29 research outputs found

    Atomistic insight into the essential binding event of ACE2-derived peptides to the SARS-CoV-2 spike protein

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    The pathogenic agent of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) enters into human cells through the interaction between the receptor binding domain (RBD) of its spike glycoprotein and the angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) receptor. Efforts have been made towards finding antivirals that block this interaction, therefore preventing infection. Here, we determined the binding affinity of ACE2-derived peptides to the RBD of SARS-CoV-2 experimentally and performed MD simulations in order to understand key characteristics of their interaction. One of the peptides, p6, binds to the RBD of SARS-CoV-2 with nM affinity. Although the ACE2-derived peptides retain conformational flexibility when bound to SARS-CoV-2 RBD, we identified residues T27 and K353 as critical anchors mediating the interaction. New ACE2-derived peptides were developed based on the p6-RBD interface analysis and expecting the native conformation of the ACE2 to be maintained. Furthermore, we found a correlation between the helicity in trifluoroethanol and the binding affinity to RBD of the new peptides. Under the hypothesis that the conservation of peptide secondary structure is decisive to the binding affinity, we developed a cyclized version of p6 which had more helicity than p6 and approximately half of its K D value

    Reabilitação oral em paciente acometido por cárie da primeira infância: relato de caso

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    Aim: To present the approaches adopted in the rehabilitative aesthetic treatment of pediatric patients affected by early childhood caries, respecting individualities and seeking the integrality of the child patient. Case report: The clinical case describes the oral rehabilitation performed in a child aged 4 years and 6 months, diagnosed with early childhood caries. After careful anamnesis, physical and complementary examinations and in possession of the diagnosis, a treatment plan was established, complying with all therapeutic phases, in which the preparatory phase included a psychological approach, fluortherapy, extractions and teeth sealing with glass ionomer cement. Subsequently, the esthetic-rehabilitation phase was carried out through direct and indirect restorations, installation of an esthetic-functional space maintainer and fabrication and installation of an upper total denture. After completion of the dental treatment, those responsible were instructed on the need and importance of multidisciplinary treatment with the speech therapist for the complete recovery of the patient's health and periodic visits to the dentist for follow-up. Conclusion: The child's oral rehabilitation provided the reestablishment of the functions of the stomatognathic system and promoted the recovery of their oral health.Objetivo: Apresentar as abordagens adotadas no tratamento estético reabilitador de paciente pediátrico acometido por cárie da primeira infância respeitando as individualidades e buscando a integralidade do paciente infantil. Relato do caso: O caso clínico descreve a reabilitação bucal realizada em uma criança de 4 anos e 6 meses de idade, diagnosticada com cárie da primeira infância. Após anamnese criteriosa, exames físicos e complementares e de posse do diagnóstico, estabeleceu-se um plano de tratamento obedecendo-se a todas as fases terapêuticas, nas quais a fase preparatória englobou abordagem psicológica, fluorterapia, exodontias e selamento dos dentes com cimento de ionômero de vidro. Posteriormente, procedeu-se à fase estético-reabilitadora por meio de restaurações diretas e indireta, instalação de mantenedor de espaço estético-funcional e confecção e instalação de uma prótese total superior. Após a conclusão do tratamento odontológico, os responsáveis foram orientados quanto à necessidade e importância do tratamento multidisciplinar com o fonoaudiólogo para completa recuperação da saúde do paciente e de visitas periódicas ao cirurgião-dentista para acompanhamento. Conclusão: A reabilitação bucal da criança propiciou o restabelecimento das funções do sistema estomatognático e promoveu a recuperação da sua saúde bucal

