Zap1 is required for Candida glabrata response to fluconazole

Invasive fungal infections are a major healthcare problem. In these diseases, the fungus enters the bloodstream and can affect any organ, causing serious hard-to-treat infections that are associated with high mortality rates. The first line of treatment for many invasive fungal infections is fluconazole, the most prescribed antifungal drug in the world. However, the fungistatic, rather than fungicidal, nature of this drug has fostered the emergence of resistant clinical isolates. To overcome this problem, great efforts have been made to fully understand the fungal response to fluconazole. In this work, we show that in Candida glabrata, one of the most prevalent fungal species causing nosocomial invasive infections, the transcription factor Zap1 is important for yeast growth under zinc-limited conditions. We also demonstrate that Zap1 down-regulates biofilm formation. Moreover, in line with our group’s previous work, showing that deletion of ZAP1 renders cells more sensitive to fluconazole, we found that the mutant CgΔzap1 accumulates higher levels of fluconazole, which correlates well with its lower levels of ergosterol. Surprisingly, we observed that Zap1 is a negative regulator of the drug efflux transporter gene CDR1 and of its regulator, PDR1. The apparent paradox of drug accumulation in cells where genes encoding transporters relevant for drug extrusion are being overexpressed, led us to test if their activity could be impaired. Our results indicate that Zap1-depleted cells present, in addition to decreased ergosterol levels, altered composition of membrane phospholipids, which together should impact membrane function and therefore prevent fluconazole detoxification. Overall, this study brings to light the multifaceted transcription factor Zap1 as an important hub in Candida glabrata response to zinc deficiency, biofilm formation and fluconazole detoxification.As infeções fúngicas invasivas são um problema de saúde preocupante, principalmente no meio hospitalar. Nestas doenças infeciosas, o fungo entra na corrente sanguínea e pode afetar qualquer órgão. Sendo infeções graves e de difícil tratamento que estão geralmente associadas a elevadas taxas de mortalidade. O tratamento de primeira linha para as infeções fúngicas invasivas é o fluconazol, um dos antifúngico mais prescrito mundialmente. No entanto, a sua natureza fungistática, em vez de fungicida, tem favorecido o aparecimento de isolados clínicos resistentes. De forma a superar este problema, têm sido envidados grandes esforços para compreender a resposta dos fungos ao fluconazol. Neste trabalho mostramos que, em Candida glabrata, uma das espécies fúngicas mais prevalentes em infeções invasivas nosocomiais, o fator de transcrição Zap1 é necessário para o seu crescimento em condições de deficiência de zinco. Demonstramos também que Zap1 é um regulador negativo da formação de biofilmes. Corroborando trabalhos anteriores do nosso grupo, onde se observou que a deleção de ZAP1 torna as células mais sensíveis ao fluconazol, verificámos ainda que o mutante CgΔzap1 acumula mais fluconazol e apresenta níveis menores de ergosterol. Surpreendentemente, observámos que Zap1 é um regulador negativo do transportador de efluxo de drogas CDR1 e do seu regulador, PDR1. O aparente paradoxo da acumulação da droga em células onde transportadores relevantes para a sua extrusão estão a ser sobrexpressos, levou-nos a considerar que a atividade destes poderia estar afectada. Corroborando esta hipótese, constatámos que células sem Zap1 apresentam, além da diminuição dos níveis de ergosterol, uma composição de fosfolipídios membranares alterada que, em conjunto, poderão afetar a função da membrana prejudicando a desintoxicação de fluconazol. Em suma, provamos que, em Candida glabrata, o fator de transcrição Zap1 é um regulador multifacetado, cuja função engloba a adaptação à deficiência de zinco, formação de biofilmes e desintoxicação de fluconazol

IFRS - a pathway to financial development: assessing the effects of international financial reporting standards adoption on financial development

IFRS has brought better quality and more transparent financial reports for companies, which can ultimately benefit investors and the financial system as a whole. The goal of this paper is therefore to assess the contribution of the adoption of IFRS in the financial development of a country. Moreover, an in-depth examination of the origin of such effect will be conducted. It was used panel data models with fixed effects based on 34 countries and 22 years. Overall, it was found that IFRS contributes positively to financial development, with the relation deriving from improvements in financial institutions

