Randomised Controlled Trial: Partial Hydrolysation of Casein Protein in Milk Decreases Gastrointestinal Symptoms in Subjects with Functional Gastrointestinal Disorders

Unspecific gastrointestinal symptoms associated with milk consumption are common. In addition to lactose, also other components of milk may be involved. We studied whether the partial hydrolysation of milk proteins would affect gastrointestinal symptoms in subjects with functional gastrointestinal disorders. In a randomised, placebo-controlled crossover intervention, subjects (n = 41) were given ordinary or hydrolysed high-protein, lactose-free milkshakes (500 mL, 50 g protein) to be consumed daily for ten days. After a washout period of ten days, the other product was consumed for another ten days. Gastrointestinal symptoms were recorded daily during the study periods, and a validated irritable bowel syndrome-symptom severity scale (IBS-SSS) questionnaire was completed at the beginning of the study and at the end of both study periods. Blood and urine samples were analysed for markers of inflammation, intestinal permeability and immune activation. Both the IBS-SSS score (p = 0.001) and total symptom score reported daily (p = 0.002) were significantly reduced when participants consumed the hydrolysed product. Less bloating was reported during both study periods when compared with the baseline (p < 0.01 for both groups). Flatulence (p = 0.01) and heartburn (p = 0.03) decreased when consuming the hydrolysed product but not when drinking the control product. No significant differences in the levels of inflammatory markers (tumor necrosis factor alpha, TNF-α and interleukin 6, IL-6), intestinal permeability (fatty acid binding protein 2, FABP2) or immune activation (1-methylhistamine) were detected between the treatment periods. The results suggest that the partial hydrolysation of milk proteins (mainly casein) reduces subjective symptoms to some extent in subjects with functional gastrointestinal disorders. The mechanism remains to be resolved

Hole misalignment and gain performance of Gaseous Electron Multipliers

It is well known and has been shown that the gain performance of Gaseous Electron Multipliers (GEM) depends on the size of the holes. With an optical scanner it is possible to measure the dimensions of the holes, and to predict the performance of GEMs. However, the gain prediction of GEMs that are manufactured with a double mask etching technique is not straightforward. With the hole size information alone, it is not possible to make precise prediction of the gain. We show that the alignment of the photo-masks between the two sides of the GEM foils plays a crucial role. A misalignment of a few microns can lower the gain substantially. The study is performed by using the Helsinki high definition optical scanner for quality control of GEM foils, and this will show its true potential.Peer reviewe

The influence of implicit and explicit biofeedback in first-person shooter games

To understand how implicit and explicit biofeedback work in games, we developed a first-person shooter (FPS) game to experiment with different biofeedback techniques. While this area has seen plenty of discussion, there is little rigorous experimentation addressing how biofeedback can enhance human–computer interaction. In our two-part study, (N=36) subjects first played eight different game stages with two implicit biofeedback conditions, with two simulation-based comparison and repetition rounds, then repeated the two biofeedback stages when given explicit information on the biofeedback. The biofeedback conditions were respiration and skin-conductance (EDA) adaptations. Adaptation targets were four balanced player avatar attributes. We collected data with psychophysiological measures (electromyography, respiration, and EDA), a game experience questionnaire, and game-play measures. According to our experiment, implicit biofeedback does not produce significant effects in player experience in an FPS game. In the explicit biofeedback conditions, players were more immersed and positively affected, and they were able to manipulate the game play with the biosignal interface. We recommend exploring the possibilities of using explicit biofeedback interaction in commercial games. Author Keywords Games, playing, affective computing, biosignals

Identification of proprotein convertase substrates using genome-wide expression correlation analysis

