29 research outputs found
Revealing personal identity through conferences about short stories in low-ses preschoolers.
This paper reveals personal identity through conferences about short stories in low-SES (Socio Economic Status) preschoolers between four and five years old in a kindergarten from the ICBF (Instituto Colombiano de Bienestar Familiar) in Bogotá. This research project´s objective is to analyze low-Ses preschoolers´ personal identity through conferences about short stories, identify criteria that determine low-SES preschoolers´ personal identity and describe the relationship between personal identity criteria and low-SES preschoolers´ life experiences. To achieve this purpose, the researchers selected ten preschoolers between four and five years old, five girls and five boys. For the implementation there were seven sessions in total in which the researchers applied seven personal identity criteria by showing children different short stories. These stories were created by the researchers and tailored to be relevant to the children. Also, different reading comprehension strategies and activities were carried out, children then drew about their life experiences and answered multiple questions designed by the researchers which were called conferences. To collect the data, the researchers used field notes, children´s drawings and conferences. After the process, it was found that feeling like part of a family, building relationships, recognizing their bodies and abilities, absorbing their environment, using their imagination to solve problems and dreaming about their future were relevant aspects and are related to their personal identity
Identificación de determinantes genéticos y molecurales asociados a los mirnas en la variabilidad de la evolución y respuesta al tratamiento del cáncer de mama
[ES] De acuerdo a lo reportado en el informe GLOBOCAN 2012 por la Agencia Internacional para Investigación en Cáncer (IARC), el cáncer de mama ocupó el primer lugar en incidencia y mortalidad por cáncer en mujeres, representado en cifras de 25.215 y 6.075 (casos por 100.000 habitantes) respectivamente (Ferlay, 2015). En el informe editado por la Sociedad Española de Oncología Médica la mayor incidencia, mortalidad y prevalencia a 5 años es para el cáncer de mama es de 29%, 15,5% y 40,8%, respectivamente (SEOM, 2014). Siendo así el tumor más frecuente en mujeres, tanto en España como en el resto del mundo, puesto que en Norte América la mortalidad anual es de 48.850 mujeres por año, con un número de nuevos casos anuales de más de 256.222 los cuales representan el 29.6% del total de cánceres en mujeres .
Uno de los aspectos más importantes dentro de la problemática del cáncer de mama es la alta heterogeneidad que se pone de manifiesto no sólo en el grado de susceptibilidad a padecer el cáncer, así como en los distintos resultados clínicos marcados por la agresividad, respuesta al tratamiento y posibilidad de recaída. Existe un importante componente genético que va a controlar en cierta medida esta variabilidad, dicho componente viene determinado por la suma de efectos de múltiples genes de baja penetrancia, que interaccionan entre sí y con el ambiente (genes modificadores), siguiendo un modelo de herencia poligénica o cuantitativa (Balmain et al. 2003). Dentro de estos factores se destacan los microRNAs, quienes juegan un papel importante en procesos de desarrollo, crecimiento, metástasis y resistencia a medicamentos (Graveel et al., 2015), puesto que su desregulación influye en las vías de señalización celular, debido a su interacción a nivel pre- y post-transcipcional (Mulrane, et al., 2013). Existiendo una unión entre señales alteradas de miRNA y el desarrollo de cáncer de mama y metástasis, como es el caso de la perdida de los miRNA supresores tumorales (oncosupresores-miRs) let-7s, miR-34a/125s/200s ó por el contrario la sobreexpresión miRNA oncogénicos (oncomiRs) miR-21/135/155/224/373/520c entre otros (Tang, et al., 2012).