Health inequalities in cerebro and cardiovascular health : an analysis of the e_COR study

Trabalho de Projeto de Mestrado, Bioestatística , 2022, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasSegundo a Organização Mundial de Saúde (OMS), desigualdades em saúde são diferenças sistemáticas no estado de saúde de diferentes grupos populacionais com custos significativos sociais e económicos para os indivíduos e sociedades. Estas diferenças são injustas e podem ser atenuadas através da ação de políticas governamentais, pelo que é necessário compreender qual o seu impacto. As doenças cardiovasculares (DCV) são um conjunto de doenças que afeta o cérebro, coração e vasos sanguíneos, incluindo doença coronária, doença cérebro-cardiovascular, doença cardíaca reumática, entre outras. Mais do que quatro em cada cinco mortes causadas por DCV são devido a ataques cardíacos e acidentes vasculares cerebrais (AVC), sendo que um terço destas mortes ocorre prematuramente em pessoas com menos de 70 anos (OMS). Os eventos de interesse considerados neste estudo foram os seguintes: AVC, enfarte agudo do miocárdio e doença arterial periférica. Em Portugal em 2019, os AVCs foram a principal causa de morte, representando 9.8% da mortalidade total, segundo o Instituto Nacional de Estatística (INE). As mortes por enfarte do miocárdio foram cerca de 3.8% da mortalidade total e estima-se que foram perdidos cerca de 10670 potenciais anos de vida devido às doenças cerebro-cardiovasculares. Para além de serem interessantes por serem muito prevalentes em toda a Europa, as doenças cérebro-cardiovasculares são impactadas pelo estilo de vida e comportamentos dos indivíduos. Vários estudos já concluíram que uma parte substancial do risco de desenvolver uma doença cérebro-cardiovascular pode ser reduzido através de escolhas pessoais e de abordagens preventivas, como adotar estilos de vida saudáveis. Sabe-se também que a posição socioeconómica de um indivíduo tem um potencial efeito no seu estado de saúde e também nos cuidados de saúde que recebe, o que significa que as desigualdades socioeconómicas são determinantes de saúde. O Índice Europeu de Privação (EDI) é uma forma de quantificar o nível de privação dos indivíduos e, por isso, a versão adaptada à realidade portuguesa, desenvolvida em 2016 por uma equipa multinacional e multidisciplinar de investigadores, foi incorporada neste trabalho. O objetivo principal deste trabalho é avaliar o efeito das desigualdades em saúde, nomeadamente as associadas à baixa escolaridade e aos níveis de privação na doença cérebro-cardiovascular. Para alcançar este objetivo foram utilizados os dados resultantes do estudo e_COR, realizado pelo Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, entre 2012 e 2014, no âmbito da prevenção cardiovascular e com o objetivo de estimar a prevalência dos fatores de risco cardiovascular. No presente trabalho foi estudada a passada ocorrência de pelo menos um evento cérebro-cardiovascular e o número de fatores de risco que cada um dos participantes no estudo e_COR apresentava. As variáveis em estudo são algumas das variáveis recolhidas durante o estudo e_COR, referentes a características demográficas, físicas, metabólicas, historial médico e estilos de vida dos participantes. Também foram recolhidas variáveis que caracterizam o acesso aos cuidados de saúde, extraídas a partir do INE, e variáveis relativas à condição socioeconómica que resultam do EDI adaptado à realidade portuguesa. Para modelar a ocorrência de um evento cérebro-cardiovascular foi utilizado o método de regressão logística uma vez que se adequa à natureza binária da variável resposta. Antes da modelação dos dados foram avaliadas possíveis correlações entre as variáveis em estudo. As variáveis que foram incluídas no Modelo Linear Generalizado foram selecionadas através do processo de Seleção Stepwise, considerando um p-value de entrada de 0.20 e um p-value de saída de 0.25. As variáveis de confundimento, sexo e idade, foram as primeiras a serem introduzidas no modelo e independentemente do seu p-value permaneceram sempre no modelo. Após o processo Stepwise foram introduzidas as variáveis relacionadas com níveis de educação e privação. Ao modelo final foi adicionado o efeito aleatório da região de residência. Uma vez que se verificou um grande desequilíbrio entre casos e não casos de doença cérebro-cardiovascular, foi utilizada a técnica de SMOTE para criar um conjunto de dados mais equilibrados e o mesmo processo de modelação foi aplicado. Para a validação dos modelos obtidos foi calculada a curva ROC com a respetiva AUC e também foi realizada validação cruzada. Para modelar o número de fatores de risco foi utilizada a regressão de Poisson uma vez que é um dos métodos indicados quando a variável resposta é uma contagem. Neste modelo foram incluídas, mais uma vez, as variáveis de confundimento, sexo e idade, bem como as variáveis relativas a desigualdades, níveis de educação e de privação. Foram realizadas comparações múltiplas para avaliar de que forma as variáveis associadas às desigualdades afetam o número de fatores de risco que cada indivíduo apresenta. Os eventos cérebro-cardiovasculares registados ocorreram no passado e os fatores de risco que os indivíduos apresentam estão no presente, pelo que a interpretação dos modelos não é a mais convencional e algumas das variáveis teriam valores diferentes se tivessem sido avaliadas antes do evento ocorrer. Os modelos de regressão logística sugerem que na presença de dois indivíduos com características físicas e biológicas semelhantes, a influência dos seus níveis de educação ou privação não é significativa nem são bons indicadores para distinguir indivíduos que já sofreram um evento cérebro-cardiovascular daqueles que não sofreram. O efeito aleatório da região também não é estatisticamente significativo. Uma vez que o evento já ocorreu este modelo serve sobretudo para distinguir indivíduos que já sofreram o evento daqueles que não sofreram, através das suas características. O modelo de regressão Poisson sugere que os níveis