Identification of proprotein convertase substrates using genome-wide expression correlation analysis Turpeinen, Hannu Kukkurainen, Sampo Pulkkinen, Kati Kauppila, Timo Ojala, Kalle Hytonen, Vesa P Pesu, Marko England BMC genomics BMC Genomics. 2011 Dec 20;12:618. engABSTRACT: BACKGROUND: Subtilisin/kexin-like proprotein convertase (PCSK) enzymes have important regulatory function in a wide variety of biological processes. PCSKs proteolytically process at a target sequence that contains basic amino acids arginine and lysine, which results in functional maturation of the target protein. In vitro assays have showed significant biochemical redundancy between the seven family members, but the phenotypes of PCSK deficient mice and patients carrying an inactive PCSK allele argue for a specific biological function. Modeling the structures of individual PCSK enzymes has offered little insights into the specificity determinants. However, previous studies have shown that there can be a coordinated expression between a PCSK and its target molecule. Here, we have surveyed the putative PCSK target proteins using genome-wide expression correlation analysis and cleavage site prediction algorithms. RESULTS: We first performed a gene expression correlation analysis over the whole genome for all PCSK enzymes. PCSKs were found to cluster differently based on the strength of correlations. The screen for putative PCSK target proteins showed a significant enrichment (p-values from 1.2e-4 to <1.0e-10) of putative targets among the most positively correlating genes for most PCSKs. Interestingly, there was no enrichment in putative targets among the genes that correlated positively with the biologically redundant PCSK7, whereas PCSK5 showed an inverse correlation. PCSKs also showed a highly variable degree of shared target genes that were identified by expression correlation and cleavage site prediction. Multiple alignments were used to evaluate the putative targets to pinpoint the important residues for the substrate recognition. Finally, we validated our approach and identified biochemically PAPPA1 and ADAMTS6 as novel targets for FURIN proteolytic activity. CONCLUSIONS: Most PCSK enzymes display strong positive expression correlation with predicted target proteins in our genome-wide analysis. We also show that expression correlation screen combined with a cleavage site-prediction analysis can be used to identify novel bona fide target molecules for PCSKs. Exploring the positively correlating genes can thus offer additional insights into the biology of proprotein convertases.Peer reviewe

The prevalence of cardiac complications and their impact on outcomes in patients with non-traumatic subarachnoid hemorrhage.

Subarachnoid hemorrhage (SAH) is a serious condition, and a myocardial injury or dysfunction could contribute to the outcome. We assessed the prevalence and prognostic impact of cardiac involvement in a cohort with SAH. This is a prospective observational multicenter study. We included 192 patients treated for non-traumatic subarachnoid hemorrhage. We performed ECG recordings, echocardiographic examinations, and blood sampling within 24 h of admission and on days 3 and 7 and at 90 days. The primary endpoint was the evidence of cardiac involvement at 90 days, and the secondary endpoint was to examine the prevalence of a myocardial injury or dysfunction. The median age was 54.5 (interquartile range [IQR] 48.0-64.0) years, 44.3% were male and the median World Federation of Neurological Surgeons (WFNS) score was 2 (IQR 1-4). At day 90, 22/125 patients (17.6%) had left ventricular ejection fractions ≤ 50%, and 2/121 patients (1.7%) had evidence of a diastolic dysfunction as defined by mitral peak E-wave velocity by peak e' velocity (E/e') > 14. There was no prognostic impact from echocardiographic evidence of cardiac complications on neurological outcomes. The overall prevalence of cardiac dysfunction was modest. We found no demographic or SAH-related factors associated with 90 days cardiac dysfunction

Suhteellinen deprivaatio ja sosiaaliset ongelmat: Suhteellinen näkökulma hyvinvointierojen selittämisessä

