1,092 research outputs found

    The Epstein-Barr Virus Episome Maneuvers between Nuclear Chromatin Compartments during Reactivation.

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    The human genome is structurally organized in three-dimensional space to facilitate functional partitioning of transcription. We learned that the latent episome of the human Epstein-Barr virus (EBV) preferentially associates with gene-poor chromosomes and avoids gene-rich chromosomes. Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus behaves similarly, but human papillomavirus does not. Contacts on the EBV side localize to OriP, the latent origin of replication. This genetic element and the EBNA1 protein that binds there are sufficient to reconstitute chromosome association preferences of the entire episome. Contacts on the human side localize to gene-poor and AT-rich regions of chromatin distant from transcription start sites. Upon reactivation from latency, however, the episome moves away from repressive heterochromatin and toward active euchromatin. Our work adds three-dimensional relocalization to the molecular events that occur during reactivation. Involvement of myriad interchromosomal associations also suggests a role for this type of long-range association in gene regulation.IMPORTANCE The human genome is structurally organized in three-dimensional space, and this structure functionally affects transcriptional activity. We set out to investigate whether a double-stranded DNA virus, Epstein-Barr virus (EBV), uses mechanisms similar to those of the human genome to regulate transcription. We found that the EBV genome associates with repressive compartments of the nucleus during latency and with active compartments during reactivation. This study advances our knowledge of the EBV life cycle, adding three-dimensional relocalization as a novel component to the molecular events that occur during reactivation. Furthermore, the data add to our understanding of nuclear compartments, showing that disperse interchromosomal interactions may be important for regulating transcription

    Addressing the Legacies of Historical Redlining: Correlations with Measures of Modern Housing Instability

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    "Redlining" of neighborhoods, one of a number of explicitly racist United States federal housing policies in the mid–twentieth century, blocked Black households and other communities of color from accessing home mortgages—and as a result homeownership—for decades. The practice has been linked to present day racialized neighborhood poverty and ongoing negative impacts on formerly redlined neighborhoods.In an attempt to address or mitigate decades of racist housing policies, some policymakers and jurisdictions are considering reparative policies and otherwise prioritizing Black households and others disenfranchised by past racist housing policies. Given the prominence of redlining maps and analyses that find associations between redlining and negative impacts on neighborhoods, some policy makers have focused on redlined areas as a criteria for qualifying for direct assistance.In this brief, we explore the extent to which historical redlining patterns correlate with current risk of housing instability. Using redlining maps for more than 200 cities digitized by the University of Richmond as a base and a number of instability indicators including the Urban Institute's Emergency Rental Assistance Priority (ERA Priority) Index, eviction filing data from the Eviction Lab, and Affirmatively Furthering Fair Housing (AFFH) data, we examine the extent to which redlined areas correlate with concentrations of people who are most at risk of housing instability. It is important to note that the overall practice of restricting access to housing based on race still happens today, but for the purposes of this brief, when we talk about redlining, we mean the legacy of the Federal Housing Administration (FHA)

    Experimental Constraints on Ocean Wave Erosion of Icebergs and Glaciers

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    Loss of ice from glaciers and ice sheets has been steadily increasing over recent decades due to rising oceanic and atmospheric temperatures. White (1980) developed a theoretical estimate for the erosion rate of icy surface by wave activity, which has since been used as the sole basis for calculating wave melting effects in ocean and ice sheet models. In this study, we conduct the first new experiments since White (1980) to test the established parameterization and extend it to a wider range of wave and water properties. A custom-built 1.2 meter long wave tank is used to simulate the behavior of ocean waves on ice shelves in a laboratory-scaled manner. White’s theory is tested for a wide range of conditions to within a reasonable margin of error (given the limitations of the tank and required assumptions). We further discuss how the results from this experiment can help to improve models of the high-latitude oceans for the benefit of predicting future climate, and assessing iceberg hazards to shipping

    Aproximació al coneixement de la flora liquènica i dels fongs liquenícoles dels altiplans i conques centrals de Catalunya: el sector segàrric

