BLACK MILDEW FUNGI IN POLYCULTURES FROM AGROECOLOGICAL TRANSITION AREAS

Five species of Meliola and one of Prillieuxina (black mildews) were recorded in agroecological transitional areas in polyculture crop (consortium of plants – COPs – and agroforestry systems – AFSs) located in Pernambuco State, northeast Brazilian. Meliola anacardii  on Anacardium occidentale, M. annonacearum on Annona montana, M. mangiferae on Mangifera indica, M. rhoina on Schinus terebinthifolius, M. trichostroma on Psidium guajava and Prillieuxina winteriana on Annona muricata and on Annona montana.  These species differ for host relationship and taxonomic structures. Illustrations of Prillieuxina winteriana, Meliola spp. and its hyperparasites are provided.Five species of Meliola and one of Prillieuxina (black mildews) were recorded in agroecological transitional areas in polyculture crop (consortium of plants – COPs – and agroforestry systems – AFSs) located in Pernambuco State, Brazilian northeast. Meliola anacardii on Anacardium occidentale, M. annonacearum on Annona montana, M. mangiferae on Mangifera indica, M. rhoina on Schinus terebinthifolius, M. trichostroma on Psidium guajava and Prillieuxina winteriana on A. muricata and A. montana.  These species differed for host relationship and taxonomic structures. Illustrations of P. winteriana, Meliola spp. and its epiparasites are provided

SUBSTRATES FOR THE PRODUCTION OF ENTOMOPATHOGENIC ISOLATES OF Fusarium caatingaense TO CONTROL Dactylopius opuntiae

Opuntia ficus-indica (prickly pear) is used as a source of animal feed in Northeast Brazil. Its yield has been severely affected by insect pest Dactylopius opuntiae (cochineal scale). Fusarium caatingaense isolates have been reported to be effective in controlling this pest. Therefore, this study aimed to select substrates for the production of F. caatingaense. Conidia production and viability of five F. caatingaense isolates were evaluated on six substrates: rice, sugarcane bagasse, sugarcane bagasse + 0.66% w/v peptone, corn grains, corn grains + 0.66% w/v peptone, and sweet corn grains. Rice and corn were the best substrates for the production of most isolates. Isolate URM 6778 was selected for the analyses of sporulation, germination, and pathogenicity after storage in these substrates at 4 ºC and 28 ºC and periods of 0, 15, 30, and 60 days. Corn was the best substrate for the fungus and 4 ºC was the most suitable storage temperature. The highest conidia concentration was observed on the 30th day of storage, with a decrease on the 60th day. Conidia remained viable in all periods analyzed, except on the 60th day at 28 ºC. Pathogenicity against D. opuntiae was kept until 30 days of storage.Opuntia ficus-indica (palma forrageira) é utilizada como fonte de alimentação animal no Nordeste brasileiro. Sua produtividade tem sido afetada severamente pelo inseto Dactylopius opuntiae (cochonilha-do-carmim). Isolados de Fusarium caatingaense foram reportados como eficientes no controle dessa praga. Este estudo objetivou selecionar substratos para a produção de F. caatingaense. A produção e viabilidade de conídios de cinco isolados foram avaliadas em seis substratos: arroz, bagaço de cana-de-açúcar, bagaço de cana-de-açúcar + peptona 0,66% p/v, grãos de milho, grãos de milho + peptona 0,66% p/v, e grãos de milho doce. O arroz e milho foram os melhores substratos para produzir a maioria dos isolados. O isolado URM 6778 foi selecionado para análises de esporulação, germinação e patogenicidade após o armazenamento nesses substratos nas temperaturas 4 e 28 ºC, por 0, 15, 30 e 60 dias. O milho foi o melhor substrato para esse fungo, sendo a temperatura 4 ºC a mais indicada para o armazenamento. A maior concentração de conídios foi observada no trigésimo dia de armazenamento, havendo um decréscimo no sexagésimo dia. Os conídios mantiveram-se viáveis em todos os períodos analisados, exceto no sexagésimo dia a 28 ºC. A patogenicidade contra D. opuntiae foi mantida até 30 dias de armazenamento

