Improved precision altimetry planimetric and topographic surveys in Bogota

En este artículo se analiza la información del Instituto de Desarrollo Urbano de Bogotá - IDU sobre la elaboración de levantamientos topográficos y sus resultados, con el fin de estandarizar los procedimientos técnicos que deben ser tenidos en cuenta por las empresas consultoras y constructoras. Se analizaron 164 levantamientos topográficos urbanos en los cuales se clasificaron las poligonales como poligonales alargadas y semi regulares. Se encontró que las poligonales alargadas presentan ángulos agudos en sus extremos y que su forma hace que sus alineamientos sean casi paralelos separados por distancias muy pequeñas. Las poligonales semi regulares presentan mayor regularidad desde el punto de vista geométrico, es decir que sus ángulos y distancias son relativamente iguales. Por lo tanto, se deduce que la longitud recomendable a la hora de realizar una poligonal es que esta no exceda el rango entre los 1000 y 1200 metros. Los resultados generales indican que se puede exigir un grado de precisión mínimo de 1:35000, en el aspecto planimétrico el cual es considerablemente superior al actualmente exigido por el IDUThis paper analyzes the information of the Urban Development Institute of Bogotá (IDU), Colombia, regarding the execution of urban topographic surveys and its results, aimed to standardise the technical procedures that should be considered by construction and consultant companies with current methods and equipment. One houndred and sixty four 164 urban topographic surveys were analysed. Concerning planimetric and altimetric parameters polygonal were classified as long and semi-regular. Results showed that long polygonal exhibited acute angles at their extremes and, due to their form, the alignments are almost parallel, separated by very short distances. The semi-regular polygonals showed a clear regularity from the geometric point of view, as angles and distances are relatively similar. Therefore, it is suggested, that the most favorable length when elaborating a polygonal, should range between 1000 and 1200-m. The general results indicate that for planimetric issues a level of precision of minimum 1:35000 can be requested, which is considerable higher than the one currently required by the ID

Plataforma de supercomputación para bioinformática

En el año 2007 la Universidad de Málaga amplió y trasladó sus recursos de cálculo a un nuevo centro dedicado exclusivamente a la investigación: el edificio de Supercomputación y Bioinnovación sito en el Parque Tecnológico de Andalucía. Este edificio albergaría también la Plataforma Andaluza de Bioinformática junto con otras unidades y laboratorios con instrumentación muy especializada. Desde aquel momento he trabajado como administrador de los recursos de supercomputación del centro y como parte del equipo bioinformático para proporcionar soporte a un gran número de investigadores en sus tareas diarias. Teniendo una visión de ambas partes, fue fácil detectar las carencias existentes en la bioinformática que podían ser cubiertas con una aplicación adecuada de los recursos de cálculo disponibles, y ahí es donde surgió la semilla que nos llevó a comenzar los primeros trabajos que componen este estudio. Al haberse realizado en un entorno tan orientado a la resolución de problemas como el que hemos descrito, esta tesis tendrá un carácter eminentemente práctico, donde cada aportación realizada lleva un importante estudio teórico detrás, pero que culmina en un resultado práctico concreto que puede aplicarse a problemas cotidianos de la bioinformática o incluso de otras áreas de la investigación. Así, con el objetivo de facilitar el acceso a los recursos de supercomputación para los bioinformáticos, hemos creado un generador automático de interfaces web para programas que se ejecutan en línea de comandos, que permite ejecutar los trabajos utilizando recursos de supercomputación de forma transparente para el usuario. Además aportamos un sistema de escritorios virtuales que permiten el acceso remoto a un conjunto de programas ya instalados que proporcionan interfaces visuales para analizar pequeños conjuntos de datos o visualizar los resultados más complejos que hayan sido generados con recursos de supercomputación. Para optimizar el uso de los recursos de supercomputación hemos diseñado un nuevo algoritmo para la ejecución distribuida de tareas, que puede utilizarse tanto en el diseño de nuevas herramientas como para optimizar la ejecución de programas ya existentes. Por otra parte, preocupados por el incremento en la cantidad de datos producidos por las técnicas de ultrasecuenciación, aportamos un nuevo formato de compresión de secuencias, que además de reducir el espacio de almacenamiento utilizado, permite buscar y extraer rápidamente cualquier secuencia almacenada sin necesidad de descomprimir el archivo completo. En el desarrollo de nuevos algoritmos para resolver problemas biológicos concretos, proporcionamos cuatro herramientas nuevas que abarcan la búsqueda de regiones divergentes en alineamientos, el preprocesamiento y limpieza de lecturas obtenidas mediante técnicas de ultrasecuenciación, el análisis de transcriptomas de especies no modelo obtenidos mediante ensamblajes de novo y un prototipo para anotar secuencias genómicas incompletas. Como solución para la difusión y el almacenamiento a largo plazo de resultados obtenidos en diversas investigaciones, se ha desarrollado un sistema genérico de máquinas virtuales para bases de datos de transcriptómica que ya está siendo utilizado en varios proyectos. Además, con el ánimo de difundir los resultados de nuestro trabajo, todos los algoritmos y herramientas productos de esta tesis se han publicado como código abierto en https://github.com/dariogf

