159 research outputs found

    Di-tert-butyl 2-benzoyl­hydrazine-1,1-dicarboxyl­ate

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    The crystal structure of the title compound, C17H24N2O5, was determined in the course of our studies on the preparation of two families of pseudopeptides, viz. hydrazino- and N-amino- peptides. The most significant inter­action in the crystal structure is a bifurcated inter­molecular N—H⋯O hydrogen bond

    Boc-AzAla-Ala-OMe

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    The title compound (systematic name: tert-butyl 3-{[1-(methoxy­carbon­yl)eth­yl]amino­carbon­yl}-3-methyl­carbazate), C11H21N3O5, is a precursor for the study of a new class of foldamer based on aza/α-dipeptide oligomerization [Abbas et al. (2009 ▶). Tetra­hedron Lett. 50, 4158–4160]. The asymmetric unit consists of one mol­ecule in an extended conformation which is stabilized by inter­molecular N—H⋯O and C—H⋯O hydrogen bonding

    Crystal Structure of Saccharomyces cerevisiae ECM4, a Xi-Class Glutathione Transferase that Reacts with Glutathionyl-(hydro)quinones

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    International audienceGlutathionyl-hydroquinone reductases (GHRs) belong to the recently characterized Xi-class of glutathione transferases (GSTXs) according to unique structural properties and are present in all but animal kingdoms. The GHR ScECM4 from the yeast Saccharomyces cerevisiae has been studied since 1997 when it was found to be potentially involved in cell-wall biosyn-thesis. Up to now and in spite of biological studies made on this enzyme, its physiological role remains challenging. The work here reports its crystallographic study. In addition to exhibiting the general GSTX structural features, ScECM4 shows extensions including a huge loop which contributes to the quaternary assembly. These structural extensions are probably specific to Saccharomycetaceae. Soaking of ScECM4 crystals with GS-menadione results in a structure where glutathione forms a mixed disulfide bond with the cysteine 46. Solution studies confirm that ScECM4 has reductase activity for GS-menadione in presence of glutathione. Moreover, the high resolution structures allowed us to propose new roles of conserved residues of the active site to assist the cysteine 46 during the catalytic act

    Cyclic b-peptoids

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    The first synthesis of functionalized -peptoid macrocycles is reported. X-ray crystallographic structure of tetramer 9 reveals a C2-symmetrical derivative with unexpected all-cis-amide bonds and spatial disposition of the appendages toward the two opposite faces of the ring. Quantum calculations suggest that 9 is locked in this layout. These macrocycles constitute novel promising templates for multimeric ligation of biologically active ligands. The concept was exemplified by chemical decoration of tetramer 9 via "click" reaction

    tert-Butyl 3-oxo-2-oxa-5-aza­bicyclo­[2.2.1]heptane-5-carboxyl­ate

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    The title compound, C10H15NO4, also known as N-tert-butyl­oxycarbonyl-allohydr­oxy-l-proline lactone, is quite similar to N-acetyl-allohydr­oxy-l-proline lactone [Lenstra, Petit & Geise (1979 ▶). Cryst. Struct. Commun. 8, 1023–1029], whereby both carbonyl groups point roughly in the same direction because of the trans conformation of the peptide bond

    Meson-exchange enhancement in first-forbidden β\beta -transitions: the case of 50^{50}K and 38^{38}Ca

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    The β\beta- decay of 50^{50}K and 38^{38}Ca have been investigated with the main motive of determining more accurately the first-forbidden β\beta- branches, in particular the rank-zero, Δ\DeltaJ = 0,  β\,\beta -transitions. 50^{50}K and 38^{38}Ca have been produced by fragmentation of U and Ti targets respectively, with a 1 GeV proton beam and subsequent on-line mass separation. For 50^{50}K, γ\gamma-ray spectroscopy, as well as delayed neutron spectroscopy by time of flight, were carried out to obtain a detailed decay scheme to 20 (bound and unbound) levels in 50^{50}Ca. The level structur e of 50^{50}Ca can be compared to recent calculations which incorporate 1p1h excitations from the f7/2_{7/2} shell. The first-forbidden β−\beta^- transition 50^{50} K(0−^-) →50\,\to{}^{50}Ca(0+^+) g.s. has been evaluated for the first time by a direct measurement of β\beta- and γ\gamma- activities. Its importance (61.0 ±\pm 7.4%\%) is interpreted as an effect of the meson-exchange current (MEC) l eading to an enhancement factor of 62(5)%\% in comparison with the value predicted by shell-model calculations using the impulse approximation. For the 38^{38} Ca →38\,\to{}^{38}K decay, chemical selec tive production was obtained through separation of the molecular ion CaF+^+ without contamination by isobars. In these conditions, the measurement of very weak β\beta-branches, at a level of 10−3%^{-3}\% decays, could be made and a limit, at the 2σ\sigma-confidence level, has been obtained for the 0+→^+\to 0−^- branch to the level at Ex_x = 2993 keV (Iβ_\beta < 0.0046%\%). Imp lications of these results on the general trend of meson-exchange enhancements of first-forbidden transitions within the framework of the spherical shell model are discussed

