Papel de los haplogrupos mitocondriales en la patología artrósica : influencia de la selección climática/

[Resumen] La artrosis es la enfermedad reumatológica más común y se caracteriza por una degeneración del cartilago articular junto con el resto de estructuras que forman parte de la articulación. Su prevalencia es elevada y se espera que se incremente notablemente en las próximas décadas debido al envejecimiento de la población. Es la principal causa de incapacidad laboral y una de las principales razones de consulta en medicina general. La artrosis conlleva unos elevados costes económicos tanto desde el punto de vista laboral, como médicos y de calidad de vida. Es una enfermedad compleja y multifactorial en la que interactúan tanto factores ambientales como genéticos. En los últimos años se ha puesto de manifiesto la implicación de la mitocondria en la artrosis a través de diferentes estudios. A pesar de que el metabolismo energético del condrocito es fundamentalmente glucolítico, la mitocondria tiene un papel relevante en la artrosis no solo por la aportación energética que hace a través del proceso de fosforilación oxidativa en la producción de Arp, sino que además la mitocondria constituye la principal fuente de generación de especies reactivas de oxígeno, además de regular los mecanismos de apoptosis en el condrocito, único tipo celular presente en el cartilago, entre otras funciones celulares. La mitocondria posee su propio material genético que, debido a la adaptación a las condiciones climáticas y ambientales sufridas a lo largo de las diferentes migraciones de la especie humana desde su origen africano, ha adquirido una serie de mutaciones estables que permiten caracterizar a las poblaciones humanas según su origen geográfico. Los diferentes conjuntos de polimorfismos característicos de cada una de estas poblaciones han dado lugar a los haplogrupos mitocondriales. Debido a su origen adaptativo a las condiciones ambientales, cada haplogrupo presenta unos mecanismos y funciones metabólicas diferentes. Estas diferencias se han relacionado con la predisposición a padecer diferentes enfermedades, entre las que se encuentra la artrosis. El objetivo de esta tesis es replicar los resultados obtenidos por RegoPérez et al. sobre la influencia de los haplogrupos mitocondriales en la prevalencia de la artrosis en diferentes cohortes mundiales, así como evaluar la participación de los haplogrupos en la progresión de la enfermedad. El primer trabajo de esta tesis analiza la implicación de los haplogrupos en la artrosis comparando los porcentajes de prevalencia en una cohorte del norte de España con los de una cohorte del Reino Unido. Los resultados obtenidos mostraron que existía una asociación diferencial entre las frecuencias de los haplogrupos de ambas cohortes con la artrosis. De manera que, en la cohorte española es el haplogrupo J el que actúa como factor protector frente a la artrosis, mientras que en la cohorte británica es el haplogrupo T el que muestra una asociación estadísticamente significativa como factor protector de artrosis. En el segundo trabajo de esta tesis se analizó la relación de los haplogrupos con la progresión en artrosis. Para ello se utilizaron los datos radiográficos de una cohorte de pacientes del hospital Universitario de A Coruña considerando progresión radiográfica como el incremento en el grado KL durante un periodo de seguimiento de al menos 36 meses. Los resultados obtenidos pusieron de manifiesto la influencia de los haplogrupos sobre la progresión en artrosis, siendo los pacientes pertenecientes al clúster TJ los que presentaban una progresión más lenta de la patología mientras que los portadores del haplogrupo H mostraron una mayor predisposición a alcanzar la prótesis articular .. El tercer trabajo consistió en replicar los resultados obtenidos en el segundo trabajo en una amplia y bien caracterizada cohorte Norteamericana de pacientes artrósicos de rodilla pertenecientes a la Osteoarthritis Initiative. En este estudio se analizó la influencia de los haplogrupos en la progresión de la enfermedad a través de las magnitudes (grado KL, presencia de osteofitos, esclerosis subcondral y la reducción de espacio articular) obtenidas de las imágenes radiográficas de las rodillas de los pacientes incluidos en el estudio. Asimismo, también se estudió la degradación estructural de la articulación mediante las medidas del grosor y el volumen de cartílago en las diferentes zonas que componen la rodilla, obtenidas a partir de imágenes de resonancia magnética. Los resultados mostraron que el haplogrupo T era el que presentaba una progresión radiográfica más lenta que el resto de haplogrupos así como una menor pérdida de grosor y volumen de cartílago en el tiempo en diferentes zonas del compartimento medial de la rodilla. Para finalizar se realizó también un estudio sobre la capacidad de los haplogrupos para distinguir entre diferentes fenotipos de pacientes artrósicos analizando los niveles en suero de algunos de los principales marcadores moleculares de artrosis. Los resultados obtenidos permitieron distinguir claramente dos fenotipos de artrosis; de este modo, los pacientes con mayores niveles séricos de marcadores catabólicos fueron los pacientes portadores del haplogrupo H frente a los pacientes portadores del haplogrupo J. Los resultados de este trabajo mostraron que los haplogrupos mitocondriales son posibles biomarcadores complementarios de artrosis con aplicación en la práctica clínica. En resumen, los resultados de los 4 trabajos que forman parte de esta tesis ponen de manifiesto la influencia de los haplogrupos mitocondriales en la patología artrósica. Las diferentes asociaciones encontradas entre las distintas cohortes analizadas podrían reflejar la adpatación de los haplogrupos a los diferentes patrones climáticos.