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Contenido polínico de la atmósfera de la ciudad de Orense, primeros resultados (marzo 1986-marzo 1987)
El presente trab•jo rcooge los primeroo resultadO< del contenido poltnico de la
atmWcra de la ciudad de Orcnse, regisrradoo durante el periodo de un año (!5 de Ma11.o de
1.986-14 de :>tara> de 1987) dentro de un programa P<e-;sto a largo plazo y por el que se
pretcadc conocer las fluctuaciones anuales e intcrenualcs en dicha ciudad Un 101al de 35
pcrr.Jcs rcllejan ol contenido pollnico por periodos de dos a tres dios a lo largo del año.
Pinu.s es d géocro más abundante de los rtprescnlados con m~ximos en t i mes de mayo, le
siguen Ptouuuzs (abril) y Quercm (mayo); entre las familias las Gramintae y PDpilionoctat
son las más abu ndante.~In this J'"pcr WC have collea ed pollcn·count rcadings fur tbe city or Orense,
rcgistered over • period or onc ycar (15th march l986- 14th march 1987). This ;, part of a
long-tcnn programm: of im·cstigation through whic.:h we y,rjs)¡ 10 discover the annual and in·
terannllal fi uct.uu tion of the pollcn-count in thi.s city. Thi rt yfivc graphs reflect the pol!cn·
couot for periods OÍ IWO lO threc days tal:en throoghoul the year. Of the specics rcprcscntcd
here Pimu is the most :Jbundant, with maximum oounts in may, folloy.ocd by Plarwn;s (in
april). and Quw:UJ (may). The moSI abundan! amoog thc familic! are thc Gronuncoe ond the
PapUionautu
Influencia de la temperatura en la floración de "quercus" en el Sur de Galicia: Ourense y Vigo, 1994-98
Influencia de la temnperatura en la floración de Quercus en el sur de Galica (Ourense y Vigo, 1994-98). Los requerimientos necesarios para que las plantas sobrevivan a condiciones climáticas adversas son satisfechos mediante el uso de adaptaciones fisiológicas. Así, las plantas leñosas de la zona templada, para prevenir el congelamiento del agua intracelular, ralentizan su crecimiento hasta casi paralizarlo, entrando en un estado fisiológico denominado "dormancia". Muchos autores indican que el final de la fase de dormancia requiere un período de bajas temperaturas seguido de otro con temperaturas más altas. En el momento en el que los acúmulos de frío y de calor son completados, se produce la floración. El objetivo de este estudio es conocer la influencia que un parámetro climático como la temperatura ejerce sobre Quercus en el sur de Galicia, para poder predecir el inicio del período de dormancia, su duración y los consecuentes requerimientos de frío y calor, para que la floración tenga lugar. En este sentido hemos elegido dos zonas con parámetros de temperatura diferentes: una zona con temperaturas suaves, Vigo y otra con temperaturas mas frías, Ourense. El monitorizaje ha sido llevado a cabo mediante el uso de un captador volumétrico tipo Hirst LANZONI VPPS 2000, de recambio semanal. Quercus comienza su período de polinación en el mes de marzo, se inicia durante la primera quincena en Vigo, y unos pocos días más tarde se produce en Ourense. Durante los cuatro años de estudio, para superar el periodo de dormancia Ourense necesitó una media de 778 unidades de frío (Chilling Hours) y Vigo un menor requerimiento con solamente 458 CH. En el caso del acúmulo de calor, Ourense presenta el menor requerimiento con una media de 352 GDD (Growth Degree Days) y Vigo alrededor de 450 GDD
Entorno de integración continua para la docencia práctica de Java EE
El presente trabajo propone un entorno de trabajo ba-sado en integración continua y describe la experiencia docente de su implementación con herramientas Java EE en las asignaturas de un itinerario de desarrollo de software implantado en un Máster Universitario en Ingeniería Informática. Se propone un entorno lo más cercano posible a la práctica real en las empresas de desarrollo software que no sólo acerca al alumno a la industria, sino que facilita la implementación de la metodología de aprendizaje basado en proyectos software colaborativos, ya que trata de resolver los problemas típicos, como son una baja frecuencia en las integraciones, problemas en el mantenimiento de un código fuente común, reparto de tareas equitativas, interdependencias entre las tareas, etc.The present work proposes a continuous integration environment and the teaching experience implementing it with Java EE in the subjects of a software development speciality inside a Software Engineering Master's Degree. We propose a working environment similar to those found in software development companies that not only brings students closer to industry, but also eases the implementation project-based learning via collaborative software development, given that it tries to solve typical problems, such as low integration frequency, problems to maintain a common code base, equitable distribution of tasks, task interdependencies, etc
El polen de Poaceae en la atmósfera de Lugo y su relación con los parámetros meteorológicos (1999-2001)
