Nonlinear feature extraction through manifold learning in an electronic tongue classification task

A nonlinear feature extraction-based approach using manifold learning algorithms is developed in order to improve the classification accuracy in an electronic tongue sensor array. The developed signal processing methodology is composed of four stages: data unfolding, scaling, feature extraction, and classification. This study aims to compare seven manifold learning algorithms: Isomap, Laplacian Eigenmaps, Locally Linear Embedding (LLE), modified LLE, Hessian LLE, Local Tangent Space Alignment (LTSA), and t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding (t-SNE) to find the best classification accuracy in a multifrequency large-amplitude pulse voltammetry electronic tongue. A sensitivity study of the parameters of each manifold learning algorithm is also included. A data set of seven different aqueous matrices is used to validate the proposed data processing methodology. A leave-one-out cross validation was employed in 63 samples. The best accuracy (96.83%) was obtained when the methodology uses Mean-Centered Group Scaling (MCGS) for data normalization, the t-SNE algorithm for feature extraction, and k-nearest neighbors (kNN) as classifier.Peer ReviewedPostprint (published version

Estimación de secuestro de carbono en los rodales de Puya Raimondii Harms en el Santuario Nacional de Calipuy

La Puya Raimondii Harms es una especie cuyas propiedades y procesos fenológicos contribuyen a la regulación de los servicios ambientales, en la actualidad está considerada en peligro de extinción y que por sus propias características no pueden crecer en todo el Perú actualmente el Santuario Nacional de Calipuy alberga los rodales más densos del territorio peruano de la puya raymondii harms con más de 6000ejemplares. La presente investigación se realizó con la finalidad de “Estimar la cantidad de secuestro de carbono por los rodales de puya raimondii harms según densidades forestales y estados de desarrollo en el Santuario Nacional de Calipuy, Santiago de Chuco”, para lo cual se utilizó la metodología semidestructivo aplicada tras la estratificación según densidades forestales y estados de desarrollo. Se desarrolló en 3 faces: trabajo en campo, trabajo en laboratorio y trabajo de gabinete. Concluyendo que el total de carbono almacenado por unidad de área y estados de desarrollo en los rodales de Puya Raimondii Harms del Santuario Nacional de Calipuy es de 135 tnC/ha(en el mismo formato) con un flujo anual promedio de 11 t2/ha/año, que hacen un total de 162 991 t2fijado a la actualidad y Las cantidades de almacenamiento de carbono según estratos forestales de densidad muy alta, alta, media, baja y muy baja son de 54, 38, 16, 22 y 4 tnC/ha, que hacen un total de 1954, 7591, 5984, 15486y 13394 tnC; respectivamente

Propuesta de mejora en gestión de producción y calidad aplicando herramientas Lean Manufacturing para reducir costos operativos en la empresa Nathanael SAC, Trujillo - 2022

La presente tesis trata de proponer una mejora de las áreas de producción y calidad para reducir los costos de la empresa Nathanael SAC. El tipo de metodología empleada fue aplicada – cuantitativa y el diseño fue propositiva – diagnóstica. Los instrumentos de recolección de datos fueron la observación directa, una encuesta y el análisis documental. La recopilación de los datos permitió diagnostica que el área de producción y de calidad no cuenta con una eficiente gestión en la línea de producción de espárrago blanco. Asimismo, los empleados de las áreas de producción y calidad mencionaron que nunca recibieron capacitaciones par parte de la empresa. La propuesta tuvo como base de mejora a las herramientas Lean Manufacturing, entre las cuales se aplicaron: Metodología 5S, Metodología TPM – Plan de Mantenimiento Preventivo, Metodología Heijunka, Gráficas de Control y Estandarización y Plan de Capacitaciones; con las cuales permitieron reducir los costos operativos de S/ 97,628.74 a S/ 7,810.30, permitiéndole a la empresa Nathanael SAC un beneficio económico de S/ 89,818.44. La evaluación económico financiera de la propuesta permitió determinar que esta fue viable, dando como resultados los siguientes valores: un VAN de S/ 34,614.11, una TIR del 55.52% y un PRI de 5 meses. Asimismo, el B/C fue de S/ 1.22

Análisis en redes sociales de la campaña #Másunidosquenunca, realizada por Entel-Perú en la Teletón 2015

La presente investigación “Análisis en redes sociales de la campaña #MásUnidosQueNunca, realizada por Entel-Perú en la Teletón 2015”, tiene como finalidad, analizar la conmoción que generó en su público las distintas formas de publicidad presente en plataformas virtuales, señalar los índices de popularidad, el alcance de sus publicaciones y descubrir el tratamiento de la información que se brindó. Asimismo, se considera analizar los indicadores de alcance y, cómo quiso impactar Entel – Perú en la conciencia de los peruanos para colaborar con los niños de la Teletón 2015

Geographical variation in relative risks associated with heat: Update of Spain's Heat Wave Prevention Plan