de educação de um indivíduo afetam o número de fatores de risco que o mesmo apresenta, isto é, verificou-se que indivíduos com escolaridade mais avançada apresentavam menor número de fatores de risco.According to the World Health Organization (WHO), health inequalities are systematic differences in the health status of different population groups with significant social and economic costs for individuals and societies. These differences are unfair and can be mitigated through the action of government policies, so it is necessary to understand their impact. Cardiovascular diseases (CVD) are a group of disorders of the brain, heart and blood vessels and include coronary heart disease, cerebro-cardiovascular disease, rheumatic heart disease and other conditions. More than four out of five CVD deaths are due to heart attacks and strokes, and one third of these deaths occur prematurely in people under 70 years of age (WHO). The events of interest considered in this work were stroke, acute myocardial infarction, and peripheral arterial disease. In Portugal in 2019, strokes were the number one cause of death representing 9.8% of the total mortality and the deaths by myocardial infarction represented 3.8% of the total mortality, according to INE. It is estimated that about 10 670 potential years of life were lost due to cerebro-cardiovascular diseases in Portugal in 2019. In addition to being interesting for being very prevalent across Europe, cerebrovascular diseases are impacted by the lifestyle and behavior of individuals. Several studies have concluded that a substantial part of the risk of developing cerebro-cardiovascular disease can be reduced through personal choices and preventive approaches, such as adapting healthy lifestyles. An individual’s socioeconomic position has a potential effect on their health status and also on the health care they receive, which means that socioeconomic inequalities are determinants of health. The European Deprivation Index (EDI) is a way of quantifying the level of deprivation of individuals and, therefore, the version adapted to the Portuguese reality, developed in 2016 by a multinational and multidisciplinary team of researchers, was incorporated in this work. The main objective of this work is to evaluate the effect of health inequalities, namely those associated with low education and levels of deprivation in cerebro-cardiovascular disease. To achieve this objective, the main set of data used resulted from the e_COR study, developed by the Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, between 2012 and 2014, within the scope of cardiovascular prevention and with the objective of estimating the prevalence of cardiovascular risk factors. In the present work, the past occurrence of at least one cerebro-cardiovascular event and the number of risk factors that each of the participants in the e_COR study had were studied. The variables under study are some of the variables collected during the e_COR study, referring to demographic, physical, metabolic, medical history, and lifestyle characteristics of the participants. Some other variables were collected such as variables that characterize access to healthcare, extracted from INE, and variables related to socioeconomic status, that resulted from the EDI adapted to the Portuguese context. To model the occurrence of a cerebro-cardiovascular event, the logistic regression method was used, as it suits the binary nature of the response variable. Before modeling the data, possible correlations between the variables under study were evaluated. The variables that were included in the Generalized Linear Model were selected through the Stepwise Selection process, considering an inclusion p-value of 0.20 and an exclusion p-value of 0.25. The confounding variables, sex and age, were the first to be introduced in the model and, regardless of their p-value, they always remained in the model. After the Stepwise process, variables related to levels of education and deprivation were introduced. The random effect of the region of residence was added to the final model. Since there was a large imbalance between cases and non-cases of cerebro-cardiovascular disease, the SMOTE technique was used to create a more balanced dataset and the same modeling process was applied. For the validation of the models obtained, the ROC curve with the respective AUC was calculated and cross validation was also performed. Poisson regression was used to model the number of risk factors, since it is one of the methods indicated when the response variable is a count variable. In this model, once again, confounding variables, sex and age were included, as well as the variables related to inequalities, education levels and deprivation levels. Multiple comparisons were performed to assess how variables associated with inequalities affect the number of risk factors that each individual has. The recorded cerebro-cardiovascular events that occurred happened in the past and the risk factors that individuals have are in the present, so the interpretation of the models is not the most conventional and some of the variables would have different values if they had been evaluated before the event occurred. Both logistic regression models suggest that in the presence of two individuals with similar physical and biological characteristics, the influence of their levels of education or deprivation is not significant, and these are not good indicators to distinguish individuals who have already suffered a cerebro-cardiovascular event from those who have not. The random effect of the region is also not statistically significant. Since the event has already occurred, this model is useful mainly to distinguish individuals who have already suffered the event from those who have not suffered, through their characteristics. The Poisson regression model suggests that an individual's education levels affect the number of risk factors that an individual has, i.e., it was found that individuals with more advanced education had a lower number of risk factors

