Will the institutional mandatory policies be so mandatory? Which is the degree of performance? The case of the Digital Library of IPB

O objetivo deste estudo assentou em fazer uma análise comparativa, para o período compreendido entre 2004 e 2013 tendo por base as publicações científicas dos docentes do Instituto Politécnico de Bragança (IPB), depositadas na Biblioteca Digital (repositório). Pretendia-se constatar se as publicações científicas existentes nas bases de dados WOS e Scopus estavam depositadas no repositório. Para isso criou-se um instrumento que permitiu a normalização da tipologia documental.A metodologia utilizada consistiu em retirar os dados existentes no repositório, na WOS e Scopus. Todos esses dados foram utilizados para criar tabelas dinâmicas (Excel). Foram ainda utilizadas as análises descritiva exploratória e inferencial para decidir sobre os resultados. Para o período em análise verificou-se um acréscimo de depósitos no repositório superior a 93%. Na análise temporal, referente aos três ciclos de avaliação (2004-2007, 2008-2010 e 2011-2013) verificou-se que a percentagem da taxa de depósitos ultrapassa os 86% de documentos referenciados na WOS e na Scopus. Contudo, 79% dos documentos ficaram em acesso aberto e 21% em acesso restrito. Os documentos não depositados referenciados na WOS e na Scopus, alcançaram os 14%. Constataram-se evidências estatísticas suficientes para afirmar que existiam incoerências na tipologia documental (dc:type) no repositório.The purpose of this study was the elaboration of a comparative analysis based on scientific publications of the Polytechnic Institute of Bragança (IPB), deposited in the Digital Library (repository) in the period 2004-2013. The aim was to see if the existing scientific publications in WOS and Scopus databases were deposited in the repository. For this an instrument that allowed the normalization of documental type was created.The methodology used was to remove the existing data in the repository (WOS and Scopus). All these data were used to create pivot tables (Excel). To decide on the results, the exploratory descriptive and inferential analyses were still used.For the period under review an increase in deposits upper 93% was verified. In the temporal analysis, referring to three cycles of evaluation (2004-2007, 2008-2010 and 2011-2013) it was found that the percentage of the deposits rate exceeds 86% of documents referenced in the WOS and Scopus. However, 79% of the documents were in open access and 21% in restricted access. The documents not filed referenced in the WOS and Scopus, reached the 14%. Sufficient statistical evidences were found to assert that there were inconsistencies in the document type (dc: type) in the repository

Serão as políticas institucionais mandatórias, assim tão mandatórias? Qual o grau de cumprimento? O caso da Biblioteca Digital do IPB

