Absorption spectrum in the wings of the potassium second resonance doublet broadened by helium

We have measured the reduced absorption coefficients occurring in the wings of the potassium 4S-5P doublet lines at 404.414 nm and at 404.720 nm broadened by helium gas at pressures of several hundred Torr. At the experimental temperature of 900 K, we have detected a shoulder-like broadening feature on the blue wing of the doublet which is relatively flat between 401.8 nm and 402.8 nm and which drops off rapidly for shorter wavelengths, corresponding to absorption from the X doublet Sigma+ state to the C doublet Sigma+ state of the K-He quasimolecule. The accurate measurements of the line profiles in the present work will sharply constrain future calculations of potential energy surfaces and transition dipole moments correlating to the asymptotes He-K(5p), He-K(5s), and He-K(3d).Comment: 2 figure

Genome-wide identification of splicing quantitative trait loci (sQTLs) in diverse ecotypes of Arabidopsis thaliana

Alternative splicing (AS) of pre-mRNAs contributes to transcriptome diversity and enables plants to generate different protein isoforms from a single gene and/or fine-tune gene expression during different development stages and environmental changes. Although AS is pervasive, the genetic basis for differential isoform usage in plants is still emerging. In this study, we performed genome-wide analysis in 666 geographically distributed diverse ecotypes of Arabidopsis thaliana to identify genomic regions [splicing quantitative trait loci (sQTLs)] that may regulate differential AS. These ecotypes belong to different microclimatic conditions and are part of the relict and non-relict populations. Although sQTLs were spread across the genome, we observed enrichment for trans-sQTL (trans-sQTLs hotspots) on chromosome one. Furthermore, we identified several sQTL (911) that co-localized with trait-linked single nucleotide polymorphisms (SNP) identified in the Arabidopsis genome-wide association studies (AraGWAS). Many sQTLs were enriched among circadian clock, flowering, and stress-responsive genes, suggesting a role for differential isoform usage in regulating these important processes in diverse ecotypes of Arabidopsis. In conclusion, the current study provides a deep insight into SNPs affecting isoform ratios/genes and facilitates a better mechanistic understanding of trait-associated SNPs in GWAS studies. To the best of our knowledge, this is the first report of sQTL analysis in a large set of Arabidopsis ecotypes and can be used as a reference to perform sQTL analysis in the Brassicaceae family. Since whole genome and transcriptome datasets are available for these diverse ecotypes, it could serve as a powerful resource for the biological interpretation of trait-associated loci, splice isoform ratios, and their phenotypic consequences to help produce more resilient and high yield crop varieties

A Role in Immunity for Arabidopsis Cysteine Protease RD21, the Ortholog of the Tomato Immune Protease C14

Secreted papain-like Cys proteases are important players in plant immunity. We previously reported that the C14 protease of tomato is targeted by cystatin-like EPIC proteins that are secreted by the oomycete pathogen Phytophthora infestans (Pinf) during infection. C14 has been under diversifying selection in wild potato species coevolving with Pinf and reduced C14 levels result in enhanced susceptibility for Pinf. Here, we investigated the role C14-EPIC-like interactions in the natural pathosystem of Arabidopsis with the oomycete pathogen Hyaloperonospora arabidopsidis (Hpa). In contrast to the Pinf-solanaceae pathosystem, the C14 orthologous protease of Arabidopsis, RD21, does not evolve under diversifying selection in Arabidopsis, and rd21 null mutants do not show phenotypes upon compatible and incompatible Hpa interactions, despite the evident lack of a major leaf protease. Hpa isolates express highly conserved EPIC-like proteins during infections, but it is unknown if these HpaEPICs can inhibit RD21 and one of these HpaEPICs even lacks the canonical cystatin motifs. The rd21 mutants are unaffected in compatible and incompatible interactions with Pseudomonas syringae pv. tomato, but are significantly more susceptible for the necrotrophic fungal pathogen Botrytis cinerea, demonstrating that RD21 provides immunity to a necrotrophic pathogen

Different Oxidative Stress Response in Keratinocytes and Fibroblasts of Reconstructed Skin Exposed to Non Extreme Daily-Ultraviolet Radiation

Experiments characterizing the biological effects of sun exposure have usually involved solar simulators. However, they addressed the worst case scenario i.e. zenithal sun, rarely found in common outdoor activities. A non-extreme ultraviolet radiation (UV) spectrum referred as “daily UV radiation” (DUVR) with a higher UVA (320–400 nm) to UVB (280–320 nm) irradiance ratio has therefore been defined. In this study, the biological impact of an acute exposure to low physiological doses of DUVR (corresponding to 10 and 20% of the dose received per day in Paris mid-April) on a 3 dimensional reconstructed skin model, was analysed. In such conditions, epidermal and dermal morphological alterations could only be detected after the highest dose of DUVR. We then focused on oxidative stress response induced by DUVR, by analyzing the modulation of mRNA level of 24 markers in parallel in fibroblasts and keratinocytes. DUVR significantly modulated mRNA levels of these markers in both cell types. A cell type differential response was noticed: it was faster in fibroblasts, with a majority of inductions and high levels of modulation in contrast to keratinocyte response. Our results thus revealed a higher sensitivity in response to oxidative stress of dermal fibroblasts although located deeper in the skin, giving new insights into the skin biological events occurring in everyday UV exposure

Spectroscopie UV et IR des polyynes (application aux atmosphères planétaires et au milieu interstellaire)

PARIS7-Bibliothèque centrale (751132105) / SudocSudocFranceF

Dendrochronologie : potentialités et nouveaux enjeux pour l’archéologie préventive

