Glycogenome expression dynamics during mouse C2C12 myoblast differentiation suggests a sequential reorganization of membrane glycoconjugates

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Several global transcriptomic and proteomic approaches have been applied in order to obtain new molecular insights on skeletal myogenesis, but none has generated any specific data on glycogenome expression, and thus on the role of glycan structures in this process, despite the involvement of glycoconjugates in various biological events including differentiation and development. In the present study, a quantitative real-time RT-PCR technology was used to profile the dynamic expression of 375 glycogenes during the differentiation of C2C12 myoblasts into myotubes.</p> <p>Results</p> <p>Of the 276 genes expressed, 95 exhibited altered mRNA expression when C2C12 cells differentiated and 37 displayed more than 4-fold up- or down-regulations. Principal Component Analysis and Hierarchical Component Analysis of the expression dynamics identified three groups of coordinately and sequentially regulated genes. The first group included 12 down-regulated genes, the second group four genes with an expression peak at 24 h of differentiation, and the last 21 up-regulated genes. These genes mainly encode cell adhesion molecules and key enzymes involved in the biosynthesis of glycosaminoglycans and glycolipids (neolactoseries, lactoseries and ganglioseries), providing a clearer indication of how the plasma membrane and extracellular matrix may be modified prior to cell fusion. In particular, an increase in the quantity of ganglioside G_M3at the cell surface of myoblasts is suggestive of its potential role during the initial steps of myogenic differentiation.</p> <p>Conclusion</p> <p>For the first time, these results provide a broad description of the expression dynamics of glycogenes during C2C12 differentiation. Among the 37 highly deregulated glycogenes, 29 had never been associated with myogenesis. Their biological functions suggest new roles for glycans in skeletal myogenesis.</p

Epidemiology and economic impact of bovine cysticercosis and taeniosis caused by Taenia saginata in northeastern Spain (Catalonia)

Background: In Catalonia (north-eastern Spain), Taenia saginata has been described in cattle but its occurrence in humans is unclear. Moreover, whether cattle acquired the infection in Catalonia or outside Catalonia and its economic impact have not been investigated. This study aimed to estimate the prevalence and spatial distribution of bovine cysticercosis in Catalonia (2008–2015), and the burden from T. saginata upon the animal and human sectors in Catalonia (2013–2015). Methods: Data on cattle diagnosed with cysticercosis at meat inspection were collected and analysed. Cattle movement history was used to identify the most likely place of bovine cysticercosis infection and to investigate its spatial distribution. Data on taeniosis treatment (niclosamide and praziquantel) costs and their supply in Catalonia as well as data on patients attending primary care with diagnosis of taeniosis were collected. The financial impact associated with T. saginata due to carcasses condemned and frozen, meat inspection and human taeniosis was estimated. Results: During 2008–2015, between 18 and 107 cattle were found positive for cysticercosis each year (prevalence at slaughter of 0.010%). Movement history was available for 44% of the infected cattle and in 53% of them Catalonia was identified as the place where the infection was acquired with highest probability. Two significant bovine cysticercosis clusters were detected. The number of patients diagnosed with taeniosis in primary care during the period 2013–2016 was 41–63/year. The overall economic impact of T. saginata (2013–2015) amounted to 154,903 €/year (95% CI: 113,075–196,762). Meat inspection accounted for 81.9% (95% CI: 75.8–86.2%) of the costs, followed by costs due to carcass condemnation and freezing (9.4%; 95% CI: 6.9–12.8%), and taeniosis-associated costs (8.7%; 95% CI: 6.7–11.6%). Costs due to freezing and condemnation of carcasses reached 19,442 €/year (95% CI: 17,528–21,391) (509 €/lightly infected carcass and 1,140 €/heavily infected carcass). Taeniosis-associated costs were estimated at 12,848.5 €/year (237 €/patient). Conclusions: The public health risk of T. saginata in the area seems to be low. The economic impact due to T. saginata was mainly attributed to meat inspection. The cost due to carcass condemnation and freezing was limited compared to the revenue of the beef sector. Developing and implementing risk-based surveillance is needed to lower the costs of meat inspection. Considering cattle movements might be useful in the development of such a strategy

A bloodâ based nutritional risk index explains cognitive enhancement and decline in the multidomain Alzheimer prevention trial

