Viral Evolution and Immune Responses

Antiviral responses are activated rapidly after viral infection in order to control and prevent dissemination of the virus. Different pathways are activated in the immune system, including innate and adaptive responses. On the other hand, viruses have evolved specifi c strategies to evade these responses. Due to the high viral evolutionary rates, escape variants can emerge and spread fast in the population. The co-evolution between viruses and their host is a constant arms race, and is of special interest to understand the viral escape mechanisms that may guide the future development of antiviral treatments and vaccines

Virus-Host Coevolution as a Tool for Controlling Bacterial Resistance to Phage Therapy

Bacterial resistance to antibiotics is a global public health concern. New treatments are needed to combat resistant strains, among which phage therapy is a promising option. Probably the main advantages of phage therapy are its high specificity as well as rapid viral adaptability, which in principle allows using phage evolution to overcome resistance. Here, we have performed serial coevolution passages between Escherichia coli and its phage T7 to investigate the ability of coevolved phages to reduce the emergence of resistances. We find that the initial bacterial population is less likely to undergo resistance when challenged with experimentally coevolved phages than when challenged with the wild-type phage. Hence, our findings suggest that coevolved phage preparations could be used to increase the efficacy of phage therapy

Estudio de soluciones para mejora de terraplén sobre el que asienta la plataforma ferroviaria entre los P.K. 133+800 y 133+925 de la línea Teruel-Sagunto en el T.M de Teruel

[EN] Study of solutions for the resolution of the detected settlement problems on the embankment of the platform railway of the Teruel T.M. Three possible solutions for the resolution of the problem described are technically and echonomically valued. The first (solution A) it's based on the execution of micropiled platforms, the second (solution B) consists of the ground improvement with stone columns and the third (solution C) it is based on the ground improvement with controled modul columns. After the definition of each one, the option A is considered the optimal solution, being more technicaly effective and just 10% more expensive than the others.[CA] Estudi de solucions per a la resolució dels problemes de seient detectats en terraplè de la plataforma ferroviària del T.M. de Terol. En aquest és valora'n tècnica i econòmicament tres solucions aptes per al problema presentat. La primera (solució A) es basa en l'execució de plataformes micropilotades, la segona (sol·lució B) en la millora del terreny mitjançant columnes de grava i la tercera (solució C) en la millora del terreny mitjançant columnes de mòdul controlat. Després de l'estudi i definició de les mateixes es considera que la més òptima és la A, sent la més eficaç a l'hora de resoldre els problemes de seient i a penes superant un 10% el cost de les otres.[ES] Estudio de soluciones para la resolución de problemas de asiento detectados en terraplén de la plataforma ferroviaria del T.M. de Teruel. En este se valoran técnica y económicamente tres soluciones aptas para el problema presentado. La primera (solución A) basada en la ejecución de plataformas micropilotadas, la segunda (solución B) en la mejora de terreno mediante columnas de grava y la tercera (solución C) en la mejora del terreno mediante columnas de módulo controlado. Tras el estudio y definición de las mismas se considera que la más óptima es la A, siendo más eficaz a la hora de solventar los problemas de asiento y apenas superando en un 10% el coste de las otras.Calap Quintana, G. (2019). Estudio de soluciones para mejora de terraplén sobre el que asienta la plataforma ferroviaria entre los P.K. 133+800 y 133+925 de la línea Teruel-Sagunto en el T.M de Teruel. http://hdl.handle.net/10251/127765Archivo delegad

Efectos mutacionales, evolución y adaptación en bacteriófagos de RNA y DNA de cadena sencilla