[Resumo] A artrose é a enfermidade reumatolóxica máis común e caracterízase por unha dexeneración da cartilaxe articular xunto co resto de estruturas que forman parte da articulación. A súa prevalencia é elevada e esperase que se incremente notablemente nas próximas décadas debido o envellecemento da poboación. É a principal causa de incapacidade laboral e unha das principais razóns de consulta na medicina xeral. A artrose leva consigo uns elevados custos económicos tanto dende o punto de vista laboral como médico e de calidade de vida. É unha enfermidade complexa e multifactorial na que interactuan tanto factores ambientais como xenéticos. Nos últimos anos púxose de manifesto a implicación da mitocondria na artrose a través de diferentes estudos. A pesar de que o metabolismo enerxético do condrocito é fundamentalmente glucolítico, a mitocondria ten un papel relevante na amose non só pola achega enerxética que fai a través do proceso de fosforilación oxidativa na produción de ATP, senón que ademais a mitocondria constitúe a principal fonte de xeración de especies reactivas de oslxeno, ademais de regular os mecanismos de apoptose no condrocito, único tipo celular presente na cartilaxe, entre outras funcións celulares. A mitocondria posúe ademais o seu propio material xenético que, debido á adaptación ás condicións climáticas e ambientais sufridas ao longo das diferentes migracións da especie humana dende a súa orixe africana, adquiriu unha serie de mutación s estables que permitiron caracterizar as poboacións humanas segundo a súa orixe xeográfica. Os diferentes conxuntos de polimorfismos característicos de cada unha de stas poboaci6ns de ron lugar aos haplogrupos mitocondriais. Debido á súa orixe adaptativa ás condicións ambientais, cada haplogrupo presenta uns mecanismos e funcións metabólicas diferentes. Estas diferenzas relacionáronse coa predisposición a padecer diferentes enfermidades, entre as que se en contra a artrose. O obxectivo desta tese é replicar os resultados obtidos por Rego-Pérez et al. sobre a influencia dos haplogrupos mitocondriais na prevalencia da artrose en diferentes cohortes mundiais, así como avaliar a participación dos haplogrupos na progresión da enfermidade. O primeiro traballo desta tese analiza a implicación dos haplogrupos na artrose comparando as porcentaxes de prevalencia nunha cohorte do norte de España cos dunha cohorte do Reino Unido. Os resultados obtidos mostraron que existía unha asociación diferencial entre as frecuencias dos haplogrupos de ambas as dúas cohortes coa artrose. De maneira que, na cohorte española é o haplogrupo laque actúa como factor protector fronte á artrose, mentres que na cohorte británica é o haplogrupo T o que mostra unha asociación estatísticamente significativa como factor protector de artrose. No segundo trabaIlo desta tese analizouse a relación dos haplogrupos coa progresión en artrose. Para iso utilizáronse os datos clínicos e radiográficos dunha cohorte de pacientes do hospital Universitario da Coruña avaliando a progresión radiográfica a través do incremento no grao KL durante un período de seguimento de polo menos 36 meses. Os resultados obtidos puxeron de manifesto a influencia dos haplogrupos sobre a progresión en artrose, senda os pacientes pertencentes ao c1úster TI os que presentaban unha progreslOn máis lenta da patoloJÓa, mentres que os portadores do haplogrupo H amos aro n unha maior predisposición a alcanzar a prótese articular. O terceiro traballo desta tese consistiu en replicar os resultados obtidos no segundo traballo nunha ampla e ben caracterizada cohorte norteamericana de pacientes artrósicos de xeonllo pertencentes á Osteoarthritis lnitiative. Neste estudo analizouse a influencia dos haplogrupos na progresión da enfermidade a través das magnitudes (grao KL, presenza de osteofitos, esclerose subcondral e a redución de espazo articular) obtidas das imaxes radiográficas dos xeonllos dos pacientes incluidos no estudo. Asimesmo tamén se estudou a degradación estrutural da articulación mediante as medidas do grosor e o volume de cartilaxe nas diferentes zonas que compoñen o xeonllo, obtidas a partires de imaxes de resonancia magnética. Os resultados mostraron que o haplogrupo T era o que presentaba unha progresión radiográfica máis lenta que o resto de haplogrupos así como unha menor perda de grosor e volume de cartilaxe no tempo en diferentes zonas do compartimento medial do xeonllo. Para finalizar realizo use tamén un estudo sobre a capacidad e dos haplogrupos para distinguir entre diferentes fenotipos de pacientes artrósicos analizando os niveis en soro dalgúns dos principais marcadores moleculares de artrose. Os resultados obtidos permitiron distinguir claramente dous fenotipos de artrose, deste modo, os pacientes con maiores niveis sérico s de marcadores catabólicos foron os pacientes portadores do haplogrupo H fronte aos pacientes portadores do haplogrupo j. Os resultados deste traballo mostraron que os haplogrupos mitocondriais son posibles biomarcadores complementarios de artrose con aplicación na práctica clínica. En resumo, os resultados dos 4 traballos que forman parte desta tese poñen de manifesto a influencia dos haplogrupos mitocondriais na patoloxía artrósica. As diferentes asociacións atopadas entre as distintas poboacións analizadas poderían estar a reflexar a adaptación dos haplogrupos aos diferentes patróns climáticos.