Transcript Diversity In The Protozoan Parasite Toxoplasma Gondii

Technological advances have made possible to sequence RNA transcripts at unprecedented depth, enabling deep profiling of abundance and diversity under a variety of conditions. Such information permits refinement of draft genome annotation originally generated in the absence of transcript coverage data, and provides new insights into organismal biology and regulatory mechanisms. This dissertation provides an extensive analysis of mRNA-seq data from the obligate intracellular protozoan parasite Toxoplasma gondii, a ubiquitous pathogen of humans and other vertebrates. We produced and sequenced 24 strand-specific RNA libraries from several parasite strains and developmental stages, and examined these in con�junction with 45 additional mRNA-seq libraries produced by other groups. The current reference genome annotation for T. gondii, generated using de novo methods informed by cDNA sequencing prior to mRNA-seq, identifies ~8300 protein-coding genes, fragmented by ~40K introns. Untranslated regions are incompletely defined, few alternatively-spliced transcripts are described, and non-coding transcripts remain largely unexplored. mRNA-seq datasets presented in this dissertation define a total of 2.7M introns, most observed at vanishingly low abundance. Using current annotation to define parameters minimizing false discovery yields ~60K likely splice junctions. Comparing the frequency of intron-spanning reads to the abundance of transcripts to which introns belong provides a reliable metric for estimating intron excision, readily distinguishing introns that are (i) universally used, (ii) alternatively-spliced, or (iii) likely insignificant. Genome-wide analysis suggests ~3000 annotated introns that should be deleted from the reference genome, ~1400 to be added as alternative isoforms, ~3100 as additions to existing annotation (often within UTRs) and ~3400 associated with novel transcripts. Transcriptomic expression is consis�tent with biological and phenotypic variation across the complex parasite life cycle, including undescribed differences in gene expression during intracellular tachyzoite replication. Strong circumstantial evidence also suggests that lncRNAs may play an important role in regulating stage-specific expression during sexual differentia�tion and sporogony. These results provide the basis for revising the reference T. gondii genome annotation available at ToxoDB.org and GenBank. Strategies developed in this dissertation also provide the basis for defining annotation criteria for other species, including related parasites responsible for malaria and conceivably other eukaryotes as well

Engineer and Test a Biodegradable Microneedle Patch to Deliver Meloxicam for Managing Pain in Cattle

Microneedle patches are a promising source for transdermal diffusion of macromolecules and are designed to painlessly penetrate the skin. In this study, a biodegradable chitosan microneedle patch to deliver meloxicam for managing pain in cattle was tested. The potential of reuse of the polymeric solution to fabricate the patches, optimization of fabrication, morphological analysis of the microneedle patch and analysis of preservation of the chemical composition after sterilization were evaluated. In-vitro analysis consisted of studying in-vitro penetration mechanical properties, compression testing analysis of microneedle patch, and in-vitro drug release analysis. In-vivo studies were performed to analyze the dissolution capability of the microneedle patch. Results regarding the physical characteristics, chemical composition, and mechanical properties confirmed that rheological properties of the chitosan solution, present significant differences over time, demonstrating that reusing the solution on the fourth day results in failure patches. Morphological characteristics and chemical composition studies revealed that the process of sterilization (ethylene oxide gas) needed for implanting the patches into the skin did not affect the properties of microneedle patches. In-vitro studies showed that approximately 33.02 ± 3.88% of the meloxicam was released over 7 days. A full penetration of the microneedles into the skin can be obtained by applying approximately 3.2 N. In-vivo studies demonstrated that microneedle patches were capable of swelling and dissolving, exhibiting a dissolution percentage of more than 50% of the original height of microneedle after 7 days. No abnormal tissue, swelling, or inflammation was observed in the implanted area. The results of this work show that chitosan biodegradable microneedle patches may be useful to deliver meloxicam to improve pain management of cattle with positive effects for commercial manufacturing

Engineer and Test a Biodegradable Microneedle Patch to Deliver Meloxicam for Managing Pain in Cattle

