Transcriptome and proteome mapping in the sheep atria reveal molecular featurets of atrial fibrillation progression

This work was supported by the Spanish government (BFU2017-84914-P to M.M.; FPI Fellowship to A.A.-F.; FPU Fellowship to R.R.), and in part by grants to J.J. from the National Heart, Lung and Blood Institute (R01 grant HL122352 NIH/NHLBI), the Leducq Foundation (Transatlantic Network of Excellence Program on Structural Alterations in the Myocardium and the Substrate for Cardiac Fibrillation), and the University of Michigan Health System-Peking University Health Science Center Joint Institute for Translational and Clinical Research (UMHS-PUHSC; project: Molecular Mechanisms of Fibrosis and the Progression from Paroxysmal to Persistent Atrial Fibrillation). The CNIC is supported by the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), the Ministerio de Ciencia e Innovacio ' n and the Pro CNIC Foundation and is a Severo Ochoa Center of Excellence (SEV-2015-0505).Aims Atrial fibrillation (AF) is a progressive cardiac arrhythmia that increases the risk of hospitalization and adverse cardiovascular events. There is a clear demand for more inclusive and large-scale approaches to understand the molecular drivers responsible for AF, as well as the fundamental mechanisms governing the transition from paroxysmal to persistent and permanent forms. In this study, we aimed to create a molecular map of AF and find the distinct molecular programmes underlying cell type-specific atrial remodelling and AF progression. Methods and results We used a sheep model of long-standing, tachypacing-induced AF, sampled right and left atrial tissue, and isolated cardiomyocytes (CMs) from control, intermediate (transition), and late time points during AF progression, and performed transcriptomic and proteome profiling. We have merged all these layers of information into a meaningful three-component space in which we explored the genes and proteins detected and their common patterns of expression. Our data-driven analysis points at extracellular matrix remodelling, inflammation, ion channel, myofibril structure, mitochondrial complexes, chromatin remodelling, and genes related to neural function, as well as critical regulators of cell proliferation as hallmarks of AF progression. Most important, we prove that these changes occur at early transitional stages of the disease, but not at later stages, and that the left atrium undergoes significantly more profound changes than the right atrium in its expression programme. The pattern of dynamic changes in gene and protein expression replicate the electrical and structural remodelling demonstrated previously in the sheep and in humans, and uncover novel mechanisms potentially relevant for disease treatment. Conclusions Transcriptomic and proteomic analysis of AF progression in a large animal model shows that significant changes occur at early stages, and that among others involve previously undescribed increase in mitochondria, changes to the chromatin of atrial CMs, and genes related to neural function and cell proliferation.Spanish Government European Commission BFU2017-84914-PUnited States Department of Health & Human Services National Institutes of Health (NIH) - USA NIH National Heart Lung & Blood Institute (NHLBI) HL122352 NIH/NHLBILeducq FoundationUniversity of Michigan Health System-Peking University Health Science Center Joint Institute for Translational and Clinical Research (UMHS-PUHSC)Instituto de Salud Carlos III European Commission Instituto de Salud Carlos III Spanish Government European CommissionPro CNIC FoundationSevero Ochoa Center of Excellence SEV-2015-050

Effects of new "Torulaspora delbrueckii killer" yeasts on the must fermentation kinetics and aroma compounds of white table wine

