Filogenia molecular e biogeografia de Psomophis Myers & Cadle 1994 e a história da diagonal de áreas abertas neotropicais

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2013.A diagonal de áreas abertas separa os dois grandes blocos de formações florestais da América do Sul, Floresta Amazônica e Mata Atlântica, e é formada pela união de três conjuntos de formações vegetacionais no centro do continente: Caatinga, Cerrado e Chaco. Estas regiões possuem uma herpetofauna diversa e com muitas espécies endêmicas. O gênero de serpentes Psomophis é composto por três espécies (P. joberti, P. genimaculatus e P. obtusus) e está amplamente distribuído nesta região. Entretanto, dados precisos de ocorrência dos organismos são escassos, e o processo de diversificação das biotas nestas regiões ainda é pouco compreendido. O presente trabalho objetiva estudar as relações de parentesco e a biogeografia de Psomophis, contribuindo para compreender a biogeografia da diagonal de áreas abertas neotropicais. As relações intra e interespecíficas do grupo foram inferidas a partir das sequências dos genes 12S, 16S, C-mos e NGFB. As análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos de máxima verossimilhança e inferência bayesiana. Utilizamos os pontos de coordenadas geográficas das três espécies, obtidos de literatura taxonômica e de exemplares depositados em museus para elaboração de mapas e análises biogeográficas. Modelos de distribuição potencial foram realizados para cada espécie, utilizando as variáveis bioclimáticas recentes da região neotropical. A partir destes dados, foram confeccionados mapas de distribuições realizadas e potenciais das espécies e linhagens. Finalmente, analisamos as identidades de nicho para cada clado, assim como a existência de uma barreira biogeográfica atual em suas distribuições. Realizamos ainda uma análise de relógio molecular relaxado para estimar o tempo de divergência de cada espécie. As áreas ancestrais de cada clado foram obtidas com base em inferência bayesiana implementada no programa Rasp. Os principais parâmetros de diversidade genética foram calculados para P. joberti e a relação entre os haplótipos foi obtida por median-joining. As espécies de Psomophis apresentaram baixa diversidade intraespecífica, alta diferenciação interespecífica e monofiletismo recíproco. A divergência do gênero data do Oligoceno Médio (~30 Ma) e as divergências entre as espécies foram datadas entre o meio e final do Mioceno (~13-7 Ma). Psomophis é encontrado em toda a extensão da diagonal de áreas abertas e em áreas adjacentes, como a região dos Pampas. Cada espécie apresenta relação com uma ou duas grandes formações vegetacionais inseridas nesta diagonal. Pela análise de identidade de nicho, obtivemos divergências significativas entre cada espécie e a indicação da existência de barreiras entre a distribuição das espécies de Psomophis. Observamos que a possível área ancestral do grupo esta na região ao sul do Chaco e norte dos Pampas. Ainda, o segundo evento de cladogênese no grupo provavelmente se deu em razão do surgimento da depressão do alto Paraguai, entre o Cerrado e Chaco, onde atualmente se situam as baixadas do Pantanal. O padrão de distribuição e diferenciação do grupo corrobora a hipótese de regionalização que postula a inclusão dos Pampas e Monte como áreas da província Chaquenha, junto com Cerrado, Chaco e Caatinga. O padrão observado, também, indica uma maior relação do Cerrado com Chaco com populações relictuais na região da Caatinga. Finalmente, este trabalho inclui uma compilação completa de dados moleculares e de distribuição e portanto é o mais significativo sobre Psomophis desde a sua descrição. ______________________________________________________________________________ ABSTRACTThe South American arid diagonal occurs between two large blocks of forest formations, Amazon and Atlantic Forest, and is formed by three open vegetation regions in the center of the continent: Caatinga, Cerrado and Chaco. These regions have a diverse herpetofauna and many endemic species. The genus of snakes Psomophis comprises three species (P. joberti, P. genimaculatus, and P. obtusus) and is widely distributed in this region. However, their relationships and distribution are still poorly understood. The present work aims to study the evolutionary relationships and biogeography of Psomophis to bring new data about the biogeography the South American open diagonal. For estimating the intra- and interspecific relationship we used molecular data from the genes 12S, 16S, C-mos and NGFB. Phylogenetic analyses were performed by maximum likelihood and Bayesian inference. We used geographic coordinates points of the three species for mapping and performing biogeographic analyses. These point locality records were obtained by checking taxonomic literature and localities of verified specimens deposited in museums. The estimation of potential distributions was performed for each species, using recent bioclimatic variables for the Neotropical region. Based on these models we built observed and potential distribution maps. Finally, we analyzed niche identities for each pair of species, as well as the presence of biogeographical barriers between current distributions. We also performed a relaxed molecular clock dating to estimate the divergence time of each species. The ancestral area of each clade was inferred based on Bayesian analyses implemented in the software Rasp. Measures of genetic diversity were estimated for P. joberti and the relationship between haplotypes was obtained by median-joining. The species of Psomophis showed low intraspecific diversity and high interspecific differences with high supported reciprocal monophyly. The divergence date of the genus was estimated in the Oligocene (~ 30 Ma) and the differences between species were dated from the middle to late Miocene (~ 13 - 7 Ma). Psomophis is found throughout the South American arid diagonal and in adjacent areas, such as the Pampas region. Each species is associated to one or two major vegetation formations included in this diagonal. We obtained significant niche identity differences between each species and indications that there are barriers between species distributions. The probable ancestral area of this group is between southern portions of the Chacos and northern part of the Pampas. The second divergence event in the group probably occurred between Cerrado and Chaco, after the subsidence of the Upper Paraguay depression, in the Pantanal lowlands. The distribution pattern and differentiation of the group supports the hypothesis that Pampas and Monte regions should be included as a biogeographical unit along with Cerrado, Chaco and Caatinga (the Chacoan region of Morrone). The observed pattern also indicates a close relationship between Cerrado and Chaco with only relictual, isolated populations in the Caatinga. Finally, we presented here a comprehensive compilation of molecular and distribution data, and therefore this is the most significant study about Psomophis since its description

