Um sistema gerenciador de Workflows científicos para a plataforma de nuvens federadas BioNimbuZ

Monografia (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2016.A necessidade por maior poder de processamento e armazenamento, consequência da complexidade das atuais aplicações e sistemas, tem dado espaço para o desenvolvimento de novos paradigmas na Computação. Com isso, criou-se o conceito de Computação em Nuvem. Essa nova forma de prover serviços computacionais tem possibilitado o desenvolvimento e a criação de diversas aplicações que compartilham diferentes tecnologias e provedores de serviços. Neste cenário, aplicações em Bioinformática tem se beneficiado dessa nova plataforma, devido à exigência de quantidades cada vez maiores de processamento. O BioNimbuZ, plataforma de execução de workflows em Bioinformática desenvolvido na Universidade de Brasília, utiliza o paradigma de Computação em Nuvem para processar fluxos de aplicações em diferentes provedores de serviços computacionais, como Microsoft Azure e Amazon EC2. Dessa forma, faz-se necessário o gerenciamento da execução desses workflows desde sua submissão ao sistema até sua finalização, tal como o provimento de uma interface para que o usuário possa ter acesso a esses serviços. Este trabalho propõe melhorias no gerenciamento e controle dos workflows submetidos à plataforma BioNimbuZ, com o desenvolvimento de um Sistema Gerenciador de Workflows Científicos baseado em tecnologias web. ____________________________________________________________________________ ABSTRACTThe need for greater processing power and storage, caused by the complexity of today’s applications and systems, has given space to the development of new paradigms in computing. Thus, it created the concept of Cloud Computing. This new way of providing computing services has enabled the development and creation of various applications that share different technologies and service providers. In this scenario, applications in Bioinformatics has benefited from this new platform due to demand increasing amounts of processing. The BioNimbuZ, a Bioinformatics workflow execution platform developed at the University of Brasilia, uses the Cloud Computing paradigm to process application flows in different computer services providers, such as Microsoft Azure and Amazon EC2. Thus, it is necessary to manage the execution of these flows (workflows) since its submission to the system until their completion, such as provide an interface for the user to have access to these services. This paper proposes improvements in the management and control of workflows undergoing BioNimbuZ platform, with the development of a Scientific Workflow Management System based on web technologies

As doenças parasitárias e a pobreza no Brasil: uma análise multidimensional e interdisciplinar

Este artigo investiga as doenças tropicais negligenciadas de etiologia parasitária no Brasil, e sua relação com o sistema endócrino e a vulnerabilidade social da população. Foram utilizados dados bibliográficos e estatísticos sobre as principais doenças listadas pelo boletim epidemiológico da secretaria de vigilância em saúde de 2021, incluindo seus agentes causais, seus vetores ou meios de contaminação, sua possível alteração endócrina, distribuição geográfica no país, sua correlação com os indicadores de pobreza e desenvolvimento humano. Os resultados mostraram que as doenças parasitárias são um grave problema de saúde pública no Brasil, afetando principalmente a população carente, que vive em condições precárias de saneamento, educação e acesso a serviços de saúde, promovendo a morbimortalidade, e  gerando um ciclo vicioso de exclusão e sofrimento. Além disso, essas doenças são negligenciadas pelo governo, indústrias farmacêuticas e comunidade internacional, recebendo pouca atenção e investimento. Apesar dos danos endócrinos serem considerados incomuns, recomenda-se que a federação invista tanto em pesquisa especializada quanto em políticas públicas integradas, que visem não apenas o tratamento da doença, mas que também invista na prevenção da enfermidade

Vitamin A: the functionality of supplementation for children of all ages

Objective:to analyze scientific production in the search for the best scientific evidence for vitamin A supplementation in children at different growth and development stages. Methodology: This is a systematic literature review that followed the protocol proposed by the Cochrane Center of Brazil. Data collection was performed in Pubmed, Scopus, Cinahl, Web of Science, and Cochrane databases, using the English descriptors, selected Medical Subject Headings (MeSH). Thus, from the 10 selected studies, according to the criteria, their methodological characteristics were analyzed through globally validated instruments and the degree of scientific evidence was identified. Results: As regards the analysis of the results it was evidenced that vitamin A supplementation should be as follows: first analyze the social characteristics of the population, thus defining the nutritional profile; and supplementation should be above the stimulated age, recommending the dosage of vitamin A in growth and development appointments. Conclusion: Studies show the benefit of using vitamin A in populations said to be vulnerable. However, studies show that this practice must be analyzed according to the social vulnerability of each country and region

