Analyse d'impact ex post de trente ans de recherche et développement sur les conditions de pré-abattage des ruminants

Cette analyse d’impact ex post démarre en 1984 et porte donc sur plus de 30 ans de travaux de R&D conduits par Idele et ses partenaires (MSA, DGAL, DGER, Interbev, INRAE, ADIV) sur les conditions de pré-abattage. Elle a été mise en œuvre par les méthodes ASIRPA et ImpresS. Ce cas concret a confirmé l’intérêt et l’applicabilité de ces méthodes, mais elles ont nécessité des adaptations, i) en renforçant la caractérisation des « bénéficiaires » directs comme indirects et ii) en confortant la structure du « récit d’impact ». Les connaissances opérationnelles destinées aux bouviers d'abattoirs et aux chauffeurs de camions transportant des animaux vivants, ont été valorisées sous forme i) de guides de bonnes pratiques et formations à la manipulation des animaux ; ii) de références pour la rénovation des bâtiments, utiles pour le plan de modernisation des abattoirs ; et iii) de spécifications pour l'aménagement des camions destinés au transport du bétail. Contribuant à l’élaboration de nouvelles réglementations sur le transport des animaux vivants, elles ont accompagné la mise en œuvre du règlement sur la protection animale dans les abattoirs. Ce déploiement a contribué à l’amélioration des bâtiments et des équipements de la zone de pré-abattage, mais aussi à l'appropriation de connaissances permettant aux bouviers de réduire les facteurs de stress liés à la manipulation. Les principaux impacts observables sont i) une contribution à la réduction des accidents (humains et animaux) ; ii) une meilleure rémunération des éleveurs ; iii) une amélioration de la qualité de la viande ; et iv) une contribution à construire un argumentaire de nature à rassurer les consommateurs

Integrative epigenomics in Sjögren´s syndrome reveals novel pathways and a strong interaction between the HLA, autoantibodies and the interferon signature

Primary Sjögren's syndrome (SS) is a systemic autoimmune disease characterized by lymphocytic infiltration and damage of exocrine salivary and lacrimal glands. The etiology of SS is complex with environmental triggers and genetic factors involved. By conducting an integrated multi-omics study, we confirmed a vast coordinated hypomethylation and overexpression effects in IFN-related genes, what is known as the IFN signature. Stratified and conditional analyses suggest a strong interaction between SS-associated HLA genetic variation and the presence of Anti-Ro/SSA autoantibodies in driving the IFN epigenetic signature and determining SS. We report a novel epigenetic signature characterized by increased DNA methylation levels in a large number of genes enriched in pathways such as collagen metabolism and extracellular matrix organization. We identified potential new genetic variants associated with SS that might mediate their risk by altering DNA methylation or gene expression patterns, as well as disease-interacting genetic variants that exhibit regulatory function only in the SS population. Our study sheds new light on the interaction between genetics, autoantibody profiles, DNA methylation and gene expression in SS, and contributes to elucidate the genetic architecture of gene regulation in an autoimmune population

Complement component C4 structural variation and quantitative traits contribute to sex-biased vulnerability in systemic sclerosis

Altres ajuts: Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER), "A way of making Europe".Copy number (CN) polymorphisms of complement C4 play distinct roles in many conditions, including immune-mediated diseases. We investigated the association of C4 CN with systemic sclerosis (SSc) risk. Imputed total C4, C4A, C4B, and HERV-K CN were analyzed in 26,633 individuals and validated in an independent cohort. Our results showed that higher C4 CN confers protection to SSc, and deviations from CN parity of C4A and C4B augmented risk. The protection contributed per copy of C4A and C4B differed by sex. Stronger protection was afforded by C4A in men and by C4B in women. C4 CN correlated well with its gene expression and serum protein levels, and less C4 was detected for both in SSc patients. Conditioned analysis suggests that C4 genetics strongly contributes to the SSc association within the major histocompatibility complex locus and highlights classical alleles and amino acid variants of HLA-DRB1 and HLA-DPB1 as C4-independent signals

Serum profiling identifies CCL8, CXCL13, and IL-1RA as markers of active disease in patients with systemic lupus erythematosus