Microneedle patches are a promising source for transdermal diffusion of macromolecules and are designed to painlessly penetrate the skin. In this study, a biodegradable chitosan microneedle patch to deliver meloxicam for managing pain in cattle was tested. The potential of reuse of the polymeric solution to fabricate the patches, optimization of fabrication, morphological analysis of the microneedle patch and analysis of preservation of the chemical composition after sterilization were evaluated. In-vitro analysis consisted of studying in-vitro penetration mechanical properties, compression testing analysis of microneedle patch, and in-vitro drug release analysis. In-vivo studies were performed to analyze the dissolution capability of the microneedle patch. Results regarding the physical characteristics, chemical composition, and mechanical properties confirmed that rheological properties of the chitosan solution, present significant differences over time, demonstrating that reusing the solution on the fourth day results in failure patches. Morphological characteristics and chemical composition studies revealed that the process of sterilization (ethylene oxide gas) needed for implanting the patches into the skin did not affect the properties of microneedle patches. In-vitro studies showed that approximately 33.02 ± 3.88% of the meloxicam was released over 7 days. A full penetration of the microneedles into the skin can be obtained by applying approximately 3.2 N. In-vivo studies demonstrated that microneedle patches were capable of swelling and dissolving, exhibiting a dissolution percentage of more than 50% of the original height of microneedle after 7 days. No abnormal tissue, swelling, or inflammation was observed in the implanted area. The results of this work show that chitosan biodegradable microneedle patches may be useful to deliver meloxicam to improve pain management of cattle with positive effects for commercial manufacturing

LA SOSTENIBILIDAD DE LA DEUDA EN LOS ESTADOS DE LA REPÚBLICA MEXICANA Y SU RELACIÓN CON EL CRECIMIENTO ECONÓMICO 2008-2011

De acuerdo con el panorama de antecedentes en México, las crisis económicas forman parte del contexto en el que se ha visto envuelto el incremento de la deuda pública: siendo el 2008 el año en el que inicia una de las más recientes crisis económicas mundiales, por lo que se convierte en el punto de partida de esta investigación. Además el periodo comprendido entre 2008-2011 se ha caracterizado también por otros sucesos macroeconómicos: el bajo crecimiento, el incremento del desempleo, el aumento en la inflación, que han puesto de manifiesto la debilidad estructural de las finanzas públicas. Pese a la aplicación de medidas fiscales, los riesgos para la sostenibilidad de la deuda deben ser objeto de atención con la finalidad de evaluar la magnitud de los riesgos para las finanzas públicas y el crecimiento de los estados. Por ello surge la inquietud de analizar la sostenibilidad de la deuda pública de los estados dentro del contexto de inestabilidad financiera y crisis económica, a través del Indicador de Consistencia Tributaria propuesto por Blanchard (1990) que calcula el ajuste fiscal primario que se necesita para estabilizar la razón de deuda pública al PIB en un determinado nivel, dadas las trayectorias previstas del superávit primario, a diferentes tasas tanto de interés real como de crecimiento económico real. Dicho indicador nos permitirá observar, en general, el comportamiento de las finanzas públicas entre 2008 y 2011 e identificar a las entidades que se dirigen a un proceso de excesiva acumulación de deuda, es decir una deuda insostenible; por otro lado, conocer si existe una relación entre dicha sostenibilidad y el crecimiento económico. En términos concretos la presente investigación busca, en primer lugar, estudiar la evolución de la deuda pública en los estados de la República Mexicana y, 5 posteriormente, determinar y evaluar el comportamiento de la sostenibilidad de dicha deuda pública durante el periodo 2008-2011. Lo anterior bajo la siguiente hipótesis: las entidades federativas que registran un mayor crecimiento económico muestran un mejor nivel de sostenibilidad fiscal, por el contrario las entidades con menor crecimiento muestran una insostenibilidad en su deuda pública. El fundamento teórico que ayudará al análisis de la deuda estatal ha sido extraído de la teoría tradicional, puesto que la evidencia empírica que se presentará durante el desarrollo de la misma es consistente con este enfoque teórico. Con este propósito, la investigación se divide en cuatro secciones. La primera, presenta los referentes conceptuales y teóricos que servirán como base para comprender la deuda pública. La segunda, describe los antecedentes de la deuda pública a nivel nacional y estatal, con la finalidad de conocer un panorama general de la evolución de dicho endeudamiento y poder comparar la magnitud del problema. La tercera, recurre tanto a la teoría como al análisis empírico para exponer los resultados del indicador y visualizar las entidades con mayores problemas de endeudamiento y las repercusiones de éste en su crecimiento económico, además se destacan a las dos entidades que se sitúan en los puntos extremos del indicador, a saber: Oaxaca y Coahuila. Para finalizar, se presentan las conclusiones