Desempenho agronômico de arroz e feijão em consórcio com o pinhão-manso

El objetivo fue evaluar el comportamiento agronómico de sorgo y soja intercalado con jatrofa, durante los años agrícolas del 2010/2011 y 2011/2012 en Gurupi – TO. El experimento fue compuesto por cuatro tratamientos (arroz cultivado en las entrelineas de Jatropha; arroz con sucesión de frijoles cultivado en las entrelineas de Jatropha; arroz y frijoles asociados en las entrelineas de Jatropha y frijol cultivados en las entrelineas de Jatropha) con cuatro repeticiones. El cultivar de frijol utilizado en el primer año fue el IPR- Eldorado y en el segundo cultivo fue utilizado el IAC-Alvorada y fueron evaluadas las siguientes características: altura de plantas, numero de vainas por planta, altura de la intersección de la primera vaina, diámetro de tallo, numero de semillas por planta, numero de semilla por vaina, masa de cien granos y productividad de granos. De esta forma se concluye que: la asociacion no influencia las características agronómicas evaluadas, el intercalado entre arroz y frijol es eficiente cuando es en el uso de la tierra.Objetivou-se avaliar o desempenho agronômico de sorgo e soja consorciados com o pinhão-manso, durante os anos agrícolas de 2010/2011 e 2011/2012 em Gurupi – TO. O experimento foi composto por quatro tratamentos (arroz cultivado nas entrelinhas do pinhão-manso; arroz com sucessão de feijão cultivado nas entrelinhas do pinhão-manso; arroz e feijão consorciados nas entrelinhas do pinhão-manso e feijão cultivado nas entrelinhas do pinhão-manso) com quatro repetições. A cultivar de feijão utilizada no primeiro ano cultivo foi a IPR-Eldorado e no segundo de cultivo foi utilizada a cultivar IAC-Alvorada e foram avaliadas as seguintes características: altura de plantas, número de vagens por planta, altura da inserção de primeira vagem, diâmetro de caule, número de sementes por planta, número de sementes por vagem, massa de cem grãos e produtividade de grãos. Desta forma conclui-se que: o consórcio não influencia as características agronômicas avaliadas; o consórcio entre arroz e feijão é eficiente quanto ao uso da terra.The objective was to evaluate the agronomic performance of sorghum and soybean intercropped with jatropha during the growing seasons of 2010/2011 and 2011/2012 in Gurupi - TO. The experiment consisted of four treatments (rice grown between the lines of jatropha, rice with beans grown in the succession of lines of jatropha, rice and beans intercropped between the lines of jatropha and beans grown between the lines of jatropha) wich four replications. he cultivar used in the first year was the growing IPR-Eldorado and the second crop was used IAC-Alvorada and evaluated the following characteristics: plant height, number of pods per plant, height of first pod insertion, stem diameter, number of seeds per plant, number of seeds per pod, weight of hundred grains and grain yield. Thus it is concluded that: the consortium does not influence the agronomic traits, the consortium of rice and beans is efficient in the use of land

