一种植物根系三维构型无损检测方法

本发明提供一种植物根系三维构型无损检测方法，探地雷达天线在植物根系表面实时探测，该方法还包括如下步骤：获取任意时刻探地雷达天线的三维位置与姿态信息；获得任意时刻探地雷达发射电磁波谱的三维空间信息；对电磁波谱进行数值信息和图像信息的双模式处理；对数值信息和图像信息获取的地下未知物体的截面信息进行对比，若二者获取未知物体截面信息一致，则确定该区域为非土壤物体所在区；判断未知物体是否为植物根系；若未知物体为植物根系，获取根系截面的相关形态与位置信息；利用获取的不同位置的根系断层截面对所在区域植物根系进行三维重构。本发明相对于现有技术，不需要人工设置雷达测线与测网，实现了植物根系构型、走向无损获取

Low Computational Optimization Method in the Binary Vandermonde Coded Storage Systems

针对二进制范德蒙码的编码存储与译码重构过程,提出了一种降低相关编译码过程计算量的优化方法。该方法根据二进制编译码矩阵行向量中"1"的分布以及各向量之间"1"的相互位置关系,最终确定出二进制编译码矩阵所对应的各个校验块的计算次序,从而实现降低整个编码过程或译码过程计算量的目的。实验表明,该方法可以降低30%左右的相关计算量,同时,该优化方法可以推广应用到其他二进制编码存储系统中

High-Throughput Assessment of Mitochondrial Fluorescence Labeling at Single-Particle Level

线粒体是真核细胞能量代谢和信号转导的调控中枢,虽然各种灵敏、特异的线粒体荧光标记技术已经被广泛应用于线粒体研究,但仍缺乏单线粒体水平的荧光染色性能评估方法。基于超高灵敏流式检测技术(High sensitivity flow cytometry,HSFCM)能对单个线粒体进行高灵敏、高通量、多参数定量分析的独特优势,本研究发展了一种单线粒体水平的荧光标记高通量评估方法。将携带靶向线粒体绿色荧光蛋白基因的p Ac GFP1-Mito质粒转染至人宫颈癌He La细胞中,用G418筛选出稳定转染细胞,分别从瞬时转染和稳定转染的细胞中提取线粒体。此外,从未转染质粒的正常He La细胞中提取线粒体,分别进行Mito Tracker Green标记以及SYTO 62线粒体DNA染色,应用实验室自行研制的超高灵敏流式检测装置在单线粒体水平对这4种线粒体标记方法的荧光亮度、标记效率和稳定性进行评估。实验结果表明,稳定转染细胞中单个线粒体的绿色荧光蛋白(GFP)荧光亮度为瞬时转染的17.7倍,比Mito Tracker Green标记的线粒体亮度高约两个数量级,且标记稳定性好。本研究为线粒体标记方法的选择提供了一种先进的分析方法。Mitochondria play a central role in the regulation of energy metabolism and signal transduction in eukaryotic cells. Although many fluorescent labeling strategies have been developed for mitochondrial studies,the methods that enable labeling efficiency assessment at the single-mitochondrion level are still lacking. By employing the unique advantages of high sensitivity flow cytometry( HSFCM) in the sensitive,rapid,and quantitative multiparameter analysis of individual mitochondria,here we examined the performance of several different mitochondrial labeling strategies from the perspectives of brightness,labeling ratio,and stability.Mitochondria isolated from He La cells transfected with p Ac GFP1-Mito plasmid upon transient or stable transfections,and mitochondria directly labeled with Mito Tracker Green or SYTO 62 were analyzed by a laboratory-built three-channel HSFCM. Upon the quantitative measurement of fluorescence brightness,it was found that the fluorescence intensity of green fluorescent protein( GFP) in mitochondria isolated from cells with stable transfection was about 17. 7-fold higher than the transient transfection ones,and was approximately two orders of magnitude brighter than mitochondria labeled with Mito Tracker Green. On the other hand,the fluorescence signal of SYTO 62 labeling decreased upon washing,indicating its rapid dissociation rate. The strong fluorescence intensity and good labeling stability make stable transfection an efficient method to label mitochondria. The experimental results demonstrates that HSFCM provides a powerful analytical tool to assess the performance of mitochondrial fluorescence labeling via high throughput single mitochondria analysis.国家自然科学基金项目(Nos.91313302,90913015,21225523)资助~