Reconstrução e visualização de campos escalares 3D

-A necessidade de uma representação computacional cada vez mais fiel dos objetos do mundo real é inerente ao avanço das tecnologias computacionais na sociedade atual. Em especial, na computação gráfica, o objetivo é conseguir uma visualização que represente bem os modelos reais. Para que um objeto real seja representado graficamente, o ponto de partida seria a aquisição de dados do mesmo. A depender do resultado gráfico esperado, esses dados podem passar por uma serie de processamentos até que se obtenha um modelo a ser exibido. Muitas vezes, técnicas de modelagem geométrica não são suficientes para se gerar o modelo geométrico esperado. Isso porque podem esbarrar em uma série de empecilhos como: o alto tempo gasto em todo processo, a incoerência dos dados adquiridos, as inexatidões geradas por etapas manuais, etc. O surgimento e o avanço tecnológico dos dispositivos ópticos de obtenção de dados geométricos permitem uma amostragem de dados cada vez melhor de objetos reais. Porém, introduz-se um novo problema: como extrair das amostras boas representações de superfícies? A resposta a essa pergunta é a aplicação de técnicas de uma área de estudos dentro da computação gráfica: a reconstrução de superfícies. Campos escalares podem ser arbitrariamente complexos. Isso leva a uma grande preocupação quanto ao custo dos métodos e dos modelos finais destas aplicações. A conseqüência é que a otimização, concorrentemente às pesquisas de reconstrução, mostrou-se de grande importância e com grande diversidade de métodos para a realização da mesma. A otimização é comumente realizada sobre a malha resultante do processo de reconstrução. Após a reconstrução de um campo escalar, é necessário obter um modelo computacional eficiente e com grande grau de fidelidade ao modelo real. Este projeto se insere neste contexto. O objetivo é extrair informações a partir de campos escalares (superfícies ou volumes) e processá-los de forma que possa ser visualizado e analisado eficientemente. Esses processamentos envolveram o estudo de estruturas de dados eficientes, a otimização da malha que representa o modelo computacional. Essas operações precisam, não só manter a coerência, como ser feitas em um tempo hábil, devido à necessidade, por exemplo, de que estas sejam utilizadas em uma aplicação de tempo real. O principal resultado desta primeira parte do projeto é um conjunto de soluções para reconstrução de campos escalares e processamento de malhas. Para o desenvolvimento desta biblioteca, foi fundamental um estudo sobre vários conceitos importantes para que esta fosse consistente e atendesse a diversas aplicações. Foram utilizandos o método de Hoppe para reconstrução de superfícies e da teoria estelar na área de geometria computacional. A teoria estelar consiste no estudo da equivalência entre combinações de complexos simpliciais, ou seja, estuda uma classe de operações para editar uma malha sem alterar a sua topologia. Os resultados são basante satisfatórios no sentido de que foram abertas novas linhas de pesquisa. Entre elas podemos destacar a cooperação do GCG - Grupo de Computação Gráfica, Imagem e Visão com o Grupo da Física da Matéria Condensada na formulação de soluções para construção virtual de nanotubos de carbono e processamento de campos escalares contendo aglomerados de partículas. Além desses desdobramentos, esperam-se publicações importantes ainda em 2008

A relevância da conferência familiar em contexto hospitalar - revisão integrativa

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Pathogenicity of Beauveria bassiana and production of cuticle-degrading enzymes in the presence of Diatraea saccharalis cuticle

The sugarcane borer, Diatraea saccharalis, is one of the worst pests in Brazilian sugarcane crop, causing high levels of financial losses every year. Beauveria bassiana is an entomopathogenic fungus widely used in the biological control of several agricultural pests. The aims of this study were to: (1) evaluate the pathogenicity of B. bassiana strains against D. saccharalis (2) investigate the production of proteases and chitinase by B. bassiana in the presence of the cuticle of sugarcane borer; and, (3) evaluate the relation between the production of enzymes and pathogenicity of the strains. All isolates tested were pathogenic to D. saccharalis and the mortality ranged from 36 to 88%. The production of enzymes was higher in the medium containing cuticle, showing that the process is stimulated by specific components found in the cuticle of the host. Pr1 activity was higher than Pr2 and both were produced at 24 h. The highest production of chitinase was obtained at 96 h of culture for all strains tested. Levels of specific cuticle-degrading enzymes such as proteases correlated positively with specific virulence parameters. B. bassiana URM2915 showed promising features to be used in a biological control program of D. saccharalis.Key words: Biological control, sugarcane, subtilisin-like protease, trypsin-like protease, chitinase

Programa de Educación Tutorial en salud bucal : la experiencia en atención primaria en el centro de salud de Itapoã-DF

