Redes de co-expressão entre genes codificantes de proteínas mitocondriais e todos os restantes genes nos vários tecidos humanos

Avanços na sequenciação de genomas permitem estudar, para diferentes contextos, a activi-dade de todos os genes humanos identificados (cerca de 22.000 genes codificantes de proteínas). Contudo, o conhecimento actual sobre relações entre genes encontra-se longe de estar totalmente adquirido, nomeadamente quando pelo menos um dos elementos é um gene que codifica uma pro-teína mitocondrial (cerca de 1500). As proteínas mitocondriais são codificadas quer pelo DNA mitocondrial (mtDNA; 13 proteínas) quer pelo DNA nuclear (nDNA; as restantes), o que implica uma comunicação controlada entre os dois genomas. Uma vez que as mitocôndrias coordenam várias actividades celulares essenciais à vida, nomeadamente a produção de energia e a morte celular, a desregulação desta comunicação está implicada em muitas doenças complexas como doenças neurodegenerativas, cancro e diabetes. Assim, este trabalho teve como objetivo identificar os grupos de co-expressão elevada (signi- ficativa) entre os pares de genes mitocondrial-todos os genes e as redes proteicas associadas em tecidos humanos. Os dados de expressão de genes em tecidos humanos saudáveis foram recolhidos da base de dados Genotype-Tissue Expression (https://www.gtexportal.org/home/), contabilizando 49 tecidos (um total de 8527 amostras, média de 174 por tecido). Os dados foram curados para inclusão de apenas genes codificantes de proteínas e fisicamente não sobreponíveis (só um dos genes sobreponíveis foi mantido). Os valores de correlação de Pearson foram calculados em to-dos os pares gene mitocondrial-todos os genes proteicos, tendo-se eliminado os outliers que não se incluíam no intervalo [x 4SD, x + 4SD] ou [y 4SD, y + 4SD], em que SD corresponde ao desvio padrão (standard deviation). Todos os pares com valores de correlação acima de 0.9 e 0.8, o que corresponde a elevada quantidade de informação, foram representados em estrutura de grafos e analisados com técnicas de Data Mining, nomeadamente clustering, de modo a ex-trair informação útil. Para a análise das redes foi utilizada a ferramenta Cytoscape, que permitiu avaliar vários parâmetros de extensão e conexão das redes de genes correlacionados nos vários tecidos humanos. Estas redes foram enriquecidas com dados funcionais (pathways) das bases de dados Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (http://www.genome.jp/kegg/) e Gene On-tology (http://www.geneontology.org/), que permitem inferir acerca da possível função exercida pelos genes correlacionados. De modo a comparar os dados funcionais entre tecidos, procedeu-se à técnica de clustering hierárquico, pela construção de matrizes binárias, matrizes de semelhança pelo método Jaccard e aplicação dos métodos de aglomeração UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) e NJ (Neighbor Joining). Foi desenvolvida uma plataforma web para visualizar e analisar, de forma interactiva, as árvores resultantes deste métodos. Em termos biológicos, constatamos que existem pares de genes mitocondrial-todos os genes proteicos altamente correlacionados e que estes estão incluídos em pathways de elevada importân-cia funcional como a produção de energia e síntese de metabolitos. As redes são maiores e mais densas para os tecidos do cérebro, enquanto tecidos como o rim, sangue e fibroblastos apresen-tam também um elevado número de genes correlacionados mas não tão interconetados. Em geral, as elevadas correlações entre genes mitocondriais codificados pelo mtDNA limitam-se a genes i codificados por este genoma, enquanto que genes mitocondriais codificados pelo nDNA se corre-lacionam significativamente com outros genes (mitocondriais ou não) codificados pelo nDNA. O que prova que a correlação entre genes codificados pelo mesmo genoma é mais eficiente. Toda a pipeline desenvolvida neste trabalho bem como a plataforma web será disponibilizada na plataforma GitHub em open source acompanhada da documentação de instalação para que possa ser facilmente utilizada ou adaptada a outras análises semelhantes nos muitos dados que vão sendo publicados, no contexto de doenças ou de outras espécies.Recent advances in genome sequencing allow the study, at different contexts, of all identified human gene activities (⇡ 22.000 protein encoding genes). However, current knowledge on gene interactions lags behind, especially when one of the elements is a mitochondrial protein encoding gene (⇡ 1500). Mitochondrial proteins are encoded either by mitochondrial DNA (mtDNA; 13 proteins) or by nuclear DNA (nDNA; the remaining), which implies a coordinated communication between the two genomes. Since mitochondria coordinate several life-critical cellular activities, namely energy production and cell death, deregulation of this communication is implicated in many complex diseases such as neurodegenerative diseases, cancer and diabetes. Thus, this work aimed to identify high co-expression groups between mitochondrial genes-all genes, and associated protein networks in human tissues. Gene expression data for tissues were collected from the Genotype-Tissue Expression database (https://www.gtexportal.org/home/) counting 49 tissues (a total of 8527 samples, an average of 174 per tissue). The data was filtered to include only protein-encoding and physically non-overlapping genes (only one of the overlapping genes was maintained). Pearson's correlation values were calculated on all pairs of mitochondrial genes-all protein encoding genes, and outliers in the range [x 4SD, x+4SD] or [y 4SD, y+4SD] (SD stands for standard deviation) were excluded. Gene pairs with a correlation higher than 0.9 and 0.8, corresponding to big datasets, were represented in graph structures and analyzed by Data Mining clustering techniques in order to help extracting important information. Cytoscape soft-ware was used for graph analysis, allowing to evaluate complex network parameters and identify connection properties on the biological networks. The networks were enriched with functional data (pathways) from two different biological databases: Kyoto Encyclopedia of Genes and Ge-nomes (https://www.genome.kp/kegg) and Gene Ontology (http://www.geneontology.org). This network enrichment helped to infer biological functions of the correlated genes. Functional data comparison between tissues was conducted through hierarchical clustering techniques, by building binary matrices, similarity matrices using Jaccard index and applying agglomeration methods such as UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) and NJ (Neighbor Joining). A web platform was built to interactively visualize and analyze the trees resulting from these methods. Biologically, we confirmed the existence of highly correlated pairs of mitochondrial-all pro-tein encoding genes, which are included in pathways of functional importance such as energy production and metabolite synthesis. Brain tissues have the largest and most dense networks, while kidney cortex, whole blood and fibroblasts had large but sparser networks. Generally, the strongest correlation between mitochondrial genes encoded by mtDNA belong to genes encoded by this genome, while mitochondrial genes encoded by nDNA are significantly correlated with other genes (mitochondrial or not) encoded by nDNA. This proves that correlation among genes encoded by the same genome is more efficient. The pipeline and the web tree viewer developed in this work will be available at GitHub under open source distribution along with installation documentation. This will make it possible to use and adapt the tools to the analyses of datasets being released to the public, in the context of diseases or other species