ANÁLISE DOS ANEURISMAS INTRACRANIANOS OPERADOS NO HOSPITAL POLICLÍNICA PATO BRANCO, PR

Os aneurismas intracranianos podem ser classificados em saculares, fusiformes e dissecantes. Aproximadamente 90% deles são saculares, apresentando-se com lobulações e localizados em bifurcações arteriais. Estima-se que a incidência na população seja entre 1 e 6%, dos quais a maioria é assintomática e diagnosticada apenas após seu rompimento. Diversos fatores são citados como influentes na sua gênese, como hipertensão arterial sistêmica (HAS), diabetes, dislipidemia, fumo, uso de anticoagulantes, entre outros. Com este resumo teve-se por objetivo divulgar a análise dos aneurismas intracranianos tratados no Hospital Policlínica Pato Branco para pontuar a associação da patologia com alguns fatores de risco. O estudo foi realizado por meio de uma revisão de prontuários de todos os pacientes operados para tratamento de aneurismas intracranianos entre janeiro de 2003 e agosto de 2015, perfazendo a amostra de 65 pacientes. O artigo foi submetido à comissão de ética da Instituição, sendo aprovado sob o número 001/2016. Avaliaram-se, ainda, as seguintes variáveis: gênero, idade, história de HAS, tabagismo e diabetes mellitus, local do aneurisma e pontuação nas escalas de Hunt-Hess e Fisher no momento da admissão. A predominância foi do sexo feminino (46 pacientes – 70,7%), na faixa etária de 50 a 60 anos (26 pacientes – 40%), com história de HAS (39 pacientes – 60%). No momento da admissão hospitalar, o grau I na Escala de Hunt-Hess foi o mais frequente (20 pacientes – 30,7%), enquanto o grau IV na Escala de Fisher foi o de maior prevalência (17 pacientes – 26,1%). A maior parte dos aneurismas localizou-se na circulação anterior, acometendo a artéria cerebral média. Nesta pesquisa, as mulheres foram as mais afetadas, com predomínio após os 41 anos. Diversas hipóteses são levantadas para justificar esse fenômeno; uma delas seria o fato de que a diminuição dos hormônios sexuais no plasma, sobretudo após a menopausa, inibiria a formação do colágeno, afetando os vasos sanguíneos cerebrais (DE ROOIJ et al., 2007). Em relação aos fatores de risco abordados, a hipertensão arterial sistêmica esteve presente em 60% dos pacientes encontrados neste estudo, e este, sabidamente, é um fator importante para o crescimento, desenvolvimento e ruptura dos aneurismas intracranianos. Estudos sobre a patogênese da arterioesclerose demonstraram alta tendência de a HAS causar lesão da parede íntima dos vasos, propiciando a formação aneurismática (STEHBENS, 1998). Em relação à localização dos aneurismas, 81,8% localizaram-se na circulação anterior e 18,2%, no sistema vertebro-basilar. Os resultados são bastante similares aos da literatura. A artéria cerebral média é o principal local de acometimento dos aneurismas cerebrais na presente amostra, ocorrendo em 40,2% dos pacientes. Outros trabalhos, como os de Ishibashi et al. (2009) e Suzuki et al. (1971), demonstram a artéria carótida interna como a mais afetada. Esta série aproxima-se muito da excelente série de Zamponi Junior (2012), acreditando-se que esse fato decorra da proximidade geográfica e da formação étnica e sociocultural. A despeito do grande progresso no diagnóstico, cuidados intensivos e avanços da microcirurgia, o aneurisma intracraniano permanece como a maior causa de morte e sequelas na prática neurocirúrgica. As estatísticas encontradas neste estudo são muito similares à literatura, sobretudo a nacional.Palavras-chave: Aneurismas intracranianos. Fatores de risco. Estudos retrospectivos