International audienceLa dendrochronologie, méthode de datation qui étudie la variation des largeurs des cernes de croissance des arbres, est sollicitée, en archéologie, pour l’obtention d’une date absolue. Elle nécessite un dialogue incontournable entre les différents acteurs de la discipline pour fiabiliser les acquisitions, voire tout simplement obtenir une date. L’analyse des bois archéologiques ne se limite toutefois pas à la seule datation et constitue le point de départ de nouvelles approches qui permettent de combler des espaces et des champs de recherche encore lacunaire, pour le sud de la France notamment. Dans le contexte des changements climatiques actuels, la dendrochronologie contribue à la compréhension des pratiques sylvicoles anciennes et des environnements passés et présents, mais aussi à la localisation des forêts dans des espaces peu ou fortement anthropisés. La sélection des arbres (choix des espèces, caractéristiques dendromorphologiques, types de peuplement), les exploitations forestières et leur évolution au cours du temps, l’identification de la provenance des bois, sont autant d’informations qui peuvent être mises en perspective dans l’étude d’un site archéologique et de son environnement afin d’appréhender les interactions de l’Homme et de son milieu. Cette communication aura ainsi pour vocation de présenter les nouvelles approches dendrochronologiques et ses enjeux dans le cadre de l’archéologie préventive

Dendrochronologie : potentialités et nouveaux enjeux pour l’archéologie préventive

International audienceLa dendrochronologie, méthode de datation qui étudie la variation des largeurs des cernes de croissance des arbres, est sollicitée, en archéologie, pour l’obtention d’une date absolue. Elle nécessite un dialogue incontournable entre les différents acteurs de la discipline pour fiabiliser les acquisitions, voire tout simplement obtenir une date. L’analyse des bois archéologiques ne se limite toutefois pas à la seule datation et constitue le point de départ de nouvelles approches qui permettent de combler des espaces et des champs de recherche encore lacunaire, pour le sud de la France notamment. Dans le contexte des changements climatiques actuels, la dendrochronologie contribue à la compréhension des pratiques sylvicoles anciennes et des environnements passés et présents, mais aussi à la localisation des forêts dans des espaces peu ou fortement anthropisés. La sélection des arbres (choix des espèces, caractéristiques dendromorphologiques, types de peuplement), les exploitations forestières et leur évolution au cours du temps, l’identification de la provenance des bois, sont autant d’informations qui peuvent être mises en perspective dans l’étude d’un site archéologique et de son environnement afin d’appréhender les interactions de l’Homme et de son milieu. Cette communication aura ainsi pour vocation de présenter les nouvelles approches dendrochronologiques et ses enjeux dans le cadre de l’archéologie préventive

Dendrochronologie : potentialités et nouveaux enjeux pour l’archéologie préventive

International audienceLa dendrochronologie, méthode de datation qui étudie la variation des largeurs des cernes de croissance des arbres, est sollicitée, en archéologie, pour l’obtention d’une date absolue. Elle nécessite un dialogue incontournable entre les différents acteurs de la discipline pour fiabiliser les acquisitions, voire tout simplement obtenir une date. L’analyse des bois archéologiques ne se limite toutefois pas à la seule datation et constitue le point de départ de nouvelles approches qui permettent de combler des espaces et des champs de recherche encore lacunaire, pour le sud de la France notamment. Dans le contexte des changements climatiques actuels, la dendrochronologie contribue à la compréhension des pratiques sylvicoles anciennes et des environnements passés et présents, mais aussi à la localisation des forêts dans des espaces peu ou fortement anthropisés. La sélection des arbres (choix des espèces, caractéristiques dendromorphologiques, types de peuplement), les exploitations forestières et leur évolution au cours du temps, l’identification de la provenance des bois, sont autant d’informations qui peuvent être mises en perspective dans l’étude d’un site archéologique et de son environnement afin d’appréhender les interactions de l’Homme et de son milieu. Cette communication aura ainsi pour vocation de présenter les nouvelles approches dendrochronologiques et ses enjeux dans le cadre de l’archéologie préventive

Forest Exploitation and Wood Supply: A Dendroarchaeological Approach between the Massif Central and the Southern Alps since the Middle Ages

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Dendrochronologie : potentialités et nouveaux enjeux pour l’archéologie préventive

International audienceLa dendrochronologie, méthode de datation qui étudie la variation des largeurs des cernes de croissance des arbres, est sollicitée, en archéologie, pour l’obtention d’une date absolue. Elle nécessite un dialogue incontournable entre les différents acteurs de la discipline pour fiabiliser les acquisitions, voire tout simplement obtenir une date. L’analyse des bois archéologiques ne se limite toutefois pas à la seule datation et constitue le point de départ de nouvelles approches qui permettent de combler des espaces et des champs de recherche encore lacunaire, pour le sud de la France notamment. Dans le contexte des changements climatiques actuels, la dendrochronologie contribue à la compréhension des pratiques sylvicoles anciennes et des environnements passés et présents, mais aussi à la localisation des forêts dans des espaces peu ou fortement anthropisés. La sélection des arbres (choix des espèces, caractéristiques dendromorphologiques, types de peuplement), les exploitations forestières et leur évolution au cours du temps, l’identification de la provenance des bois, sont autant d’informations qui peuvent être mises en perspective dans l’étude d’un site archéologique et de son environnement afin d’appréhender les interactions de l’Homme et de son milieu. Cette communication aura ainsi pour vocation de présenter les nouvelles approches dendrochronologiques et ses enjeux dans le cadre de l’archéologie préventive