Volatile compounds produced in wine by Colombian wildSaccharomyces cerevisiae strains

Some tropicalSaccharomyces cerevisiae strains, isolated fromChampus, a traditional Colombian low alcoholic fermented beverage, were characterised in order to select yeasts for aroma improvement in wine. H2S production, volatile acidity, β-glucosidase activity, higher alcoholesters and terpenes production were evaluated in this study. These tropical strains were characterised by a considerable production of ethyl hexanoate, 2-phenylethanol, 2-phenylethyl acetate, and geraniol, detected by SPME-GC-MS. Odor activity values were calculated to analyse the effects of yeasts strains on wine aroma, resulting in six distinctive wine groups, as evidenced by discriminant analysis. These results suggest thatSaccharomyces strains isolated fromChampus can be an important source for new tropical yeast biotypes with potential winemaking applications, producing a wide range of aroma compounds

Significado y Utilidad de La Denominación de Origen Protegida–DOP- Para Los Productores de la Loza del Carmen De Viboral

According to the World Intellectual Property Organization (OMPI), a Geographic indication (GI) is a sign used to designate the specific origin of products having qualities or a reputation derived from its place of origin. El Carmen de Viboral is recognized for traditional manufacturing of ceramics, in 2012 they obtained recognition from the Superintendence of Private Origin Denomination for these products, which validates their reputation that it has acquired. The purpose of this article is to recognize the benefits obtained by Ceramic producers of El Carmen de Viboral by having this Certificate. The research has a descriptive framework, the primary sources were the group of people who managed the DPO, surveys were conducted to producers of ceramics of the town, and the results were analyzed and triangulated with information obtained in the theoretical framework. The study shows, how APROZOLA (Asociación de Productores de Loza del Carmen de Viboral), with the support of Colombian Crafts, that helped processed the document which enables the ceramic producers of Carmen de Viboral keep the ancient tradition, gaining recognition in international markets and contribute to the construction of territorial identity on ceramics.    Según la Organización Mundial de la Propiedad Intelectual (OMPI), una indicación geográfica (IG) es un signo utilizado para designar el origen concreto de los productos que tienen unas cualidades o una reputación derivadas, de su lugar de origen. El Carmen de Viboral es reconocida por la fabricación de la loza, en el 2012 obtiene de la Superintendencia la Denominación de Origen Protegida– DOP- para estos productos, lo que lo valida como un producto autóctono y que ha adquirido reputación por su tradición.  El objetivo de este artículo, es conocer los beneficios percibidos por los productores de loza del Carmen de Viboral al contar con este certificado. La investigación es de corte descriptivo, las fuentes primarias fueron el grupo de personas que gestionaron el DOP, se realizaron entrevistas a los productores de cerámicas del municipio, los resultados se analizaron y se triangularon con la información obtenida en el marco teórico.  El estudio, muestra como APROLOZA[1] , con el apoyo de Artesanías de Colombia tramitaron el documento que permite mantener la tradición ancestral, obtener reconocimiento en los mercados internacionales y aportar a la construcción de identidad territorial entorno a la cerámica.[1] APROLOZA: Asociación de Productores de Loza del Carmen de Viboral

Significado y utilidad de la Denominación de Origen Protegida –DOP- para los productores de loza del Carmen de Viboral

Según la Organización Mundial de la Propiedad Intelectual (OMPI), una indicación geográfica (IG) es un signo utilizado para designar el origen concreto de los productos que tienen unas cualidades o una reputación derivadas, de su lugar de origen. El Carmen de Viboral es reconocida por la fabricación de la loza, en el 2012 obtiene de la Superintendencia la Denominación de Origen Protegida– DOP- para estos productos, lo que lo valida como un producto autóctono y que ha adquirido reputación por su tradición. El objetivo de este artículo, es conocer los beneficios percibidos por los productores de loza del Carmen de Viboral al contar con este certificado. La investigación es de corte descriptivo, las fuentes primarias fueron el grupo de personas que gestionaron el DOP, se realizaron entrevistas a los productores de cerámicas del municipio, los resultados se analizaron y se triangularon con la información obtenida en el marco teórico. El estudio, muestra como APROLOZA[1] , con el apoyo de Artesanías de Colombia tramitaron el documento que permite mantener la tradición ancestral, obtener reconocimiento en los mercados internacionales y aportar a la construcción de identidad territorial entorno a la cerámic