ANÁLISE DOS ANEURISMAS INTRACRANIANOS OPERADOS NO HOSPITAL POLICLÍNICA PATO BRANCO, PR

Os aneurismas intracranianos podem ser classificados em saculares, fusiformes e dissecantes. Aproximadamente 90% deles são saculares, apresentando-se com lobulações e localizados em bifurcações arteriais. Estima-se que a incidência na população seja entre 1 e 6%, dos quais a maioria é assintomática e diagnosticada apenas após seu rompimento. Diversos fatores são citados como influentes na sua gênese, como hipertensão arterial sistêmica (HAS), diabetes, dislipidemia, fumo, uso de anticoagulantes, entre outros. Com este resumo teve-se por objetivo divulgar a análise dos aneurismas intracranianos tratados no Hospital Policlínica Pato Branco para pontuar a associação da patologia com alguns fatores de risco. O estudo foi realizado por meio de uma revisão de prontuários de todos os pacientes operados para tratamento de aneurismas intracranianos entre janeiro de 2003 e agosto de 2015, perfazendo a amostra de 65 pacientes. O artigo foi submetido à comissão de ética da Instituição, sendo aprovado sob o número 001/2016. Avaliaram-se, ainda, as seguintes variáveis: gênero, idade, história de HAS, tabagismo e diabetes mellitus, local do aneurisma e pontuação nas escalas de Hunt-Hess e Fisher no momento da admissão. A predominância foi do sexo feminino (46 pacientes – 70,7%), na faixa etária de 50 a 60 anos (26 pacientes – 40%), com história de HAS (39 pacientes – 60%). No momento da admissão hospitalar, o grau I na Escala de Hunt-Hess foi o mais frequente (20 pacientes – 30,7%), enquanto o grau IV na Escala de Fisher foi o de maior prevalência (17 pacientes – 26,1%). A maior parte dos aneurismas localizou-se na circulação anterior, acometendo a artéria cerebral média. Nesta pesquisa, as mulheres foram as mais afetadas, com predomínio após os 41 anos. Diversas hipóteses são levantadas para justificar esse fenômeno; uma delas seria o fato de que a diminuição dos hormônios sexuais no plasma, sobretudo após a menopausa, inibiria a formação do colágeno, afetando os vasos sanguíneos cerebrais (DE ROOIJ et al., 2007). Em relação aos fatores de risco abordados, a hipertensão arterial sistêmica esteve presente em 60% dos pacientes encontrados neste estudo, e este, sabidamente, é um fator importante para o crescimento, desenvolvimento e ruptura dos aneurismas intracranianos. Estudos sobre a patogênese da arterioesclerose demonstraram alta tendência de a HAS causar lesão da parede íntima dos vasos, propiciando a formação aneurismática (STEHBENS, 1998). Em relação à localização dos aneurismas, 81,8% localizaram-se na circulação anterior e 18,2%, no sistema vertebro-basilar. Os resultados são bastante similares aos da literatura. A artéria cerebral média é o principal local de acometimento dos aneurismas cerebrais na presente amostra, ocorrendo em 40,2% dos pacientes. Outros trabalhos, como os de Ishibashi et al. (2009) e Suzuki et al. (1971), demonstram a artéria carótida interna como a mais afetada. Esta série aproxima-se muito da excelente série de Zamponi Junior (2012), acreditando-se que esse fato decorra da proximidade geográfica e da formação étnica e sociocultural. A despeito do grande progresso no diagnóstico, cuidados intensivos e avanços da microcirurgia, o aneurisma intracraniano permanece como a maior causa de morte e sequelas na prática neurocirúrgica. As estatísticas encontradas neste estudo são muito similares à literatura, sobretudo a nacional.Palavras-chave: Aneurismas intracranianos. Fatores de risco. Estudos retrospectivos

The contribution of meteorological parameters and the COVID-19 partial lockdown on air quality in Rio de Janeiro, Brazil

This study evaluated the pollutant levels (NO2, SO2, CO, and O3), air quality index (AQI) and the influence of meteorological variables and coronavirus disease (COVID-19) pandemic on the air quality in Rio de Janeiro. The data set used comprises periods before (March-April, 2019) and during pandemic (March-April, 2020). According to the AQI results, on most days, the air quality was ranked as “good”. Brazilian air quality standards for SO2, O3, and NO2 were not exceeded in any of the monitoring stations during partial lockdown, while CO exceeded in all periods in one site due to industrial emission. Comparing both periods, descriptive statistics for the meteorological parameters presented no differences, which suggests similar conditions. However, when evaluated week by week in 2020, weather conditions presented some differences that probably affected pollutant concentrations. The correlations between O3 and NO2 and some meteorological parameters indicate that variations in both favored ozone formation, since it is a photochemical process favored by temperature and solar radiation and that, in Rio de Janeiro, low NO2 concentrations lead to increased O3. The improvements on air quality during the partial lockdown may be attributed mainly to a reduction on emission sources rather than weather conditions.Campus Lima Centr

Perspectivas da Mauritia flexuosa como potencial agente anti-hipertensivo / Perspectives of Mauritia flexuosa as a potential anti-hypertensive agent

