第1058回千葉医学会例会・整形外科例会

Accessions of the WOSR populations. (XLSX 13 kb

Extracorporeal Membrane Oxygenation for Severe Acute Respiratory Distress Syndrome associated with COVID-19: An Emulated Target Trial Analysis.

RATIONALE: Whether COVID patients may benefit from extracorporeal membrane oxygenation (ECMO) compared with conventional invasive mechanical ventilation (IMV) remains unknown. OBJECTIVES: To estimate the effect of ECMO on 90-Day mortality vs IMV only Methods: Among 4,244 critically ill adult patients with COVID-19 included in a multicenter cohort study, we emulated a target trial comparing the treatment strategies of initiating ECMO vs. no ECMO within 7 days of IMV in patients with severe acute respiratory distress syndrome (PaO2/FiO2 <80 or PaCO2 ≥60 mmHg). We controlled for confounding using a multivariable Cox model based on predefined variables. MAIN RESULTS: 1,235 patients met the full eligibility criteria for the emulated trial, among whom 164 patients initiated ECMO. The ECMO strategy had a higher survival probability at Day-7 from the onset of eligibility criteria (87% vs 83%, risk difference: 4%, 95% CI 0;9%) which decreased during follow-up (survival at Day-90: 63% vs 65%, risk difference: -2%, 95% CI -10;5%). However, ECMO was associated with higher survival when performed in high-volume ECMO centers or in regions where a specific ECMO network organization was set up to handle high demand, and when initiated within the first 4 days of MV and in profoundly hypoxemic patients. CONCLUSIONS: In an emulated trial based on a nationwide COVID-19 cohort, we found differential survival over time of an ECMO compared with a no-ECMO strategy. However, ECMO was consistently associated with better outcomes when performed in high-volume centers and in regions with ECMO capacities specifically organized to handle high demand. This article is open access and distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial No Derivatives License 4.0 (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)

Genetic architecture of seed yield and its components in winter oilseed rape (Brassica napus L.) grown under limiting nitrogen condition

L'augmentation de la production d'huile de colza (Brassica napus L.) pour répondre à la demande alimentaire et industrielle exige d'optimiser le rendement dans un contexte de réduction des intrants, notamment azotés. Les approches de génétique offrent une voie pour répondre à ces enjeux. En effet, la connaissance des régions génomiques (QTLs) et des mécanismes qui contrôlent l'élaboration des composantes du rendement sous contrainte azotée est un prérequis à la création variétale. Dans ce contexte, les questions de recherche posées dans cette thèse sont les suivantes: i) quelle est l'architecture génétique du rendement en huile chez le colza cultivé en bas intrants azotés?, ii) quelles sont les interactions des QTLs avec l'environnement et plus particulièrement avec l'intensité du stress azoté?, et iii) comment la combinaison de données agronomiques, génétiques et génomiques peut-elle contribuer à l'amélioration de caractères d'intérêt chez le colza? Une stratégie de détection de QTLs par analyse de liaison et analyse d'association a été mise en place sur deux populations biparentales et un panel de colzas d'hiver. Ces populations ont été expérimentées sur sept lieux et six années de culture (2009-2014) en condition de nutrition azotée limitante ou suffisante. Pour chaque essai, sept caractères phénotypiques relatifs à l'élaboration du rendement ont été mesurés. Peu d'interactions génotype × azote ont été détectées sur les caractères étudiés et un nombre important de QTLs a été retrouvé dans les deux conditions azotées. A l'inverse, de fortes interactions génotype × environnement ont été mises en évidence pour la majorité des caractères et les QTLs étaient pour la plupart spécifiques d'un lieu de culture. Dix régions génomiques d'importance, stables entre environnement et populations ont ainsi été identifiés et leur organisation structurale dans le génome du colza a été analysée. Le contrôle génétique de la teneur en huile des graines de colza a ensuite été étudié en combinant à la fois les informations de dix études indépendantes, les informations procurées par la récente publication du génome de B. napus et la recherche de variabilité haplotypique dans une région d'intérêt identifiée sur le chromosome A1 dans une population de colzas d'hiver.The increase of rapeseed (Brassica napus L.) oil production to answer the demand for human consumption and industrial applications requires the optimisation of seed yield in a context of reduction of inputs, including the nitrogen fertilization. Genetic approaches are a way to respond to this challenge. Indeed, determining the genomic regions (QTLs) and mechanisms controlling seed yield components under nitrogen limitation is a prerequisite for plant breeding programs. In this context, the scientific questions raised in this thesis are: i) what is the genetic architecture of seed yield components in rapeseed grown under limiting nitrogen condition? ii) how do the QTLs interact with the environment, and especially with the nitrogen stress?, and iii) how the combination of agronomic, genetic and genomic information can lead to the improvement of traits of interest in rapeseed? A strategy of QTL detection by linkage and linkage disequilibrium analyses was set up on two biparental populations and a winter oilseed rape diversity set. Those populations were trialled in seven location and six growing seasons (2009-2014) under low and sufficient nitrogen conditions. For each trial, seven seed yield-related traits were acquired. Few genotype × nitrogen condition interactions were detected and an important number of QTLs were common to the two nitrogen regimes. On the contrary, strong genotype × environment interactions were evidenced for most of the traits under study and the majority of the QTLs were location-specific. Ten critical genomic regions for yield associated traits stable through the environments and populations were identified and their structural organization in the rapeseed genome was investigated. The genetic control of oil content was then studied by combining the information from ten independent reports, the genomic information provided by the recent release of the B. napus genome and the haplotype variations among a winter oilseed rape population within one particular region identified on the A1 chromosome