Caracterización funcional de la podocalicina humana expresada en sistemas heterólogos

139 p.-56 fig.-3 tab.En 1970 Michael y colaboradores (Michael, Blau y Vernier 1970) mostraron que la cara luminal de los podocitos o células epiteliales del glomérulo renal, estaban recubiertas de una superficie que podía ser digerida con neuraminidasa a la cual denominaron “polianión epitelial” por su afinidad por colorantes catiónicos. Posteriormente, otros autores (Kerjaschki, Sharkey y Farquhar 1984), aislaron una sialoproteína glomerular de unos 140 kDa, tingible por colorantes catiónicos, digerible por neuraminidasa y capaz de fijarse a aglutinina de germen de trigo. Estos autores concluyeron que esta proteína era el equivalente bioquímico del polianión del epitelio glomerular, descrito por medios histoquímicos, y la denominaron podocalicina (PODXL) dada su localización en el glicocalix de los podocitos glomerulares. Trabajos posteriores demostraron que su carga negativa era debida a su alto contenido en sulfato y ácido siálico (Dekan, Gabel y Farquhar 1991). Se ha considerado que la podocalicina o, para ser más precisos, su carga superficial, es esencial para mantener la estructura de las células epiteliales (podocitos) de los glomérulos renales e impedir la oclusión de las rendijas epiteliales, también denominadas espacios urinarios (Charest y Roth 1985, Kerjaschki y col. 1984, Michael y col. 1970). La importancia patológica de la podocalicina se apoya en los hallazgos de la disminución del contenido glomerular de ácido siálico, distorsión de la estructura de los podocitos y obliteración de las rendijas epiteliales en casos de nefrosis humana de “cambios mínimos” o en nefrosis experimentales (Caulfield, Reid y Farquhar 1976, Seiler y col. 1977).CD34, podocalicina y endoglicano se agrupan como una familia de proteínas (familia CD34) en base a la conservación de la organización de sus dominios así como de su organización genómica (Doyonnas y col. 2001, Nielsen y col. 2002, Li y col. 2001).Beca del Consejo Superior de Investigaciones Científicas y Banco Santander Central Hispano (CSIC-BSCH). Contrato del Centro de Investigación Biomédicas en Red de Enfermedades Raras (CIBERer). Instituto de Salud Carlos III. Ministerio de Ciencia e Innovación. Proyectos del Plan Nacional de I+D+i, Programa de Biomedicina, Ministerio de Ciencia e Innovación, SAF2004-04345, SAF2005-01261 y SAF2007-61701Peer reviewe

Building Resilience with Aerobic Exercise: Role of FKBP5.