A decade after the implementation of prevention plans designed to minimise the impact of high temperatures on health, some countries have decided to update these plans in order to improve the weakness detected in these ten years of operation. In the case of Spain, this update has fundamentally consisted of changing the so-called "threshold" or "trigger" temperatures used to activate the plan, by switching from temperature values based on climatological criteria to others obtained by epidemiological studies conducted on a provincial scale. This study reports the results of these "trigger" temperatures for each of Spain's 52 provincial capitals, as well as the impact of heat on mortality by reference to the relative risks (RRs) and attributable risks (ARs) calculated for natural as well as circulatory and respiratory causes. The results obtained for threshold temperatures and RRs show a more uniform behaviour pattern than those obtained using temperature values based on climatological criteria; plus a clear decrease in RRs of heat-associated mortality due to the three causes considered, at both a provincial and regional level as well as for Spain as a whole. The updating of prevention plans is regarded as crucial for optimising the operation of these plans in terms of reducing the effect of high temperatures on population health.This study was supported by grants FIS ENPY 1001/13 & SEPY 1037/14 from Spain's Health Research Fund.S

Padrões eletrocardiográficos em pacientes com doença de Chagas no sul da cidade de Salta

Introducción. Los pacientes con serología positiva para enfermedad de Chagas pueden presentar en su evolucióndiferentes lesiones eléctricas que difieren de acuerdo a la distribución geográfica del Trypanosoma cruzi.Objetivos. Determinar qué lesiones electrocardiográficas se observan en pacientes que residen en zona sur de la ciudadde Salta (Salta, Argentina).Materiales y métodos. Se realizó un estudio prospectivo y observacional desde el 10/11/2013 hasta 29/02/2016, enel servicio de cardiología del Hospital Papa Francisco localizado en zona sur de la ciudad de Salta (Salta, Argentina).A todos los pacientes se les realizó historia clínica, electrocardiograma de 12 derivaciones y se les diagnosticóenfermedad de Chagas con dos reacciones serológicas positivas HAI y Elisa. Se utilizó el Consenso Internacional deChagas del año 2010. Variable estadística: porcentaje.Resultados. Fueron evaluados 400 pacientes con epidemiología positiva para enfermedad de Chagas de los cuales110 tuvieron diagnóstico de enfermedad de Chagas: 59 (54%) pacientes de sexo femenino con promedio de edad paraambos sexos de 47 años. La enfermedad de Chagas crónica sin patología demostrada se presentó en 60 (55%) pacientes,edad promedio de 45 años, la enfermedad de Chagas crónica con patología demostrada en 50 (45%) pacientes, conedad promedio de 59 años. El patrón electrocardiográfico más frecuente en la población analizada fue el HBAI+BRD.Conclusión. El patrón electrocardiográfico más frecuente en la población analizada fue HBAI+BRD, predominandoen la consulta el sexo femenino.Introduction. In patients with positive serology for Chagas disease, different electrical injuries can occur during their evolution, and they differ according to the geographical distribution of Trypanosoma cruzi. Objectives. To determine which electrocardiographic lesions have seen in patients living in south of Salta city (Salta, Argentine) Materials and methods. A prospective observational study was conducted from 11/10/2013 to 02/29/2016, at the cardiology department of Pope Francisco Hospital located in southern part of Salta city. All patients underwent a complete clinical history, 12-lead electrocardiogram and diagnosed with Chagas disease by two positive serological reactions: HAI and Elisa. The International Consensus of Chagas disease 2010 was used. Statistical variable: the percentage was used. Results. We evaluated 400 patients with positive epidemiology for Chagas disease, 110 were finally diagnosed with Chagas disease; 59 (54%) female patients, the average age for both sexes was 47 years. Chronic Chagas disease without proven structural pathology occurred in 60 (55%) patients, average age 45 years. Chronic Chagas disease with structural damage 50 (45%) average age of 59 years, the most frequent electrocardiographic pattern in the analyzed population was LAHB + RBB. Conclusion. The most frequent electrocardiographic pattern in the analyzed population was LAHB + RBB, predominating in our consultation females patients.Antecedentes. Os pacientes com sorologia positiva para doença de Chagas pode ocorrer em sua evolução diferente lesões elétricas diferem de acordo com a distribuição geográfica das Trypanosoma cruzi. Objetivos. Determinar quais lesões eletrocardiogramas são vistas em pacientes residentes no sul da cidade de Salta (Salta, Argentina). Materiais e métodos. Um estudo observacional prospectivo foi realizado de 10/11/2013 a 29/02/2016, no departamento de cardiologia do Hospital Papa Francisco localizado na parte sul da cidade de Salta (Salta, Argentina). Todos os pacientes foram submetidos à história clínica, eletrocardiograma de 12 derivações e foram diagnosticados com a doença de Chagas com duas reações sorológicas positivas: HAI e Elisa. Consenso Internacional Chagas 2010. Estatísticas de variáveis: a percentagem foi usada. Resultados. Foram avaliados 400 pacientes com epidemiologia positiva para doença de Chagas dos quais 110 foram diagnosticados com Chagas: 59 (54%) pacientes do sexo feminino, com idade média para ambos os sexos de 47 anos. Doença de Chagas crônicas sem patologia comprovada ocorreu em 60 (55%) pacientes, com idade média de 45 anos. Doença de Chagas crônica demonstrada em 50 (45%) pacientes com idade média de 59 anos. O padrão eletrocardiográfico mais frequente na população analisada foi HBAE + BRD. Conclusão. O padrão eletrocardiográfico mais frequente na população analisada foi HBAE + BRD, predominando no sexo feminino de consulta.Fil: Nuñez Burgos, Aida. Gobierno de la Provincia de Salta. Ministerio de Salud Publica. Hospital Papa Francisco.; ArgentinaFil: Ortega, Marisa. Gobierno de la Provincia de Salta. Ministerio de Salud Publica. Hospital Papa Francisco.; ArgentinaFil: Borgatta, Marianela. Gobierno de la Provincia de Salta. Ministerio de Salud Publica. Hospital Papa Francisco.; ArgentinaFil: Cossio, María Eugenia. Gobierno de la Provincia de Salta. Ministerio de Salud Publica. Hospital Papa Francisco.; ArgentinaFil: Nuñez Burgos, Julio. Gobierno de la Provincia de Salta. Ministerio de Salud Publica. Hospital Papa Francisco.; ArgentinaFil: Leon de la Fuente, Ricardo Alfonso. Gobierno de la Provincia de Salta. Ministerio de Salud Publica. Hospital Papa Francisco.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

