Bridge helix bending promotes RNA polymerase II backtracking through a critical and conserved threonine residue.

The dynamics of the RNA polymerase II (Pol II) backtracking process is poorly understood. We built a Markov State Model from extensive molecular dynamics simulations to identify metastable intermediate states and the dynamics of backtracking at atomistic detail. Our results reveal that Pol II backtracking occurs in a stepwise mode where two intermediate states are involved. We find that the continuous bending motion of the Bridge helix (BH) serves as a critical checkpoint, using the highly conserved BH residue T831 as a sensing probe for the 3'-terminal base paring of RNA:DNA hybrid. If the base pair is mismatched, BH bending can promote the RNA 3'-end nucleotide into a frayed state that further leads to the backtracked state. These computational observations are validated by site-directed mutagenesis and transcript cleavage assays, and provide insights into the key factors that regulate the preferences of the backward translocation

A Role for Both Conformational Selection and Induced Fit in Ligand Binding by the LAO Protein

Molecular recognition is determined by the structure and dynamics of both a protein and its ligand, but it is difficult to directly assess the role of each of these players. In this study, we use Markov State Models (MSMs) built from atomistic simulations to elucidate the mechanism by which the Lysine-, Arginine-, Ornithine-binding (LAO) protein binds to its ligand. We show that our model can predict the bound state, binding free energy, and association rate with reasonable accuracy and then use the model to dissect the binding mechanism. In the past, this binding event has often been assumed to occur via an induced fit mechanism because the protein's binding site is completely closed in the bound state, making it impossible for the ligand to enter the binding site after the protein has adopted the closed conformation. More complex mechanisms have also been hypothesized, but these have remained controversial. Here, we are able to directly observe roles for both the conformational selection and induced fit mechanisms in LAO binding. First, the LAO protein tends to form a partially closed encounter complex via conformational selection (that is, the apo protein can sample this state), though the induced fit mechanism can also play a role here. Then, interactions with the ligand can induce a transition to the bound state. Based on these results, we propose that MSMs built from atomistic simulations may be a powerful way of dissecting ligand-binding mechanisms and may eventually facilitate a deeper understanding of allostery as well as the prediction of new protein-ligand interactions, an important step in drug discovery

MEMÓRIAS DO CURSO DE PROEJA EM ELETROMECÂNICA DO IF-SC, CAMPUS CHAPECÓ

A educação profissional no Brasil vem passando por importantes mudanças nos últimos anos, com a expansão da rede federal de ensino e a criação dos Institutos Federais de Educação, Ciência e Tecnologia. Um dos marcos neste contexto de mudanças foi a criação, em 2005, do PROEJA que, a partir de 2006 passou a ser identificado como Programa de Integração da Educação Básica com a Educação Profissional na modalidade de Educação de Jovens e Adultos. A instituição do PROEJA obrigou a rede federal de ensino a ampliar sua atuação com o público jovem e adulto e fez surgir novas experiências educativas em todo o Brasil

Nuanced qualitative trait approaches reveal environmental filtering and phylogenetic constraints on lichen communities

We propose that a qualitative trait approach based on more detailed nuanced traits may reveal previously overlooked patterns, especially when combined with phylogenetic perspectives. By sampling epiphytic lichens and using a functional approach based on nuanced qualitative traits, such as a much greater resolution over photobiont identity, type of cortex, and chemical compounds, we evaluated the effects of environmental filtering and phylogenetic constraints on community assembly along a natural succession of Atlantic rainforest. We found changes in taxonomic, functional, and phylogenetic composition, structure, and diversity. Functional traits such as photobiont genera, type of cortex, reproductive structures, propagule size, and protection strategies showed strong responses to succession. Mature forests with a closed canopy impose strong environment filtering that is reflected in lichen species turnover, limiting diversity, but also holding different functional and phylogenetic composition. The use of a nuanced qualitative trait approach may overcome some of the limitations of using this type of traits and shows the importance of often-overlooked key lichen functional traits, including the presence of carbon-concentrating mechanisms in photobionts and cortex properties. Furthermore, this is the first study showing how patterns of phylogenetic assembly along forest succession structure lichen communities