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    L'estudi del sector segàrric dels altiplans i conques centrals catalanes, una àrea poc explorada des d'un punt de vista liquènic, ha aportat un catàleg de 334 tàxons, dels quals 301 són fongs liquenificats, i 33, fongs liquenícoles. Cal destacar l'aportació de sis nous tàxons per a la península Ibèrica (Acarospora chrysocardia, Diplotomma hedinii, Lecanora barkmanniana, L. farinaria, Lichenostigma subradians i Skyttea hawksworthii). A més, s'incrementa en 14 tàxons la llista de líquens i fongs liquenícoles de Catalunya (Caloplaca lucifuga, Candelariella faginea, Catapyrenium daedalum, Chaenothecopsis viridireagens, Collema fragrans, Lecania spadicea, Lepraria elobata, Lichenostigma gracilis, Lichinella jodopulchra, Muellerella hospitans, Placidium semaforonense, Solenopsora cesatii, Trapeliopsis pseudogranulosa i Xanthoparmelia pokornyi) i 96 tàxons són citacions noves per a les comarques lleidatanes. La composició florística de la zona estudiada se situa a mig camí entre la flora de les zones muntanyoses i de la regió mediterrània, sobretot pel que fa a les formes vitals i al tipus de fotobiont.A lichenological survey of the plateaus and basins of the central part of Catalonia has yielded a catalogue of 334 taxa, 301 of which are lichenized fungi and 33 lichenicolous fungi. Among the quoted species, six taxa are newly reported for the Iberian Peninsula (Acarospora chrysocardia, Diplotomma hedinii, Lecanora barkmanniana, L. farinaria, Lichenostigma subradians and Skyttea hawksworthii). In addition, 14 taxa are added to the current biota of Catalonia (Caloplaca lucifuga, Candelariella faginea, Catapyrenium daedalum, Chaenothecopsis viridireagens, Collema fragrans, Lecania spadicea, Lepraria elobata, Lichenostigma gracilis, Lichinella jodopulchra, Muellerella hospitans, Placidium semaforonense, Solenopsora cesatii, Trapeliopsis pseudogranulosa and Xanthoparmelia pokornyi). 96 taxa are newly reported for the province of Lleida. The floristic analysis of the area reveals that the lichen biota of the area shows a distribution of life forms and type of photobiont with an intermediate position between montane areas and the Mediterranean region.El estudio del sector segárrico de los altiplanos y cuencas centrales catalanas, un área poco explorada desde un punto de vista liquénico, ha aportado un catálogo de 334 taxones, de los que 301 son hongos liquenificados, y 33, hongos liquenícolas. Se destaca la aportación de seis nuevos taxones para la Península Ibérica (Acarospora chrysocardia, Diplotomma hedinii, Lecanora barkmanniana, L. farinaria, Lichenostigma subradians y Skyttea hawksworthii). Además, 14 taxones son nuevas citas para la biota liquènica y fúngica de Cataluña (Caloplaca lucifuga, Candelariella faginea, Catapyrenium daedalum, Chaenothecopsis viridireagens, Collema fragrans, Lecania spadicea, Lepraria elobata, Lichenostigma gracilis, Lichinella jodopulchra, Muellerella hospitans, Placidium semaforonense, Solenopsora cesatii, Trapeliopsis pseudogranulosa y Xanthoparmelia pokornyi) y 96 taxones son nuevas citas para las comarcas leridanas. El análisis de la composición florística sitúa a la flora liquénica de la zona a caballo entre la flora de las zonas de montaña y la región mediterránea, sobretodo por las formas vitales y el tipo de fotobionte presente

    Contribució al conocimiento de la micoflora del Parc de la Serralada Litoral

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    Aportem l'examen de 6 espècies, corresponents a 3 gèneres diferents de basidiomicets, Entoloma, Leucoagaricus, i Trichocybe, mitjançant la descripció dels seus caràcters morfològics, i en algun cas, també amb anàlisis filogenètiques. També hi afegim una contribució a la iconografia de les espècies en el seu hàbitat natural, amb imatges dels caràcters microscòpics més rellevants. Es descriuen les següents espècies: Entoloma dysthales f. acystidiosum, Entoloma scabiosum, Entoloma speculum, Leucoagaricus crystallifer, Leucoagaricus ionidicolor, i Trichocybe pubèrula.We provide the examination of 6 species corresponding to 3 different genera of basidiomycetes, Entoloma, Leucoagaricus, and Trichocybe, describing their morphological characters, and, in some instances, including phylogenetic analysis. Also included in this study is a contribution to the iconography of the species in their natural habitat, with images of the most relevant microscopic characters. The following species are described: Entoloma dysthales f. acystidiosum Noordel., E. scabiosum (Fr) Quél., E. speculum (Fr) Quél. Leucoagaricus crystallifer Vellinga, L. ionidicolor Bellù & Lanzoni, and Trichocybe puberula (Kuyper) Vizzini.Aportamos el examen de 6 especies correspondientes a 3 géneros distintos de basidiomicetes, Entoloma, Leucoagaricus, y Trichocybe, mediante la descripción de sus caracteres morfológicos, y en algún caso incluyendo análisis filogenéticos. También se incluye en este estudio una aportación a la iconografía de las especies en su hábitat natural, con imágenes de los caracteres microscópicos más relevantes. Se describen las siguientes especies: Entoloma dysthales f. acystidiosum Noordel., E. scabiosum (Fr) Quél., E. speculum (Fr) Quél. Leucoagaricus crystallifer Vellinga, L. ionidicolor Bellù & Lanzoni, y Trichocybe puberula (Kuyper) Vizzini