Em 30 de abril de 2010, o Conselho Permanente do Instituto Politécnico de Bragança (IPB), aprovou por unanimidade a Política de Auto-Arquivo de Publicações na Biblioteca Digital do IPB, tornando-se na primeira instituição portuguesa de ensino superior politécnico a possuir uma política de obrigatoriedade de autoarquivo de todas as publicações produzidas pelos seus docentes e investigadores. Posteriormente, em 10 de Janeiro de 2011, foi publicado o Regulamento n.º 14/2011 - Regulamento do Sistema de Avaliação do Desempenho do Pessoal Docente do Instituto Politécnico de Bragança (RAD) – que veio reforçar a obrigatoriedade do autoarquivo, impondo o depósito prévio da produção científica na Biblioteca Digital do IPB (adiante designada por repositório), como condição para ser considerada na avaliação de desempenho. De facto, este regulamento estabelece que “São apenas considerados os artigos depositados na Biblioteca Digital do IPB”. Desta forma, o repositório do IPB foi o primeiro repositório em instituições do ensino superior a ser interoperável com o sistema institucional de avaliação docente (RAD) (Pais, Clarisse; Alves, Albano, 2013). Para que haja uma ligação ao RAD, os docentes são obrigados a indicar os handles dos registos correspondentes às suas publicações depositadas no repositório do IPB. Com base no handle, são descarregados do repositório os metadados da publicação (título, ano, autores, URI), sendo logo de seguida apresentada a valoração respetiva (Pais, Clarisse; Alves, Albano, 2013). Desde a promulgação da política, já decorreram três ciclos de avaliação de docentes (2005-2007, 2008-2010 e 2011-2013) e portanto, neste trabalho pretende-se fazer uma análise comparativa entre as publicações depositadas no repositório e as publicações com afiliação do IPB referenciadas na Web of Science e na Scopus, inferindo ainda se essas publicações depositadas no repositório estão em Acesso Aberto. Metodologia A metodologia utilizada consistiu em retirar os dados relativos ao Instituto Politécnico de Bragança na WOS, na Scopus e os existentes no repositório. Todos esses dados foram utilizados para criar tabelas dinâmicas – no excel - que permitem cruzar dados e combinar valores de diferentes campos. Este estudo de monitorização também permitiu verificar a consistência dos metadados no repositório, verificar se as publicações que têm mais citações na WOS e na Scopus estão em acesso aberto no repositório. Resultados preliminares Nos três ciclos de avaliação, com datas limite de depósito, deliberadas pelo Conselho Técnico-Científico do IPB, verificou-se um acréscimo de depósitos no repositório superior a 93%. Quando se faz uma análise temporal referente aos três ciclos de avaliação (2005-2007, 2008-2010 e 2011-2013) verifica-se que a percentagem da taxa de depósitos ultrapassa os 86%, de documentos referenciados na WOS e na Scopus. No entanto, os documentos não depositados referenciados na WOS e na Scopus, alcançou os 14%. Nos três ciclos de avaliação foi verificado que 79% dos documentos ficaram em Acesso Aberto e 21% em acesso restrito. No entanto, do primeiro ciclo para o último ciclo verificou-se um aumento do acesso restrito de 18% para 37%, respetivamente. Relativamente às publicações mais citadas na WOS e Scopus, analisaram-se todos artigos que receberam até 10 citações. Verificou-se que 67% dos artigos estão em Acesso Aberto e 33% em acesso restrito. Conclusão Como foi o primeiro Politécnico em Portugal a implementar uma política de autoarquivo obrigatória, o relatório efetuado pelo Projeto PASTEUR4OA , coloca o IPB em segundo lugar, a nível mundial, em termos da taxa de depósitos dos artigos nos universos dos repositórios com políticas obrigatórias. No caso da Biblioteca Digital do IPB, verifica-se que desde da implementação da política de autoarquivo, tem sido parcialmente cumprida porque está associada ao Sistema de Avaliação do Desempenho do Pessoal Docente do Instituto Politécnico de Bragança. A avaliação dos dados, permitiu aferir que as políticas de obrigatoriedade institucionais não são 100% eficazes e portanto terão que se incorporar nos repositórios procedimentos que possibilitem a interoperabilidade com outros sistemas e serviços, como por exemplo, o CrossRef Metadata Search, ou API’s da WOS e da Scopus. Mesmo lutando contra estas particularidades, há docentes, para quem o repositório é fundamental e depositam toda a produção científica com regularidade. As potencialidades que esta plataforma possui, são indiscutíveis em relação a muitas outras plataformas, porque para além de todas as publicações ficarem integradas, também o curriculum DeGóis é imediatamente atualizado