Development of low cost spectrum qualifier for new iot technologies

With the evolution of radio technologies during the last decades, the companies are replacing equipment with individual components with particular functions by systems where most signals are treated digitally through digital signal processing techniques. With this, engineers can develop many applications at the software level, enabling new analyses to exists. With the growth of the internet of things, companies are deploying new solutions around the world. Most of these solutions are wireless applications that use the unlicensed frequency spectrum band, which increases the density of wireless devices in a location. In environments with numerous wireless equipment transmitting simultaneously, it is essential to detect how busy the frequency spectrum is before deploying a new solution. A spectrum analyzer can analyze this, but the cost of acquiring suitable equipment can be very high. Besides that, these devices only allow users to analyze the frequency spectrum, not the technology itself, packet loss, data rate, and coverage, without purchasing expensive software licenses. This thesis presents the development of a software-defined radio application capable of evaluating the performance of radio technologies, such as Bluetooth or Wi-SUN, and shows their behavior in a noisy environment

Multilayer Complex Network Descriptors for Color-Texture Characterization

A new method based on complex networks is proposed for color-texture analysis. The proposal consists on modeling the image as a multilayer complex network where each color channel is a layer, and each pixel (in each color channel) is represented as a network vertex. The network dynamic evolution is accessed using a set of modeling parameters (radii and thresholds), and new characterization techniques are introduced to capt information regarding within and between color channel spatial interaction. An automatic and adaptive approach for threshold selection is also proposed. We conduct classification experiments on 5 well-known datasets: Vistex, Usptex, Outex13, CURet and MBT. Results among various literature methods are compared, including deep convolutional neural networks with pre-trained architectures. The proposed method presented the highest overall performance over the 5 datasets, with 97.7 of mean accuracy against 97.0 achieved by the ResNet convolutional neural network with 50 layers.Comment: 20 pages, 7 figures and 4 table

Ruta N- promoviendo el ecosistema de innovación de Medellín

L'objectiu d'aquest document és identificar quins factors han contribuït a l'èxit de Ruta N. Ruta N fomentava l'ecosistema d'innovació de Medellín, però fins ara segueix inexplicat com va ocórrer des de la perspectiva interna, quins actors van participar en el procés i quines pràctiques es van fer. Mitjançant la recollida de dades secundàries, entrevistes amb directors directament implicats i visites tècniques que es van fer, apareixen alguns punts importants que poden il·lustrar com es va desenvolupar el projecte i així  poder aplicar aquestes pràctiques i configuracions intencionadament en altres ciutats amb contextos similars.The aim of this paper is to identify which factors have contributed to the success of Ruta N. Ruta N fostered the innovation ecosystem of Medellín, but until now it remains open how it happened from the inside perspective, which actors were involved in the process and which practices were made. Secondary data collection, interviews with directors directly involved and technical visits were made, and some important points emerged from the field that can shed light in order to apply those practices and configurations intentionally in other cities with similar contexts. El objetivo de este documento es identificar qué factores han contribuido al éxito de Ruta N. Ruta N fomento el ecosistema de innovación de Medellín, pero hasta ahora no está explicado cómo esto ha sido posible desde una perspectiva interna, analizando los agentes involucrados en el proceso, y sus prácticas. A través de la recopilación de evidencias secundarias, entrevistes con directores directamente involucrados, y visitas técnicas, se han obtenido conclusiones importantes que pueden ilustrar cómo se ha desarrollado el proyecto, y proporcionar lecciones que puedan aplicarse intencionadamente a otras ciudades con contextos similares

O desaparecimento social das diferenças nas políticas de exceção: vidas e memórias de crianças e mulheres para a reinvenção de uma educação democrática

A democracia tem sido tema recorrente no Brasil da última década, devido à emergência de narrativas e movimentos conservadores que interditam o debate público sobre assuntos que trazem as diferenças para o campo social, como é o caso do racismo e das violências de gênero e sexuais, além de fazerem apelos à reedição de políticas de exceção vigentes na ditadura cívicomilitar no Brasil. Desse modo, o objetivo principal deste artigo é analisar os sentidos de democracia e educação a partir de incursões no passado da ditadura militar, como forma de problematizar as políticas de exceção vigentes no Brasil do presente. Para tanto, pretende-se discutir: (1) as necropolíticas que incidiram sobre as vidas de crianças e mulheres na ditadura militar, a partir de depoimentos sobre torturas praticadas por agentes do Estado, extraídos do relatório da Comissão Nacional da Verdade, e suas relações com necropolíticas do Brasil atual que remetem ao racismo e às violências de gênero, com base em críticas às noções de proteção e desenvolvimento em seus efeitos colonizadores; e (2) o desaparecimento social como política de extermínio da memória e suas repercussões nefastas na educação. Por fim, busca-se salientar o processo devastador das diferenças, sejam de gênero, sexuais, raciais, étnicas e etárias, implementado por políticas de exceção do passado e do presente, e como uma educação democrática, que se posicione na contramão dessas políticas, pode ser resistência à barbárie