Both preclinical and clinical studies have pointed that aerobic exercise, at moderate doses, is beneficial at all stages of life by promoting a range of physiological and neuroplastic adaptations that reduce the anxiety response. Previous research about this topic have repeatedly described how the regular practice of aerobic exercise induces a positive regulation of neuroplasticity and neurogenesis-related genes, as well as a better control of the HPA axis function. However, limited progress has been carried out in the integration of neuroendocrine and neuroplastic changes, as well as in introducing new factors to understand how aerobic exercise can promote resilience to future stressful conditions. Resilience is defined as the ability to adapt to stress while maintaining healthy mental and physical performance. Consistent findings point to an important role of FKBP5, the gene expressing FK506-binding protein 51 (FKBP51), as a strong inhibitor of the glucocorticoid receptor (GR), and thus, an important regulator of the stress response. We propose that aerobic exercise could contribute to modulate FKBP5 activity acting as a potential therapeutic approach for mood disorders. In this sense, aerobic exercise is well known for increasing the growth factor BDNF, which by downstream pathways could affect the FKBP5 activity. Therefore, our manuscript has the aim of analyzing how FKBP5 could constitute a promising target of aerobic exercise promoting resilient-related phenotypes.pre-print346 K

Diferencias culturales en la expresión verbal y no verbal de las emociones

In this research the relationship between a series of cultural dimensions and the emotional verbal and non verbal reactions in three prototypical emotions (joy, anger and sadness) will be analyzed. Results show that Asians has a stronger normative system of emotional display rules than other groups. They also show lower gender differences. In order to predict lower emotional verbal and non verbal expression the most important cultural dimension is cultural masculinity. High power distance cultures foster emotional reactions which respect and legitimize status differences. This dimension also predicts a lower verbal expression of negative emotions. On the other hand, Uncertainty Avoidance is not generally associated to a high emotional expression. Finally. Communicating good feelings to other people is more typical of collectivistic and high power distance countriesLa investigación que presentamos tiene como objeto analizar la relación entre las dimensiones culturales y la expresión verbal y no verbal de las emociones de alegría, cólera - enfado y tristeza. Los resultados confirman que las culturas asiáticas presentan un sistema de regulación emocional más fuerte o marcado que los otros grupos culturales estudiados. Además, estas sociedades asiáticas presentan menos diferencias de género. La dimensión cultural que mejor predice la baja expresividad verbal y la no expresión verbal emocional es la masculinidad cultural. La expresión emocional en las culturas con alta distancia de poder se caracteriza por el respeto y la deferencia. Asimismo, esta dimensión predice la baja expresión verbal de las emociones negativas. Por otra parte, la evitación de la incertidumbre no está asociada generalmente a la alta expresividad emocional. Finalmente, los datos corroborar que comunicar buenos sentimientos a otras personas es más típico de los países colectivistas y con alta distancia de poderThis study was supported by the following Basque Country Government Research Grants. Projects 109.231 – HA 118/96; 109.231 – HA 208/97 and the Basque Country University group. UPV 109.231 - G 56/9

Revisión de la literatura en el marco de un proyecto para la validación de estrategias de aprendizaje de la Geometría en ambientes apoyados con TIC

Este artículo tiene el propósito de mostrar algunos elementos que constituyen una propuesta de acercamiento al estado del arte, como marco de referencia para un proyecto de investigación enfocado al estudio de las condiciones bajo las cuales una herramienta informática permite que los estudiantes obtengan aprendizajes significativos en Geometría

Adult hippocampal neurogenesis and cognitive aging

Aging is a normal developmental process associated with neurobiological changes leading to cognitive alterations with preserved, impaired, and enhanced functions. Evidence from animal and human studies is reviewed to explore the potential role of hippocampal plasticity on age-related cognitive changes with special attention to adult hippocampal neurogenesis. Results from lesion and stimulation strategies, as well as correlation data, support either a direct or modulatory role for adult newborn neurons in cognition at advanced ages. Further research on this topic may help to develop new treatments and to improve the quality of life of older people