Morbidades após tratamento do câncer de mama

Introdução: O câncer de mama tem comportamento heterogêneo e variável com incidência global crescente, sendo neoplasia mais temida pelas mulheres devido à alta frequência e efeitos físicos e psicológicos associadas ao póstratamento. Objetivo: Descrever as morbidades após tratamento do câncer de mama. Métodos: Trata-se de revisão narrativa nas bases de dados PubMed, BIREME, Scielo e BVS via descritores DeCS/MeSH, nas línguas inglesa, portuguesa e espanhola atualizadas. Foram arrolados os estudos que avaliavam as entidades psicopatológicas: depressão, medo de recidivas, distúrbios do sono, problemas cognitivos, fadiga e problemas sexuais. Comentários: Morbidades psicossomáticas, cirúrgicas associadas a plexos nervosos, restrição dos movimentos braquiais, efeitos da terapia sistêmica e da radioterapia, lesão dos sistemas linfático e hematológico, presença de infecção, dor, amenorreia, síndrome da rede axilar (SRA) e a síndrome do ombro congelado foram mais frequentemente encontrados. Conclusão: Diversos fatores mórbidos estão vinculados ao tratamento do câncer de mama e deve-se considerar individualidade de respostas às terapêuticas propostas no manuseio desta afecção

SERÃO AS POLÍTICAS INSTITUCIONAIS MANDATÓRIAS, ASSIM TÃO MANDATÓRIAS? QUAL O GRAU DE CUMPRIMENTO? O CASO DA BIBLIOTECA DIGITAL DO IPB

O objetivo deste estudo assentou em fazer uma análise comparativa, para o período compreendido entre 2004 e 2013 tendo por base as publicações científicas dos docentes do Instituto Politécnico de Bragança (IPB), depositadas na Biblioteca Digital (repositório). Pretendia-se constatar se as publicações científicas existentes nas bases de dados WOS e Scopus estavam depositadas no repositório. Para isso criou-se um instrumento que permitiu a normalização da tipologia documental.A metodologia utilizada consistiu em retirar os dados existentes no repositório, na WOS e Scopus. Todos esses dados foram utilizados para criar tabelas dinâmicas (Excel). Foram ainda utilizadas as análises descritiva exploratória e inferencial para decidir sobre os resultados. Para o período em análise verificou-se um acréscimo de depósitos no repositório superior a 93%. Na análise temporal, referente aos três ciclos de avaliação (2004-2007, 2008-2010 e 2011-2013) verificou-se que a percentagem da taxa de depósitos ultrapassa os 86% de documentos referenciados na WOS e na Scopus. Contudo, 79% dos documentos ficaram em acesso aberto e 21% em acesso restrito. Os documentos não depositados referenciados na WOS e na Scopus, alcançaram os 14%. Constataram-se evidências estatísticas suficientes para afirmar que existiam incoerências na tipologia documental (dc:type) no repositório

Surgical aortic valve replacement and patient-prosthesis mismatch a meta-analysis of 108 182 patients

OBJECTIVES: This study sought to evaluate the impact of patient–prosthesis mismatch (PPM) on the risk of perioperative, early-, mid- and long-term mortality rates after surgical aortic valve replacement. METHODS: Databases were searched for studies published until March 2018. The main outcomes of interest were perioperative mortality, 1-year mortality, 5-year mortality and 10-year mortality. RESULTS: The search yielded 3761 studies for inclusion. Of these, 70 articles were analysed, and their data were extracted. The total num- ber of patients included was 108 182 who underwent surgical aortic valve replacement. The incidence of PPM after surgical aortic valve re- placement was 53.7% (58 116 with PPM and 50 066 without PPM). Perioperative mortality [odds ratio (OR) 1.491, 95% confidence interval (CI) 1.302–1.707; P < 0.001], 1-year mortality (OR 1.465, 95% CI 1.277–1.681; P < 0.001), 5-year mortality (OR 1.358, 95% CI 1.218–1.515; P < 0.001) and 10-year mortality (OR 1.534, 95% CI 1.290–1.825; P < 0.001) were increased in patients with PPM. Both severe PPM and moderate PPM were associated with increased risk of perioperative mortality, 1-year mortality, 5-year mortality and 10-year mortality when analysed together and separately, although we observed a higher risk in the group with severe PPM. CONCLUSIONS: Moderate/severe PPM increases perioperative, early-, mid- and long-term mortality rates proportionally to its severity. The findings of this study support the implementation of surgical strategies to prevent PPM in order to decrease mortality rates