    Carbohydrate-based peptidomimetics targeting neuropilin-1: synthesis, molecular docking study and in vitro biological activities

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    International audienceNeuropilin-1 (NRP-1), a transmembrane glycoprotein acting as a co-receptor of VEGF-A, is expressed by cancer and angiogenic endothelial cells and is involved in the angiogenesis process. Taking advantage of functionalities and stereodiversities of sugar derivatives, the design and the synthesis of carbohydrate based peptidomimetics are here described. One of these compounds (56) demonstrated inhibition of VEGF-A165 binding to NRP-1 (IC50 = 39 μM) and specificity for NRP-1 over VEGF-R2. Biological evaluations were performed on human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) through activation of downstream proteins (AKT and ERK phosphorylation), viability/proliferation assays and in vitro measurements of anti-angiogenic abilities

    Quelle R&D Mener pour le Développement Des Réseaux D'énergie De Demain ? Les Propositions de L'ancre en 2015

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    Feuille de route sur les réseaux électriques et stockage élaborée par le GP10 Réseaux et Stockages de l'Energie de l'ANCRECette feuille de route concerne les réseaux d’énergie électrique, de chaleur et de froid, les réseaux de gaz (hydrogène, gaz naturel), leurs stockages associés, ainsi que leurs couplages à venir dans le cadre de la transition énergétique et des évolutionsqui l’accompagneront, que ce soit sur les modes de production d’énergie ou sur l’évolution des usages.Le focus est porté sur les réseaux électriques qui seront les premiers impactés par cette transition énergétique. Hormisquelques éléments très spécifiques aux réseaux électriques (et qui seront notés dans le texte par une couleur différente)il est à souligner que la quasi-totalité des considérations et axes de R&D évoqués pour les réseauxélectriques et le développement de leur « intelligence » et/ou de leur flexibilité s’appliquentégalement aux autres réseaux d’énergie. Par ailleurs, si le groupe programmatique« Réseaux et Stockage » de l’ANCRE (GP10) s’est largement appuyé sur les nombreuses feuilles de route émises tant au niveau national, dont celles de l’ADEME, qu’européen, il a également souhaité s’en démarquer en insistantlargement et en détaillant les recherches scientifiques et technologiques à mener face aux verrous actuellement identifiés

    Reconnaissance spécifique des cofacteurs NAD/NADP par les oxydoréductases : étude cristallographique du site de fixation du coenzyme dans la Glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase de Bacillus stearothermophilus

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    Non disponible / Not availableLa glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase (gapdh) est une enzyme essentielle des voies métaboliques et appartient à la famille des oxydoréductases nad(p) dépendantes. L'une de ses particularités est d'utiliser le nad ou le nadp en fonction de sa localisation subcellulaire : la gapdh glycolytique reconnait très spécifiquement le nad, tandis que la gapdh chloroplastique présente une dualité de cofacteur avec une préférence pour le nadp. L'objectif de ce travail cristallographique était de caractériser le mode de fixation du nadp dans des mutants de la gapdh glycolytique de bacillus stearothermophilus. Plusieurs résidus du site de fixation du nad de l'enzyme glycotique ont été substitués pour inverser sa spécificité vers nadp : - les résidus 33 a 35, 187 et 188 ont été mutés par les résidus correspondants dans les séquences des gapdh chloroplastiques - l'acide aspartique 32 a été muté pour éliminer les répulsions électrostatiques avec le phosphate supplémentaire du nadp situé en position 2' du ribose de l'adénosine. Les structures du triple mutant d32g-s (d32g, l187a, p188s) et du quintuple mutant b-s (l33t, t34g, d35g, l187a, p188s) complexés avec nad#+ et nadp#+ ont été résolues. Les limites de résolution obtenues sont comprises entre 2.5 et 2.2 a. Les résultats structuraux apparaissent en parfait accord avec ceux obtenus en enzymologie et par rmn : - la reconnaissance efficace du nadp#+ par le mutant d32g-s est en partie due à l'élimination de la répulsion électrostatique intra sous-unité (d32g) et à l'élimination des contraintes stérique inter sous-unité (l187a, p188s). De plus, le 2'-phosphate est stabilisé par la chaine latérale du résidu s188 nouvellement introduit. En comparant avec les sites de fixation du nadp naturels connus, ce résultat montre que la présence d'un résidu chargé positivement n'est pas absolument nécessaire pour inverser la sélectivité de cofacteur de nad vers nadp. - dans le mutant b-s, la faible affinité de l'enzyme de type sauvage pour nadp#+ semble subsister essentiellement en raison de la répulsion électrostatique entre le 2'-phosphate et le carboxylate du résidu d32. Ainsi, le mutant b-s ne mime pas efficacement les gapdh chloroplastiques, et les effets à longue distance et/ou de second ordre, difficiles à mettre en évidence, doivent être pris en compte pour obtenir un mutant de la gapdh cytosolique se comportant comme la dgpdh chloroplastique
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