Democratização do acesso à Cultura no Ceará: a experiência dos editais de Cultura

This work aims to examine the democartization of access to culture in Ceará during the second term of the government Cid Gomes (2011-2014) analyzing the relationship between the financing of cultural projects, through public notices, as a government policy for culture, as well as such as the different historical moments of Ceará's culture, its cultural legislation, and the role of the Secretariat of Culture of Ceará-SECULT in the scope of public policies. The work is based on the analysis of the cultural incentive laws in Brazil and Ceará (Rouanet Law and Jereissati Law) and the ways in which the culture financing system influenced and / or influences the field of cultural production in the state of Ceará, discussing on access to culture through democratic policies, with an emphasis on contemporary democratic theory, using parameters that are based on the literature on public policies and cultural financing, providing some elements that enable the understanding of the field of cultural production in Ceará and its articulation with public financing policies for Brazilian Culture.Este trabalho visa examinar a democartização do  acesso a cultura no Ceará durante o segundo mandato do governo Cid Gomes ( 2011-2014) analisando a relação entre o financiamento de projetos culturais, por meio dos editais públicos, enquanto politica de governo para a cultura, assim como os diferentes momentos históricos da Cultura cearense, sua legislação cultural, e a atuação da Secretaria de Cultura do Ceará-SECULT no âmbito das políticas públicas. O trabalho baseia na análise  das leis de incentivo a cultura do Brasil e do Ceará ( Lei Rouanet e Lei Jereissati) e as formas como  o sistema de financiamento à Cultura, influenciaram e/ou influenciam o campo da produção cultural no estado do Ceará, discutindo  sobre o acesso à cultura por meio de políticas democráticas, com ênfase  na teoria democrática contemporânea, utilazando-se de  parâmetros que se baseiam na literatura sobre políticas públicas e  financiamento cultural, fornecendo alguns elementos  que possibiltam a compreensão do campo da produção de cultura no Ceará e sua articulação  com as políticas de financiamento público à Cultura do Brasil