Aumento da ingesta de magnésio na dieta associada à redução da dor crônica: Uma revisão sistemática

Objetivos: Realização de uma revisão sistemática que aborda a associação entre o aumento da ingesta de magnésio, através da dieta, com a redução da dor crônica. Métodos: Foi desenvolvida uma revisão sistemática a partir das bases de dados, PubMed, BIREME e LILACS, via descritores DeCS/MeSH; incluindo estudos que abordassem a temática da ingesta de magnésio na dieta de indivíduos com dor crônica. Utilizando os idiomas inglês, português e espanhol. O levantamento bibliográfico foi realizado no período entre agosto e setembro de 2018. Resultados: Do total de artigos selecionados, 3 atenderam aos critérios de inclusão, sendo que em 1 não houve significância (p>0,05). Em mulheres com fibromialgia (FM), entre 18-60 anos, a ingestão de magnésio e cálcio apresentou correlação positiva com o limiar da dor (r=0,25; p=0,01 e r=0,32; p=0,01, respectivamente) e correlação negativa com os TP (r=-0,23; p=0,02 e r=- 0,28; p=0,03, respectivamente). A intensidade da enxaqueca foi significativamente reduzida no grupo de suplementação (magnésio, riboflavina e coezima Q10), comparado ao placebo (p = 0,03). Nas 90 mulheres com artrite reumatoide (AR), não houve significativa relação entre a ingestão de nutrientes e escore de atividade da doença. Conclusão: Definiu-se que há uma correlação no aumento da ingesta de magnésio com a redução da dor crônica, reforçando a relevância do cuidado nutricional para melhora da qualidade de vida

COVID-19 outcomes in people living with HIV: Peering through the waves

Objective: To evaluate clinical characteristics and outcomes of COVID-19 patients infected with HIV, and to compare with a paired sample without HIV infection. Methods: This is a substudy of a Brazilian multicentric cohort that comprised two periods (2020 and 2021). Data was obtained through the retrospective review of medical records. Primary outcomes were admission to the intensive care unit, invasive mechanical ventilation, and death. Patients with HIV and controls were matched for age, sex, number of comorbidities, and hospital of origin using the technique of propensity score matching (up to&nbsp;4:1). They were compared using the Chi-Square or Fisher's Exact tests for categorical variables and the Wilcoxon for numerical variables. Results: Throughout the study, 17,101&nbsp;COVID-19 patients were hospitalized, and 130&nbsp;(0.76%) of those were infected with HIV. The median age was&nbsp;54&nbsp;(IQR:&nbsp;43.0;64.0) years in&nbsp;2020 and 53&nbsp;(IQR:&nbsp;46.0;63.5) years in&nbsp;2021, with a predominance of females in both periods. People Living with HIV (PLHIV) and their controls showed similar prevalence for admission to the ICU and invasive mechanical ventilation requirement in the two periods, with no significant differences. In&nbsp;2020, in-hospital mortality was higher in the PLHIV compared to the controls (27.9%&nbsp;vs.&nbsp;17.7%; p&nbsp;=&nbsp;0.049), but there was no difference in mortality between groups in&nbsp;2021 (25.0%&nbsp;vs.&nbsp;25.1%; p &gt; 0.999). Conclusions: Our results reiterate that PLHIV were at higher risk of COVID-19 mortality in the early stages of the pandemic, however, this finding did not sustain in&nbsp;2021, when the mortality rate is similar to the control group

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear un derstanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5–7 vast areas of the tropics remain understudied.8–11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world’s most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepre sented in biodiversity databases.13–15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may elim inate pieces of the Amazon’s biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological com munities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple or ganism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region’s vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most ne glected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lostinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear understanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5,6,7 vast areas of the tropics remain understudied.8,9,10,11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world's most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepresented in biodiversity databases.13,14,15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may eliminate pieces of the Amazon's biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological communities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple organism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region's vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most neglected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lost