Una vez diagnosticado el cáncer de mama, hay una serie de criterios establecidos para definir el pronóstico de las pacientes. Sin embargo, incluso en pacientes con el mismo subtipo de tumor, la respuesta de éste al tratamiento, tanto con la terapia habitual como con los inhibidores específicos de ERBB2 (Dean-Colomb and Esteva, 2008) es heterogénea: (i) tanto a corto plazo: incluido el grado de respuesta (completa, parcial y/o nula) (Smigal et al. 2006); (ii) como a largo plazo: incluida la recaída (con variable tiempo de latencia e “hibernación”), la resistencia tardía al tratamiento y el efecto sobre la progresión tardía a distancia o metástasis, causa última de la muerte de las pacientes. Parece que la diseminación tumoral y la respuesta al tratamiento tienen un importante control poligénico, cuya caracterización haría posible diseñar tratamientos más eficaces para el cáncer diseminado (Balmain et al. 2003, Winter et al. 2008).
Siendo la recaída el problema de los pacientes que sí responden inicialmente, debido a que por criterios pronósticos deberían evolucionar bien, como sucede en un porcentaje de pacientes con tumor localizado y receptor de estrógenos positivo (ER+) que recaen (van de Vijver et al. 2002). El gran problema de la recaída es que, en muchas ocasiones, el tumor acaba por no responder a las líneas de tratamiento establecidas como antraciclinas y taxanos (resistencia “tardía”), incluso con los nuevos tratamientos como los inhibidores específicos de ERBB-2 Trastuzumab y Lapatinib (Slamon et al. 2001, Xia et al. 2006). Es preciso definir la causa como multifactorial, por la participación tanto del sistema inmune, la angiogénesis, apoptosis, etc. y, por tanto, poligénica (Aguirre-Ghiso 2007, Wahler J, 2015). En relación a esto, un importante número de miRNAs han sido relacionados con un incremento en la sensibilidad a agentes quimioterapéuticos, debido a su interacción con proteínas envueltas en procesos de apoptosis o de supervivencia celular, tal es el caso de miR-128, 21, 200b/c, 451a relacionados con respuesta a Doxorrubicina, y miR-24, 125b a Docetaxel (Mulrane, et al., 2013). Por lo anterior es trascendental conocer los procesos y factores que determinan la resistencia al tratamiento (Cameron y Stein, 2008), así como los relacionados con la progresión de la enfermedad. La diferente progresión de tumores aparentemente similares y su respuesta al tratamiento está influenciada por un componente poligénico de genes modificadores (Balmain et al. 2003), y su caracterización permitirá una mejor evaluación pronostica de las pacientes, predecir su respuesta al tratamiento y tomar medidas más individualizadas.
Finalmente, lograr dilucidar el componente poligénico de genes modificadores que determina la heterogeneidad en la evolución o comportamiento temprano y tardío del tratamiento, así como en susceptibilidad y progresión entre individuos que aparentemente poseen la misma enfermedad histopatológica, permitirá no sólo un mejor conocimiento de los mecanismos patogénicos de la enfermedad, sino también diseñar mejores estrategias de prevención, pronóstico y tratamiento.
Hipótesis
Uno de los aspectos más importantes dentro de la problemática del cáncer de mama es la alta heterogeneidad de su presentación clínica entre pacientes, considerándose una enfermedad de génesis compleja. Existen grandes diferencias en el grado de susceptibilidad a desarrollarlo y en la evolución de la enfermedad entre pacientes, en cuanto a la agresividad, respuesta al tratamiento y riesgo de recidiva, considerándose todos ellos fenotipos (en este caso, patofenotipos) complejos determinados por el efecto de genes encargados de regular diversos procesos en los diferentes niveles de la organización biológica. Una vez diagnosticado el cáncer de mama, hay una serie de criterios clínico-patológicos y moleculares establecidos para definir su pronóstico. Aún así, incluso en pacientes con el mismo subtipo de tumor y estadio de desarrollo tumoral, la respuesta al tratamiento es heterogénea (330). Ello se traduce en diferencias tanto en la respuesta inmediata al tratamiento como a largo plazo, incluidas la recaída, la resistencia tardía al tratamiento y el efecto sobre la metástasis, causa última de la muerte de las pacientes (331).