Política(s), Prácticas e Intervención: En el camino de una perspectiva teórica-metodológica del Trabajo Social desde una perspectiva de género

En las últimas décadas el trabajo social, en tanto disciplina, ha generado profundas críticas sobre si misma, cuestionando sus objetivos, sus métodos y el lugar de la reflexión y la investigación en su práctica. Sin embargo, como señalan diversas/os autoras/es -a las/os que haremos referencia en el texto- el Trabajo Social presenta una multiplicidad de prácticas que, aun en contextos de intervención, ofrecen características reflexivas y críticas. A partir de una investigación mayor que analiza diferentes prácticas en los contextos de intervención social; y, desde un enfoque socioantropológico y una mirada de género, este artículo se propone un doble objetivo. Por un lado, reflexionar sobre la potencialidad que la intervención social presentan al aplicarse las categorías y políticas desarrolladas desde otros ámbitos disciplinares de conocimiento. Por otro, construir una mirada teórica-metodológica (entre otras) para que las/os trabajadoras/es sociales pongan a prueba, critiquen, y planteen las posibilidades y limitaciones que puedan generarse en el quehacer cotidiano. Afirmamos que reconsiderar las políticas estatales, las prácticas y las intervenciones que hacemos desde el trabajo social utilizando una perspectiva de género, nos permite analizar críticamente cómo se despliegan formas de disciplinamiento y control - así como de normalización- que (re) significan la propia práctica disciplinar que se (re)produce desde micro espacios localizados.Nas últimas décadas, o trabalho social como disciplina, gerou forte crítica sobre si mesma, questionando os seus objetivos, métodos e lugar da reflexão e pesquisa em sua prática. No entanto, como apontado por vários autoras/es -os que nos referimos no texto- o Trabalho social apresenta uma multiplicidade de práticas que, mesmo em contextos de intervenção, oferecem características reflexivas e críticas. A partir de uma pesquisa mais amplia que analisa diferentes práticas nos contextos de intervenção social, com uma abordagem de gênero e um perspectivo sócio- antropológico este trabalho tem um duplo objetivo. Por um lado, reflete sobre o potencial que a intervenção social tem que aplicar as categorias e as políticas desenvolvidas a partir de outras áreas disciplinares do conhecimento. Além disso, procura construir um olhar teórico-metodológico (entre outros) para que as / os trabalhadores testem, critiquem e visualizem as possibilidades e limitações que possam surgir nas tarefas diárias. Afirmamos que reconsiderar, com uma perspectiva de gênero, as políticas, as práticas e intervenções que fazemos a partir do trabalho so-cial nos permite analisar criticamente como se desdobram formas de disciplina, controle e normalização que (ré) significam a própria prática disciplinar e que sons (ré) produzidos a partir de micro espaços localizados.Fil: Pais Andrade, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras; ArgentinaFil: Gonzalez Martin, Miranda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Sociales; Argentin

El uso del castigo físico por parte del docente, y el rendimiento de los estudiantes en la sierra peruana

Garantizar una educación de calidad implica contar con un ambiente adecuado, propicio al desarrollo de los estudiantes; no obstante, la violencia infantil es uno de los factores que aún afecta el ambiente escolar. Dado este problema, el objetivo del presente estudio es explorar el efecto a mediano plazo del uso del castigo físico por parte del docente en el rendimiento de los estudiantes en la sierra. Esto debido a que la sierra es una de las regiones más vulnerables por los altos índices de pobreza, analfabetismo y desnutrición infantil. Haciendo uso de la base de datos del estudio longitudinal Niños del Milenio y del Censo Escolar, se estimó un modelo de mínimos cuadrados ordinarios (MCO) así como un modelo de propensity score matching (PSM) para calcular el efecto de la violencia en el rendimiento de estudiantes de escuelas públicas en la sierra. Los resultados muestran que ser víctima de castigo corporal a los 8 años de edad afecta de manera negativa el rendimiento en matemáticas y vocabulario a los 12 años, aun luego de controlar por características del niño, de la familia y la escuela. Asimismo, se encontró que, aunque los niños varones son más propensos a ser víctimas de este tipo de violencia, el efecto en el rendimiento es diferenciado, siendo más perjudicial para las niñas.Ensuring a quality education means having a suitable environment for students' development. In Peru, violence against children is one of the factors that continues to affect this environment. Due to this fact, the objective of the study is to explore the medium-term effect of teachers' use of corporal punishment in the highlands on students' achievement. Due to its high poverty, illiteracy, and malnutrition rates, the highlands is one of the most vulnerable regions in Peru. Using data from the Longitudinal Young Lives Study and the School Census, an OLS model as well as a Propensity Score Matching were performed to estimate the effect of teachers' violence on students' achievement from public schools in the highlands. Results show that being a victim of corporal punishment at the age of 8 years old negatively affects students' achievement in math and vocabulary at age 12, even after other characteristics of the child, family, and school are controlled. It was also found that although boys are more likely to be victims of such violence, the effect on achievement is heterogeneous, and more harmful for girls than boys