一种高可靠性生态环境参数无线传感系统

本发明公开了一种高可靠性生态环境参数无线传感系统，包括中心数据传输节点和多个无线传感数据采集节点，与现有技术相比，本发明提出了针对野外环境参数无线采集系统的自适应存储方法，当系统的远程无线数据传输节点正常运行时，数据采集节点采集的数据通过远程无线数据传输节点上传到服务器，当远程无线数据传输节点出现损毁时，数据采集节点将会自组织形成一个区域存储网络，每个数据采集节点上的数据通过编码的方式，分存到系统的各个节点中，当自组织存储网络的存储空间不足时，系统通过设定的数据覆盖规则，用新采集的数据按照一定的间隔将历史数据覆盖掉。该方法将大大提高系统存储数据的可靠性。具有推广应用的价值

一种针对二进制编码冗余存储系统的低带宽数据重构方法

本发明提供一种针对二进制编码冗余存储系统的低带宽数据重构方法，包括如下步骤：（1）建立丢失的数据块与数据校验矩阵行向量之间的对应关系，根据存储系统中未丢失数据块所对应的数据校验矩阵的列向量所构成的子矩阵确定低带宽校验矩阵；（2）判断低带宽校验矩阵是否多于一个；（3）若多于一个，则判断利用各低带宽校验矩阵对丢失数据块进行恢复给各存储节点带来的I/O压力是否相同；（4）若不相同，则选择I/O压力影响最小的低带宽校验矩阵对丢失的数据块进行数据重构。相对于现有技术，通过确定低带宽校验矩阵查找I/O读取压力最小的存储节点进行丢失数据块的恢复，可减少数据块重构时对系统存储节点进行数据读取的网络带宽消耗

The development of a light-up red-emitting fluorescent probe based on a G-quadruplex specific cyanine dye

A cyanine dye-dimethylindole red containing an extending polymethine chain, a sterically bulky dimethylindole heterocycle and an anionic propylsulfonate substituent on the quinoline ring was found to behave as a high specific light-up G-quadruplex probe in the red-emitting region above 650 nm, especially for parallel G-quadruplex c-myc. The 10 to 70-fold enhancement in the fluorescence quantum yield of dimethylindole red when incubating with G-quadruplexes may benefit more accurate definition of the distribution of G-quadruplexes across the genome

用于生命之树重建的数据集

由中国科学院计算机网络信息中心、中国科学院植物研究所、深圳市中国科学院仙湖植物园"三方两地"共同合作研究建设的"达尔文树"——分子数据分析应用环境(DarwinTree——Molecular Data Analysis and Application Environment),从中国陆地植物发育系统框架的研究出发,逐步推动解决生命之树构建过程中存在的技术难题,探索利用基因和基因组信息构建生命之树的策略和方法,研究和开发DNA序列信息自动采集和生命之树自动生成技术(Automatic Reconstruction of The Tree of Life),建立生命之树信息平台及其利用体系,为最终在我国建立具有国际影响的,能很好地兼容物种分类、地理分布、形态性状、化石信息以及DNA信息的物种库(Species Bank)创造条件。DarwinTree旨在为科研人员提供数据和分析并举的工作平台,该平台将承担数据汇集和面向实际科研工作应用的双重作用。本文发布的数据集包括:(1)DarwinTree基础数据集:来自国际公共序列数据的标记处理得到的分子标记数据及其与任意阶元物种分类名称对应的统计数据集;(2)DarwinTree自测序数据集:面向中国陆地植物研究的补充测序序列数据;(3)DarwinTree中国维管植物进化数据集:已构建的中国维管植物属系统发育树的数据(Generic tree of Chinese vascular plants)