The FANCM:p.Arg658* truncating variant is associated with risk of triple-negative breast cancer

Breast cancer is a common disease partially caused by genetic risk factors. Germline pathogenic variants in DNA repair genes BRCA1, BRCA2, PALB2, ATM, and CHEK2 are associated with breast cancer risk. FANCM, which encodes for a DNA translocase, has been proposed as a breast cancer predisposition gene, with greater effects for the ER-negative and triple-negative breast cancer (TNBC) subtypes. We tested the three recurrent protein-truncating variants FANCM:p.Arg658*, p.Gln1701*, and p.Arg1931* for association with breast cancer risk in 67,112 cases, 53,766 controls, and 26,662 carriers of pathogenic variants of BRCA1 or BRCA2. These three variants were also studied functionally by measuring survival and chromosome fragility in FANCM (-/-) patient-derived immortalized fibroblasts treated with diepoxybutane or olaparib. We observed that FANCM:p.Arg658* was associated with increased risk of ER-negative disease and TNBC (OR = 2.44, P = 0.034 and OR = 3.79; P = 0.009, respectively). In a country-restricted analysis, we confirmed the associations detected for FANCM:p.Arg658* and found that also FANCM:p.Arg1931* was associated with ER-negative breast cancer risk (OR = 1.96; P = 0.006). The functional results indicated that all three variants were deleterious affecting cell survival and chromosome stability with FANCM:p.Arg658* causing more severe phenotypes. In conclusion, we confirmed that the two rare FANCM deleterious variants p.Arg658* and p.Arg1931* are risk factors for ER-negative and TNBC subtypes. Overall our data suggest that the effect of truncating variants on breast cancer risk may depend on their position in the gene. Cell sensitivity to olaparib exposure, identifies a possible therapeutic option to treat FANCM-associated tumors

Estandarización de un protocolo sencillo para la extracción de ADN genómico de levaduras

Standardising a simple protocol for extracting yeast from genomic DNA   Resumen: Se estandarizó un protocolo rápido, sencillo y de bajo costo para la extracción de ADN genómico de levaduras a partir de lisis de la pared celular mediante tratamiento enzimático y precipitación por alcoholes. El empleo de la enzima Beta-glucoronidasa en reemplazo de la enzima Zimolasa, permitió obtener ADN en alta concentración (124,9±30,2 ng/μl) y de buena calidad (A260/A280 nm =1,86±0,1), ideal para su uso en estudios de biología molecular. Además, se adicionó un paso de incubación del ADN obtenido a 100° C para inactivar ADNasas. La calidad del ADN obtenido fue evaluada por medio de la amplificación de la región ITS1-5.8S-ITS2, presentando bandas definidas y cuantificables (entre 380 y 880 pb) ideales para estudios de identificación molecular y filogenia. Palabras clave: levadura; extracción de ADN; Beta-Glucoronidasa.   Abstract: A quick, simple and low-cost protocol for extracting genomic DNA from yeast by cell wall lysis involving enzymatic treatment and alcoholic precipitation was standardised. Higher DNA yields (124.9±30.2 ng/μl) were obtained by using beta-glucuronidase instead of zymolyase; these had very high quality (A260/A280 nm = 1.86±0.1) and would be suitable for use in molecular biology assays. Moreover, a DNAse inactivation step was also introduced by incubation at 100 °C to further ensure DNA stability. DNA quality was assayed by PCR amplification of the ITS1-5.8S-ITS2 region, revealing defined, quantifiable 380 to 880 bp bands. These results show that the protocol is ideal for molecular identification and phylogenetic studies. Key words: Yeast; DNA extraction; beta-glucoronidase