    Insights into the product release mechanism of dengue virus NS3 helicase

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    The non-structural protein 3 helicase (NS3h) is a multifunctional protein that is critical in RNA replication and other stages in the flavivirus life cycle. NS3h uses energy from ATP hydrolysis to translocate along single stranded nucleic acid and to unwind double stranded RNA. Here we present a detailed mechanistic analysis of the product release stage in the catalytic cycle of the dengue virus (DENV) NS3h. This study is based on a combined experimental and computational approach of product-inhibition studies and free energy calculations. Our results support a model in which the catalytic cycle of ATP hydrolysis proceeds through an ordered sequential mechanism that includes a ternary complex intermediate (NS3h-Pi-ADP), which evolves releasing the first product, phosphate (Pi), and subsequently ADP. Our results indicate that in the product release stage of the DENV NS3h a novel open-loop conformation plays an important role that may be conserved in NS3 proteins of other flaviviruses as well.Fil: Adler, Natalia Sol. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Cababie, Leila Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; ArgentinaFil: Sarto, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Cavasotto, Claudio Norberto. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Biomédicas. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Medicina Traslacional; ArgentinaFil: Gebhard, Leopoldo German. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Estrin, Dario Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; ArgentinaFil: Gamarnik, Andrea Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Arrar, Mehrnoosh. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Calculo. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Calculo; ArgentinaFil: Kaufman, Sergio Benjamín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; Argentin

    Representações sociais de mulheres sobre a violência doméstica

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    Objetivo: Analisar as representações sociais de mulheres sobre violência doméstica contra a mulher. Métodos: Pesquisa qualitativa, fundamentada na Teoria das Representações Sociais. Os dados foram coletados por meio do Teste de Associação Livre de Palavras (TALP) e entrevista semiestruturada. Participaram 80 mulheres em situação de violência. Os dados obtidos foram analisados pelo software EVOC e pela Técnica de Análise de Conteúdo. Resultados: Foi obtido um corpus constituído de 77,75% de evocações livres, os termos agressão, humilhação, medo e xingamento foram os constituidores do núcleo central, sendo os mais evocados. Os termos agressão e xingamento obtiveram maior expressividade, sendo consideradas as principais representações da violência sofrida. Conclusões: As representações sociais de mulheres em situação de violência doméstica, à luz de suas experiências, encontram-se permeadas de medo, tristeza, insegurança, revelando uma significativa insatisfação; assim, o cuidado integral de enfermagem deve respeitar essas particularidades

    Development and validation of the Brazilian Version of Lay Persons’ Social Judgements about Cleft-lip Scale (B-LSojCleft-S)

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    Abstract The aim of this study was to develop and analyze the psychometric properties of the Brazilian Version of Lay Person's Social Judgement about Cleft-lip Scale (B-LSojCleft-S). A standardized photograph of a 16-year-old girl was manipulated by using photo editing software, to simulate different cleft-lip situations. The cleft-free image was used as a control. The researchers structured an initial questionnaire that was evaluated by experts and a sample of the target population to evaluate the construct. After analysis by the researchers, a final version of the B-LSojCleft-S containing 14 items was generated. Each answer was awarded score from 1 to 3 points, yielding a total score of 14 to 42 points. Higher scores represented better social judgements. The B-LSojCleft-S was applied online to 103 test participants and 73 retest participants with an interval of 20 days between application. Aspects of acceptability, discriminant property, internal consistency, reliability and construct validity were evaluated. Construct validity was assessed using the Friedman test (p 0.70, and internal consistency using Cronbach's alpha > 0.81. The B-LSojCleft-S showed high acceptability, strong discriminant property, excellent internal consistency and reliability, but had a floor and ceiling effect. The instrument reached valid and reliable scores and had acceptable psychometric properties to evaluate the social judgments of lay persons about different cleft lip situations in a Brazilian population

    Breakthrough invasive fungal infection among patients with haematologic malignancies: A national, prospective, and multicentre study