IntroductionSystemic lupus erythematosus (SLE) is a clinically heterogeneous disease that presents a challenge for clinicians. To identify potential biomarkers for diagnosis and disease activity in SLE, we investigated a selected yet broad panel of cytokines and autoantibodies in patients with SLE, healthy controls (HC), and patients with other autoimmune diseases (AIDs).MethodsSerum samples from 422 SLE patients, 546 HC, and 1223 other AIDs were analysed within the frame of the European PRECISESADS project (NTC02890121). Cytokine levels were determined using Luminex panels, and autoantibodies using different immunoassays.ResultsOf the 83 cytokines analysed, 29 differed significantly between patients with SLE and HC. Specifically, CCL8, CXCL13, and IL-1RA levels were elevated in patients with active, but not inactive, SLE versus HC, as well as in patients with SLE versus other AIDs. The levels of these cytokines also correlated with SLE Disease Activity Index 2000 (SLEDAI-2K) scores, among five other cytokines. Overall, the occurrence of autoantibodies was similar across SLEDAI-2K organ domains, and the correlations between autoantibodies and activity in different organ domains were weak.DiscussionOur findings suggest that, upon validation, CCL8, CXCL13, and IL-1RA could serve as promising serum biomarkers of activity in SLE

O31 Integrative analysis reveals a molecular stratification of systemic autoimmune diseases

n/

Prévention et développements durables dans la filière du commerce du bétail : récit d'un accompagnement ergonomique par une démarche d'innovation anthropocentrée

International audienc

Analyse d'impact ex post de trente ans de recherche et développement sur les conditions de pré-abattage des ruminants

Cette analyse d’impact ex post démarre en 1984 et porte donc sur plus de 30 ans de travaux de R&D conduits par Idele et ses partenaires (MSA, DGAL, DGER, Interbev, INRAE, ADIV) sur les conditions de pré-abattage. Elle a été mise en œuvre par les méthodes ASIRPA et ImpresS. Ce cas concret a confirmé l’intérêt et l’applicabilité de ces méthodes, mais elles ont nécessité des adaptations, i) en renforçant la caractérisation des « bénéficiaires » directs comme indirects et ii) en confortant la structure du « récit d’impact ». Les connaissances opérationnelles destinées aux bouviers d'abattoirs et aux chauffeurs de camions transportant des animaux vivants, ont été valorisées sous forme i) de guides de bonnes pratiques et formations à la manipulation des animaux ; ii) de références pour la rénovation des bâtiments, utiles pour le plan de modernisation des abattoirs ; et iii) de spécifications pour l'aménagement des camions destinés au transport du bétail. Contribuant à l’élaboration de nouvelles réglementations sur le transport des animaux vivants, elles ont accompagné la mise en œuvre du règlement sur la protection animale dans les abattoirs. Ce déploiement a contribué à l’amélioration des bâtiments et des équipements de la zone de pré-abattage, mais aussi à l'appropriation de connaissances permettant aux bouviers de réduire les facteurs de stress liés à la manipulation. Les principaux impacts observables sont i) une contribution à la réduction des accidents (humains et animaux) ; ii) une meilleure rémunération des éleveurs ; iii) une amélioration de la qualité de la viande ; et iv) une contribution à construire un argumentaire de nature à rassurer les consommateurs

Vaccination contre la COVID-19 des patients atteints de cancer solide : revue et préconisations d’un inter-groupe oncologique français (CGO, TNCD, UNICANCER)

National audienceThe COVID-19 pandemic has a major impact at all stages of cancer treatment. Risk of death from COVID-19 in patients treated for a cancer is high. COVID-19 vaccines represent a major issue to decrease the rate of severe forms of the COVID-19 cases and to maintain a normal cancer care. It is difficult to define the target population for vaccination due to the limited data available and the lack of vaccine doses available. It appears theoretically important to vaccinate patients with active cancer treatment or treated since less than three years, as well as their family circle. In France, patients actually defined at "high risk" for priority access to vaccination are those with a cancer treated by chemotherapy. A panel of experts recently defined another "very high-priority" population, which includes patients with curative or palliative first or second-line chemotherapy, as well as patients requiring surgery or radiotherapy involving a large lung volume, lymph nodes and/or of hematopoietic tissue. Ideally, it is best to vaccinate before cancer treatment. Despite the lack of published data, COVID-19 vaccines can also be performed during chemotherapy by avoiding periods of bone marrow aplasia and if possible, to do it in cancer care centers. It is necessary to implement cohorts with immunological and clinical monitoring of vaccinated cancer patients. To conclude, considering the current state of knowledge, the benefit-risk ratio strongly favours COVID-19 vaccination of all cancer patients