IntroductionMultinutrient approaches may produce more robust effects on brain health through interactive qualities. We hypothesized that a bloodâ based nutritional risk index (NRI) including three biomarkers of diet quality can explain cognitive trajectories in the multidomain Alzheimer prevention trial (MAPT) over 3â years.MethodsThe NRI included erythrocyte nâ 3 polyunsaturated fatty acids (nâ 3 PUFA 22:6nâ 3 and 20:5nâ 3), serum 25â hydroxyvitamin D, and plasma homocysteine. The NRI scores reflect the number of nutritional risk factors (0â 3). The primary outcome in MAPT was a cognitive composite Z score within each participant that was fit with linear mixedâ effects models.ResultsEighty percent had at lease one nutritional risk factor for cognitive decline (NRI â ¥1: 573 of 712). Participants presenting without nutritional risk factors (NRI=0) exhibited cognitive enhancement (β = 0.03 standard units [SU]/y), whereas each NRI point increase corresponded to an incremental acceleration in rates of cognitive decline (NRIâ 1: β = â 0.04 SU/y, P = .03; NRIâ 2: β = â 0.08 SU/y, P < .0001; and NRIâ 3: β = â 0.11 SU/y, P = .0008).DiscussionIdentifying and addressing these wellâ established nutritional risk factors may reduce ageâ related cognitive decline in older adults; an observation that warrants further study.Highlightsâ ¢Multiâ nutrient approaches may produce more robust effects through interactive propertiesâ ¢Nutritional risk index can objectively quantify nutritionâ related cognitive changesâ ¢Optimum nutritional status associated with cognitive enhancement over 3â yearsâ ¢Suboptimum nutritional status associated with cognitive decline over 3â yearsâ ¢Optimizing this nutritional risk index may promote cognitive health in older adultsPeer Reviewedhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/152935/1/trc2jtrci201911004.pd

Projet Seine-Aval 6 PHARESEE « Productivité microphytobenthique des HAbitats intertidaux en lien avec la dynamique sédimentaire, biogéochimique et les ingénieurs d'écosystème de la faune benthique : implication pour des enjeux de modélisation et de REhabilitation des vasières de la SEine Estuarienne »