    Trastorno de estrés post-traumático y factores asociados en distintas poblaciones laborales en la ciudad de Huancayo, 2022 – 2023

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    El periodo de aislamiento social y el confinamiento durante la pandemia del COVID-19 ha generado a nivel mundial un aumento indiscriminado y silencioso, y ahora notable de los trastornos de la esfera mental, y su asociación a padecer de trastorno de estrés postraumático (TEP), no obstante, estas cifras también han ido teniendo cambios según la flexibilidad de las normas en cuanto a cada ola que por la enfermedad hubo, teniendo en cuenta este contexto, no hay estudios hasta el momento sobre el tema que mencionen el impacto de diversos factores como sociolaborales, psicológicos y los propios por padecimiento de COVID-19 y su asociación con el riesgo de padecer de trastorno de estrés postraumático en los distritos de El Tambo, Huancayo y Chilca de la provincia de Huancayo. El objetivo del estudio fue determinar los factores asociados a padecer trastorno de estrés postraumático durante la pandemia de COVID-19 en distintas poblaciones laborales en la ciudad de Huancayo en el periodo 2022-2023. Se utilizó los métodos hipotético-deductivo y transversal-analítico; en el cual se utilizaron dos escalas: DASS -21 y IES-R, los mismo que fueron validados para la evaluación de tres trastornos en la esfera mental: la depresión, ansiedad y estrés, y la medición del trastorno de estrés postraumático, según corresponda; además de factores sociolaborales y los propios por el padecimiento por el COVID-19. Se evidenciaron datos estadísticos descriptivos y analíticos. Los resultados señalan que, de 900 trabajadores encuestados, al realizar el análisis crudo para las patologías de la esfera mental, hubo más estrés postraumático entre los trabajadores que tuvieron grados moderados o severos de depresión (RPc: 5,71; IC95 %: 4,41-7,38; valor p<0,001), ansiedad (RPc: 7,28; IC95 %: 5,13-10,33; valor p<0,001) y estrés (RPa: 5,27; IC95 %: 4,32-6,41; valor p < 0,001). La conclusión señala que se encontró una mayor frecuencia de estrés postraumático entre los trabajadores que tuvieron grados moderados o severos de depresión, y también entre los que tuvieron ansiedad

    Historia, identidad, paisaje, sentimientos y turismo en Tlalpujahua de Rayón

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    El objetivo de este texto es un acercamiento a la valoración sociocultural por parte de los habitantes de Tlalpujahua de su localidad, que reúne descripciones y narraciones de historia y paisaje, tradiciones y costumbres, sentires y emociones, y hasta una propuesta de conservación por medio del turismo. Lo cual se realiza a través de la aplicación de entrevistas a profundidad. Los resultados dibujan el gusto de vivir en el lugar, lo auténtico y lo tranquilo, y el interés de mantener dicho estilo de vida, así como buscar la sobrevivencia con la actividad turística

    D:A4.1 Socio-economic impact assessment

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    The executive summary ends with six concise recommendations for facilitating more accountability for data management in cloud ecosystems: 1. Provide a stronger legal base for and enforcement of data protection and accountable behavior; 2. Facilitate independent auditing of responsible data stewardship; 3. Increase public awareness of the need for accountability; 4. Balance existing information asymmetries via partnerships; 5. Focus on larger enterprises working in the public sector first, as these can serve as an example for other types of businesses; 6. Demonstrate how A4Cloud tools and mechanisms can be turned into a business model in order to encourage greater uptake and use
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