Error Orthogonal Models: Structure, Operations and Inference

In this thesis, we develop the theory of Error-Orthogonal Models availing ourselves of the identity of these models and those with Commutative Orthogonal Block Structure. Thus our treatment will rest on the algebraic structure of the models. In our development we consider: the estimation of variance components; crossing and nesting of models; model joining, in which observations vectors obtained separately are jointly analyzed; step nesting which require much less observations than the corresponding usual models. To broaden our treatment we also consider L Extensions of Error-Orthogonal models. In this way, we may consider interesting cases such as models otherwise balanced with different numbers of replicates for the treatments. Last we include normality. We will be interested in obtaining sufficient statistics as well as conditions for them to be complete. We will carry out inference and consider orthogonal L extensions.Nesta tese é desenvolvida a teoria dos modelos Error-orthogonal recorrendo à identidade entre estes modelos e os modelos com estrutura ortogonal de blocos comutativos. Desta forma, o tratamento apresentado irá assentar na estrutura algébrica dos modelos. No desenvolvimento considera-se: a estimação das componentes de variância; o cruzamento e aninhamento de modelos; a junção de modelos, na qual vectores das observações obtidos separadamente são analisados conjuntamente; aninhamento em escada, que requer muito menos observações do que os modelos correspondentes. Para alargar o tratamento apresentado consideram-se também Extensões L de modelos Error-orthogonal. Desta forma, poderemos considerar casos interessantes como o dos modelos com número diferente de repetições para os vários tratamentos. Por fim, inclui-se o caso normal. Com base no pressuposto da normalidade pretende-se obter estatísticas suficientes assim como condições para que estas sejam completas. É realizada inferência e consideram-se extensões L ortogonais