Este artigo apresenta o relato de experiência do Programa de Educação Tutorial em Odontologia da Universidade de Brasília, durante o período de março a dezembro de 2010. O cenário de prática das atividades de campo é a Regional Administrativa do Itapoã, no Distrito Federal, e a atuação do grupo tutorial acontece junto às Equipes de Saúde da Família por meio de rotinas educativo-preventivas em saúde bucal durante as visitas domiciliares, atividades clínicas e desenvolvimento de pesquisas. Alunos e preceptores estão sendo capazes de reconhecer os determinantes sociais do processo saúdedoença, analisar os indicadores de saúde bucal da população, aprimorar práticas educativas utilizadas na Estratégia Saúde da Família e promover saúde no âmbito da comunidade. As principais dificuldades encontradas dizem respeito a limitação de espaço físico e de recursos capazes de atender a demanda do grupo tutorial e das famílias assistidas. Esta experiência tutorial junto à Estratégia Saúde da Família possibilita um aprendizado que vai muito mais além do que a tradição de ensino bio-tecnicista da odontologia, bem como permite aos discentes de odontologia da UnB ‘vivenciar uma experiência real’ e refletir sobre os conhecimentos teóricos obtidos nos ‘bancos da universidade’. _________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRACTThis paper presents an experience report of the Tutorial Program in Dentistry from the University of Brasília, during the period from March to December, 2010. The scenario of practice is the Itapoã - an Administrative Area of the Distrito Federal - and the activities of the tutorial group take place in partnership with the Family Health Team through a preventive educational oral health routine during home visits, as well as clinical activities and development of research. Students and preceptors are being able to recognize the social determinants of the health-disease process, analyze oral health indicators of the population, improve educational practices and promote health within the community. The main barriers of the tutorial group are the lack of physical space and dental equipment capable of meeting the demand of the tutorial group and assisted families. This tutorial experience within the Family Health Strategy provides a learning experience that goes far beyond the tradition of teaching bio-technicalities of dentistry, as well as allows dental students real to live through a real field experience and reflect on the theoretical knowledge obtained from the ‘university seats’. _________________________________________________________________________________________________________________ RESUMENEste documento presenta el relato de la experiencia del Programa de Educación Tutorial en Odontología de la Universidad de Brasília, durante el período de Marzo a Diciembre de 2010. El escenário de práctica de las actividades de campo es el Sector Regional Administrativo de Itapoã, en el Distrito Federal, donde el trabajo del grupo tutorial acompaña el trabajo de los Equipos de Salud de la Família a través de la educación preventiva de rutina en la salud bucal de la población, mejorando las prácticas educativas utilizadas en la estrategia de salud familiar y promoviendo la salud en la comunidad. Las principales dificultades se refieren a la limitación del espacio físico y el equipo dental capaces de satisfacer la demanda del grupo tutorial y de las famílias atendidas. Esta actividad tutorial con la Estrategia de Salud de la Família ofrece una experiencia de aprendizaje que vá más allá de la tradición de la enseñanza de técnicas bio-odontológicas, así como permite a los estudiantes de odontología de la UnB “pasar una verdadera experiencia” y reflexionar sobre el conocimiento teórico obtenido en “los bancos de datos de la universidad”

Portal de Busca Integrada do SIBiUSP: metodologia de implantação

Relata o estudo, a instalação e implantação de ferramenta de descoberta e entrega do Portal de Busca Integrada, para o Sistema Integrado de Bibliotecas da Universidade de São Paulo (SIBiUSP). Esta nova interface denominada Portal de Busca Integrada possibilita uma nova experiência de pesquisa científica ao usuário final pela recuperação de literatura em diferentes fontes de informação

The TAL Effector PthA4 Interacts with Nuclear Factors Involved in RNA-Dependent Processes Including a HMG Protein That Selectively Binds Poly(U) RNA

Plant pathogenic bacteria utilize an array of effector proteins to cause disease. Among them, transcriptional activator-like (TAL) effectors are unusual in the sense that they modulate transcription in the host. Although target genes and DNA specificity of TAL effectors have been elucidated, how TAL proteins control host transcription is poorly understood. Previously, we showed that the Xanthomonas citri TAL effectors, PthAs 2 and 3, preferentially targeted a citrus protein complex associated with transcription control and DNA repair. To extend our knowledge on the mode of action of PthAs, we have identified new protein targets of the PthA4 variant, required to elicit canker on citrus. Here we show that all the PthA4-interacting proteins are DNA and/or RNA-binding factors implicated in chromatin remodeling and repair, gene regulation and mRNA stabilization/modification. The majority of these proteins, including a structural maintenance of chromosomes protein (CsSMC), a translin-associated factor X (CsTRAX), a VirE2-interacting protein (CsVIP2), a high mobility group (CsHMG) and two poly(A)-binding proteins (CsPABP1 and 2), interacted with each other, suggesting that they assemble into a multiprotein complex. CsHMG was shown to bind DNA and to interact with the invariable leucine-rich repeat region of PthAs. Surprisingly, both CsHMG and PthA4 interacted with PABP1 and 2 and showed selective binding to poly(U) RNA, a property that is novel among HMGs and TAL effectors. Given that homologs of CsHMG, CsPABP1, CsPABP2, CsSMC and CsTRAX in other organisms assemble into protein complexes to regulate mRNA stability and translation, we suggest a novel role of TAL effectors in mRNA processing and translational control