L'estuaire de la Seine est soumis à divers stress anthropiques et hydro-climatiques. Cet écosystème côtier perd son caractère estuarien à cause d'aménagements qui ont eu comme conséquence de voir disparaître de vastes surfaces de vasières intertidales. Ces habitats fonctionnels jouent un rôle majeur dans le fonctionnement écologique des estuaires, car ils abritent des communautés méio- et macro-benthiques très diversifiées et représentent la principale zone d’alimentation de nombreux vertébrés dont certains d’intérêt écologique ou commercial majeur (e.g. poissons, oiseaux). La dynamique des vasières intertidales est fortement influencée par les processus hydro-sédimentaires estuariens, étant tantôt source, tantôt puits de sédiment. Elles constituent ainsi un élément essentiel des cycles biogéochimiques se déroulant au sein des estuaires. Les caractéristiques morphologiques et biogéochimiques de ces zones vont directement influencer les échanges de matière et d’énergie qui s’y déroulent. Il est donc impératif d'avoir une approche pluridisciplinaire pour comprendre leur fonctionnement. Le projet PHARE-SEE avait pour objectif (i) de mieux comprendre le rôle des bioturbateurs et leur effet sur le microphytobenthos, les paramètres hydrosédimentaires et biogéochimiques dans les vasières de l’estuaire de Seine et (ii) de développer un modèle de production primaire microphytobenthique couplant l’ensemble des paramètres susmentionnés. Le premier objectif du projet a été réalisé en couplant expériences sur le terrain et en laboratoire. Ainsi, des expériences d’exclusion/ensemencement de faune ont été menées sur la vasière Nord, à l’aval de l’estuaire de Seine, et sur 2 faciès sédimentaires contrastés, avec un suivi de la dynamique saisonnière du microphytobenthos et de l’ensemble des paramètres biogéochimiques et hydrosédimentaires. De plus, des expériences en laboratoire ont été réalisées, avec une évaluation des flux diffusifs de nutriments à 2 saisons contrastées (hiver/été) en fonction du mélange sablo-vaseux et de l’intensité de la bioturbation par la macrofaune benthique dominante de la vasière (le ver Hediste diversicolor et le bivalve Scrobicularia plana). Les expériences de terrain ont montré que l’effet saisonnier était plus prononcé que celui des bioturbateurs sur l’ensemble des paramètres biogéochimiques dans le sédiment (matière organique sédimentaire, processus et biomasse microbiens). Contrairement à la matière organique sédimentaire, principalement d’origine terrigène, la matière organique dissoute présente dans les eaux interstitielles, majoritairement d’origine autochtone, est réactive et influencée par l’activité des bioturbateurs. Ces derniers ont une influence prononcée sur l’érodabilité, avec un rôle biostabilisateur efficace pour Hediste diversicolor en été comme en hiver et un rôle déstabilisateur pour Scrobicularia plana exclusivement en été. Malgré des processus de consommations primaires très élevés et des pertes par érosion, le niveau de production primaire microphytobenthique reste par ailleurs très important sur la vasière. Les analyses réalisées ont également révélé le rôle majeur du microphytobenthos dans le réseau trophique pour H. diversicolor, S. plana et la méiofaune (analyses isotopes stables, collaboration projet SA6 SENTINELLES). Les expériences en mésocosme, complémentaires de celles réalisées sur le terrain, ont montré que l’activité de bioturbation des deux ingénieurs d’écosystème diffère quelle que soit la saison. Ainsi, le processus de transport d’eau et des composés dissous (bioirrigation) domine chez H. diversicolor, alors que l’activité de S. plana est dominée par le remaniement sédimentaire. Les flux biogéochimiques à l’interface eau-sédiment sont principalement influencés par la bioirrigation. Enfin, il a été observé que S. plana consomme très activement les biofilms microphytobenthiques et limite fortement leur capacité de développement, alors que la biomasse microphytobenthique n’est pas affectée par les activités de Hediste. Cela démontre que la consommation herbivore est totalement compensée par des effets positifs liés probablement à la bioirrigation, activée de manière générale plus de 40 fois par Hediste. Dans un second temps, ce projet proposait de modéliser la production primaire microphytobenthique en relation avec la dynamique sédimentaire et les processus biogéochimiques. Les données acquises via expériences en laboratoire et sur le terrain ont servi à développer ce modèle. Ainsi, le modèle MARS3D en version Cross-shore 2DV a été implémenté sur la vasière intertidale étudiée avec une très bonne qualité des simulations des processus hydrosédimentaires et des variations altimétriques. L’intégration de l’effet de la bioturbation et de la régulation de l’érodabilité des sédiments a permis d’améliorer encore la qualité des simulations. Un modèle de diffusion thermique a été intégré, testé et amélioré en termes d’interaction avec la composition sédimentaire. Le modèle biogéochimique BLOOM a été intégré également dans le modèle MARS3D avec une dynamique biogéochimique saisonnière bien représentée. Le modèle prend en compte le rôle des bioturbateurs sur les flux diffusifs, mais une perspective d’amélioration doit être envisagée pour mieux reproduire les flux à l’interface eau-sédiment et l’assimilation du NH4 + par le microphytobenthos en surface. Enfin, le modèle de la production primaire microphytobenthique a été implémenté dans le code MARS3D et fournit des simulations de la dynamique spatio-temporelle des biomasses microphytobenthiques intéressantes, même si les flux sont encore sous-estimés dans le modèle et les interactions avec la faune doivent encore être améliorées. Au final, les très nombreuses données issues du projet PHARESEE et le modèle associé serviront à comprendre et relier les nombreux facteurs influençant le fonctionnement des vasières et leurs rôles écosystémiques essentiels – rôle physique, de régulation sur les cycles biogéochimiques et rôle de productivité biologique et soutien au réseau trophique. Des travaux de synthèse ont été engagés en particulier pour tenter d’expliquer le haut niveau de productivité actuel du système en lien avec la bonne santé des espèces sentinelles (ingénieurs d’écosystèmes) de la macrofaune benthique

Socio-demographic and lifestyle factors associated with overweight in a representative sample of 11-15 year olds in France: Results from the WHO-Collaborative Health Behaviour in School-aged Children (HBSC) cross-sectional study