O livro didático e os problemas matemáticos relacionados a calculadora

This article aims to point out if there are mathematical problems in the textbooks of the final grades of elementary school that require the use of the calculator, as well as its relationship with the skills of the BNCC. It is a theoretical research with a qualitative approach. Its methodology had three stages, where the first listens to the choice of the book, the second, the identification of the problems that use the calculator and the third, where the relation of the questions with the competences was established. The results show that there are a considerable number of mathematical problems that require the use of the calculator. In addition, the 9th grade book presented a greater number of problems related to a single content, financial mathematics.Este artigo pretende apontar se existem problemas matemáticos nos livros didáticos das series finais do ensino fundamental que solicitam o uso da calculadora, bem como a sua relação com as competências da BNCC. Trata-se de uma pesquisa teórica com uma abordagem qualitativa. Sua metodologia teve três etapas, onde a primeira ouve a escolha do livro, a segunda, a identificação dos problemas que utilizam a calculadora e a terceira, onde foi estabelecida a relação das questões com as competências. Os resultados apontam que existe uma quantidade, considerável de problemas matemáticos que solicitam o uso da calculadora. Além disso, o livro do 9o ano apresentou uma maior quantidade de problemas relacionados a um único conteúdo, matemática financeira

O contributo da ilustração para o ensino-aprendizagem da leitura

Dissertação de mestrado em Ensino na especialidade de educação pré-escolar e ensino do 1º ciclo do Ensino Básico. Instituto Politécnico de Beja, Escola Superior de Educação, 2014.A presente investigação, elaborada no âmbito do Mestrado em Ensino na Especialidade de Educação Pré-Escolar e Ensino do 1º ciclo do Ensino Básico, pretende compreender quais os contributos da ilustração para o ensino-aprendizagem da leitura. Neste trabalho utilizou-se uma metodologia de investigação para ação de natureza diagnóstica, visto que o investigador recolhe dados, interpreta-os, estabelece um diagnóstico e estrutura medidas para a ação, de modo a atenuar o problema previamente encontrado. Desta forma, foram necessárias consultas bibliográficas de diferentes autores para uma compreensão mais clarificada dos benefícios da ilustração no processo de ensinoaprendizagem. Foi realizada uma consulta ao Programa de Português do Ensino Básico, para apurar quais os descritores de desempenho do 1º ano de escolaridade, respeitante à compreensão do oral, à expressão oral e à leitura. Posteriormente, efetuaram-se novas pesquisas sobre a ilustração estas mais específicas, determinando as funções e qual o contributo da ilustração no ensino da leitura no âmbito do Português do 1º ano, 1º ciclo do Ensino Básico

Análise comparativa de diferentes métodos laboratoriais na caracterização física de solos utilizados em obras de engenharia civil