Onboarding New Research Staff Through Asynchronous Learning

Onboarding processes have become standard best practice across organizations and businesses when it comes to training new employees. These processes have proven to be one of the most important factors that employers can implement at an early stage of employment to ensure employees understand their new role and how they fit within the organization. Establishing an effective onboarding process can increase employee productivity and can also help the new employee build confidence to start supporting their new team at a faster rate. Organizations have been utilizing onboarding processes for new employees for decades. Most recently, organizations have recognized the need to modify their onboarding processes to include new methods for training and orientating new research staff, such as asynchronous learning tools. These new methods can include building a repository to make these tools accessible to employees. As such, this Capstone Project describes the need for asynchronous onboarding sessions, why this is important, and the design and development of new onboarding processes that can be utilized by organizations in need of updating their onboarding process

La dilución de los medicamentos intravenosos y su relación con la incidencia de flebitis de ocurrencia menor a las 72 horas de la venopunción

El trabajo de investigación sobre “La dilución de medicamentos intravenosos y su relación con la incidencia de casos de flebitis menor a 72 horas posterior a la venopunción”, a fin de descubrir si la forma de dilución de los medicamentos es la causa principal de una flebitis, la cual está relacionada con el contacto de soluciones hipertónicas o medicamentos con pH acido o Alcalino. Es por ello que se realizó una clasificación de medicamentos endovenosos más utilizados en las áreas del 2° Medicina Interna Hombres y 2° Medicina Interna Mujeres del Hospital Nacional Rosales. La clasificación de estos medicamentos permitió indagar sobre sus características químicas que mediante ellas se llegan a considerar de: bajo, mediano y de alto riesgo Flebitico. La ejecución de este Proyecto de Investigación se llevó a cabo mediante dos estudiantes egresadas de la carrera de Licenciatura en Enfermería de la Universidad Dr. José Matías Delgado en el periodo de Diciembre del 2015 a Marzo 2016. La investigación se efectuó mediante la lógica del método deductivo ya que se realizó un acercamiento teórico al fenómeno en estudio, describiendo las variables, y mediante ello se logró establecer una relación entre éstas facilitando la construcción de las hipótesis de investigación; y por tanto se considera de tipo correlacional. Se efectuó un sondeo de los Enfermeras y Enfermeros que administran medicamentos endovenosos de las áreas antes mencionadas, de igual forma se observó a diez pacientes de cada área verificando así el efecto que produce la dilución de medicamentos endovenosos y de esta forma poder comprobar las hipótesis de investigación. Para el procesamiento y análisis de los datos se hizo uso del software SPSS y para la comprobación de hipótesis se utilizó el estadístico Chi Cuadrado. Se considera que los posibles hallazgos que pueden surgir en la investigación podrían ser que en los servicios mencionados se cumplan los requerimientos necesarios para diluir medicamentos endovenosos y no afectar al paciente, o pudiese suceder lo contrario; afectar al paciente por un dilución inadecuada, por lo que mediante este estudio se obtuvieron resultados que sean útiles para justificar iniciativas de modificación o actualización de protocolos de Enfermería contribuyendo directamente al bienestar de los pacientes de dichas áreas al reducir las lesiones tisulares.Tesis para optar a la Licenciatura en Enfermerí