[Abstract]Osteoartritis (DA) is the most common rheumatic disease related to ageing and is characterized by the degeneration of articular cartilage together witb the rest of joint structures. Since DA is an age-related disease, its prevalence and burden are expected to increase substantially in the near future due to demographic changes and ageing population. DA is the leading cause ofwork incapacitation and one ofthe most common reasons for visiting primary care physicians. The economic cost of DA is also particularly high, resulting in a decreased quality oflife, hospitalizations and loss ofproductivity. DA is a multifactorial disease in which both enviromental and genetic factors interact. In recent years a growing body of evidence suggests the implication of the mitochondria in the pathogenesis of DA, even though the glycolitic nature of articular chondrocytes. In addition to the energetic contribution, mitocondria is the main source of reactive oxygen species which lead to cause sigRificant oxidative damage to the cell, and one of the major celular pathways of apoptosis in DA chondrocytes, among other cellular functions. Mitochondria also have their own DNA and, as the result of an adaptative process to the new climatic and environmental conditions suffered throughout the different migrations humans from their African origin, it acquired a series of stable mutations that allow nowadays the characterization of human populations according to their geographical origino So, a particular set of single nucleotide polymorphisms defines each of the mtDNA haplogroups, and these haplogroups represent populations of different ancestral origins. As a result of their enviromental adaptation, each haplogroup shows different mechanisms and metabolic functions. Recent studies provided evidence that mtDNA haplogroups inlluence the penetrance and c1inical severity of modern diseases, including DA. The aim ofthis thesis is to reply the results obtained by Rego-Pérez et al. on the inlluence of the mitochondrial haplogroups in the prevalence of DA in different world cohorts, as well as to evaluate the participation of the haplogrupos in the progression ofthe disease. In the first chapter of this thesis we analyze the frecuency distribution of the mtDNA haplogroups in two DA cohorts of populations from different geograpbic locations. The results obtained showed a differential association among the frequencies of the haplogroups of both cohorts with DA. The haplogroup J appeared underrepresented in DA patients from 5pain when compared with the healthy controls whereas the haplogroup T showed a decreased risk of DA in the UK cohort. In the second work of this thesis we analyzed the inlluence of the mtDNA haplogroups on the radiographic progression of DA. We evaluated the radiographic progression in a well-characterized follow-up cohort of 5panish patients, from Hospital Universitario de A Coruña, defining DA progression as any radiographic worsening of the KL score in a follow up period of not less than 36 months between radiographs. The results showed that patients belonging to cluster TJ had a slower DA progression and patients with mtDNA haplogroup H were more apt to require joint replacement surgery than non-H carriers. In the third work we evaluated the occurrence of the mtDNA haplogroups in the progression of knee DA using the longitudinal data obtained from radiographs and magentic resonance images of knee DA patients belonging to the progression subcohort of the Dsteoarthritis Initiative. In this study the progression criteria was defined as an increase of at least one KL grade in either knee; additionally, we also analyzed the progression ofjoint space narrowing, osteophytes and subchondral sclerosis in the medial compartment where the progression criteria was an increase of at least one DARSI atlas grade in either knee. We also analyzed the cartilage integrity by measuring cartilage thickness and volume through magnetic resonance images from knee DA patients. The results revealed that patients carrying mtDNA haplogroup T show a lower cumulative probability of radiographic progression as well as a significant reduced loss of knee cartilage thickness and volume over tiem in the medial compartment of the knee. Finally, the fourth study aims to assess a mitochondrion-related phenotype in DA patients. We analyzed the serum levels of DA-related biomarlers between DA patients and healthy controls in carriers of haplogroups H and ¡. The results showed two different mitochondrion-related DA phenotypes clearly defined, thereby, patients that carry haplogroup H showed higher levels of catabolic markers of DA than DA patients carrying the mtDNA haplogroup ¡. Briefly, the results of the 4 works that form part of this thesis show the influence of the mitochondrial haplogroups in the DA disease. The different association found among cohorts could reflect the adaptation of the mtDNA haplogroups to different climatic patterns

