Genome sequence of the necrotrophic plant pathogen Pythium ultimum reveals original pathogenicity mechanisms and effector repertoire

Background: Pythium ultimum (P. ultimum) is a ubiquitous oomycete plant pathogen responsible for a variety of diseases on a broad range of crop and ornamental species. Results: The P. ultimum genome (42.8 Mb) encodes 15,290 genes and has extensive sequence similarity and synteny with related Phytophthora species, including the potato blight pathogen Phytophthora infestans. Whole transcriptome sequencing revealed expression of 86% of genes, with detectable differential expression of suites of genes under abiotic stress and in the presence of a host. The predicted proteome includes a large repertoire of proteins involved in plant pathogen interactions although surprisingly, the P. ultimum genome does not encode any classical RXLR effectors and relatively few Crinkler genes in comparison to related phytopathogenic oomycetes. A lower number of enzymes involved in carbohydrate metabolism were present compared to Phytophthora species, with the notable absence of cutinases, suggesting a significant difference in virulence mechanisms between P. ultimum and more host specific oomycete species. Although we observed a high degree of orthology with Phytophthora genomes, there were novel features of the P. ultimum proteome including an expansion of genes involved in proteolysis and genes unique to Pythium. We identified a small gene family of cadherins, proteins involved in cell adhesion, the first report in a genome outside the metazoans. Conclusions: Access to the P. ultimum genome has revealed not only core pathogenic mechanisms within the oomycetes but also lineage specific genes associated with the alternative virulence and lifestyles found within the pythiaceous lineages compared to the Peronosporaceae

Wirtschaftstextsorten im Schnittpunkt von Praxis, Lehre und Wissenschaft

Nicht für die Schule – fürs Leben lernen wir. Wer erinnert sich nicht an diesen Satz aus dem Lateinunterricht? Aber wer weiß noch, wie dieser Satz korrekt ins Lateinische übersetzt wird? Vielleicht zeigt sich schon daran eine weitreichende Bedeutung des Satzes selber: Was wir in der Ausbildung lernen, soll einen Praxisbezug haben, es soll in der realen Welt anwendbar sein und die Umsetzung soll sinnvoll und nützlich sein. Dazu müssen aber die Lehrerinnen und Lehrer, die Dozentinnen und Dozenten wissen, was in der Praxis vor sich geht und worauf sie ihre Schützlinge vorbereiten sollen

Textlinguistische Analyse und Textsortenkompetenz: Der Aktionärsbrief

In dem vorliegenden Beitrag möchte ich illustrieren, wie sich textlinguistische Analysen von Wirtschaftstextsorten zur Vermittlung von spezifischen Textsortenkompetenzen beziehungsweise zu ihrer selbstständigen Erschließung nutzen lassen. Dies werde ich am Beispiel einer verbreiteten und relativ gut untersuchten Textsorte aus dem Bereich der externen Unternehmenskommunikation zu zeigen versuchen, nämlich dem Aktionärsbrief (vgl. Halff 2009, Wawra 2008, Keller 2006, Baetge & Brötzmann 2003, Böttger 2003, Ditlevsen 2002, Gohr 2002, Gazdar & Kirchhoff 1999, Fløttum 1998)