Las dificultades que plantean los virus para su control se deben, en gran medida, a su rápida evolución. Factores responsables de esta rápida evolución son su rápida tasa de replicación, sus elevados tamaños poblacionales y su elevada variabilidad genética. Estos dos últimos factores aumentan la efectividad de la selección natural, permitiendo a los virus escapar no sólo a las defensas del hospedador, sino también a los fármacos antivirales o de las vacunas. La mutación es la fuente última de variación genética. Por ello, la tasa de mutación es un parámetro fundamental para entender la evolución. No obstante, la relación entre tasa de mutación y adaptación no es inmediata. Por un lado, la producción de variación genética es indispensable para la adaptación, pero por otro lado, las mutaciones son más a menudo deletéreas que beneficiosas, de modo que, en promedio, tienden a reducir la eficacia biológica de las poblaciones (carga genética. La teoría predice que, como consecuencia del balance entre adaptación y carga genética, debe existir un valor intermedio para la tasa de mutación que maximiza el éxito evolutivo. Los virus de ARN presentan las mayores tasas de mutación por sitio nucleotídico descritas, órdenes de magnitud superiores a las de los virus de ADN y los demás genomas de ADN. Aún así, las diferencias en tasas de evolución en la naturaleza son a veces similares entre virus de ARN y ADN, y algunas propiedades de los genomas virales pueden ser debidas no a su material genético, sino al hecho de presentar pequeños genomas, por los que virus de ARN y ADN de cadena sencilla pueden compartir características, y en este caso, la evolución experimental es una herramienta muy útil para poder comparar directamente distintas especies virales. El objetivo central de la tesis es comparar las propiedades evolutivas de virus de ARN y ADN de cadena sencilla. Para ello se han escogido seis especies virales, tres de ARN (Qβ, MS2 y SP), y tres de ADN (ФX174, G4 y f1), todos ellos de cadena sencilla; con el fin de determinar si los efectos mutacionales difieren entre estos dos tipos de virus, si los virus de ARN se adaptan más rápido que los virus de ADN, si las tasas de mutación virales son óptimas para la adaptación, y qué ocurre cuando se aumenta artificialmente la tasa de mutación de virus de ARN y ADN de cadena sencilla.133 p

VIDEOJUEGO EN FASE ALFA

[ES] En este documento expondré mi trabajo final de grado, de carácter práctico, el cual consiste en el diseño y elaboración de los distintos niveles que aparecerán en un videojuego, actualmente en desarrollo, utilizando para ello el motor gráfico para videojue gos UNITY. El videojuego en cuestión, está siendo elaborado actualmente por una única persona. Debido a este hecho, las características de producción - recursos y personal - son limitadas, incluso para un juego de carácter independiente. He asumido la reali zación en solitario tanto de personajes, diseño, escenografía, modelado 3D, materiales, texturas, animación, sonido y programación. Este juego, de título por determinar, será una experiencia para un solo jugador. Ambientado en diferentes entornos, basados tanto en entornos reales como de propia creación imaginativa , el personaje ira avanzando por los distintos niveles utilizando su inteligencia, percepción y habilidad para llegar hasta el final del recorrido. Los niveles cuentan tanto con escenas de plataf ormas, como con laberintos, puzles y zonas de exploración. En cuanto al apartado artístico y gráfico, se ha optado por modelos de alto nivel de polígonos y un apartado visual realista (no fotorrealista), por este motivo estará destinado a equipos de gama m edia - alta , los requi sitos aparecerán más adelante en el apartado optimización, para poder mover con suavidad y con la máxima calidad gráfica la aplicación. Como resultado práct ico presentar é todos los niveles jugables realizados hasta la fecha dentro de un archivo ejecutable . El desarrollo de la historia no ir á vinculado con la presentación[EN] In this document I will show my pr actical final degree work, which consists in the use of the graphic engine UNITY to design and create the different levels of a videogame, currently in development . The game is currently being developed by a single person. Due to this fact, the characteristics of production - resources and staff - are limited, even for a n independent game. I have assumed character creation , design, set design, 3D modeling, materials, textures, animation, sound and programming. This game, now without title , will be a single - player experience. Set in different environments, based both in real and imaginary environments, the main character will move through the different levels using their intelligence, perception and ability to reach the end of the journey . The game l evels have platforms, mazes, puzzles and exploration areas. Regarding the artistic and graphic component, high - polygon models and realistic visuals (non - photorealistic) have been chosen. F or this reason, the game will be intended for mid - end computer. T he requirements to move smoothly and with maximum quality graphics this application will appear below in the optimization section . As a practical res ult I will present all levels, which contains the objects, characters and functions created up to date , within an executable file. The development of the story will not be part of the presentation.Calap Quintana, R. (2016). VIDEOJUEGO EN FASE ALFA. http://hdl.handle.net/10251/75126.TFG

Vigilancia de COVID 19 en aguas residuales

Utilidad de las aguas residuales como herramienta de vigilancia • Seguimiento temporal • Detección temprana? • Nuevos brotes? • Transmisión comunitaria? • ¿Grandes ciudades? ¿Pueblos? ¿Edificios? • ¿Residencias de ancianos o de estudiantes, colegios, prisiones? ¿Hoteles, cruceros? • Correlación con casos clínicos • Modelización • Predicción • Países no desarrollados • Falta de red de saneamiento • Puesta a punto de metología para futuras pandemiasS