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The prevalence of overweight in children and adolescents is high and overweight is associated with poor health outcomes over short- and long-term. Lifestyle factors can interact to influence overweight. Comprehensive studies linking overweight concomitantly with several demographic and potentially-modifiable lifestyle factors and health-risk behaviours are limited in adolescents - an age-group characterized by changes in lifestyle behaviours and high prevalence of overweight. Thus, the objective of the current study was to examine the association of overweight with several socio-demographic and lifestyle variables simultaneously in a representative sample of adolescents.</p> <p>Methods</p> <p>A nationally representative sample of 11-15 year-olds (n = 7154) in France participated as part of the WHO-Collaborative Health Behaviour in School-aged Children (HBSC) study. Students reported data on their age, height, weight, socio-demographic variables, lifestyle factors including nutrition practices, physical activity at two levels of intensity (moderate and vigorous), sedentary behaviours, as well as smoking and alcohol consumption patterns using standardized HBSC protocols. Overweight (including obesity) was defined using the IOTF reference. The multivariate association of overweight with several socio-demographic and lifestyle factors was examined with logistic regression models.</p> <p>Results</p> <p>The adjusted odds ratios for the association with overweight were: 1.80 (95% CI: 1.37-2.36) for low family affluence; 0.73 (0.60-0.88) for eating breakfast daily; 0.69 (0.56-0.84) for moderate to vigorous physical activity (MVPA); and 0.71 (0.59-0.86) for vigorous physical activity (VPA). Significant interactions between age and gender as well as television (TV) viewing and gender were noted: for boys, overweight was not associated with age or TV viewing; in contrast, for girls overweight correlated negatively with age and positively with TV viewing. Fruit and vegetable intake, computer and video-games use, smoking and alcohol consumption were not associated with overweight.</p> <p>Conclusions</p> <p>In multivariate model, family affluence, breakfast consumption and moderate to vigorous as well as vigorous physical activity were negatively associated with overweight. These findings extend previous research to a setting where multiple risk and protective factors were simultaneously examined and highlight the importance of multi-faceted approaches promoting physical activity and healthy food choices such as breakfast consumption for overweight prevention in adolescents.</p

CITY AUTOMATED TRANSPORT SYSTEM (CATS): THE LEGACY OF AN INNOVATIVE EUROPEAN PROJECT

CATS is a collaborative European project promoting driverless vehicles that ended in December 2014. This contribution explains how the project evolved, including the handling of unexpected events and concentrating on lessons learned. The constructor and vehicle had to be changed for economic reasons in the middle of the project timeline. A second constructor went bankrupt, although access to his vehicles could be secured. For security and legal reasons, part of the final demonstration was relocated at short notice to the EPFL campus in Lausanne, Switzerland, where around 1600 people were transported during 16 days of vehicle operation. Reactions to the driverless vehicle concept were overwhelmingly positive. Implications for the acceptability of driverless vehicles in Europe and elsewhere are discussed

Analyse et modélisation des données d’inspection en abattoir dans l’objectif de contribuer à la surveillance épidémiologique de la population bovine

The slaughterhouse is a unique dedicated vantage point from which to observe bovine health, making it possible to consider implementation of bovine surveillance based on meat inspection data. But the exploitation of these data for epidemiological purposes is not without difficulties (data complexity, large number of cattle movements from birth to slaughter). In order to deal with the data complexity issue, a statistical approach (multiple factor analysis in combination with clustering methods), in addition to the gathering of expert opinions, enables us to create a typology of the lesions detected at the slaughterhouse. Approximately ten lesion groups were identified which cover various areas including animal heath, animal welfare and public health. Meat inspection data can be used for the surveillance of targeted diseases such as bovine cysticercosis. Robust surveillance indicators have been created to enable prevalence comparisons of this zoonosis over time and space. An innovative approach that takes into account uncertainty regarding the location where the animal became infected was implemented to identify areas of higher risk of infection. A similar method could be used for the implementation of a future risk-based meat inspection initiative so as to improve meat inspection efficiency. The use of meat inspection data for the implementation of a syndromic surveillance system was investigated using a temporal analysis of the weekly proportion of whole carcass condemnations, and assessment of the performance of several algorithms for temporal aberration detection was conducted on simulated dataL'abattoir est un observatoire privilégié de la santé des bovins, permettant d'envisager une surveillance de la population bovine à partir des données d'inspection sanitaire qui y sont collectées. Mais la valorisation épidémiologique de ces données fait face à des difficultés (complexité des données, nombreux mouvements des bovins de leur naissance à l'abattoir). Afin de gérer cette complexité, une approche statistique (analyse multifactorielle et classification mixte) associée à des avis d'experts ont permis d'établir une typologie des lésions observées à l'abattoir. Une dizaine de groupes lésionnels ont été identifiés qui relèvent de divers domaines tels que la santé animale, la protection animale ou la santé publique. Les données d'abattoir peuvent être utilisées pour la surveillance de maladies ciblées telles que la cysticercose bovine. Des indicateurs de surveillance robustes ont été élaborés pour permettre la comparaison des prévalences de cette zoonose dans le temps et l'espace. Une méthode innovante de prise en compte de l'incertitude liée au lieu d'infestation des animaux a été mise en oeuvre pour identifier les zones à risque plus élevé d'infestation. Un tel outil sera mobilisable pour la mise en oeuvre ultérieure d'une inspection basée sur le risque visant à améliorer l'efficience de l'inspection en abattoir. L'utilisation des données d'abattoir pour la mise en place d'un dispositif de surveillance syndromique a par ailleurs été investiguée par modélisation de la proportion hebdomadaire de bovins ayant fait l'objet d'une saisie totale. Une évaluation des performances de plusieurs algorithmes de détection d'anomalies temporelles a été menée sur données simulée