Hóquei em Patins

Dissertação de Mestrado em Treino Desportivo apresentada na Escola Superior de Desporto e Lazer do Instituto Politécnico de Viana do CasteloO presente relatório enquadra-se no âmbito do Mestrado em Treino Desportivo, da Escola Superior de Desporto e Lazer e diz respeito ao estágio anual a realizar no 2º ano, com entidades desportivas de referência. O objeto de estudo é o estágio curricular realizado no Futebol Clube do Porto, clube onde acompanhei um grupo de trabalho composto pelas equipas sénior b e sub20. O estágio visou a aprendizagem e aplicação de competências e conhecimentos adquiridos na área do treino desportivo, ao longo da época desportiva de 2017/2018. Inerente a isto, planificar, implementar, monitorizar e avaliar todo o processo relacionado com a preparação de uma equipa de hóquei em patins fez parte do meu trabalho enquanto preparador físico e treinador adjunto. Em suma, este estágio permitiu a aquisição de mais e melhores competências adquiridas em contexto prático. Esta vivência capacita-me para desempenhar melhor as funções de treinador de hóquei em patins, preparador físico e analista desportivo.This report falls within the scope of the Master’s Degree in Sports Training from the School of Sports and Leisure and refers to the anual internship to be completed on the second school year with sports entities of reference. The object of study is the curricular internship completed at Futebol Clube do Porto, the club where I had the chance to follow a workgroup made by the Senior’s B and Under 20 teams. The internship had the goal of learning and practicing skills and knowledge acquired in the realm of sports training, during the 2017/2018 competitive season. Adding to this, planning, implementing, monitoring and evaluating the whole process around the preparation of a roller hockey team was part of my role as a physical trainer and assistant coach. In summary, this internship has allowed me to acquire more and better skills in a practical context. This experience has made me capable of performing the role of a roller hockey coach, physical trainer and sports Analyst at a higher level

Nutrição de larvas e adultos de anopheles darlingi (diptera: culicidae) em laboratório