Tässä artikkelimuotoisessa pro gradu -tutkielmassa tarkastelen ihmisten välisiin vertailuihin perustuvan suhteellisen näkökulman käyttökelpoisuutta hyvinvointierojen tarkastelussa. Käytän teoreettisena viitekehyksenä suhteellisen deprivaation teoriaa, missä merkittävässä asemassa ovat ihmisten subjektiiviset sosiaaliset vertailut omiin merkityksellisiksi koettuihin viiteryhmiinsä. Tutkimuksen mielenkiinto kohdistuu erityisesti siihen, kuinka henkilön kokemus omasta asemastaan suhteessa muihin vaikuttaa hänen hyvinvointiinsa. Tarkastelen, miten objektiivisten ja subjektiivisten vertailujen kautta syntyvät suhteelliset erot selittävät erilaisten konkreettisten vaikeuksien esiintymistä ja kasautumista aineistossa. Nimitän vaikeuksia sosiaalisiksi ongelmiksi ja suhteellisia eroja suhteelliseksi deprivaatioksi. Tutkimuksen tarkoituksena on selvittää, miten suhteellinen deprivaatio ilmenee aineistossa sekä tarkastella, onko suhteellinen deprivaatio yhteydessä sosiaalisiin ongelmiin. Lisäksi selvitetään, minkälaiset kyselystä valikoidut hyvinvointieroja selittävät tarkastelutavat ovat voimakkaimmin yhteydessä sosiaalisiin ongelmiin. Tutkimuksen aineistona toimii vuonna 2012 Itä-Suomen yliopiston WEBE-hankkeen yhteydessä kerätty 1883 vastaajan kysely. Tutkimusmenetelminä käytän ristiintaulukointia, korrelaatioita ja multinomiaalista regressioanalyysia. Tulokset osoittavat, että vertailuun perustuvat suhteelliset erot hyvinvoinnissa ovat yhteydessä aineistossa ilmeneviin ongelmiin. Korkeammasta suhteellisesta deprivaatiosta raportoivilla oli aineistossa keskimäärin enemmän sosiaalisia ongelmia. Regressioanalyysissa subjektiivista vertailua korostava malli selitti samanveroisen osan sosiaalisten ongelmien vaihtelusta kuin objektiiviseen vertailuun perustuva malli tai onnellisuuteen ja tyytyväisyyteen perustuva subjektiivisen hyvinvoinnin malli. Tutkimus antaa viitteitä siitä, että suhteellinen näkökulma vaikuttaa käyttökelpoiselta ainakin sosiaalisten ongelmien tutkimisessa mutta myös laajemmin hyvinvointitutkimuksessa. Suhteellisen näkökulman selkeyttämiseksi ja käytännön mittareiden aikaansaamiseksi jatkotutkimus, mukaan lukien näkökulman teoreettinen kehittely, näyttää tarpeelliselta.This article examines the usefulness of a relative approach toward explaining differences in reported welfare or well-being in Finnish adult population. Relative deprivation is used as a theoretical framework, which emphasizes subjective social comparisons to significant reference groups. A special interest is in understanding how people’s subjective experiences of their own position in comparison to other people affect their welfare. The article investigates how relative differences formed by subjective or objective comparisons to other people explain a scope of concrete difficulties experienced by the respondents and how these difficulties accumulate. The difficulties are described as social problems and the relative differences in welfare are considered as relative deprivation. The aim of the study is to find out how much relative deprivation occurs in the data and how it is related to social problems. Also, the explanatory power of different selected approaches or models are compared. The data is from University of Eastern Finland research project (WEBE) survey which had 1883 respondents. The data was gathered in 2012. Crosstabulation and correlations are used to describe the data and multinomial logistic regression is used model the interactions between relative deprivation and social problems. The results show a connection between relative differences in welfare and the number of reported difficulties in the data. The more relatively deprived the respondents were, the more social problems they reported. The multinomial logistic regression analysis found that the model based on subjective social comparisons had an equal or even superior explanatory power compared to other models. The study suggests at least some usefulness of a relative approach in examining social problems and more broadly, understanding the differences in welfare and/or well-being. Further study, including theoretical development, is recommended for uncluttering the concepts and devising practical indicators

Avoimen lähdekoodin ohjelmia paikkatietoaineiston käsittelyssä

Tässä opinnäytetyössä on tarkasteltu yleisimpiä avoimen lähdekoodin lisenssejä sekä avoimen lähdekoodin ohjelmia paikkatietoaineistojen käsittelyyn liittyen. Ensisijaisesti on keskitytty QGIS-ohjelmiston toimintaan ja sen käyttökelpoisuuteen. Opinnäytetyö on syntynyt tekijän oman kiinnostuksen pohjalta avoimen lähdekoodin ohjelmiin sekä avoimeen aineistoon. Työssä on pyritty selvittämään tarjolla olevia ohjelmistoja Open Source Geospatial-paikkatietoportaalista ja testaamaan ohjelmia käyttämällä avointa aineistoa. Työssä havaittiin QGIS-ohjelmiston laaja-alaisuus ja skaalattavuus eri käyttötarpeisiin, etenkin jos on valmis panostamaan ohjelmien koodaamiseen. Ohjelman haittapuolena voidaan toisaalta pitää sen monipuolisuutta, joka vaatii paljon perehtymistä