Modelos de ataxia de Friedreich en Drosophila: identificación de candidatos terapéuticos y caracterización de un modelo portador de las repeticiones GAA

La ataxia de Friedreich es una enfermedad neurodegenerativa hereditaria que constituye la ataxia autosómica recesiva más común a nivel mundial. La ataxia de la marcha es el síntoma más temprano, pudiéndose encontrar otros síntomas neurológicos como disartria, disfagia o neuropatías ópticas y auditivas, y síntomas no neurológicos como deformidades esqueléticas, diabetes y cardiomiopatía hipertrófica. La enfermedad está causada en la mayoría de los pacientes por la presencia en homocigosis de una expansión patológica de las repeticiones del triplete GAA situadas en el intrón 1 del gen FXN. Dicha mutación provoca la represión transcripcional del gen y la reducción de los niveles de la proteína mitocondrial frataxina, cuya función está relacionada con la síntesis de los centros Fe-S. En este trabajo se ha utilizado un modelo de la enfermedad generado en D. melanogaster basado en la interferencia del gen fh, ortólogo en la mosca del gen FXN. Empleando dicho modelo, se ha realizado un rastreo farmacológico con el objetivo de identificar compuestos capaces de corregir los fenotipos causados por la deficiencia de frataxina. Entre los compuestos con un posible potencial terapéutico se identificó el inhibidor del complejo TORC1 rapamicina. El complejo TORC1 es un elemento regulador central de muchos procesos biosintéticos de la célula, entre otras funciones. El tratamiento con rapamicina es capaz de corregir los defectos motores de las moscas modelo y de incrementar su supervivencia, además de combatir el incremento en el estrés oxidativo encontrado en éstas induciendo la activación de defensas antioxidantes por medio del factor de transcripción Cnc, ortólogo del Nrf2 humano. Las moscas con deficiencia de frataxina también presentan una mayor sensibilidad a fuentes de estrés oxidativo exógeno como la hiperoxia. El tratamiento con rapamicina también es capaz de incrementar la resistencia de las moscas modelo a dichas condiciones, siendo la inducción del proceso de autofagia un mediador clave de este efecto. Los resultados obtenidos apuntan a la ruta de señalización del complejo TORC1 como una posible diana terapéutica para la ataxia de Friedreich. En este trabajo también se ha generado un nuevo modelo en D. melanogaster en adultos y células S2 basado en el efecto de un número patológico de repeticiones del triplete GAA sobre el gen reportero luciferasa de luciérnaga. De forma análoga al efecto observado sobre el gen FXN, la expansión de repeticiones del triplete GAA es capaz de reducir la expresión del gen reportero, produciendo un incremento en el estado de compactación de la cromatina que afecta de forma significativa al gen más cercano a la construcción, además de a ésta. Mediante el uso de diferentes modificadores genéticos en el modelo celular y de adultos, se ha observado que las modificaciones postraduccionales de histonas H3K9me3 y H3K27me3 pueden tener un papel relevante en la represión transcripcional mediada por las repeticiones GAA en D. melanogaster, de forma similar a lo observado en pacientes y otros modelos de la enfermedad. Los resultados obtenidos permitirán utilizar este nuevo modelo en un rastreo genético a gran escala para identificar elementos implicados en la represión del gen FXN

Estudi de viabilitat econòmica-financera per a la construcció d'una bassa de laminació d'aigües pluvials i xarxa separativa en el municipi de La Pobla Llarga (València)