La Torulaspora delbruecki es cada vez más ampliamente recomendado para mejorar algunas características específicas de los vinos. Sin embargo, su impacto en la calidad del vino está todavía lejos de ser satisfactorio en bodega, principalmente porque es fácilmente debe ser reemplazada por levaduras como Saccharomyces cerevisiae durante la fermentación. Aquí se ha aislado una cepa asesina nueva de T. delbrueckii y han sido seleccionadas para la elaboración de vino. Éstas eliminaron las levaduras S. cerevisiae y fueron capaces de dominar y completar la fermentación del mosto esteril de uva. La inoculación de levadura secuencial de mosto estéril no-blanco con T. delbrueckii, seguida de S. cerevisiae, no asegura el dominio de la T. delbrueckii, o la mejora de la calidad del vino. Una única inoculación inicial en concentraciones altas de células permitió que las cepas asesinas de T. delbrueckii deben alcanzar por encima de 11% de etanol para dominar y completar la fermentación, pero no las cepas no-asesino. Ninguno de los vinos sometidos a una fermentación maloláctica tan larga ha generado tan poca turbiedad y pH. Los vinos dominados por S. cerevisiae eran los preferidos a los dominados por T. delbrueckii porque los primeros tenían aromas de fruta fresca de alta intensidad, mientras que los segundos tenían una intensidad más baja, pero no obstante agradables e inusuales aromas de frutos secos y pastelería.. Excepto ethylpropanoate y 3-ethoxy-1-propanol, que eran más abundantes en el vino con T. delbrueckii, dominado por la mayoría de los compuestos con descriptores de olor de fruta fresca, incluyendo aquellos con los mayores valores de actividad de olor (isoamyl, acetato de etilo y etil hexanoate octanoate, eran más abundantes en los vinos dominados por la S. cerevisiae. Las bajas concentraciones relativas de estos compuestos afrutados hizo posible detectar vinos dominados por T. delbrueckii con una baja concentración relativa de compuestos con olores de pastelería y frutos secos. Un ejemplo fue la γ-butyrolactona ethoxy- que fue significativamente más abundante en estos vinos que en los dominados por S. cerevisiae.Torulaspora delbruecki is becoming widely recommended for improving some specific characteristics of wines. However, its impact on wine quality is still far from satisfactory at the winery level, mostly because it is easily replaced by Saccharomyces cerevisiae-like yeasts during must fermentation. New T. delbrueckii killer strains were here isolated and selected for wine making. They killed S. cerevisiae yeasts and were able to dominate and complete the fermentation of sterile grape must. Sequential yeast inoculation of non-sterile white must with T. delbrueckii followed by S. cerevisiae did not ensure T. delbrueckii dominance or wine quality improvement. Only a single initial must inoculation at high cell concentrations allowed the T. delbrueckii killer strains to dominate and complete the must fermentation to reach above 11% ethanol, but not the non-killer strains. None of the wines underwent malolactic fermentation as long as the must had low turbidity and pH. Although no statistically significant differences were found in the wine quality score, the S. cerevisiae-dominated wines were preferred dover the T. delbrueckii-dominated ones because the former had high-intensity fresh fruit aromas while the latter had lower intensity, but nevertheless nice and unusual dried fruit/pastry aromas. Except for ethylpropanoate and 3-ethoxy-1-propanol, which were more abundant in the T. delbrueckii–dominated wines, most of the compounds with fresh fruit odor descriptors, including those with the greatest odor activity values (isoamyl acetate, ethyl hexanoate, and ethyl octanoate), were more abundantin the S. cerevisiae–dominated wines. The low relative concentrations of these fruity compounds made it possible to detectin the T. delbrueckii–dominated wines the low-relative-concentration compounds with dried fruit and pastry odors. An example was γ-ethoxy-butyrolactone which was significantly more abundantin these wines than in those dominated by S. cerevisiae.Trabajo financiado por: Ministerio de Educación y Ciencia. Proyecto AGL2011-25711 (I+D+i) Junta de Extremadura. Ayuda GR10088peerReviewe

¿Piensa el profesor como actúa? Estudio del feedback aportado por docentes de educación física en clase

El feedback es un recurso que ha adquirido gran importancia en Educación Física ya que permite mejorar los procesos de enseñanza y aprendizaje gracias a su inmediatez para modificar los comportamientos motores del alumno. El objetivo de este trabajo fue analizar el feedback que aportan los profesores de educación física y compararlo con la opinión que tienen respecto a su uso. Participaron 3 profesores de educación de la Comunidad de Madrid (España). Siguiendo una metodología observacional, se grabaron y analizaron un total de 18 sesiones, 6 por cada profesor. El análisis comparado de los datos obtenidos en los cuestionarios y los registrados en las sesiones reveló diferencias entre la opinión del profesorado y su actuación en clase. Asimismo, se hallaron tendencias a utilizar determinados tipos de feedback y patrones de administración diferenciados en cada docente.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació

¿Piensa el profesor como actúa? Estudio del feedback aportado por docentes de educación física en clase

El feedback es un recurso que ha adquirido gran importancia en Educación Física ya que permite mejorar los procesos de enseñanza y aprendizaje gracias a su inmediatez para modificar los comportamientos motores del alumno. El objetivo de este trabajo fue analizar el feedback que aportan los profesores de educación física y compararlo con la opinión que tienen respecto a su uso. Participaron 3 profesores de educación de la Comunidad de Madrid (España). Siguiendo una metodología observacional, se grabaron y analizaron un total de 18 sesiones, 6 por cada profesor. El análisis comparado de los datos obtenidos en los cuestionarios y los registrados en las sesiones reveló diferencias entre la opinión del profesorado y su actuación en clase. Asimismo, se hallaron tendencias a utilizar determinados tipos de feedback y patrones de administración diferenciados en cada docente.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació

¿Piensa el profesor como actúa? Estudio del feedback aportado por docentes de educación física en clase

El feedback es un recurso que ha adquirido gran importancia en Educación Física ya que permite mejorar los procesos de enseñanza y aprendizaje gracias a su inmediatez para modificar los comportamientos motores del alumno. El objetivo de este trabajo fue analizar el feedback que aportan los profesores de educación física y compararlo con la opinión que tienen respecto a su uso. Participaron 3 profesores de educación de la Comunidad de Madrid (España). Siguiendo una metodología observacional, se grabaron y analizaron un total de 18 sesiones, 6 por cada profesor. El análisis comparado de los datos obtenidos en los cuestionarios y los registrados en las sesiones reveló diferencias entre la opinión del profesorado y su actuación en clase. Asimismo, se hallaron tendencias a utilizar determinados tipos de feedback y patrones de administración diferenciados en cada docente.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació

Gamificación de las competencias comunicativa y sociocultural por medio de la tecnología y la participación activa del alumnado

Memoria ID-087 Ayudas de la Universidad de Salamanca para la innovación docente, curso 2020-2021

Cuéntame: El podcast como herramienta de innovación docente en la enseñanza de lengua y literatura

Memoria ID2022-138 Ayudas de la Universidad de Salamanca para la innovación docente, curso 2022-2023

Long runs of homozygosity are associated with Alzheimer's disease

Altres ajuts: The Genome Research at Fundació ACE project (GR@ACE) is supported by Fundación bancaria "La Caixa," Grifols SA and Fundació ACE. L.M.R. is supported by Consejería de Salud de la Junta de Andalucía (Grant PI-0001/2017).Long runs of homozygosity (ROH) are contiguous stretches of homozygous genotypes, which are a footprint of inbreeding and recessive inheritance. The presence of recessive loci is suggested for Alzheimer's disease (AD); however, their search has been poorly assessed to date. To investigate homozygosity in AD, here we performed a fine-scale ROH analysis using 10 independent cohorts of European ancestry (11,919 AD cases and 9181 controls.) We detected an increase of homozygosity in AD cases compared to controls [ β (CI 95%) = 0.070 (0.037-0.104); P = 3.91 × 10 −5 ; β (CI95%) = 0.043 (0.009-0.076); P = 0.013]. ROHs increasing the risk of AD (OR > 1) were significantly overrepresented compared to ROHs increasing protection (p < 2.20 × 10 −16). A significant ROH association with AD risk was detected upstream the HS3ST1 locus (chr4:11,189,482‒11,305,456), (β (CI 95%) = 1.09 (0.48 ‒ 1.48), p value = 9.03 × 10 −4), previously related to AD. Next, to search for recessive candidate variants in ROHs, we constructed a homozygosity map of inbred AD cases extracted from an outbred population and explored ROH regions in whole-exome sequencing data (N = 1449). We detected a candidate marker, rs117458494, mapped in the SPON1 locus, which has been previously associated with amyloid metabolism. Here, we provide a research framework to look for recessive variants in AD using outbred populations. Our results showed that AD cases have enriched homozygosity, suggesting that recessive effects may explain a proportion of AD heritability

Estudio comparativo del consumo de aminoácidos y amonio en acetificaciones con cultivo superficial y amonio en acetificaciones con cultivo superficial y sumergido

Se han estudiado los cambios en el contenido de aminoácidos y amonio durante diferentes procesos de acetificación de tres vinos tintos mediante cultivo superficial y cultivo sumergido (8 acetificaciones superficiales y 3 sumergidas). Se tomaron muestras al inicio y al final de las mismas. La determinación de aminoácidos y amonio se realizó por CLAE-fluorescencia empleando AQC como agente de derivatización precolumna. Este método, validado satisfactoriamente, demostró su utilidad para el análisis rutinario de dichos compuestos durante la acetificación. Los resultados mostraron que al inicio de la acetificación el aminoácido más abundante fue prolina seguido de arginina. Se observó un comportamiento diferente entre los dos métodos de acetificación, siendo mucho menor el consumo de aminoácidos en la acetificación sumergida que en la superficial. En esta última, el más consumido fue la prolina, siendo la arginina la principal fuente de nitrógeno en los sistemas sumergidos, lo cual parece estar relacionado con la especie de bacterias acéticas implicadas en el proceso. Además, parece existir cierta correlación entre requerimiento de nitrógeno de estas bacterias y duración del proceso de acetificación

Genome-wide association analysis of dementia and its clinical endophenotypes reveal novel loci associated with Alzheimer's disease and three causality networks : The GR@ACE project

Introduction: Large variability among Alzheimer's disease (AD) cases might impact genetic discoveries and complicate dissection of underlying biological pathways. Methods: Genome Research at Fundacio ACE (GR@ACE) is a genome-wide study of dementia and its clinical endophenotypes, defined based on AD's clinical certainty and vascular burden. We assessed the impact of known AD loci across endophenotypes to generate loci categories. We incorporated gene coexpression data and conducted pathway analysis per category. Finally, to evaluate the effect of heterogeneity in genetic studies, GR@ACE series were meta-analyzed with additional genome-wide association study data sets. Results: We classified known AD loci into three categories, which might reflect the disease clinical heterogeneity. Vascular processes were only detected as a causal mechanism in probable AD. The meta-analysis strategy revealed the ANKRD31-rs4704171 and NDUFAF6-rs10098778 and confirmed SCIMP-rs7225151 and CD33-rs3865444. Discussion: The regulation of vasculature is a prominent causal component of probable AD. GR@ACE meta-analysis revealed novel AD genetic signals, strongly driven by the presence of clinical heterogeneity in the AD series