Dissertação submetida ao Programa de Pós Graduação em Biologia Experimental do Departamento de Medicina da Universidade Federal de Rondônia como requisito para a obtenção do título de Mestre em Biologia Experimental.Orientador: Alexandre de Almeida e SilvaA malária é uma doença infecciosa causada por protozoários do gênero Plasmodium. Ela é transmitida pela picada da fêmea de Anopheles darlingi, o principal vetor da doença na Amazônia. Por ser o principal vetor na região, muitos estudos sobre a ecologia e comportamento têm sido realizados. No entanto, há poucos estudos sobre as condições de criação de imaturos e adultos. A alimentação para larvas de mosquito em laboratório é algo que já vem sendo estudado e que é muito importante quando se tem a intenção de criar esses insetos, pois a nutrição larval interfere diretamente no adulto. O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de diferentes alimentos na biologia larval e também da concentração e fonte de carboidratos para adultos de Anopheles darlingi. As larvas de primeiro estádio foram separadas em bacias contendo um litro de água e foram alimentadas diariamente de acordo com o estádio larval. O tempo de desenvolvimento larval foi estimado como o tempo necessário para 50% das larvas atingirem o último estádio larval. A taxa de pupação foi obtida dividindo-se o número de pupas pelo número de larvas L4 vivas e a taxa de emersão foi obtida pela razão entre o número de adultos e o número de pupas. Os adultos foram alimentados com diferentes soluções açucaradas, mel 10%, sacarose 10% e melado de cana 10%. Todos os dias era trocado os algodões umedecidos e foi acompanhada a longevidade dos mosquitos. Verificou-se que as larvas de mosquito alimentadas com ração de peixe tiveram um desenvolvimento mais rápido em relação as demais comidas. A média de produção de pupas diárias foi significativamente maior nos tratamentos utilizando comida de peixe do que as demais. O número de adultos total foi maior nas larvas criadas com comida de peixe. Em relação aos adultos oriundos de larvas alimentadas com diferentes alimentos constatou-se que o mel 10% prolongou o tempo de vida desses mosquitos, independente da alimentação das larvas. Com isso, verificou-se que o tratamento com ração de peixe e mel 10% foi melhor do que os demais tratamentos

Segmentação do mercado consumidor do Distrito Federal conforme o seu comportamento ambiental

The objective of this work is to segment the consumer of the Distrito Federal - DF according to their environmental behavior. To this, from a random sample of 131 questionnaires, was applied the method of factor analysis to define the dimensions representing the environmental behavior of residents in the DF. The analysis revealed the existence of four dimensions, dividing consumers of the DF in the segments: 1) "Concerned by the pollution of garbage"; 2) "Highly aware to the environmental issue"; 3) " Concerned with the financial impact of the resource waste"; 4) "Unconcerned with the environment". Except for the "unconcerned with the environment," strategies of the environmental and social marketing can be effective, since they consider the different needs of specified groups. While the "concerned by the pollution of garbage" valorize the social recognition of their actions the "concerned with the financial impact of the resource waste" prioritize direct and indirect economic benefits. For the "highly aware to the environmental issue" the most important is to demonstrate the effectiveness of green actions, regardless of these will promote social recognition or promote economic advantage for the segment.A segmentação de mercado é importante para entender os anseios de um grupo de consumidores. Com a segmentação é possível direcionar as forças e as ações de marketing ambiental e social para um determinado grupo, surtindo efeito, pois o produto ou a mensagem suprirá as necessidades ou desejos específicos. O objetivo deste trabalho é segmentar o consumidor do Distrito Federal - DF conforme o seu comportamento ambiental. Para tanto, a partir de uma amostra aleatória de 131 questionários, aplicou-se o método da análise fatorial para definir as dimensões representativas do comportamento ambiental dos moradores do DF. A análise revelou a existência de quatro dimensões, dividindo os consumidores do DF nos segmentos: 1) “Preocupados com a poluição do lixo”; 2) “Altamente conscientes com a questão ambiental”; 3) “Preocupados com o impacto financeiro pelo desperdício de recursos”; 4) “Despreocupados com o meio ambiente”. Exceto para os “despreocupados com o meio ambiente”, as estratégias de marketing ambiental e social podem ser efetivas, desde que considerem as necessidades diferenciadas dos grupos especificados. Enquanto os “preocupados com a poluição do lixo” valorizam o reconhecimento social de suas ações, os “preocupados com o impacto financeiro pelo desperdício de recursos” priorizam vantagens econômicas diretas ou indiretas das mesmas. Para os “altamente conscientes com a questão ambiental” o mais importante é demonstrar a efetividade de ações verdes, não importando se essas vão promover algum reconhecimento social ou aferir alguma vantagem econômica para o segmento

Marginal integrity of restorations produced with a model composite based on polyhedral oligomeric silsesquioxane (POSS)