Microbiological characteristics of Kumis, a traditional fermented Colombian milk, with particular emphasis on enterococci population

Kumis is a traditional fermented cow milk produced and consumed in South West Colombia. The mainobjective of this research was to studied the enterococcal population, present in 13 kumis samplestraditionally manufactured, for their role as beneficial organisms or opportunistic pathogens. Themolecular identification of 72 isolates evidenced that Enterococcus faecalis and E. faecium were thedominant species. The genes gelE, esp, asa1, cyl and hyl, all associated with virulence factors in enterococci,were detected in 30 isolates, while 42 were free of virulence determinants. Skim milk media werefermented by all the different isolates and further tested for proteolysis (free NH3 groups), Angiotensin-IConverting Enzyme (ACE) inhibitory activity and biogenic amines production. Nine E. faecalis and twoE. faecium strains produced fermented milk with ACE-inhibitory activity values ranging from 39.7% to84.35% .The digestion of fermented milk samples by pepsin and pancreatin evidenced an increase in ACEinhibitory activity, with E. faecalis KE09 as the best producer (IC50 ¼ 14.25 mg ml1). Moreover, thestrains showed a very low tyrosine decarboxylase activity and did not produce histamine during 48 hfermentation in milk. This study underlines the that Colombian kumis is a good source of not virulententerococci able to produce fermented milks with ACE-inhibitory activity.[...

Diversidad de levaduras asociadas a chichas tradicionales de Colombia

Knowledge about yeast communities in Colombia has been limited because most reports have focused on clinically-relevant yeast species . The spontaneous fermentation of different substrates creates important habitats for analysing wild yeast populations; this study thus involved isolating and identifying yeasts associated with the corn, pineapple and arracacha (Peruvian carrot) �chichas� (traditional fermented Colombian alcoholic drink usually made from fermented maize). The most representative yeasts were isolated from �chicha� during its three fermentation phases: initial, tumultuous and final. Isolated yeasts were partially characterised; this included macroscopic and microscopic descriptions, physiological tests and measuring spore- and filament-producing capacity. However, because these techniques proved insufficient for identifying isolated yeasts at genus and species level the study was complemented by using molecular techniques based on restriction analysis of the ITS1-5.8S rRNA gene- ITS2. When this technique did not lead to positive results being obtained and PCR-RFLP results confirmed, then the 26S rRNA gene D1/D2 domain sequence was used instead for most representative isolates. These techniques led to identifying the most representative yeast species from the three types of �chicha�: Candida tropicalis, Pichia kluyveri, Pichia guilliermondii, Hanseniapora guilliermondii, Pichia fermentans, Saccharomyces cerevisiae, Candida maltosa, Rhodotorula glutinis, Torulaspora delbrueckii, Hanseniaspora uvarum, Kazachstania exigua, Kluyveromyces marxianus, Yarrowia lypolitica, Candida parapsilosis, Debaromyces hansenii, Cryptococcus arboriformis, Saccharomyces martiniae, Dekkera anomala, Aureobasidium pullulans and Candida pseudointermedia. The preliminary characterisation of isolated yeasts, based on ethanol-tolerance and salt-tolerance tests, led to recognising wild yeasts having potential biotechnological use in industry.En Colombia el conocimiento de la comunidad levaduriforme ha sido limitado, ya que los estudios se han enfocado principalmente en especies de interés clínico. Las fermentaciones espontáneas a partir de diversos sustratos representan hábitats de gran importancia para el estudio de la dinámica de las poblaciones de levaduras nativas, por esta razón, en el presente estudio se aislaron e identificaron las levaduras asociadas a las chichas de maíz, piña y arracacha, que son bebidas fermentadas de manera artesanal en Colombia. Se realizó el aislamiento de las levaduras más representativas de la chicha durante sus tres fases de fermentación: inicial, tumultuosa y final. Inicialmente, se hizo una caracterización parcial de los aislados, que incluyó pruebas fisiológicas, y medición de su capacidad para producir filamentos y esporas. Sin embargo, debido a que estas técnicas no fueron suficientes para identificar los aislados hasta el nivel taxonómico de género o de especie, se complementó el estudio de cada aislado empleando técnicas moleculares basadas en el análisis de restricción del gen rRNA 5.8S y los espaciadores transcritos internos (ITS1 e ITS2). Cuando el empleo de esta técnica no permitió obtener resultados definitivos y para confirmar las asignaciones realizadas usando PCR-RFLPs, se secuenció el dominio D1/D2 del gen 26S rRNA de los aislados más representativos. Mediante estas técnicas se lograron identificar las especies más representativas de los tres tipos de chicha: Candida tropicalis, Pichia kluyveri, Pichia guilliermondii, Hanseniapora guilliermondii, Pichia fermentans, Saccharomyces cerevisiae, Candida maltosa, Rhodotorula glutinis, Torulaspora delbrueckii, Hanseniaspora uvarum, Kazachstania exigua, Kluyveromyces marxianus, Yarrowia lypolitica, Candida parapsilosis, Debaromyces hansenii, Cryptococcus arboriformis, Saccharomyces martiniae, Dekkera anomala, Aureobasidium pullulans y Candida pseudointermedia. La caracterización preliminar de los aislados obtenidos, basada en pruebas de tolerancia a etanol y halo-tolerancia, permitió identificar levaduras nativas con posible utilización biotecnológica en el sector industrial