. El polen de Poaceae en la atmósfera de Lugo y su relación con los parámetros meteorológicos (1999-2001). Se han estudiado las concentraciones de polen de Poaceae presente en la atmósfera de la ciudad de Lugo durante 3 años (1999-2001). Para ello se ha utilizado un captador volumétrico tipo Hirst, modelo Lanzoni VPPS-2000. El polen de Poaceae es el más abundante y su porcentaje frente al total de polen anual es de un 38-40%. La cantidad total de polen anual es de 8.400 granos como resultado de la media de los tres años de estudio, con un período de polinización durante los meses de Junio y Julio. A lo largo del día los máximos de concentración tienen lugar durante la tarde. Se ha realizado un análisis de correlación con los principales parámetros meteorológicos, siendo la temperatura máxima la variable que presentó el coeficiente más elevado. La suma acumulada de la temperatura máxima y la regresión múltiple integrando la temperatura máxima y las concentraciones de polen del día anterior como estimadores, resultaron métodos válidos y complementarios para realizar la predicción del inicio del periodo de polinización y de las concentraciones medias diarias que se alcanzan durante el periodo de polinización principal respectivament
El polen de Eucalyptus y su incidencia en la atmósfera de Vigo (NO España)
El polen de Eucalyptus y su incidencia en la atmósfera de Vigo (N.O. España). Eucalyptus globulus Labill. es la especie arbórea de la familia Myrtaceae, más frecuente en los alrededores de la ciudad de Vigo formando abundantes y densas masas forestales. Aunque su polen se considera moderadamente alergénico, en áreas en las que, como consecuencia de repoblación forestal ocupa extensiones importantes, puede llegar a causar problemas alérgicos.Entre los años 1995 y 2000 se ha realizado el estudio aerobiológico en la ciudad de Vigo mediante un captador LANZONI VPPS 2000 situado en la margen derecha de la ría de Vigo (42º14'15''N, 8º43'30''W). La cantidad de granos de polen anual de Myrtaceae varía ampliamente, alternándose años de concentraciones bajas con otros de valores elevados que representan entre un 1 y un 3% del polen total anual. El valor más elevado se detectó en 1997 con 1.147 granos de polen.Se encuentra en la atmósfera de Vigo durante todo el año, aunque las concentraciones más importantes se producen generalmente durante los meses de marzo y abril. Asimismo, a lo largo del día los máximos de concentración tienen lugar entre las 15 y las 17 horas. Finalmente se ha realizado un análisis estadístico para poner de manifiesto la posible correlación existente entre las concentraciones de polen y los principales parámetros meteorológicos. El viento procedente del N-NE fue el parámetro con el que se obtuvo correlación positiva y significativa de forma constante, mientras que esta fue negativa con la humedad relativa
Predicting Specificities Under the Non-self Gametophytic Self-Incompatibility Recognition Model
Non-self gametophytic self-incompatibility (GSI) recognition system is characterized by
the presence of multiple F-box genes tandemly located in the S-locus, that regulate
pollen specificity. This reproductive barrier is present in Solanaceae, Plantaginacea and
Maleae (Rosaceae), but only in Petunia functional assays have been performed to get
insight on how this recognition mechanism works. In this system, each of the encoded
S-pollen proteins (called SLFs in Solanaceae and Plantaginaceae /SFBBs in Maleae)
recognizes and interacts with a sub-set of non-self S-pistil proteins, called S-RNases,
mediating their ubiquitination and degradation. In Petunia there are 17 SLF genes
per S-haplotype, making impossible to determine experimentally each SLF specificity.
Moreover, domain –swapping experiments are unlikely to be performed in large scale to
determine S-pollen and S-pistil specificities. Phylogenetic analyses of the Petunia SLFs
and those from two Solanum genomes, suggest that diversification of SLFs predate the
two genera separation. Here we first identify putative SLF genes from nine Solanum
and 10 Nicotiana genomes to determine how many gene lineages are present in the
three genera, and the rate of origin of new SLF gene lineages. The use of multiple
genomes per genera precludes the effect of incompleteness of the genome at the
S-locus. The similar number of gene lineages in the three genera implies a comparable
effective population size for these species, and number of specificities. The rate of origin
of new specificities is one per 10 million years. Moreover, here we determine the amino
acids positions under positive selection, those involved in SLF specificity recognition,
using 10 Petunia S-haplotypes with more than 11 SLF genes. These 16 amino acid
positions account for the differences of self-incompatible (SI) behavior described in the
literature. When SLF and S-RNase proteins are divided according to the SI behavior, and the positively selected amino acids classified according to hydrophobicity, charge, polarity and size, we identified fixed differences between SI groups. According to the in silico 3D structure of the two proteins these amino acid positions interact. Therefore, this methodology can be used to infer SLF/S-RNase specificity recognition.This work was financed by the project Norte-01-0145-FEDER-000008-Porto Neurosciences and Neurologic Disease Research Initiative at I3S, supported by Norte Portugal Regional Operational Programme (NORTE 2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (FEDER). SR is supported by a post-doctoral fellowship under this project. HL-F is supported by a post-doctoral fellowship from Xunta de Galicia (ED481B 2016/068-0). SING group acknowledges Consellería de Educación, Universidades e Formación Profesional (Xunta de Galicia) for the ED431C2018/55-GRC grant and CITI (Centro de Investigación, Transferencia e Innovación) from University of Vigo for hosting its IT infrastructure