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    Objectives: We describe the current epidemiology, causes, and outcomes of breakthrough invasive fungal infections (BtIFI) in patients with haematologic malignancies.Methods: BtIFI in patients with & GE; 7 days of prior antifungals were prospectively diagnosed (36 months across 13 Spanish hospitals) according to revised EORTC/MSG definitions.Results: 121 episodes of BtIFI were documented, of which 41 (33.9%) were proven; 53 (43.8%), probable; and 27 (22.3%), possible. The most frequent prior antifungals included posaconazole (32.2%), echinocandins (28.9%) and fluconazole (24.8%)-mainly for primary prophylaxis (81%). The most common haematologic malignancy was acute leukaemia (64.5%), and 59 (48.8%) patients had undergone a hematopoietic stem-cell transplantation. Invasive aspergillosis, principally caused by non-fumigatus Aspergillus, was the most fre-quent BtIFI with 55 (45.5%) episodes recorded, followed by candidemia (23, 19%), mucormycosis (7, 5.8%), other moulds (6, 5%) and other yeasts (5, 4.1%). Azole resistance/non-susceptibility was commonly found. Prior antifungal therapy widely determined BtIFI epidemiology. The most common cause of BtIFI in proven and probable cases was the lack of activity of the prior antifungal (63, 67.0%). At diagnosis, antifungal therapy was mostly changed (90.9%), mainly to liposomal amphotericin-B (48.8%). Overall, 10 0-day mor-tality was 47.1%; BtIFI was either the cause or an essential contributing factor to death in 61.4% of cases.Conclusions: BtIFI are mainly caused by non-fumigatus Aspergillus, non-albicans Candida, Mucorales and other rare species of mould and yeast. Prior antifungals determine the epidemiology of BtIFI. The exceed-ingly high mortality due to BtIFI warrants an aggressive diagnostic approach and early initiation of broad-spectrum antifungals different than those previously used.& COPY; 2023 The Author(s). Published by Elsevier Ltd on behalf of The British Infection Association. This is an open access article under the CC BY license (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

    Abordagem das implicações práticas da cirurgia geral minimamente invasiva

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    Minimally invasive general surgery (MIS) has revolutionized surgical practice by minimizing tissue damage with less invasive techniques such as laparoscopy. Technological advances, such as robotics and optical coherence tomography, have improved the precision and safety of procedures, speeding patient recovery and reducing complications. CMI also reduced hospital stays and costs, with greater patient adherence to postoperative guidelines. This article aims to broaden the understanding of the practical implications of CMI, highlighting its relevance in modern medicine. A comprehensive literature review was employed, including experimental and non-experimental studies. The research was qualitative, exploratory and bibliographic, with data collected from databases such as PubMed, MedlinePlus, SciELO and Google Scholar. Specific descriptors and Boolean operators were used to select relevant articles, monographs, dissertations and theses in Portuguese or English. Benefits of CMI were observed, such as reduced surgical trauma and a lower risk of postoperative complications, including infections and hernias. The accelerated recovery of patients is another positive point, reducing hospitalization time and associated costs. Furthermore, IMC promotes better healing and fewer aesthetic complications. However, implementing these techniques requires advanced technology and specialized training, which can be challenging due to the high costs and learning curve. The importance of CMI in modern medicine is highlighted, highlighting the clinical and economic benefits. Despite challenges, such as the need for adequate infrastructure and specialized training, continuous technological advancement and investment in professional training are essential to maximize the benefits of CMI.A cirurgia geral minimamente invasiva (CMI) revolucionou a prática cirúrgica ao minimizar danos teciduais com técnicas menos invasivas, como a laparoscopia. Avanços tecnológicos, como a robótica e a tomografia de coerência óptica, melhoraram a precisão e a segurança dos procedimentos, acelerando a recuperação dos pacientes e reduzindo complicações. A CMI também diminuiu o tempo de internação hospitalar e os custos, com uma maior adesão dos pacientes às orientações pós-operatórias. Este artigo visa ampliar o entendimento das implicações práticas da CMI, sublinhando sua relevância na medicina moderna. Empregou-se uma revisão de literatura abrangente, incluindo estudos experimentais e não experimentais. A pesquisa foi qualitativa, exploratória e bibliográfica, com dados coletados de bases como PubMed, MedlinePlus, SciELO e Google Acadêmico. Utilizou-se descritores específicos e operadores booleanos para selecionar artigos relevantes, monografias, dissertações e teses em português ou inglês. Foi observado benefícios da CMI, como a redução do trauma cirúrgico e o menor risco de complicações pós-operatórias, incluindo infecções e hérnias. A recuperação acelerada dos pacientes é outro ponto positivo, diminuindo o tempo de internação e os custos associados. Além disso, a CMI promove uma melhor cicatrização e menos complicações estéticas. No entanto, a implementação dessas técnicas requer tecnologia avançada e treinamento especializado, o que pode ser um desafio devido aos altos custos e à curva de aprendizado. Destaca-se a importância da CMI na medicina moderna, ressaltando os benefícios clínicos e econômicos. Apesar dos desafios, como a necessidade de infraestrutura adequada e treinamento especializado, o contínuo avanço tecnológico e o investimento em formação profissional são essenciais para maximizar os benefícios da CMI. &nbsp