Parece que la diferente evolución tumoral y la respuesta al tratamiento están influenciadas por un importante control poligénico y por múltiples determinantes moleculares (332, 333). Entre estos determinantes moleculares estarían los miRNAs, que son pequeñas moléculas de RNA que participan, fundamentalmente, en la degradación de mRNA específicos. De este modo, participan en la regulación de la expresión génica y tienen una función importante en procesos fisiológicos y patológicos, incluido el cáncer. Así, se describen diferentes miRNAs que participan en el desarrollo, crecimiento y capacidad de diseminación tumoral, así como en la resistencia a la quimioterapia (334).
La desregulación de los niveles de miRNAs, influye en las vías de señalización celulares, debido a sus complejas interacciones a niveles pre- y post-transcripcionales (173). Se ha descrito la asociación entre señales alteradas de miRNAs y el desarrollo del cáncer, en general, y del cáncer de mama, en particular. Este sería el caso de la pérdida de miRNA supresores tumorales (oncosupresores-miRs) como let-7s, miR-34a, miR-125s y miR-200s, entre otros; así como de la sobreexpresión miRNA oncogénicos (onco-miRs), como miR-21, miR-135, miR-155, miR-224, miR-373 y miR-520c, entre otros (223) y con la respuesta al tratamiento (173).
El distinto comportamiento del cáncer de mama entre pacientes que aparentemente tienen la misma enfermedad histopatológica y estadio evolutivo vendría determinado, en parte, por la suma de efectos de genes modificadores de baja penetrancia. Nuestra hipótesis de tra-bajo es que los miRNAs serían subfenotipos moleculares que contribuyen a la heterogeneidad de comportamiento tumoral. Por tanto, los genes que codifican los miRNAs podrían formar parte del componente poligénico que regula la diferente susceptibilidad y evolución del cáncer; y, en concreto, del cáncer de mama.
Objetivos
Objetivo global
El objetivo global de este estudio es determinar si algunos miRNAs contribuyen a explicar la diferente susceptibilidad, evolución y respuesta al tratamiento del cáncer de mama y si los genes que los codifican pueden contribuir a la influencia poligénica de la enfermedad.
Estudiar esta influencia en la población humana es difícil por la heterogeneidad genética de la población y la influencia ambiental compleja. Por ello, los estudios se llevan a cabo en un modelo de variabilidad fenotípica y genética limitadas y controladas. Este se generó mediante un cruce retrógrado o backcross entre dos cepas de ratón genéticamente homogéneas, singénicas, con distinto grado de susceptibilidad al cáncer de mama.
Para responder a este objetivo global, planteamos los siguientes objetivos específicos:
Objetivos específicos
Objetivo 1. Evaluar si los niveles intratumorales de algunos miRNAs pueden contribuir a explicar la diferente susceptibilidad y evolución del cáncer de mama en ausencia de trata-miento.
Objetivo 2. Determinar si los niveles intratumorales de algunos miRNAs contribuyen a explicar la variable respuesta al tratamiento del cáncer de mama con antraciclinas y taxanos, en condiciones de homogeneidad en los factores extrínsecos a la célula tumoral.
Objetivo 3. Determinar si los niveles intratumorales de algunos miRNAs contribuyen a explicar la variable respuesta al tratamiento del cáncer de mama con antraciclinas y taxanos, en condiciones de heterogeneidad en los factores intrínsecos y extrínsecos a la célula tumoral.
Objetivo 4. Validar in vitro el papel de algunos de los miRNAs estudiados sobre la respuesta al tratamiento del cáncer de mama con doxorrubicina.
Conclusiones
Primera
Los niveles intratumorales de expresión de algunos miRNAs mostraron relación con el grado de susceptibilidad y evolución del cáncer de mama, así como con los niveles de proteínas de señalización y composición celular del tumor en ausencia de tratamiento.