[ES] Descripción: El municipio de La Pobla Llarga (Valencia) cuenta con problemas de inundaciones recurrentes durante los periodos de lluvias torrenciales de la comarca de La Ribera Alta a causa de una red de alcantarillado unitaria insuficiente y un punto de vertido de aguas pluviales en el cauce del Barranc de Barxeta por debajo de la cota de inundación de este, situación que impide el correcto desagüe de la red. Con el objeto de resolver los incidentes y daños ocasionados por dichos episodios se propone llevar a cabo un estudio de viabilidad económica-financiera de la construcción de una balsa de laminación y una red principal de colectores de pluviales. La construcción de la balsa de laminación supone la expropiación de terrenos destinados actualmente al cultivo de cítricos. Se trata por tanto de analizar los beneficios que proporciona la balsa de laminación frente a la producción de los campos de cultivo, de tal forma que las pérdidas económicas que supone la eliminación de estos campos de cultivos justifiquen los beneficios (en este caso el coste de los daños de las avenidas) que proporciona la balsa de laminación. Alcance: Estudio económico-financiero que justifique la necesidad de ejecución de una balsa de laminación junto con una red principal de colectores en parte del municipio de La Pobla Llarga. Se analiza el coste aproximado que supondría la ejecución de dicho proyecto y las pérdidas económicas que supone la supresión de los campos de cultivo en detrimento de la mitigación de daños ocasionados por los episodios de lluvias. Objetivos: Determinar los beneficios que proporciona una balsa de laminación y la red de colectores, frente al coste de la construcción y la pérdida que supone las zonas de sacrificio de los campos de cultivo. Proponer una solución a la problemática existente lo suficientemente definida como para realizar un análisis coste-beneficio de la solución propuesta, así como una planificación de implementación de esta Propuesta de índice: INTRODUCCIÓN 1.1. ANTECEDENTES 1.2. OBJETO 1.3. LOCALIZACIÓN 2. DESCRIPCIÓN DE LA SITUACIÓN ACTUAL 2.1. RED DE ALCANTARILLADO ACTUAL DEL MUNICIPIO DE LA POBLA LLARGA 2.2. PROBLEMÁTICA EXISTENTE 2.3. ESTIMACIÓN DE LOS COSTES DE INUNDACIÓN ACTUALES 3. DESCRIPCIÓN DE LA SOLUCIÓN PROPUESTA. (PROYECTO BÁSICO) 3.1. MEMORIA DESCRIPTIVA 3.2. DOCUMENTACIÓN GRÁFICA 3.3. VALORACIÓN ECONÓMICA 4. ANÁLISIS DE LA VIABILIDAD ECONÓMICO-FINANCIERA DEL PROYECTO 5. PLANIFICACION DE IMPLEMENTACIÓN DEL PROYECTO ANEXOS Plan de trabajo: - - Estimación de los costes ocasionados por las lluvias torrenciales en la situación actual - Definición de la solución propuesta - Valoración de los costes de ejecución de la solución propuesta - Análisis coste-beneficio de la solución propuesta - Planificación de implementación de la solución propuesta Materias relacionadas: - Administración y gestión de obras - Gestión de proyectos - Técnicas de programación de proyectos - Métodos y tecnologías avanzadas en obra[EN] Description: The town of La Pobla Llarga (Valencia) has recurrent flooding problems during periods of torrential rain in the region of La Ribera Alta due to an insufficient unitary sewerage network and a point of discharge of rainwater in the water course of the Barranc of Barxeta below the level of flooding of this, a situation that difficults the correct drainage of the network. In order to resolve the incidents and damages caused by these episodes, it is proposed to carry out an economic-financial viability study of the construction of a retention pond and a main network of rainwater collectors. The construction of the retention pond involves the expropriation of land currently used for citrus cultivation. Therefore, the aim is to analyze the benefits provided by the retention pond compared to the production of the crop fields, in such a way that the economic losses involved in the elimination of these crop fields justify the benefits (in this case the cost of flood damage) provided by the retention pond.Calap Quintana, G. (2022). Estudio de viabilidad económica-financiera para la construcción de una balsa de laminación de aguas pluviales y red separativa en el municipio de La Pobla Llarga (Valencia). Universitat Politècnica de València. http://hdl.handle.net/10251/18888

Estudio de la influencia del injerto en pimiento (Capsicum spp.) frente a estrés salino