Marginal integrity is one of the most crucial aspects involved in the clinical longevity of resin composite restorations.Objective To analyze the marginal integrity of restorations produced with a model composite based on polyhedral oligomeric silsesquioxane (POSS).Material and Methods A base composite (B) was produced with an organic matrix with UDMA/TEGDMA and 70 wt.% of barium borosilicate glass particles. To produce the model composite, 25 wt.% of UDMA were replaced by POSS (P25). The composites P90 and TPH3 (TP3) were used as positive and negative controls, respectively. Marginal integrity (%MI) was analyzed in bonded class I cavities. The volumetric polymerization shrinkage (%VS) and the polymerization shrinkage stress (Pss - MPa) were also evaluated.Results The values for %MI were as follows: P90 (100%) = TP3 (98.3%) = B (96.9%) >; P25 (93.2%), (

Medidas governamentais de enfrentamento à Covid-19 a partir do Projeto São José III

that during the period of social isolation experienced by the state was important to strengthen the maintenance of family farming enterprises served by the agrarian development policies covered by the secretariat. Thus, even having suffered losses in production and marketing, investment alternatives in technical assistance and guidance to family farmers, fairs, virtual assistance to beneficiaries contributed to minimizing the effects caused by the Covid-19 pandemic. The methodology used was a qualitative research, using a questionnaire. A total of 267 questionnaires were sent, with 237 being returned, corresponding to 88.8% of the total. The Google Web virtual tool was used to answer the questionnaire.O estudo tem por objetivo identificar os impactos causados pelo vírus Sars Cov 2, nos empreendimentos apoiados pelo Projeto São José III. No percurso de identificação de políticas públicas voltadas para o enfrentamento da crise econômica e social, fruto do avanço da Covid-19 pelo interior do Ceará. Foram identificados os esforços da Secretaria do Desenvolvimento Agrário na manutenção de uma agenda de ações que, ao longo do período de isolamento social vivenciado pelo estado, foi importante para o fortalecimento de manutenção dos empreendimentos da agricultura familiar atendidos pelas políticas de desenvolvimento agrário abrigados no âmbito da secretaria. Assim, mesmo tendo sofrido perdas na produção e comercialização, as alternativas de investimentos em assistência técnica e orientação aos agricultores familiares, realização de feiras, atendimento virtual aos beneficiários contribuíram para a minimização dos efeitos causados pela pandemia da Covid-19. A metodologia utilizada foi a de uma pesquisa de cunho qualitativo com o uso de questionário. Foram enviados 267 questionários, sendo devolvidos 237, o que corresponde a 88,8% do total. A ferramenta virtual Google Web foi utilizada para responder o questionário

Prospecção fitoquímica e atividade antiradicalar de extratos e frações de folhas e galhos de Pouteria ramiflora (Sapotaceae) / Phytochemical prospection and anti-radical activity of extracts and fractions of leaves and branches of Pouteria ramiflora (Sapotaceae)

O uso de plantas medicinais é uma prática importante na medicina mundial. Pouteria ramiflora, conhecida vulgarmente como curriola ou figo do Cerrado, é uma frutífera empregada na medicina popular no tratamento de inflamações e obesidade. Frutas e vegetais são ricos em substâncias antioxidantes, que podem prevenir ou atenuar doenças relacionadas ao estresse oxidativo quando incluídos na dieta. No intuito de fornecer maiores informações sobre P. ramiflora realizou-se a prospecção fitoquímica, a determinação do teor de fenóis totais e avaliou-se a atividade antioxidante pelo ensaio do DPPH de extratos e frações orgânicas de folhas e galhos desta espécie medicinal e alimentícia. A prospecção fitoquímica detectou a presença de flavonoides, taninos, saponinas, alcaloides e triterpenos/esteroides nas diferentes amostras. O extrato em etanol dos galhos de P. ramiflora apresentou o maior teor de fenóis totais e maior atividade sequestradora frente ao radical DPPH em comparação as demais amostras, com os valores de 132,73±2,5 mg EAG. g-1 e CE50 46,98 µg. mL-1, respectivamente. Os resultados sugerem que a curriola é uma importante fonte de antioxidantes naturais e que pode ser utilizada no tratamento de doenças relacionadas ao estresse oxidativo