Segunda
Se identificaron miRNAs cuyos niveles intratumorales se asocian con el grado de respuesta al tratamiento con docetaxel o doxorrubicina, tanto en condiciones de homogeneidad de compartimentos extrínseco-celulares, como de heterogeneidad de los mismos
Tercera
El fondo genético influye en la respuesta del cáncer de mama al tratamiento con docetaxel y doxorrubicina. En este sentido, regiones genéticas que controlan los niveles de miRNAs intracelulares contribuyen al componente poligénico de la diferente evolución y respuesta al tratamiento del cáncer de mama.
Cuarta
Los miRNAs están integrados en redes de asociación complejas con otros subfenotipos moleculares y celulares que definen la evolución y respuesta al tratamiento del cáncer de mama.
Quinta
Se analizaron los efectos del aumento y la disminución de la expresión de let7b_5p como ejemplo de validación de las asociaciones observadas. Los niveles de este miRNA en distintas líneas de cáncer de mama en presencia de la doxorrubicina se asociaron con alteraciones en el ciclo celular
Revealing personal identity through conferences about short stories in low-ses preschoolers.
This paper reveals personal identity through conferences about short stories in low-SES (Socio Economic Status) preschoolers between four and five years old in a kindergarten from the ICBF (Instituto Colombiano de Bienestar Familiar) in Bogotá. This research project´s objective is to analyze low-Ses preschoolers´ personal identity through conferences about short stories, identify criteria that determine low-SES preschoolers´ personal identity and describe the relationship between personal identity criteria and low-SES preschoolers´ life experiences. To achieve this purpose, the researchers selected ten preschoolers between four and five years old, five girls and five boys. For the implementation there were seven sessions in total in which the researchers applied seven personal identity criteria by showing children different short stories. These stories were created by the researchers and tailored to be relevant to the children. Also, different reading comprehension strategies and activities were carried out, children then drew about their life experiences and answered multiple questions designed by the researchers which were called conferences. To collect the data, the researchers used field notes, children´s drawings and conferences. After the process, it was found that feeling like part of a family, building relationships, recognizing their bodies and abilities, absorbing their environment, using their imagination to solve problems and dreaming about their future were relevant aspects and are related to their personal identity
Niños Activos: Adultos Saludables
La actividad física en la primera infancia es la principal estrategia para educar al niño en lo que tiene que ver con la adquisición de hábitos y estilos de vida saludables. Es necesario conocer sobre los beneficios y las recomendaciones para promover la actividad física en los primeros años, responsabilidad que le atañe principalmente a los padres y cuidadores con el fin de alcanzar el máximo de salud, crecimiento y calidad en el resto de la vida del niño
Risk Factors Associated To Burnout Sindrome In Dentistry Students From University Of Valle.
Objetivo: Determinar los factores de
riesgo predisponentes al síndrome de
agotamiento laboral (BURNOUT) en estudiantes
del Programa de Odontología de
la Universidad del Valle.
Materiales y métodos: En este estudio
de tipo transversal, se seleccionaron 90
estudiantes matriculados en el periodo
Febrero-Junio de 2012 en el programa
académico de Odontología de la Universidad
del Valle, que cursan tercero, cuarto y
quinto año. A los sujetos seleccionados se
les aplicó El test Maslach Burnout Inventory
(MBI) el cual consta de 22 ítems con
7 opciones de respuesta que corresponden
a tres dimensiones básicas del síndrome de
BURNOUT; agotamiento emocional (AE),
despersonalización (D) y baja realización
personal o profesional (BR). Se realizaron
pruebas de Chi2 y pruebas no paramétricas
de Kruscal Wallis, y la prueba ANOVA.
Resultados: Los estudiantes de quinto año
obtuvieron un promedio de 5.60 en la escala
de despersonalización (D), indicando
que hay un factor de riesgo presente en este
grupo de estudiantes. En esta dimensión, se
encontraron los valores más bajos para los
estratos 1, 2, 3 y 6 sin embargo no hubo
diferencias estadísticamente significativas.