Analysis and modeling of meat inspection data to contribute to surveillance of the cattle population

L'abattoir est un observatoire privilégié de la santé des bovins, permettant d'envisager une surveillance de la population bovine à partir des données d'inspection sanitaire qui y sont collectées. Mais la valorisation épidémiologique de ces données fait face à des difficultés (complexité des données, nombreux mouvements des bovins de leur naissance à l'abattoir). Afin de gérer cette complexité, une approche statistique (analyse multifactorielle et classification mixte) associée à des avis d'experts ont permis d'établir une typologie des lésions observées à l'abattoir. Une dizaine de groupes lésionnels ont été identifiés qui relèvent de divers domaines tels que la santé animale, la protection animale ou la santé publique. Les données d'abattoir peuvent être utilisées pour la surveillance de maladies ciblées telles que la cysticercose bovine. Des indicateurs de surveillance robustes ont été élaborés pour permettre la comparaison des prévalences de cette zoonose dans le temps et l'espace. Une méthode innovante de prise en compte de l'incertitude liée au lieu d'infestation des animaux a été mise en oeuvre pour identifier les zones à risque plus élevé d'infestation. Un tel outil sera mobilisable pour la mise en oeuvre ultérieure d'une inspection basée sur le risque visant à améliorer l'efficience de l'inspection en abattoir. L'utilisation des données d'abattoir pour la mise en place d'un dispositif de surveillance syndromique a par ailleurs été investiguée par modélisation de la proportion hebdomadaire de bovins ayant fait l'objet d'une saisie totale. Une évaluation des performances de plusieurs algorithmes de détection d'anomalies temporelles a été menée sur données simuléesThe slaughterhouse is a unique dedicated vantage point from which to observe bovine health, making it possible to consider implementation of bovine surveillance based on meat inspection data. But the exploitation of these data for epidemiological purposes is not without difficulties (data complexity, large number of cattle movements from birth to slaughter). In order to deal with the data complexity issue, a statistical approach (multiple factor analysis in combination with clustering methods), in addition to the gathering of expert opinions, enables us to create a typology of the lesions detected at the slaughterhouse. Approximately ten lesion groups were identified which cover various areas including animal heath, animal welfare and public health. Meat inspection data can be used for the surveillance of targeted diseases such as bovine cysticercosis. Robust surveillance indicators have been created to enable prevalence comparisons of this zoonosis over time and space. An innovative approach that takes into account uncertainty regarding the location where the animal became infected was implemented to identify areas of higher risk of infection. A similar method could be used for the implementation of a future risk-based meat inspection initiative so as to improve meat inspection efficiency. The use of meat inspection data for the implementation of a syndromic surveillance system was investigated using a temporal analysis of the weekly proportion of whole carcass condemnations, and assessment of the performance of several algorithms for temporal aberration detection was conducted on simulated dat

Les plateformes d’épidémiosurveillance : un concept novateur au service de l’efficience des dispositifs de surveillance

Created in 2011, the animal health epidemiological surveillance platform (ESA) aims at improving surveillance systems efficiency through technical and scientific support. The platform organization is an innovative concept because it is based on i) a partnership between private and public sector ii) the faith between all stakeholders and iii) a decision process through a consensus approach. This concept has proven its relevancy and efficiency. It encouraged the creation, in 2018, of two new epidemiological surveillance platforms, one for plant heath surveillance and the other one for food chain surveillance. All three platforms share the same objective, optimization of surveillance, with the same working principles.Créée en 2011, la Plateforme d’épidémiosurveillance en santé animale (ESA) a pour objectif d’apporter un appui scientifique et technique pour améliorer l’efficience des dispositifs de surveillance. Avec une gouvernance associant des acteurs publics et privés ainsi qu’une méthode de travail basée sur le consensus et la confiance entre les acteurs, la Plateforme ESA est un concept novateur qui a su démontrer sa pertinence et son efficacité. Elle a ouvert la voie, en 2018, à la création des Plateformes d’épidémiosurveillance en santé végétale et de surveillance de la chaîne alimentaire. Les trois plateformes partagent l’objectif d’optimisation de la surveillance et les méthodes de travail reposent sur les mêmes principes.Amar Hélène, Dupuy Céline. Les plateformes d’épidémiosurveillance : un concept novateur au service de l’efficience des dispositifs de surveillance. In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 173, 2020. pp. 200-205