Correction: Gustafson et al., Whole Genome Sequencing Revealed Mutations in Two Independent Genes as the Underlying Cause of Retinal Degeneration in an Ashkenazi Jewish Pedigree. Genes 2017, 8, 210.

Following publication of our article [1], we identified discrepancies between the pedigree shown in Figure 1 and the rest of the text.[...]

Aqueous Two-Phase Systems: A Correlation Analysis

Aqueous two-phase systems involve a limited region of a complicated phase diagram usually containing solid phases. Studies regarding these systems generally focus on the liquid–liquid region because it provides a suitable medium for liquid extraction of biomolecules and metal ions. In this work, the whole phase diagram was determined for ternary mixtures of water, dipotassium tartrate, and ethanol or 1-propanol at several temperatures and atmospheric pressure. In addition, density and refractive index of a diluted region of the mixtures were measured for compositional analysis of samples. Different regions were found involving solid and liquid phases, or the anhydrous and hemihydrated salt. The correlation of equilibrium data within the different regions was carried out with the nonrandom two-liquid model. To that aim, some restrictions were required to ensure the miscibility of the binary subsystem with water and alcohol. Individual correlation at each temperature and simultaneous correlation of data at all temperatures led to adequate phase diagram representation and low deviations. Despite the use of temperature-dependent parameters, results were slightly worse in the latter case (around or below 1%). The liquid–liquid equilibrium (LLE) data alone were also correlated, obtaining similar deviations to those obtained considering all equilibrium data. In all cases deviations found with 1-propanol are higher (in the range of 3–4%) due to the proximity of the LLE region to the miscible water + 1-propanol binary subsystem. The correlation of exclusive LLE data is easier from the point of view of computation but leads to model parameters with limited utility.The authors are grateful to Xunta de Galicia for support through Project ED431B 2017/023 and the Galician Network of Ionic Liquids (ED431D 2017/06) and the CRETUS Strategic Partnership (ED431E 2018/01), cofunded by the European Regional Development Fund

Effects of aluminum and zinc on the oxidative stress caused by 6-hydroxydopamine autoxidation: relevance for the pathogenesis of Parkinson’s disease

AbstractAluminum and zinc have been related to the pathogenesis of Parkinson’s disease (PD), the former for its neurotoxicity and the latter for its apparent antioxidant properties. 6-Hydroxydopamine (6-OHDA) is an important neurotoxin putatively involved in the pathogenesis of PD, its neurotoxicity often being related to oxidative stress. The potential effect of these metals on the oxidative stress induced by 6-OHDA autoxidation and the potential of ascorbic acid (AA), cysteine, and glutathione to modify this effect were investigated. Both metals, particularly Al3+, induced a significant reduction in ⋅OH production by 6-OHDA autoxidation. The combined action of AA and a metal caused a significant and sustained increase in ⋅OH generation, particularly with Al3+, while the effect of sulfhydryl reductants was limited to only the first few minutes of the reaction. However, both Al3+ and Zn2+ provoked a decrease in the lipid peroxidation induced by 6-OHDA autoxidation using mitochondrial preparations from rat brain, assessed by TBARS formation. In the presence of AA, only Al3+ induced a significant reduction in lipid peroxidation. After intrastriatal injections of 6-OHDA in rats, tyrosine hydroxylase immunohistochemistry revealed that Al3+ reduces 6-OHDA-induced dopaminergic lesion in the striatum, which corroborates the involvement of lipid peroxidation in 6-OHDA neurotoxicity and appears to discard the participation of this mechanism on PD by Al3+ accumulation. The previously reported antioxidant properties of Zn2+ appear to be related to the induction of Zn2+-containing proteins and not to the metal per se

