatos y otros implicados en sordera). De media, se obtuvieron cerca de 53Mb de secuencias, con un on target del 52%. La profundidad de cobertura obtenida fue de 77X, superando los 40X necesarios. Para evaluar la sensibilidad y fiabilidad de la técnica, en una primera fase se estudiaron 47 pacientes que tenían analizados previamente algunos de los genes Usher. Esta primera cohorte de pacientes nos permitió establecer los criterios adecuados para los sucesivos filtros que se aplicaron a las variantes obtenidas. Esto se automatizó mediante el diseño de un propio programa bioinformático, llamado GSdot. Solo un 2% de las variaciones conocidas no fueron detectadas por NGS debido principalmente a la presencia de regiones con homopolímeros, problemas de alineamiento o una baja cobertura. También nos permitió detectar mutaciones adicionales en 12 de los 47 pacientes, bien porque las mutaciones no se habían detectado por Sanger o el gen implicado no se había estudiado. Una vez comprobada la validez de la técnica, se estudiaron 13 nuevos pacientes con USH, pero sin ningún gen analizado anteriormente. Se detectaron las dos mutaciones en 10 de los 13 casos y en otros dos pacientes se detectó una variante clasificada como UV3. Además, se estudiaron 11 pacientes con sordera no sindrómica, lo que permitió identificar 3 mutaciones en 3 de ellos. En varios pacientes solo se identificó una mutación, y aunque alguno de ellos pueda ser simplemente portador de una mutación en los genes Usher y las mutaciones responsables estén en otro gen, la mayoría de ellos deben tener una segunda mutación, posiblemente en regiones no analizadas con esta técnica (por ejemplo: regiones intrónicas). En otros pacientes, no se pudo detectar ninguna mutación. En estos casos, el estudio del exoma entero ayudará a encontrar el gen implicado. Aunque es necesario mejorar la técnica, los resultados obtenidos son muy prometedores para una futura traslación al diagnóstico. Esta estrategia facilitará el diagnóstico del USH de pacientes que no presentan mutaciones en los genes principalmente implicados o de aquellos casos que presentan mutaciones en genes típicamente responsables de otro subtipo clínico.Usher syndrome is a genetic disorder combining sensorineural hearing loss (HL) and retinitis pigmentosa (RP). Some patients will also exhibit vestibular areflexia (VA). The majority of patients with Usher syndrome usually fall into one of three clinical categories. Of these, Usher syndrome type I (USH1) is the most severe form, consisting of profound hearing loss and vestibular dysfunction from birth. Moreover, onset of RP occurs earlier in USH1 than in Usher syndrome type II (USH2), which produces less severe congenital hearing loss and does not impair normal vestibular function. In most populations, USH1 accounts for approximately one-third of USH patients whereas two- thirds are classified as USH2. Usher syndrome type III (USH3) is a less common form except in such populations as Finns and Ashkenazi Jews. In this USH3 type, hearing loss is progressive and leads to variable vestibular dysfunction and onset of RP. It is important to use all accessible genetic tools to identify and characterize molecular origin in order to improve the knowledge of the physiopathological mechanisms causing Usher Syndrome.
This clinical heterogeneity is accompanied by high genetic heterogeneity. To date a minimum of eleven genes responsible for the disease are known. Five USH1 genes have been extensively studied: MYO7A (USH1B), CDH23 (USH1D), PCDH15 (USH1F), USH1C (USH1C) and USH1G (USH1G), with MYO7A being the most prevalent. A sixth gene, CIB2 (USH1J), has been very recently reported in a single family. Among the three identified USH2 genes, USH2A (USH2A), GPR98 (USH2C) and DFNB31 (USH2D), USH2A has been shown to be responsible for 70-80% of the USH2. Until recently, CLRN1 (USH3A) was the only gene known responsible for USH3
In this context, we have performed an exhaustive molecular analysis of the three causative USH2 genes (USH2A, GPR98 and DFNB31). The study was not limited to the search of point mutations; CGH-array analysis, computational predictions and functional studies were carried out when necessary. Thanks to this work, we determined that in Spain, USH2A and GPR98 are responsible for 94.8% and 5.2% of USH2 mutated cases, respectively. DFNB31 plays a minor role in the Spanish population. USH3 is thought to be a minor type of USH in our population.
Mutations in CLRN1 were initially responsible for USH3, but mutations in this gene have also been reported in patients with clinical features similar to USH1 or USH2. In this work, we have reported the results of the molecular analysis of CLRN1 in a cohort of patients and the low involvement of this gene in our population.
We have then designed a targeted exome of the Usher genes to be sequenced using the GS Junior system (Roche 454). The aim of the study was to test the feasibility of this new technics for a possible transfer to diagnostic facilities. Quality criteria and variant prioritization were set up on a control cohort (previously studied in one of the USH gene). The study has then been extended on a patient cohort. Our results indicate that NGS Usher-exome can be used in molecular diagnostics but improvement of the reliability of the sequencing technology, bioinformatics tools and dedicated databases is essential
QUI LLANÇA LA PRIMERA PEDRA? VIOLÈNCIA FEMINICIDA, UN CRIM D¿ESTAT. Interpretacions des dels processos litogràfics, el dibuix i el llibre alternatiu
Les violències contra les dones han estat històricament espentades cap a la intimitat, han sigut llegides com a comportaments tolerats i legitimats, dinàmiques de poder persistents i assumides com alienes i particulars. La violència i l'agressió, manifestacions extremes del control dels cossos llegits com femenins, s'han entès com a pràctiques aïllades i allunyades del context polític i social.
Existeix una evident vinculació entre les Violències Feminicides, les dinàmiques de poder i l'ordre legal de l'Estat, a més, l'estreta complicitat dels mitjans de comunicació que qüestionen, culpabilitzen a la víctima i converteixen la violència exercida sobre el seu cos en un espectacle de la crueltat i la morbositat.
A partir de l'experimentació amb diferents processos litogràfics, del dibuix directe i del llibre alternatiu, aquest projecte pretén trobar connexions (lapidàries) entre les primerenques i aparentment innocents pràctiques feminicides des de la infància fins l'edat adulta i la producció activa al taller.Violence against women has historically been pushed towards intimacy, read as tolerated and legitimized behaviours, persistent dynamics of Power and assumed as alien and private. Violence and aggression, extreme manifestations of bodies control read as feminine ones, have been understood as isolated practices, away from the political and social context.
There is an obvious link between the Feminicide Violence, the power dynamics and the legal order of the State, in addition, the close complicity of the Mass Media which questions, blames the victim and turns the violence on her body in a spectacle of cruelty and morbidity.
From a phase of experimentation with different lithographic processes, from direct drawing and from alternative book, this project aims to find (stoning) connections between the early and seemingly innocent feminicide practices from childhood to adulthood and the active production at the Graphic Workshop.García García, G. (2019). QUI LLANÇA LA PRIMERA PEDRA? VIOLÈNCIA FEMINICIDA, UN CRIM D¿ESTAT. Interpretacions des dels processos litogràfics, el dibuix i el llibre alternatiu. http://hdl.handle.net/10251/12396
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