Architecture génétique du rendement et de ses composantes chez le colza d’hiver (Brassica napus L.) cultivé sous contrainte azotée

The increase of rapeseed (Brassica napus L.) oil production to answer the demand for human consumption and industrial applications requires the optimisation of seed yield in a context of reduction of inputs, including the nitrogen fertilization. Genetic approaches are a way to respond to this challenge. Indeed, determining the genomic regions (QTLs) and mechanisms controlling seed yield components under nitrogen limitation is a prerequisite for plant breeding programs. In this context, the scientific questions raised in this thesis are: i) what is the genetic architecture of seed yield components in rapeseed grown under limiting nitrogen condition? ii) how do the QTLs interact with the environment, and especially with the nitrogen stress?, and iii) how the combination of agronomic, genetic and genomic information can lead to the improvement of traits of interest in rapeseed? A strategy of QTL detection by linkage and linkage disequilibrium analyses was set up on two biparental populations and a winter oilseed rape diversity set. Those populations were trialled in seven location and six growing seasons (2009-2014) under low and sufficient nitrogen conditions. For each trial, seven seed yield-related traits were acquired. Few genotype × nitrogen condition interactions were detected and an important number of QTLs were common to the two nitrogen regimes. On the contrary, strong genotype × environment interactions were evidenced for most of the traits under study and the majority of the QTLs were location-specific. Ten critical genomic regions for yield associated traits stable through the environments and populations were identified and their structural organization in the rapeseed genome was investigated. The genetic control of oil content was then studied by combining the information from ten independent reports, the genomic information provided by the recent release of the B. napus genome and the haplotype variations among a winter oilseed rape population within one particular region identified on the A1 chromosome.L'augmentation de la production d'huile de colza (Brassica napus L.) pour répondre à la demande alimentaire et industrielle exige d'optimiser le rendement dans un contexte de réduction des intrants, notamment azotés. Les approches de génétique offrent une voie pour répondre à ces enjeux. En effet, la connaissance des régions génomiques (QTLs) et des mécanismes qui contrôlent l'élaboration des composantes du rendement sous contrainte azotée est un prérequis à la création variétale. Dans ce contexte, les questions de recherche posées dans cette thèse sont les suivantes: i) quelle est l'architecture génétique du rendement en huile chez le colza cultivé en bas intrants azotés?, ii) quelles sont les interactions des QTLs avec l'environnement et plus particulièrement avec l'intensité du stress azoté?, et iii) comment la combinaison de données agronomiques, génétiques et génomiques peut-elle contribuer à l'amélioration de caractères d'intérêt chez le colza? Une stratégie de détection de QTLs par analyse de liaison et analyse d'association a été mise en place sur deux populations biparentales et un panel de colzas d'hiver. Ces populations ont été expérimentées sur sept lieux et six années de culture (2009-2014) en condition de nutrition azotée limitante ou suffisante. Pour chaque essai, sept caractères phénotypiques relatifs à l'élaboration du rendement ont été mesurés. Peu d'interactions génotype × azote ont été détectées sur les caractères étudiés et un nombre important de QTLs a été retrouvé dans les deux conditions azotées. A l'inverse, de fortes interactions génotype × environnement ont été mises en évidence pour la majorité des caractères et les QTLs étaient pour la plupart spécifiques d'un lieu de culture. Dix régions génomiques d'importance, stables entre environnement et populations ont ainsi été identifiés et leur organisation structurale dans le génome du colza a été analysée. Le contrôle génétique de la teneur en huile des graines de colza a ensuite été étudié en combinant à la fois les informations de dix études indépendantes, les informations procurées par la récente publication du génome de B. napus et la recherche de variabilité haplotypique dans une région d'intérêt identifiée sur le chromosome A1 dans une population de colzas d'hiver