Teniendo en cuenta la sub-escala de
agotamiento Emocional (AE) los valores
más altos se relacionaron con los estratos
socio-económicos 3, 4 y 5.
Conclusiones: La carga académica puede
ser un factor predisponente que impacta
principalmente en la despersonalización y
se manifiesta al finalizar la carrera universitaria.
Las variables socio-económicas,
el ambiente familiar, la edad o cursar un
semestre específico no se constituyeron
factores de riesgo para el desarrollo del
síndrome. SUMMARY
Objective: To determine the risk factors
predisposing to burnout syndrome in
students from Dentistry Program at the
University of Valle.
Materials and Methods: In this cross
-sectional study were enrolled 90 students
in the period from February to June 2012
in the academic program of Dentistry from
the Universidad del Valle, who attend third,
fourth and fifth year. The test Maslach Burnout
Inventory (MBI) was applied which
consists of 22 items with 7 response options
corresponding to three basic dimensions of
burnout syndrome, emotional exhaustion
(AE), depersonalization (D) and reduced
personal or professional accomplishment
(BR). Chi2 test were run for each of the
factors and Kruscal Wallis and ANOVA
were also applied.
Results: The fifth graders scored an average
of 5.60 on a scale of depersonalization
(D), which was statistically significant,
indicating that there is a risk factor present
in this group of students. In this dimension
of depersonalization, values were lower
for levels 1, 2, 3 and 6 but there was no
statistically significant differences between
them. Given the sub-scale of emotional
exhaustion (AE) the highest values were
associated with socio-economic levels 3,
4 and 5.
Conclusions: Our results show that the academic
load can be a predisposing factor that
impacts mainly on the depersonalization
and manifests itself at the end of college.
Socioeconomic variables, family environment,
age, or spend a certain semester
do not constitute specific risk factors for
development of the syndrome
Proyecto pedagógico para el aprendizaje de prácticas bucales saludables con niños y niñas escolarizados entre 8 y 10 años
El objetivo de la presente investigación fue desarrollar un proyecto pedagógico para el aprendizaje de prácticas bucales saludables con los estudiantes de tercer grado de la escuela Alfonso Jaramillo Gutiérrez en la ciudad de Pereira. La metodología utilizada fue la pedagogía por proyectos apoyada en la lúdica como herramienta esencial buscando la construcción de un aprendizaje significativo. Los resultados obtenidos fueron positivos pues se logró la participación activa por parte de los niños y niñas, igualmente demostraron entender y relacionar los temas enseñados y mostraron interés en acoger las prácticas bucales saludables para su vida cotidiana. Se concluyó que la pedagogía por proyectos, como metodología, permitió afianzar y construir aprendizajes a través de la planificación de un proyecto flexible que tuvo en cuenta los conocimientos previos de la comunidad
The biological age linked to oxidative stress modifies breast cancer aggressiveness
The incidence of breast cancer increases with age until menopause, and breast cancer is more aggressive in younger women. The existence of epidemiological links between breast cancer and aging indicates that both processes share some common mechanisms of development. Oxidative stress is associated with both cancer susceptibility and aging. Here we observed that ERBB2-positive breast cancer, which developed in genetically heterogeneous ERBB2-positive transgenic mice generated by a backcross, is more aggressive in chronologically younger than in older mice (differentiated by the median survival of the cohort that was 79 weeks), similar to what occurs in humans. In this cohort, we estimated the oxidative biological age using a mathematical model that integrated several subphenotypes directly or indirectly related to oxidative stress. The model selected the serum levels of HDL-cholesterol and magnesium and total AKT1 and glutathione concentrations in the liver. The grade of aging was calculated as the difference between the predicted biological age and the chronological age. This comparison permitted the identification of biologically younger and older mice compared with their chronological age. Interestingly, biologically older mice developed more aggressive breast cancer than the biologically younger mice. Genomic regions on chromosomes 2 and 15 linked to the grade of oxidative aging were identified. The levels of expression of Zbp1 located on chromosome 2, a gene related to necroptosis and inflammation, positively correlated with the grade of aging and tumour aggressiveness. Moreover, the pattern of gene expression of genes linked to the inflammation and the response to infection pathways was enriched in the livers of biologically old mice. This study shows part of the complex interactions between breast cancer and aging.JPL was partially supported by FEDER and the MICINN (SAF2014-56989-R and SAF2017-88854R), the Instituto de Salud Carlos III (PIE14/00066), >Proyectos Integrados IBSAL 2015> (IBY15/00003), the Sandra Ibarra Foundation >de Solidaridad Frente al Cáncer> Foundation and >We can be heroes> Foundation. JHM was supported by the National Institutes of Health, a National Cancer Institute grant (R01 CA116481), and the Low-Dose Scientific Focus Area, Office of Biological & Environmental Research, US Department of Energy (DE-AC02-05CH11231).Peer Reviewe
