Comprehensive transcriptome of the maize stalk borer, Busseola fusca, from multiple tissue types, developmental stages, and parasitoid wasp exposures

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Phylogénie moléculaire des gènes viraux impliqués dans le métabolisme et la réplication de l'ADN

Un faisceau de preuves tend à démontrer que les virus sont des éléments génétiques très anciens, d'une origine probablement antérieure à la divergence des trois domaines du vivant. Cette longue histoire suggère fortement que les virus aient pu jouer un rôle important dans l'évolution de leurs hôtes. Cette hypothèse est particulièrement pertinente en ce qui concerne les gènes viraux ayant des homologues cellulaires et soulève la question de leur relation phylogénétique. Les génomes viraux codent pour diverses enzymes impliquées dans le métabolisme et la réplication de l'ADN. Les gènes correspondants sont très souvent phylogénétiquement éloignés de ceux de leurs hôtes; par contre, quand ils sont étroitement apparentés, souvent, l'explication la plus probable indique que le gène cellulaire est d'origine virale. La situation est particulièrement intéressante dans le cas des mitochondries, où au moins trois enzymes cellulaires auraient été remplacées par des contre parties virales. Ces propositions s'inscrivent dans la problématique plus générale de l'évolution et de l'origine des enzymes informationnelles. Nous montrons que les répartitions phylogénétiques de ces enzymes ne supportent pas l'hypothèse d'une double invention de l'ADN: une dans la lignée des Archéobactéries/Eucaryotes et une dans la lignée des Bactéries. Pour rendre compte de ces répartitions, il est plus vraisemblable d'imaginer de nombreux évènements de transferts horizontaux de gènes entre les trois domaines cellulaires du vivant, et entre cellule et virus, suivis, ou non, du remplacement non-homologue du gène initialement présent. Ces travaux posent aussi clairement l'importance de l'échantillonnage de séquences utilisé: une meilleure connaissance de la biodiversité des virus et des êtres cellulaires pourra sans aucun doute éclaircir les points encore en suspens à l'issue de ce travail.ORSAY-PARIS 11-BU Sciences (914712101) / SudocSudocFranceF

An alternative flavin-dependent mechanism for thymidylate synthesis

International audienceAlthough deoxythymidylate cannot be provided directly by ribonucleotide reductase, the gene encoding thymidylate synthase ThyA is absent from the genomes of a large number of nonsymbiotic microbes. We show that ThyX (Thy1) proteins of previously unknown function form a large and distinct class of thymidylate synthases. ThyX has a wide but sporadic phylogenetic distribution, almost exclusively limited to microbial genomes lacking thyA. ThyX and ThyA use different reductive mechanisms, because ThyX activity is dependent on reduced flavin nucleotides. Our findings reveal complexity in the evolution of thymidine in present-day DNA. Because ThyX proteins are found in many pathogenic microbes, they present a previously uncharacterized target for antimicrobial compounds

Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

La CID 51 s’intéresse aux interactions entre les sciences de la modélisation (mathématique, informatique, physique) et les sciences du vivant. Ces interactions sont anciennes et se nourrissent des avancées de chaque discipline. Or la biologie, comme les sciences de la modélisation ont connu des avancées spectaculaires ces dernières années, technologiques et conceptuelles. Ces progrès rendent nécessaire la réflexion sur une nouvelle interdisciplinarité et sur l’exploration de défis scientifiques émergents aux interfaces qu’il semble crucial de relever. Ce rapport de conjoncture pour la période 2016-2021 est donc organisé en six axes qui n’ont pas vocation à être exhaustifs, mais qui ont permis aux membres de la CID 51 de structurer une réflexion sur l’interdisciplinarité de demain. En préambule de notre rapport scientifique, nous proposons de dresser le premier portrait des chercheuses et des chercheurs rattachés à la CID 51

Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

La CID 51 s’intéresse aux interactions entre les sciences de la modélisation (mathématique, informatique, physique) et les sciences du vivant. Ces interactions sont anciennes et se nourrissent des avancées de chaque discipline. Or la biologie, comme les sciences de la modélisation ont connu des avancées spectaculaires ces dernières années, technologiques et conceptuelles. Ces progrès rendent nécessaire la réflexion sur une nouvelle interdisciplinarité et sur l’exploration de défis scientifiques émergents aux interfaces qu’il semble crucial de relever. Ce rapport de conjoncture pour la période 2016-2021 est donc organisé en six axes qui n’ont pas vocation à être exhaustifs, mais qui ont permis aux membres de la CID 51 de structurer une réflexion sur l’interdisciplinarité de demain. En préambule de notre rapport scientifique, nous proposons de dresser le premier portrait des chercheuses et des chercheurs rattachés à la CID 51

Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

La CID 51 s’intéresse aux interactions entre les sciences de la modélisation (mathématique, informatique, physique) et les sciences du vivant. Ces interactions sont anciennes et se nourrissent des avancées de chaque discipline. Or la biologie, comme les sciences de la modélisation ont connu des avancées spectaculaires ces dernières années, technologiques et conceptuelles. Ces progrès rendent nécessaire la réflexion sur une nouvelle interdisciplinarité et sur l’exploration de défis scientifiques émergents aux interfaces qu’il semble crucial de relever. Ce rapport de conjoncture pour la période 2016-2021 est donc organisé en six axes qui n’ont pas vocation à être exhaustifs, mais qui ont permis aux membres de la CID 51 de structurer une réflexion sur l’interdisciplinarité de demain. En préambule de notre rapport scientifique, nous proposons de dresser le premier portrait des chercheuses et des chercheurs rattachés à la CID 51

Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

La CID 51 s’intéresse aux interactions entre les sciences de la modélisation (mathématique, informatique, physique) et les sciences du vivant. Ces interactions sont anciennes et se nourrissent des avancées de chaque discipline. Or la biologie, comme les sciences de la modélisation ont connu des avancées spectaculaires ces dernières années, technologiques et conceptuelles. Ces progrès rendent nécessaire la réflexion sur une nouvelle interdisciplinarité et sur l’exploration de défis scientifiques émergents aux interfaces qu’il semble crucial de relever. Ce rapport de conjoncture pour la période 2016-2021 est donc organisé en six axes qui n’ont pas vocation à être exhaustifs, mais qui ont permis aux membres de la CID 51 de structurer une réflexion sur l’interdisciplinarité de demain. En préambule de notre rapport scientifique, nous proposons de dresser le premier portrait des chercheuses et des chercheurs rattachés à la CID 51

Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

La CID 51 s’intéresse aux interactions entre les sciences de la modélisation (mathématique, informatique, physique) et les sciences du vivant. Ces interactions sont anciennes et se nourrissent des avancées de chaque discipline. Or la biologie, comme les sciences de la modélisation ont connu des avancées spectaculaires ces dernières années, technologiques et conceptuelles. Ces progrès rendent nécessaire la réflexion sur une nouvelle interdisciplinarité et sur l’exploration de défis scientifiques émergents aux interfaces qu’il semble crucial de relever. Ce rapport de conjoncture pour la période 2016-2021 est donc organisé en six axes qui n’ont pas vocation à être exhaustifs, mais qui ont permis aux membres de la CID 51 de structurer une réflexion sur l’interdisciplinarité de demain. En préambule de notre rapport scientifique, nous proposons de dresser le premier portrait des chercheuses et des chercheurs rattachés à la CID 51

Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

La CID 51 s’intéresse aux interactions entre les sciences de la modélisation (mathématique, informatique, physique) et les sciences du vivant. Ces interactions sont anciennes et se nourrissent des avancées de chaque discipline. Or la biologie, comme les sciences de la modélisation ont connu des avancées spectaculaires ces dernières années, technologiques et conceptuelles. Ces progrès rendent nécessaire la réflexion sur une nouvelle interdisciplinarité et sur l’exploration de défis scientifiques émergents aux interfaces qu’il semble crucial de relever. Ce rapport de conjoncture pour la période 2016-2021 est donc organisé en six axes qui n’ont pas vocation à être exhaustifs, mais qui ont permis aux membres de la CID 51 de structurer une réflexion sur l’interdisciplinarité de demain. En préambule de notre rapport scientifique, nous proposons de dresser le premier portrait des chercheuses et des chercheurs rattachés à la CID 51