SARS-CoV-2 introductions and early dynamics of the epidemic in Portugal

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Portugal was rapidly implemented by the National Institute of Health in the early stages of the COVID-19 epidemic, in collaboration with more than 50 laboratories distributed nationwide. Methods By applying recent phylodynamic models that allow integration of individual-based travel history, we reconstructed and characterized the spatio-temporal dynamics of SARSCoV-2 introductions and early dissemination in Portugal. Results We detected at least 277 independent SARS-CoV-2 introductions, mostly from European countries (namely the United Kingdom, Spain, France, Italy, and Switzerland), which were consistent with the countries with the highest connectivity with Portugal. Although most introductions were estimated to have occurred during early March 2020, it is likely that SARS-CoV-2 was silently circulating in Portugal throughout February, before the first cases were confirmed. Conclusions Here we conclude that the earlier implementation of measures could have minimized the number of introductions and subsequent virus expansion in Portugal. This study lays the foundation for genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Portugal, and highlights the need for systematic and geographically-representative genomic surveillance.We gratefully acknowledge to Sara Hill and Nuno Faria (University of Oxford) and Joshua Quick and Nick Loman (University of Birmingham) for kindly providing us with the initial sets of Artic Network primers for NGS; Rafael Mamede (MRamirez team, IMM, Lisbon) for developing and sharing a bioinformatics script for sequence curation (https://github.com/rfm-targa/BioinfUtils); Philippe Lemey (KU Leuven) for providing guidance on the implementation of the phylodynamic models; Joshua L. Cherry (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health) for providing guidance with the subsampling strategies; and all authors, originating and submitting laboratories who have contributed genome data on GISAID (https://www.gisaid.org/) on which part of this research is based. The opinions expressed in this article are those of the authors and do not reflect the view of the National Institutes of Health, the Department of Health and Human Services, or the United States government. This study is co-funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia and Agência de Investigação Clínica e Inovação Biomédica (234_596874175) on behalf of the Research 4 COVID-19 call. Some infrastructural resources used in this study come from the GenomePT project (POCI-01-0145-FEDER-022184), supported by COMPETE 2020 - Operational Programme for Competitiveness and Internationalisation (POCI), Lisboa Portugal Regional Operational Programme (Lisboa2020), Algarve Portugal Regional Operational Programme (CRESC Algarve2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (ERDF), and by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

MAMMALS IN PORTUGAL : A data set of terrestrial, volant, and marine mammal occurrences in P ortugal

Mammals are threatened worldwide, with 26% of all species being includedin the IUCN threatened categories. This overall pattern is primarily associatedwith habitat loss or degradation, and human persecution for terrestrial mam-mals, and pollution, open net fishing, climate change, and prey depletion formarine mammals. Mammals play a key role in maintaining ecosystems func-tionality and resilience, and therefore information on their distribution is cru-cial to delineate and support conservation actions. MAMMALS INPORTUGAL is a publicly available data set compiling unpublishedgeoreferenced occurrence records of 92 terrestrial, volant, and marine mam-mals in mainland Portugal and archipelagos of the Azores and Madeira thatincludes 105,026 data entries between 1873 and 2021 (72% of the data occur-ring in 2000 and 2021). The methods used to collect the data were: live obser-vations/captures (43%), sign surveys (35%), camera trapping (16%),bioacoustics surveys (4%) and radiotracking, and inquiries that represent lessthan 1% of the records. The data set includes 13 types of records: (1) burrowsjsoil moundsjtunnel, (2) capture, (3) colony, (4) dead animaljhairjskullsjjaws, (5) genetic confirmation, (6) inquiries, (7) observation of live animal (8),observation in shelters, (9) photo trappingjvideo, (10) predators dietjpelletsjpine cones/nuts, (11) scatjtrackjditch, (12) telemetry and (13) vocalizationjecholocation. The spatial uncertainty of most records ranges between 0 and100 m (76%). Rodentia (n=31,573) has the highest number of records followedby Chiroptera (n=18,857), Carnivora (n=18,594), Lagomorpha (n=17,496),Cetartiodactyla (n=11,568) and Eulipotyphla (n=7008). The data setincludes records of species classified by the IUCN as threatened(e.g.,Oryctolagus cuniculus[n=12,159],Monachus monachus[n=1,512],andLynx pardinus[n=197]). We believe that this data set may stimulate thepublication of other European countries data sets that would certainly contrib-ute to ecology and conservation-related research, and therefore assisting onthe development of more accurate and tailored conservation managementstrategies for each species. There are no copyright restrictions; please cite thisdata paper when the data are used in publications.info:eu-repo/semantics/publishedVersio