Breast cancer phenotypic variability is affected by the biological age
Resumen del póster presentado al XXXIX Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular, celebrado en Salamanca del 5 al 8 de septiembre de 2016.Breast cancer incidence rates considerably increase with age and young age at diagnosis correlates with worse prognosis due to a more aggressive breast cancer behaviour. Biological age estimates the functional status of individuals comparing to other individuals of the same chronological age. We defined the biological age integrating phenotypes of oxidative stress, and calculated Δ biological age as the difference between chronological and predicted (biological) age. Mice with predicted ages older than chronological age, were considered biologically older; and mice with predicted ages younger than chronological age, were considered biologically younger. Our main goals were (i) define biological age using processes that are common to cancer and ageing, such as the oxidative stress, and (ii) analyze breast cancer phenotypic variability according to the biological age. We generated a cohort of mice with different susceptibility and evolution to ERBB2-induced breast cancer, using a backcross strategy, and dissected the disease into different pathophenotypes. We also measured intermediate phenotypes of oxidative stress. Linkage analysis was carried out to identify quantitative trait loci (QTL) associated with these phenotypes, and used multivariate models to define biological age. We identified that biologically older mice developed more aggressive disease than biologically younger mice. We also identified QTL simultaneously associated with Δ biological age and tumor pathophenotypes. We identified several genetic and molecular markers that define biological age and observed that ERBB2 breast cancer phenotypic variability is affected by the biological age.Peer reviewe
Intermediate Molecular Phenotypes to Identify Genetic Markers of Anthracycline-Induced Cardiotoxicity Risk.
Cardiotoxicity due to anthracyclines (CDA) affects cancer patients, but we cannot predict who may suffer from this complication. CDA is a complex trait with a polygenic component that is mainly unidentified. We propose that levels of intermediate molecular phenotypes (IMPs) in the myocardium associated with histopathological damage could explain CDA susceptibility, so variants of genes encoding these IMPs could identify patients susceptible to this complication. Thus, a genetically heterogeneous cohort of mice (n = 165) generated by backcrossing were treated with doxorubicin and docetaxel. We quantified heart fibrosis using an Ariol slide scanner and intramyocardial levels of IMPs using multiplex bead arrays and QPCR. We identified quantitative trait loci linked to IMPs (ipQTLs) and cdaQTLs via linkage analysis. In three cancer patient cohorts, CDA was quantified using echocardiography or Cardiac Magnetic Resonance. CDA behaves as a complex trait in the mouse cohort. IMP levels in the myocardium were associated with CDA. ipQTLs integrated into genetic models with cdaQTLs account for more CDA phenotypic variation than that explained by cda-QTLs alone. Allelic forms of genes encoding IMPs associated with CDA in mice, including AKT1, MAPK14, MAPK8, STAT3, CAS3, and TP53, are genetic determinants of CDA in patients. Two genetic risk scores for pediatric patients (n = 71) and women with breast cancer (n = 420) were generated using machine-learning Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) regression. Thus, IMPs associated with heart damage identify genetic markers of CDA risk, thereby allowing more personalized patient management.J.P.L.’s lab is sponsored by Grant PID2020-118527RB-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/
501100011039; Grant PDC2021-121735-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011039 and by
the “European Union Next Generation EU/PRTR”, the Regional Government of Castile and León
(CSI144P20). J.P.L. and P.L.S. are supported by the Carlos III Health Institute (PIE14/00066). AGN
laboratory and human patients’ studies are supported by an ISCIII project grant (PI18/01242). The
Human Genotyping unit is a member of CeGen, PRB3, and is supported by grant PT17/0019 of the
PE I + D + i 2013–2016, funded by ISCIII and ERDF. SCLl is supported by MINECO/FEDER research
grants (RTI2018-094130-B-100). CH was supported by the Department of Defense (DoD) BCRP,
No. BC190820; and the National Cancer Institute (NCI) at the National Institutes of Health (NIH),
No. R01CA184476. Lawrence Berkeley National Laboratory (LBNL) is a multi-program national
laboratory operated by the University of California for the DOE under contract DE AC02-05CH11231.