Multiple independent L-gulonolactone oxidase (GULO) gene losses and vitamin C synthesis reacquisition events in non-Deuterostomian animal species
Background: L-ascorbate (Vitamin C) is an important antioxidant and co-factor in eukaryotic cells, and in mammals it is indispensable for brain development and cognitive function. Vertebrates usually become L-ascorbate auxothrophs when the last enzyme of the synthetic pathway, an L-gulonolactone oxidase (GULO), is lost. Since Protostomes were until recently thought not to have a GULO gene, they were considered to be auxothrophs for Vitamin C. Results: By performing phylogenetic analyses with tens of non-Bilateria and Protostomian genomes, it is shown, that a GULO gene is present in the non-Bilateria Placozoa, Myxozoa (here reported for the first time) and Anthozoa groups, and in Protostomians, in the Araneae family, the Gastropoda class, the Acari subclass (here reported for the first time), and the Priapulida, Annelida (here reported for the first time) and Brachiopoda phyla lineages. GULO is an old gene that predates the separation of Animals and Fungi, although it could be much older. We also show that within Protostomes, GULO has been lost multiple times in large taxonomic groups, namely the Pancrustacea, Nematoda, Platyhelminthes and Bivalvia groups, a pattern similar to that reported for Vertebrate species. Nevertheless, we show that Drosophila melanogaster seems to be capable of synthesizing L-ascorbate, likely through an alternative pathway, as recently reported for Caenorhabditis elegans. Conclusions: Non-Bilaterian and Protostomians seem to be able to synthesize Vitamin C either through the conventional animal pathway or an alternative pathway, but in this animal group, not being able to synthesize L-ascorbate seems to be the exception rather than the rule.This work is financed by the project Norte-01-0145-FEDER-000008 - Porto Neurosciences and Neurologic Disease Research Initiative at I3S, supported by Norte Portugal Regional Operational Programme (NORTE 2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (FEDER). S. F. Henriques is supported by a post-doctoral fellowship also funded by the above mentioned project. SING group is supported by the Consellería de Educación, Universidades e Formación Pro-fesional (Xunta de Galicia) by the ED431C2018/55-GRC grant. H. López-Fer-nández is supported by a post-doctoral fellowship from Xunta de Galicia (ED481B 2016/068–0). The funding bodies played no role in the design of the study and collection, analysis, and interpretation of data and in writing the manuscript
ATXN1 N-terminal region explains the binding differences of wild-type and expanded forms
BACKGROUND:
Wild-type (wt) polyglutamine (polyQ) regions are implicated in stabilization of protein-protein interactions (PPI). Pathological polyQ expansion, such as that in human Ataxin-1 (ATXN1), that causes spinocerebellar ataxia type 1 (SCA1), results in abnormal PPI. For ATXN1 a larger number of interactors has been reported for the expanded (82Q) than the wt (29Q) protein.
METHODS:
To understand how the expanded polyQ affects PPI, protein structures were predicted for wt and expanded ATXN1, as well as, for 71 ATXN1 interactors. Then, the binding surfaces of wt and expanded ATXN1 with the reported interactors were inferred.
RESULTS:
Our data supports that the polyQ expansion alters the ATXN1 conformation and that it enhances the strength of interaction with ATXN1 partners. For both ATXN1 variants, the number of residues at the predicted binding interface are greater after the polyQ, mainly due to the AXH domain. Moreover, the difference in the interaction strength of the ATXN1 variants was due to an increase in the number of interactions at the N-terminal region, before the polyQ, for the expanded form.
CONCLUSIONS:
There are three regions at the AXH domain that are essential for ATXN1 PPI. The N-terminal region is responsible for the strength of the PPI with the ATXN1 variants. How the predicted motifs in this region affect PPI is discussed, in the context of ATXN1 post-transcriptional modifications.This work was financed by the project Norte-01-0145-FEDER-000008 -Porto
Neurosciences and Neurologic Disease Research Initiative at I3S, supported
by Norte Portugal Regional Operational Programme (NORTE 2020), under the
PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development
Fund (FEDER). Sara Rocha is supported by a post-doctoral fellowship
under this project. Hugo López-Fernández is supported by a postdoctoral
fellowship from Xunta de Galicia (ED481B 2016/068–0). SING group
thanks Consellería de Educación, Universidades e Formación Profesional
(Xunta de Galicia) for the ED431C2018/55-GRC grant and CITI (Centro de
Investigación, Transferencia e Innovación) from University of Vigo for hosting
its IT infrastructure. The funding bodies played no role in the design of the
study and collection, analysis, and interpretation of data and in writing the
manuscript
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