[EN] Salinity is one of the biggest environmental problems in horticulture. Grafting is presented as a sustainable and respectful technique with the environment. The grafting implementation as an alternative goes through the selection of a good combination of rootstocks and varieties with a good adaptation to stress conditions, in this case salt stress, with an optimum production and quality. In this work, 6 combinations of pepper genotypes (Capsicum spp.) were analyzed: the commercial variety Adige, the accessions A5 and A7 and the graft of the cultivar variety onto itself, as well as onto each of the rootstocks used. These genotypes were studied both, in the germination phase and in the vegetative growth phase, under salinity conditions, using different salinity treatments with different electric conductivity (CE). In order to evaluate the salinity influence on the germination of the used genotypes, a germination essay of them was done first of all. With the objective of evaluating the graft influence over salinity stress, in this study different vegetative parameters were analyzed: plant height, leaves dry weight, stem dry weight, root dry weight and the ratio ((leaves dry weight+ stem dry weight)/ root dry weight); as well as the osmotic potential and the photosynthesis to evaluate the salinity tolerance to the different studied genotypes. As conclusion, taking into account the results, the graft presents better results compared to the ungrafted plants in every cases. The best results, are obtained with the combination Adige/A5. For this reason, the accession A5, could be select to use in breeding programs to improve the salt stress in pepper. For that, is necessary to realize more experiments to understand their physiological and agronomic behavior.[ES] La salinidad es uno de los mayores problemas medio ambientales al que tienen que hacer frente los cultivos. El injerto se presenta como una técnica sostenible y respetuosa con el medio ambiente. La implementación del injerto como una alternativa pasa por la selección de una buena combinación patrón/variedad que tenga una buena adaptación a los estreses, en este caso salino, con una óptima producción y calidad. En este trabajo se analizaron 6 combinaciones de genotipos de pimiento (Capsicum spp): la variedad comercial Adige, las accesiones A5 y A7 y el injerto de la variedad cultivada sobre si misma, así como sobre cada uno de los patrones empleados. Estos genotipos se estudiaron tanto en fase de germinación como en fase de crecimiento vegetativo bajo condiciones de estrés salino, empleando diferentes tratamientos salinos a distintas conductividades eléctricas (CE). Para evaluar la influencia de la salinidad sobre la germinación de los genotipos empleados en el estudio, en primer lugar se llevó a cabo un ensayo de germinación de los mismos. Con el objetivo de evaluar la influencia del injerto frente al estrés salino, en este trabajo se estudiaron distintos parámetros vegetativos: altura de la planta, peso seco de las hojas, peso seco del tallo, peso seco de las raíces y el ratio ((peso seco hojas+peso seco tallo)/peso seco raíces); así como el potencial osmótico y la fotosíntesis, para poder evaluar la tolerancia a la salinidad de los distintos genotipos estudiados. De los resultados se concluye, que en todos los casos, el injerto presenta mejores resultados frente a las plantas sin injertar, siendo la combinación Adige/A5 la que mejores resultados presenta. Es por ello, por lo que se podría seleccionar la accesión A5 para su uso en mejora de pimiento frente a estrés salino, siempre y cuando se realizasen estudios más exhaustivos para conocer mejor su comportamiento a nivel fisiológico y agronómicoDomingo Calap, ML. (2014). Estudio de la influencia del injerto en pimiento (Capsicum spp.) frente a estrés salino. http://hdl.handle.net/10251/51125Archivo delegad

Diseño de una propuesta didáctica para 2º de bachillerato sobre el aprendizaje del metabolismo

El aprendizaje de las ciencias en nuestro país presenta serias deficiencias y parece empeorar año tras año. Los estudiantes de 2º de Bachillerato se encuentran especialmente con dificultades para comprender e integrar los contenidos relacionados con el estudio del metabolismo. Teniendo como punto de partida una perspectiva constructivista de la enseñanza, en este Trabajo de Fin de Master se ha diseñado una propuesta de unidad didáctica que intente ayudar a los estudiantes en el aprendizaje del metabolismo. En ella se han desarrollado actividades que intentarán mejorar los procesos de aprendizaje, pero también se ha puesto especial atención a los materiales de estudio. Estos presentan una selección de contenidos que intentan recoger con precisión lo que los estudiantes deberían aprender, intentando no sobrecargar a los alumnos con información adicional. La gran variedad de herramientas y recursos digitales presentes en la actualidad permiten diseñar materiales capaces de integrar y presentar los contenidos de forma más eficaz que un libro de texto convencional. Temas de especial complejidad, como el metabolismo, son un objetivo ideal para intentar desarrollar nuevas propuestas didácticas que favorezcan su aprendizaje.Science learning in our country has serious deficiencies and seems to get worse year after year. Second year high school students find it especially difficult to understand and integrate the contents related to the study of metabolism. Taking as a starting point a constructivist perspective on teaching, in this Master's End Project a proposal for a didactic unit has been designed to try helping students to learn metabolism. In this proposal, different activities have been developed to improve learning processes, but special attention has also been paid to the studying materials. These present a selection of content that try to collect precisely what students should learn, trying not to overload them with additional information. The wide variety of tools and digital resources present today make it possible to design materials capable of integrating and presenting content more effectively than a conventional textbook. Topics of special complexity, such as metabolism, are an ideal objective to try to develop new didactic proposals that favor their learning