The Proteomics Unit belongs to ProteoRed, PRB3-ISCIII, supported by grant PT17/0019/0023 of
the PE I + D +i, 2017–2020, funded by ISCIII and FEDER. RCC is funded by fellowships from
the Spanish Regional Government of Castile and León. NGS is a recipient of an FPU fellowship
(MINECO/FEDER). hiPSC-CM studies were funded in part by the “la Caixa” Banking Foundation
under the project code HR18-00304 and a Severo Ochoa CNIC Intramural Project (Exp. 12-2016
IGP) to J.J.S
Latin American study of hereditary breast and ovarian cancer LACAM : a genomic epidemiology approach
Q2Q1Artículo original1-13Purpose: Hereditary Breast and Ovarian Cancer (HBOC) syndrome is responsible for ~5–10% of all diagnosed breast and ovarian cancers. Breast cancer is the most common malignancy and the leading cause of cancer-related mortality among women in Latin America (LA). The main objective of this study was to develop a comprehensive understanding of the genomic epidemiology of HBOC throughout the establishment of The Latin American consortium for HBOC-LACAM, consisting of specialists from 5 countries in LA and the description of the genomic results from the first phase of the study.
Methods: We have recruited 403 individuals that fulfilled the criteria for HBOC from 11 health institutions of Argentina, Colombia, Guatemala, Mexico and Peru. A pilot cohort of 222 individuals was analyzed by NGS gene panels. One hundred forty-three genes were selected on the basis of their putative role in susceptibility to different hereditary cancers. Libraries were sequenced in MiSeq (Illumina, Inc.) and PGM (Ion Torrent-Thermo Fisher Scientific) platforms.
Results: The overall prevalence of pathogenic variants was 17% (38/222); the distribution spanned 14 genes and varied by country. The highest relative prevalence of pathogenic variants was found in patients from Argentina (25%, 14/57), followed by Mexico (18%, 12/68), Guatemala (16%, 3/19), and Colombia (13%, 10/78). Pathogenic variants were found in BRCA1 (20%) and BRCA2 (29%) genes. Pathogenic variants were found in other 12 genes, including high and moderate risk genes such as MSH2, MSH6, MUTYH, and PALB2. Additional pathogenic variants were found in HBOC unrelated genes such as DCLRE1C, WRN, PDE11A, and PDGFB.
Conclusion: In this first phase of the project, we recruited 403 individuals and evaluated the germline genetic alterations in an initial cohort of 222 patients among 4 countries. Our data show for the first time in LA the distribution of pathogenic variants in a broad set of cancer susceptibility genes in HBOC. Even though we used extended gene panels, there was still a high proportion of patients without any detectable pathogenic variant, which emphasizes the larger, unexplored genetic nature of the disease in these populations