A geometric network model of intrinsic grey-matter connectivity of the human brain

Network science provides a general framework for analysing the large-scale brain networks that naturally arise from modern neuroimaging studies, and a key goal in theoretical neuro- science is to understand the extent to which these neural architectures influence the dynamical processes they sustain. To date, brain network modelling has largely been conducted at the macroscale level (i.e. white-matter tracts), despite growing evidence of the role that local grey matter architecture plays in a variety of brain disorders. Here, we present a new model of intrinsic grey matter connectivity of the human connectome. Importantly, the new model incorporates detailed information on cortical geometry to construct ‘shortcuts’ through the thickness of the cortex, thus enabling spatially distant brain regions, as measured along the cortical surface, to communicate. Our study indicates that structures based on human brain surface information differ significantly, both in terms of their topological network characteristics and activity propagation properties, when compared against a variety of alternative geometries and generative algorithms. In particular, this might help explain histological patterns of grey matter connectivity, highlighting that observed connection distances may have arisen to maximise information processing ability, and that such gains are consistent with (and enhanced by) the presence of short-cut connections

Multidrug resistant pulmonary tuberculosis treatment regimens and patient outcomes: an individual patient data meta-analysis of 9,153 patients.

Treatment of multidrug resistant tuberculosis (MDR-TB) is lengthy, toxic, expensive, and has generally poor outcomes. We undertook an individual patient data meta-analysis to assess the impact on outcomes of the type, number, and duration of drugs used to treat MDR-TB

Potential Utility of Protein Targets of Cysteine-S-Nitrosylation in Identifying Clinical Disease Status in Human Chagas Disease

Trypanosoma cruzi (Tc) infection causes Chagas disease (ChD) presented by dilated cardiomyopathy and heart failure. During infection, oxidative and nitrosative stresses are elicited by the immune cells for control the pathogen; however, excess nitric oxide and superoxide production can result in cysteine S-nitrosylation (SNO) of host proteins that affects cellular homeostasis and may contribute to disease development. To identify the proteins with changes in SNO modification levels as a hallmark of ChD, we obtained peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from seronegative, normal healthy (NH, n = 30) subjects, and from seropositive clinically asymptomatic (ChD CA, n = 25) or clinically symptomatic (ChD CS, n = 28) ChD patients. All samples were treated (Asc+) or not-treated (Asc−) with ascorbate (reduces nitrosylated thiols), labeled with the thiol-labeling BODIPY FL-maleimide dye, resolved by two-dimensional electrophoresis (total 166 gels), and the protein spots that yielded significant differences in abundance or SNO level at p-value of ≤ 0.05t−test/Welch/BH were identified by MALDI-TOF/TOF MS or OrbiTrap LC-MS/MS. Targeted analysis of a new cohort of PBMC samples (n = 10–14/group) was conducted to verify the differential abundance/SNO levels of two of the proteins in ChD (vs. NH) subjects. The multivariate adaptive regression splines (MARS) modeling, comparing differences in relative SNO level (Asc−/Asc+ ratio) of the protein spots between any two groups yielded SNO biomarkers that exhibited ≥90% prediction success in classifying ChD CA (582-KRT1 and 884-TPM3) and ChD CS (426-PNP, 582-KRT1, 486-ALB, 662-ACTB) patients from NH controls. Ingenuity Pathway Analysis (IPA) of the SNO proteome dataset normalized to changes in protein abundance suggested the proteins belonging to the signaling networks of cell death and the recruitment and migration of immune cells were most affected in ChD CA and ChD CS (vs. NH) subjects. We propose that SNO modification of the select panel of proteins identified in this study have the potential to identify ChD severity in seropositive individuals exposed to Tc infection