Operations research applications in health systems in Colombia

Sin duda, ver los sistemas de salud desde la perspectiva de la investigación de operaciones impone nuevos retos que no son insalvables. Hay en los sistemas de salud desafíos y dilemas a los que quizás antes no nos veíamos enfrentados al trabajar en otras industrias o servicios. Desde dilemas éticos, causados por la naturaleza del servicio de salud como un derecho fundamental, bien sea porque en las decisiones que se modelan muchas veces están involucradas las vidas y el bienestar de los pacientes, o porque los objetivos de los sistemas de salud van más allá de la rentabilidad o la disminución de costos a los que estamos comúnmente acostumbrados (v. g., mejorar la cobertura o lograr equidad). Por otro lado, entender los sistemas de salud y las decisiones que en ellos se toman (para el tratamiento de los pacientes, para la planeación de las operaciones de los servicios o para la definición de políticas públicas) exige apropiarse de conocimientos que son ajenos a la formación tradicional en investigación de operaciones. Por fortuna, esto último exige la conformación de equipos multidisciplinarios, con personal asistencial (médicos, enfermeras, instrumentadores, terapeutas, etc.), con epidemiólogos, con funcionarios del Estado, con expertos en sistemas de información, calidad y acreditación en salud, entre otros. En estos equipos es también importante la investigación de operaciones, pues los complementa aportando una visión cuantitativa, analítica e ingenieril que algunas veces no tienen.Certainly, viewing health systems from the perspective of operations research poses new challenges that are not insurmountable. There are challenges and dilemmas in health systems that we may not have faced before when working in other industries or services. From ethical dilemmas, caused by the nature of the health service as a fundamental right, either because the decisions that are modeled often involve the lives and well-being of patients, or because the objectives of the health systems are more beyond the profitability or cost reduction that we are commonly used to (eg, improving coverage or achieving equity). On the other hand, understanding the health systems and the decisions made in them (for the treatment of patients, for the planning of the operations of the services or for the definition of public policies) requires the appropriation of knowledge that is foreign to traditional training in operations research. Fortunately, the latter requires the formation of multidisciplinary teams, with healthcare personnel (doctors, nurses, instructors, therapists, etc.), with epidemiologists, with State officials, with experts in information systems, quality and health accreditation, among others. Operations research is also important in these teams, as it complements them by providing a quantitative, analytical and engineering vision that sometimes they do not have.Bogot