Prediction of protein-protein interactions through support vector machines

En este artículo, se implementa un método basado en SVM para la predicción de interacciones proteína-proteína. Este modelo es inicialmente entrenado con un conjunto de más de 69.000 pares de secuencias de proteínas basado en interacciones positivas documentadas. Luego, Se realiza un método de validación cruzada para estimar la precisión del sistema, mostrando rendimientos aceptables en términos de sensibilidad, especificidad y media geométrica. los los resultados son aproximadamente equilibrados y el rendimiento general si alrededor del 70% se clasifica a través de un kernel por pares y los parámetros se establecen a través de una optimización de enjambre de partículas meta-heurística y mostrando resultados prometedores para el campo de la bioinformática.In this paper, a SVM-based method is implemented for the prediction of protein-protein interactions. This model is initially trained with a set of over 69.000 pairs of protein sequences based on documented positive interactions. Then, a cross-validation method is performed for estimating the accuracy of the system, showing acceptable performances in terms of sensitivity, specificity and geometric mean. The results are approximately balanced and the overall performance if around 70% classified through a pairwise kernel and the parameters are set through an particle swarm optimization meta-heuristic and showing promising results for the field of bioinformatics.Ingeniero Biomédicopregrad

Clasificación de patrones de aceleración relacionados con el bruxismo nocturno

En este proyecto se clasificaron movimientos de la boca capturados por una férula dental instrumentada con un acelerómetro de tres ejes. Los patrones fueron realizados en laboratorio, en un único sujeto, imitando movimientos relacionados con el bruxismo nocturno, y otras actividades que ocurren durante el sueño. El vector de características se construyó a partir del cepstro real de tramas de las señales y sus respectivas primeras diferencias. Con estos datos, se construyó un modelo de mezcla de Gaussianas para todas las señales de estudio, para posteriormente clasificar tramas de cada señal según el modelo. Las tramas individuales no pudieron separarse por este método, pero las agrupaciones de tramas presentaban distribuciones distintas que permitían la clasificación. Se utilizó la distancia de Kullback-Leibler como medida de divergencia entre distribuciones de referencia y de prueba, para luego clasificar mediante dos métodos. El primer método consistió en clasificar según la distancia mínima de la distribución de prueba a las de referencia. En el segundo, se utilizó una red neuronal cuyas entradas eran los vectores de distancias y sus rótulos.In this Project, movements of the mouth were captured by a dental splint instrumented with a three-axis accelerometer. The patterns were generated in a controlled environment, by a single subject, imitating movements related to sleep bruxism and other activities that occur during sleep. The feature vector was built with real cepstral coefficients and their respective first differences. With this data, a Gaussian mixture model was constructed for the whole set of signals, for their posterior classification using the same model. Individual signal frames could not be separated using this method, but groups of frames showed distinctive distributions that allowed their classification. As a measure of distance between reference and test distributions, Kullback-Leibler divergence was used, and later classified in two different ways. The first method consisted in classifying according to the minimum distance between the test distribution and the reference distributions. In the second method, a neural network was implemented, using the distance vectors and their targets as inputs.Magíster en Ingeniería ElectrónicaMaestrí

Dinámica de los predictores de adopción de Internet en Medellín

En este trabajo se propone analizar la dinámica del impacto asociado a algunos predictores de la adopción de internet en la ciudad de Medellín (Colombia), utilizando como base de datos la Encuesta de calidad de vida de Medellín (ECV) desde el año 2006 a 2014 -- Se analizarán que variables inciden en la tenencia de internet, se realizará la estadística descriptiva necesaria, y regresiones mediante los modelos Logit y Probit -- El acceso a internet aún se encuentra reservado para una parte privilegiada de la población que cuenta con suficiente ingreso para tener servicio en casa y computador -- Se evidenció igualmente que en la ciudad no hay presencia de brecha de género contrario a lo encontrado en la literatur

¿Crean valor los fondos de inversión colectiva colombianos enfocados en acciones?

Esta investigación evalúa el desempeño de 73 fondos de inversión colectiva (FIC) colombianos enfocados en acciones de 2005 a 2015 -- Para cuantificar el valor generado por estos fondos en comparación con sus respectivos activos de referencia (“benchmarks”), se calcula el alfa de Jensen mediante dos metodologías de regresión: Mínimos Cuadrados Ordinarios (MCO) y Regresión por Cuantiles -- También se analiza si estos fondos muestran evidencia de “market timing” o no, utilizando dos modelos: efecto cuadrático y variable binaria interactiva -- De igual manera, nuestro estudio propone la creación de una empresa privada en Colombia que provea a los inversores de información precisa sobre las características y desempeño histórico de estos fondos de inversión colectiva, como lo hace Morningstar Inc. en Estados Unidos -- Esto permitiría a los inversores seleccionar los fondos con mejores perspectivas y, como es de esperarse, haría este mercado más eficiente y atractivo para nuevos inversores potencialesIn this research we evaluate the performance of 73 Colombian stock mutual funds from 2005 to 2015 -- To quantify the value added by these funds compared to their respective benchmarks, Jensen’s alpha is calculated using two regression methodologies: Ordinary Least Squares (OLS) and Quantile Regression -- We also analyze whether these funds show any evidence of market timing -- We recommend the creation of a private firm in Colombia that would provide investors with accurate information about the features and historical performance of Colombian mutual funds, as Morningstar Inc. does in the USA -- This would enable investors to choose the best fund options andmake the mutural fund market more efficient and appealing to new potential investor

Participación Laboral en Ibagué

La alta tasa de participación laboral en Ibagué ha tenido como consecuencia que la tasa de desempleo en dicha ciudad haya sido la mayor en los últimos años en relación con las principales ciudades del país. Este trabajo presenta evidencia sobre los determinantes de la participación laboral de Ibagué para el período 2001 - 2005 y los compara con los determinantes de trece ciudades. Con base en la Encuesta Continua de Hogares se estiman tres modelos "probit" de participación: uno para el total de trece áreas, otro para Ibagué y uno conjunto en el que se diferencia a Ibagué del promedio nacional. En general, los signos de los coeficientes son los esperados. El hecho fundamental es la alta participación de las personas que integran los grupos de 12 a 17 años. La participación del grupo de edad de 18 a 23 años es también importante. La baja remuneración en el mercado laboral y la caída en el empleo formal (de personas no beneficiarias del subsidio monetario entregado por las Cajas de Compensación Familiar) son las dos hipótesis básicas para explicar el fenómeno de la alta participación en Ibagué. Sin embargo, queda por responder la pregunta del porqué no emigran a otras ciudades.oferta laboral, tasa de participación, modelos pooled - probit, Ibagué. Classification JEL: J22; C21.

Modelo de planeación para la Fundación Centro de Bienestar del Anciano Betsabé Arbeláez de Santa Rosa de Cabal

Este proyecto busca desarrollar diferentes estrategias y herramientas que junto con la planeación estratégica de la organización, también desarrollada, le permitan a la fundación Centro de Bienestar del anciano Betsabé Arbeláez convertirse en una entidad sostenible en el largo plazo, que está en mejora continua de sus procesos y que presta un servicio de alta calidad a los adultos mayores que allí residen. Para llegar a la creación de dicho proyecto, se realizaron una serie de actividades y análisis de todos los aspectos de la fundación tanto económicos, como financieros, legales, organizacionales, administrativos etc., que permitieron abordar y entender más a fondo las diferentes necesidades y retos que tiene la fundación