Paikallisen turvallisuustilanteen nykytilan arviointi

Opinnäytetyö käsittelee paikallisen turvallisuustilanteen arviointia paikallisessa turvallisuussuunnittelussa. Työ jakautuu kahteen osaan, joista ensimmäisessä kuvataan Helsingin kaupungin Vuosaaren peruspiirissä tehty turvallisuustilanteen arviointi tai turvallisuuskartoitus. Työn toisessa osassa pohditaan tehdyn kartoituksen ja paikallisen turvallisuussuunnittelun teorian avulla saatua kuvaa paikallisen turvallisuustilanteen arvioinnista ja sitä, mitkä tekijät vaikuttavat paikallisen turvallisuussuunnittelun tueksi tuotettavan tiedon muodostamiseen. Vuonna 2007 Itäkeskuksen poliisipiirin alueella käynnistetty uuden lähipoliisimallin pilottihanke ja siitä saadut myönteiset kokemukset käynnistivät alueella paikallisen turvallisuussuunnittelun harjoittamisen. Eri viranomaisten keskinäisen yhteistyön perinteestä käynnistynyt tur-vallisuusyhteistyö sai ensimmäisen valtakunnallisen mallinsa vuoden 1999 Turvallisuustalkoot –rikostorjunnan periaateohjelmassa. Turvallisuustalkoista alkanut, systemaattisuuteen ja laaja-alaiseen turvallisuuden hallintaan tähtäävä turvallisuusyhteistyö ja sitä tukeva turvallisuus-suunnittelu pyrittiin vuoden 2004 ja 2008 sisäisen turvallisuuden ohjelmilla vakiinnuttamaan keskeiseksi paikallista turvallisuustyötä ohjaavaksi muodoksi. Itä-Helsingissä käynnistetyn turvallisuussuunnittelun oli määrä laajeta käsittämään myös ai-emmasta suunnitelmasta pois jätetty kaupungin peruspiirijaon mukainen Vuosaaren peruspiiri. Paikallisen turvallisuussuunnittelun prosessissa kuvattujen vaiheiden mukaisesti tulisi alueen turvallisuuden nykytilasta tehdä arviointi, joka toimisi paikallisen turvallisuussuunnitelman muodostamisen tukena. Vuosaaren turvallisuuden kartoittamisen välineet ja menetelmät pohjautuvat paikallisen turvallisuussuunnittelun teoriaan. Käytettyjä aineistoja ovat eri toimijoiden tilastot, aiemmat tutkimukset, sekä asiantuntijoiden haastattelut. Turvallisuustilanteen arvioimisen ja tiedonmuodostuksen pohtimisen pohjan muodostavat sekä Vuosaaren kartoittamisessa tehdyt havainnot että toisaalta paikallisen turvallisuussuunnittelun teoria-aineistosta esiin nousevat periaatteet. Kuvaan teorian muodostumista ja turvallisuussuunnittelun vakiintumista turvallisuusyhteistyön keskeiseksi muodoksi, sekä siinä asetettuja tavoitteita, vaatimuksia ja suosituksia turvallisuustilannetta kuvaavalle ja turvallisuusyhteistyötä tukevalle tiedolle. Turvallisuussuunnittelun kohteena olevan alueen arviointi on keskeinen osa turvallisuussuunnittelun prosessia. Turvallisuussuunnittelu puolestaan on keskeinen turvallisuusyhteistyön väline. Turvallisuusyhteistyön jäsentyminen vaikuttaa siten suoraan sen tueksi tuotettavaan tietoon. Turvallisuusyhteistyö, sekä paikallinen turvallisuussuunnittelu sen välineenä ovat sidoksissa paikallisen turvallisuuden kuvaan samoin kuin kuvan muodostuminen on sidoksissa turvallisuusyhteistyön rakenteisiin ja toimijoihin. Pyrin opinnäytetyössäni kuvaamaan myös näiden tiedonmuodostuksen ja turvallisuussuunnittelun prosessin välistä suhdetta.Local safety assessment The conduction of a pilot project of a new local policing model in the Itäkeskus –police precinct in 2007 and the positive response it raised, began the process of local safety planning in the region. Local safety planning originates from local crime prevention planning established in 1999 through the “Turvallisuustalkoot” national crime prevention program. This local co-operation between public officials and other participants, such as companies and the third sector, was to be established through the internal safety programs of 2004 and 2008 as the most essential form of local safety work. The safety planning which had begun in Eastern Helsinki in 2007 was to be brought to include the previously excluded district of Vuosaari. According to the described phases of local safety planning, an assessment of the current state of safety in the district was to be made. This audit would then be used to support the formation of a local safety plan. The purpose of this thesis is, on one hand to describe the current state of safety in Vuosaari and the process leading to that assessment, and on the other hand to find out through practice and theory what kind of information should be produced to support local safety planning. The methods and sources of information used to describe the state of safety in Vuosaari were found in, and used according to the theory of local safety planning and local crime prevention. The main sources were statistical data from public officials, previous studies and questionnaires and interviews of experts. The information gained through these sources will be analyzed and the key factors contributing to the state of safety brought forth. The ideas of how and what type of information should be gathered or produced to support local safety planning are formed through analyzing the process and the theory describing it. The objective of this analysis is to find out the principles guiding local safety planning and what requirements they set to the information produced through audits and assessments, and also how they affect the process in practice. Auditing and assessing the state safety of a local area is an essential part of the whole process of local safety planning. Also, safety planning is an essential, if not the most essential form of safety co-operation, thus affecting directly the information produced to support it. Safety co-operation through safety planning is a form of finding answers to the question “how” rather than “what”. Thus, when assessing and forming an image of local safety, the question of “how” should be addressed more vigorously. In a multilateral co-operation the conception of the state of safety is affected by the participants. Also, the number and nature of the participants is affected by the image formed of the state of safety