Mitochondrial Haplogroups Define Two Phenotypes of Osteoarthritis

Objective: To assess a mitochondrion-related phenotype in patients with osteoarthritis (OA). Methods: Serum levels of the following OA-related biomarkers: matrix metalloproteinase-1 (MMP-1); MMP-3; MMP-13; myeloperoxidase (MPO); a peptide of the alpha-helical region of type II collagen, Coll2-1, and its nitrated form Coll2-1NO2; a C-terminal neoepitope generated by the collagenase-mediated cleavage of collagen type II triple helix, C2C; the C-propeptide of collagen type II, CPII; hyaluronic acid (HA); human cartilage glycoprotein 39, YKL-40; cartilage oligomeric matrix protein; and cathepsin K were analyzed in 48 OA patients and 52 healthy controls carrying the haplogroups H and J. Logistic regression models and receiver operating characteristic (ROC) curves were performed to predict the onset of OA. Results: MMP-13 was the only biomarker significantly increased in OA patients compared to healthy controls in both haplogroups H and J. The collagen type II biomarkers, Coll2-1, Coll2-1NO2, the Coll2-1NO2/Coll2-1 ratio, C2C, CPII, and the C2C:CPII ratio were significantly increased in OA patients carrying haplogroup H compared to OA carriers of the haplogroup J. Two logistic regression models for diagnosis were constructed and adjusted for age, gender, and body mass index. For haplogroup H, the biomarkers significantly associated with OA were MMP-13 and Coll2-1; the area under the curve (AUC) of the ROC curve for this model was 0.952 (95% CI = 0.892–1.012). For haplogroup J, the only biomarker significantly associated with OA was MMP-13; the AUC for this model was 0.895 (95% CI = 0.801–0.989). Conclusion: The mitochondrial DNA haplogroups are potential complementary candidates for biomarkers of OA; their genotyping in conjunction with the assessment of classical protein molecular markers is recommended

Reinterpreting Interpretability for Fuzzy Linguistic Descriptions of Data

Postprin

Mitochondrial DNA haplogroups influence the risk of incident knee osteoarthritis in OAI and CHECK cohorts: a meta-analysis and functional study

Extended report[Abstract] Objective To evaluate the influence of the mitochondrial DNA (mtDNA) haplogroups in the risk of incident knee osteoarthritis (OA) and to explain the functional consequences of this association to identify potential diagnostic biomarkers and therapeutic targets. Methods Two prospective cohorts contributed participants. The osteoarthritis initiative (OAI) included 2579 subjects of the incidence subcohort, and the cohort hip and cohort knee (CHECK) included 635, both with 8-year follow-up. The analysis included the association of mtDNA haplogroups with the rate of incident knee OA in subjects from both cohorts followed by a subsequent meta-analysis. Transmitochondrial cybrids harbouring haplogroup J or H were constructed to detect differences between them in relation to physiological features including specific mitochondrial metabolic parameters, reactive oxygen species production, oxidative stress and apoptosis. Results Compared with H, the haplogroup J associates with decreased risk of incident knee OA in subjects from OAI (HR=0.680; 95% CI 0.470 to 0.968; p<0.05) and CHECK (HR=0.728; 95% CI 0.469 to 0.998; p<0.05). The subsequent meta-analysis including 3214 cases showed that the haplogroup J associates with a lower risk of incident knee OA (HR=0.702; 95% CI 0.541 to 0.912; p=0.008). J cybrids show a lower free radical production, higher cell survival under oxidative stress conditions, lower grade of apoptosis as well as lower expression of the mitochondrially related pro-apoptotic gene BCL2 binding component 3 (BBC3). In addition, J cybrids also show a lower mitochondrial respiration and glycolysis leading to decreased ATP production. Conclusions The physiological effects of the haplogroup J are beneficial to have a lower rate of incident knee OA over time. Potential drugs to treat OA could focus on emulating the mitochondrial behaviour of this haplogroup.Instituto de Salud Carlos III; CIBERCB06/01/0040-SpainInstituto de Salud Carlos III; RETIC-RIER-RD12/0009/0018Instituto de Salud Carlos III; PI14/01254Instituto de Salud Carlos III; CP12/0319