INTRODUÇÃO: As doenças cardiovasculares representam desafio de saúde pública, destacando-se a hipertensão arterial sistêmica (HAS), devido ao alto índice de incidência populacional. O buriti (Mauritia flexuosa (MF)) é uma palmeira, encontrada nas regiões norte, nordeste e centro oeste, abundante em carotenoides e polifenóis, sendo empregado, farmacologicamente, como agente cicatrizante e antibacteriano. OBJETIVO: Investigar as perspectivas da MF como potencial agente anti-hipertensivo. METODOLOGIA: Trata-se de uma revisão de literatura, realizada de dezembro/2021 a fevereiro/2022 através dos bancos de dados on-line: PubMed, Scielo e Lilacs, utilizando os descritores: Mauritia flexuosa, buriti, sistema cardiovascular e hipertensão, nas línguas inglesa e portuguesa. Os artigos selecionados atendem ao período de 2008 a 2016, abordando-se a relação da MF com o sistema cardiovascular (SCV). Os dados foram organizados e expressos em tabela, utilizando-se o programa Excel®. RESULTADOS: De 46 artigos encontrados, 6 foram selecionados. Nenhum estudo emprega o buriti como agente hipotensor e anti-hipertensivo. Entretanto, constatou-se que a MF é rica em substâncias químicas com potencial antioxidante, antitrombótica e anti-plaquetária, tais como o ß-caroteno e ácidos graxos. CONCLUSÃO: Há escassez de estudos acerca da ação da MF sobre o SCV. Contudo, os constituintes químicos da MF representam potente perspectiva anti-hipertensiva, necessitando estudos farmacológicos do seu papel na fisiopatologia da HAS

O uso do Resveratrol na terapêutica da Endometriose: uma revisão sistemática / The use of Resveratrol on the treatment of Endometriosis: a systematic review

A endometriose é um distúrbio ginecológico que pode ser impactado por diversos fatores, inclusive a dieta. Há vários nutrientes que refletem em alterações no metabolismo lipídico, estresse oxidativo e favorecem anormalidades epigenéticas possivelmente envolvidas em sua patogenia e progressão. Por isso, muito se tem pesquisado sobre a influência da alimentação e de alguns nutrientes no comportamento da doença. O resveratrol (RVT), substância presente em alguns alimentos, como amendoim, vinho, uva e frutas do tipo “berries” é considerado um nutracêutico, com propriedades anti-inflamatórias, antioxidantes, anti-angiogênicas e anti-proliferativas, e por essa razão poderia agir na contramão da fisiopatologia da endometriose, retardando a sua progressão. Propusemos, portanto, uma revisão sistemática da literatura para melhor compreender esses mecanismos e avaliar os reais benefícios do RVT, com fins terapêuticos em pacientes com endometriose. Realizou-se levantamento bibliográfico de 2012 a 2022 nas bases de dados Pubmed, SCIELO e ScienceDirect, e os descritores utilizados foram: “resveratrol” and “endometriosis”. Foram incluídos somente os artigos disponíveis que tinham a sua versão completa no idioma inglês, e que satisfizeram o espectro temático desejado. Identificamos 20 artigos, sendo a maioria estudos experimentais, utilizando animais ou cultivo de células endometriais, com evidências significativas que sustentam seguramente os efeitos benéficos do RVT na redução do crescimento e desenvolvimento das lesões, através de seus mecanismos já reconhecidos. Entretanto, há poucos estudos em humanos para reforçar esses achados, sendo prudente que sejam reproduzidos outros ensaios clínicos controlados e, preferencialmente, randomizados. Apesar dos dados clínicos não serem suficientes ainda para defini-lo como uma opção terapêutica, a plausibilidade da inclusão deste nutriente na alimentação pode ser promissora para as pacientes acometidas por endometriose

Perfil dos usuários cadastrados em um Centro de Atenção Psicossocial - Álcool e Drogas (CAPS-AD) / Profile of users registered at a Psychosocial Care Center - Alcohol and Drugs (CAPS-AD)