Etude expérimentale des avalanches denses de neige sèche

Dry snow dense avalanches are gravity-driven non-turbulent flows in which there is no liquid water. The dynamic of such flows is thus governed by contacts in between snow grains. The motivation of the works presented here is to improve our knowledge of the snow rheology by applying the methods used by the community or granular media. To do so, an experimental set-up designed to perform free surface snow flows was installed in an altitude site. The velocity profiles measured in quasi-permanent and quasi-fully-developed flows are linear. This enabled us to establish a friction law and flowing law. Besides, the presence of snow agregates was emphasized. They have various sizes and are carried within the flow, mostly a its surface. avalanche, formalisme de Saint-Venant, rhéologie de la neige sèche, écoulements permanents uniformes, profils de vitesse, loi de friction, loi d'écoulement, agrégatsLes avalanches denses de neige sèche sont des écoulements non turbulents, descendants des pentes sous l'effet de leur propre poids, et dans lesquelles l'eau n'apparaît pas sous forme liquide. La dynamique d'un tel écoulement est alors gouvernée par les contacts entre les grains de neige. La motivation des présents travaux est d'améliorer notre compréhension de la rhéologie de la neige en appliquant les démarches employées par la communauté des milieux granulaires. Pour ce faire, un dispositif expérimental permettant de réaliser des écoulements de neige à surface libre a été installé sur un site d'altitude. La mise en évidence de profils de vitesse linéaires pour des écoulements quasi-permanents et quasi-uniformes a permis d'établir une loi de friction et une loi d'écoulement. D'autre part, la présence d'agrégats a été observée. Ceux-ci sont de tailles diverses et sont transportés par l'écoulement, préférentiellement à sa surface

Etude expérimentale des avalanches de neige dense : profils de vitesse d`un écoulement développé quasi-permanent

International audienceIn order to study channelled snow flows over rough surfaces, a laboratory scale experiment was installed at the col du lac blanc, a 2800 m high pass in the French Alps, near the Alpe d'Huez ski resort. It consists of a 0.2 m wide channel fed with snow by a motorized hopper. Both the slope of the channel and the feeding rate of the hopper can be modified. Sensors in the channel provide measurements of the velocity profile, the flow height and the shear and normal stresses at the bottom of the flow. Velocity profiles for different slopes are presented in this paper. Results indicate the presence of a highly active layer at the bottom. This layer is mainly responsible for the avalanche velocity, while the upper layer has a much smaller velocity gradient. A first interpretation of both layers is given.Etude expérimentale des avalanches de neige dense : profils de vitesse d`un écoulement développé quasi-permanent

Etude expérimentale des avalanches de neige dense : profils de vitesse d`un écoulement développé quasi-permanent

International audienceIn order to study channelled snow flows over rough surfaces, a laboratory scale experiment was installed at the col du lac blanc, a 2800 m high pass in the French Alps, near the Alpe d'Huez ski resort. It consists of a 0.2 m wide channel fed with snow by a motorized hopper. Both the slope of the channel and the feeding rate of the hopper can be modified. Sensors in the channel provide measurements of the velocity profile, the flow height and the shear and normal stresses at the bottom of the flow. Velocity profiles for different slopes are presented in this paper. Results indicate the presence of a highly active layer at the bottom. This layer is mainly responsible for the avalanche velocity, while the upper layer has a much smaller velocity gradient. A first interpretation of both layers is given.Etude expérimentale des avalanches de neige dense : profils de vitesse d`un écoulement développé quasi-permanent

Relation between the level of acoustic variability and the call social function in red-capped mangabeys

International audienceDespite a strong influence of genetic factors on the structuring of nonhuman primate vocalrepertoires, the last decade evidenced to some extent abilities in vocal plasticity. Snowdon etal. (1997) suggested a relation between the level of acoustic variability and the call function.The highest variability is expected in calls with an affiliative social value. But this hypothesishas rarely been tested. Here, we conducted a quantitative analysis of acoustic structures’variability and associated contexts of emission by studying the, still unknown, vocalrepertoire of red-capped mangabeys (Cercocebus torquatus torquatus). Seven adult males andseven adult females were studied in captivity. We found 13 structurally-different sound units(4 peculiar to females, 3 to males and 6 shared). These units were combined to form 12 calltypes (including 6 sex-specific) that were also contextually differentiable. Interestingly,females, who are more socially integrated than males, produced a higher number of call typesand unclassifiable graded acoustic structures. The highest level of inter- and intra-individualacoustic variability was found in the intra-group socially affiliative grunts and the lowest innon-affiliative calls like Wahoo alarm calls and inter-group Whoop-gobble loud calls. Anintermediate pattern of variability was found in food calls for instance. Thus, our data supportSnowdon et al.’s hypothesis