Os solos são amplamente utilizados tanto no suporte às fundações, quanto como material de escavação ou de construção, o que torna fundamental o estudo de suas propriedades e do seu desempenho. A caracterização de um terreno é realizada utilizando-se técnicas de prospeção geotécnica e recorrendo-se aos ensaios in situ e/ou aos ensaios de laboratório, dependendo da finalidade prevista para o uso do solo. Estas atividades devem ser executadas de acordo com normas técnicas que definem a metodologia a ser empregada em cada um desses procedimentos. Recentemente, novas normas europeias de caracterização dos solos estão sendo implementadas, com o objetivo de desenvolver metodologias comparáveis nos diferentes países da União Europeia. Este trabalho apresenta um estudo das principais alterações na nova normalização para os ensaios de determinação da massa volúmica das partículas e determinação da distribuição granulométrica dos solos. Neste estudo, para avaliar o impacto das novas metodologias de ensaio na rotina dos laboratórios e nos resultados obtidos, foram realizados cerca de 230 ensaios laboratoriais e utilizados dois tipos de solos, um solo residual granítico e um solo argiloso de natureza caulinítica. A partir destes ensaios foi possível verificar que na maioria das situações as modificações introduzidas pelas novas metodologias de ensaio não introduzem alterações significativas nos resultados obtidos; há, no entanto, determinados aspetos insuficientemente padronizados na nova normalização que não garantem a uniformidade das práticas de ensaio, nem a precisão fundamental nestes tipos de determinações, pelo que deverão ser trabalhados e contemplados em futuras revisões das normas.Soil is widely used for supporting foundations and as an excavation or construction material, which makes the study of its properties and performance essential. Soil characterization is performed using geotechnical evaluation techniques and, depending on the intended purpose of the soil use, in situ and/or laboratory tests. These activities should be performed in accordance with technical standards that define the methodology to be applied in each of these procedures. Recently, new European soil characterization standards are being formulated and implemented with the purpose of developing comparable methodologies in the different countries of the European Union. This work presents a study of the main changes in the new standardization for the determination of particle density and the determination of particle size distribution. In this study, to evaluate the impact of the new standard methodologies on the routine of the laboratories and on the results obtained, about 230 laboratory tests were carried out and two soil types were used: a granitic residual soil and a kaolinitic clay soil. From these tests it was possible to verify that the modifications introduced by the new standardization do not introduce significant changes in the obtained results in most situations; there are, however, certain aspects, insufficiently standardized in the new normalization, which do not guarantee uniformity of testing practices or fundamental accuracy in these types of determinations. They should, therefore, be addressed in future standards revisions

Análise comparativa de diferentes métodos laboratoriais na caracterização física de solos utilizados em obras de engenharia civil

Soil is widely used for supporting foundations and as an excavation or construction material, which makes the study of its properties and performance essential. Soil characterization is performed using geotechnical evaluation techniques and, depending on the intended purpose of the soil use, in situ and/or laboratory tests. These activities should be performed in accordance with technical standards that define the methodology to be applied in each of these procedures. Recently, new European soil characterization standards are being formulated and implemented with the purpose of developing comparable methodologies in the different countries of the European Union. This work presents a study of the main changes in the new standardization for the determination of particle density and the determination of particle size distribution. In this study, to evaluate the impact of the new standard methodologies on the routine of the laboratories and on the results obtained, about 230 laboratory tests were carried out and two soil types were used: a granitic residual soil and a kaolinitic clay soil. From these tests it was possible to verify that the modifications introduced by the new standardization do not introduce significant changes in the obtained results in most situations; there are, however, certain aspects, insufficiently standardized in the new normalization, which do not guarantee uniformity of testing practices or fundamental accuracy in these types of determinations. They should, therefore, be addressed in future standards revisions.Os solos são amplamente utilizados tanto no suporte às fundações, quanto como material de escavação ou de construção, o que torna fundamental o estudo de suas propriedades e do seu desempenho. A caracterização de um terreno é realizada utilizando-se técnicas de prospeção geotécnica e recorrendo-se aos ensaios in situ e/ou aos ensaios de laboratório, dependendo da finalidade prevista para o uso do solo. Estas atividades devem ser executadas de acordo com normas técnicas que definem a metodologia a ser empregada em cada um desses procedimentos. Recentemente, novas normas europeias de caracterização dos solos estão sendo implementadas, com o objetivo de desenvolver metodologias comparáveis nos diferentes países da União Europeia. Este trabalho apresenta um estudo das principais alterações na nova normalização para os ensaios de determinação da massa volúmica das partículas e determinação da distribuição granulométrica dos solos. Neste estudo, para avaliar o impacto das novas metodologias de ensaio na rotina dos laboratórios e nos resultados obtidos, foram realizados cerca de 230 ensaios laboratoriais e utilizados dois tipos de solos, um solo residual granítico e um solo argiloso de natureza caulinítica. A partir destes ensaios foi possível verificar que na maioria das situações as modificações introduzidas pelas novas metodologias de ensaio não introduzem alterações significativas nos resultados obtidos; há, no entanto, determinados aspetos insuficientemente padronizados na nova normalização que não garantem a uniformidade das práticas de ensaio, nem a precisão fundamental nestes tipos de determinações, pelo que deverão ser trabalhados e contemplados em futuras revisões das normas