INTRODUÇÃO: A prática do uso de substâncias psicoativas advém desde os tempos pré-históricos como forma de aumentar o prazer e diminuir o sofrimento. Entretanto, atualmente a droga se tornou produto comercial utilizado por pessoas de ambos os sexos, de todas as faixas etárias, independentemente do nível de instrução e do poder aquisitivo. (MATOS, et al., 2015). A literatura sobre dependência de álcool e drogas no Brasil tem mostrado uma prevalência de 3% a 10% na população geral adulta. Entre as drogas psicotrópicas o álcool é a substância mais consumida no Brasil (PILLON e LUIS, 2004). O Centro de Atenção Psicossocial - Álcool e Drogas (CAPS - AD) foi instituído devido ao grande número de crianças, adolescentes e adultos que vem utilizando álcool e drogas de forma abusiva, e consequentemente tornando-se dependentes com sérios danos físicos, psíquicos e mentais (GONÇALVES E NUNES, 2014). O CAPS é um dos dispositivos de atenção à saúde mental. Funciona como um serviço substitutivo ao hospital psiquiátrico, permitindo a organização da rede de atenção às pessoas com transtornos mentais. O CAPS   - AD é uma modalidade de atendimento ao dependente de substâncias psicoativas, oferecendo atividades individuais e em grupo, oficinas terapêuticas, visitas e atendimentos domiciliares, atividades comunitárias com o objetivo de reinserção familiar, social e atendimento de desintoxicação (BRASIL, 2002b). OBJETIVO: Analisar o perfil dos usuários cadastrados do Centro de Atenção Psicossocial - Álcool e Drogas (CAPS-AD). METODOLOGIA: Trata-se de um estudo transversal, de abordagem quantitativa, em que foi utilizado a análise em prontuários de 15 pacientes em tratamento do CAPS-AD de Araguari/MG em junho de 2016. Os dados coletados foram idade, substância psicoativa utilizada, tempo de uso e tempo de tratamento. Para embasamento teórico foram utilizados artigos científicos dos bancos de dados LILACS, BIREME e SCIELO. RESULTADOS E DISCUSSÃO: Foram analisados os prontuários de 15 pacientes frequentadores do CAPS AD, destes 74,3% eram do sexo masculino e 26,6% do feminino. A média de idade foi de 39 anos, tempo de uso das substâncias psicoativas de 16,7 anos (mínimo de 2 anos e máximo de 33 anos) e tempo de início de tratamento 17 meses, além de outros dois pacientes que entre recaídas e tratamento estão cadastrados há mais de 10 anos na instituição. De acordo com os registros as substâncias mais consumidas são álcool (80%), seguido de crack (66,6%), cocaína e tabaco (26,6%) e maconha (20%), e as medicações mais utilizadas foram clonazepam (por três pacientes) e diazepam (por quatro pacientes). O predomínio do sexo masculino e faixa etária observado no presente estudo assemelham-se aos resultados encontrados na literatura. De acordo com Matos e colaboradores (2015) que avaliaram o perfil de usuários do CAPS - AD em Montes Claros – MG, 85% eram do sexo masculino e idade entre 21 e 40 anos (BATISTA; BATISTA e CONSTANTINO, 2012). O álcool foi a substância mais consumida tanto no presente estudo quanto na literatura consultada (MATOS, et al., 2015). CONCLUSÕES: Este estudo procurou conhecer e discutir o perfil dos usuários do CAPS AD, que fazem o uso de álcool e outras drogas, envolvendo as informações sobre a droga utilizada, tempo de uso e tempo de tratamento, bem como as medicações utilizadas por cada paciente cujo prontuário foi analisado. A pesquisa mostrou prevalência do sexo masculino, média de idade de 39 anos e de tempo de uso de 16,7 anos. A droga mais utilizada foi o álcool e o medicamento com mais prescrições nos prontuários foi o Diazepam, utilizado por 4 pacientes. O período médio de tratamento encontrado foi de 17 meses, além de dois casos refratário de pacientes com tratamento de 10 anos. Diante do que foi vivenciado durante a pesquisa e dos dados obtidos, destaca-se a dificuldade de obtenção dos dados através dos prontuários, que, na maioria das vezes, eram preenchidos com letras pouco legíveis, além de conter poucas informações sobre a história do paciente e a evolução do quadro. Foi possível, no entanto, notar que a maioria participava as atividades propostas e seguia o tratamento de forma satisfatória. Diante dos resultados apresentados neste estudo, espera-se que o conhecimento do perfil dos usuários dos serviços do CAPS AD seja utilizado para o desenvolvimento de atendimentos e atividades que atendam às necessidades reais desse grupo, aumentando o sucesso do tratamento. Vê-se também a necessidade de alertar médicos, psicólogos e demais responsáveis pelos serviços do CAPS AD sobre a importância do preenchimento adequado dos prontuários