    Evaluando la capacidad de unión de péptidos contra la proteína spike decoronavirus por métodos computacionales

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    Los anticuerpos contra las glicoproteínas spike del coronavirus se utilizan comoherramientas para la caracterización de virus y enfoques terapéuticos. Sin embargo, eldesarrollo, la producción y el control de calidad de anticuerpos son costosas y requierenmucho tiempo. Para sortear estas dificultades, se han empleadoya en otros virusfragmentos derivados de anticuerpos que demostraron capacidad inhibitoria en otrosmodelos.En este trabajo, presentamos una aproximación inicial para el estudio de dospéptidosque se derivaron de regiones del receptor ACE2 de la glicoproteína spike delcoronavirus. Sus propiedades aglutinantes ya han sido estudiadas por métodosexperimentales, por lo que estudiamos en detalle por simulaciones de dinámicamolecular las interacciones responsables de su efectividad. Comentaremos sobreestrategias para mejorar la afinidad y adaptar la especificidad, y discutiremos yejemplificaremos. Así como han sido demostrados para el virus de la Influenza, estospéptidos y sus derivados tienen un potencial para el desarrollo de fármacos y para labiodetección.Fil: Sarto, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; ArgentinaFil: Arrar, Mehrnoosh. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Calculo. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Calculo; ArgentinaFil: Lauster, Daniel. Freie Universität Berlin; AlemaniaFil: Di Lella, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaPrimeras Jornadas Virtuales SAB 2020Buenos AiresArgentinaSociedad Argentina de Biofisic

    Nucleotide-dependent dynamics of the Dengue NS3 helicase

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    Dengue represents a substantial public health burden, particularly in low-resource countries. Non-structural protein 3 (NS3) is a multifunctional protein critical in the virus life cycle and has been identified as a promising anti-viral drug target. Despite recent crystallographic studies of the NS3 helicase domain, only subtle structural nucleotide-dependent differences have been identified, such that its coupled ATPase and helicase activities remain mechanistically unclear. Here we use molecular dynamics simulations to explore the nucleotide-dependent conformational landscape of the Dengue virus NS3 helicase and identify substantial changes in the protein flexibility during the ATP hydrolysis cycle. We relate these changes to the RNA-protein interactions and proposed translocation models for other monomeric helicases. Furthermore, we report a novel open-loop conformation with a likely escape route for Pi after hydrolysis, providing new insight into the conformational changes that underlie the ATPase activity of NS3.Fil: Sarto, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física; ArgentinaFil: Kaufman, Sergio Benjamín. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; ArgentinaFil: Estrin, Dario Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física; ArgentinaFil: Arrar, Mehrnoosh. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Inorgánica, Analítica y Química Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentin
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