AGRICULTURA FAMILIAR DE PRODUTOS ORGÂNICOS: UM OLHAR SOB A ÓTICA DO MARKETING

As mudanças de comportamento do consumidor de alimentos têm determinado e influenciado as estratégias e atitudes dos outros elos das cadeias produtivas. Esta lógica altera a visão de que a produção determina o consumo e, portanto, as estratégias de marketing, para uma visão da produção orientada pelo consumo. Assim, este estudo objetiva identificar as principais estratégias de marketing dos produtores familiares de produtos orgânicos, expostos na 29ª Exposição Feira Internacional (Expointer) realizada em agosto/setembro de 2006, no Parque de Exposições Assis Brasil, em Esteio, Rio Grande do Sul (RS). Para fundamentar as proposições e questionamentos deste estudo, foram abordadas algumas reflexões teóricas acerca da agricultura familiar, produção orgânica,cooperação e marketing. Os dados foram coletados através da aplicação de um questionário semi-estruturado a representantes de nove agroindústrias familiares produtora de orgânicos. Verificou-se que os produtores orgânicos estudados apresentam estratégias de marketing incipientes, centradas principalmente na participação em feiras. Neste sentido, percebe-se a cooperação, mediante a formação de redes de cooperação, como alternativa relevante no estabelecimento de um olhar da produção e comercialização de orgânicos a partir do marketing, orientado pela demanda

FRUTICULTURA E ATIVIDADE DOCEIRA COMO ALTERNATIVAS PROMOTORAS DE DESENVOLVIMENTO DO MUNICÍPIO DE PELOTAS/RS/BRASIL

Durante muitos anos o município de Pelotas ocupou posição de destaque no desenvolvimento do Estado do Rio Grande do Sul, principalmente no período das charqueadas, entrando em declínio posteriormente. Contudo, novas alternativas têm emergido ao longo dos anos, objetivando retomar o desenvolvimento local e regional. Assim, o presente estudo tem por objetivo apresentar a fruticultura e a atividade doceira como alternativas promotoras de desenvolvimento para o município de Pelotas, bem como a rastreabilidade e identificação de procedência como fatores de diferenciação e competitividade para estes setores. Tomou-se como lente de análise algumas reflexões sobre desenvolvimento regional e local, focado na problemática das desigualdades regionais, bem como nas alternativas e potencialidades locais para alavancar o desenvolvimento. A fruticultura e a atividade doceira do município de Pelotas e região estão inseridas na geração de desenvolvimento local e regional, impulsionando a promoção de empregos e renda, tanto na produção agrícola, industrial e de serviços. No entanto, estes setores apresentam potencialidades que podem ser agregadas através da prática de rastreabilidade na fruticultura e identificação de procedência no setor doceiro

O aproveitamento dos resíduos do setor florestal de Lages- Santa Catarina

O agronegócio florestal tem ganhado destaque nosúltimos anos no Brasil e no mundo, principalmente em funçãode tratar-se de recursos renováveis dentro da ótica desustentabilidade ambiental e seguindo a trajetória de substituiçãoou produção de recursos até então extraídos da natureza.Porém, mesmo se tratando de recursos renováveis, osetor florestal, como a maioria das outras atividades produtivas,produz grandes quantidades de sobras de menor valorcomercial, chamados tradicionalmente de resíduos. Sobrasestas que muitas vezes são destinadas erroneamente ao meioambiente, causando sérios problemas de poluição ambiental.Dentro desta perspectiva, realizou-se o presente estudo, como objetivo de verificar alternativas de aproveitamento dosresíduos florestais, bem como suas contribuições parasustentabilidade ambiental da região de Lages (SC). Paratanto, tomou-se como objeto de estudo o setor florestal daregião de Lages (SC) e mais especificamente a Unidade deCo-geração Tractebel Energia, empresa consumidora debiomassa dos resíduos das indústrias madeireiras, gerandoenergia elétrica e vapor para indústrias locais. Verificou-seque a referida empresa está aplicando conceitos e práticasde sustentabilidade ambiental, podendo ser considerada umaexperiência modelo

Metodologia para desenvolvimento de subsistemas de TT&C em CubeSats

The CubeSats concept began in 1999 as a collaboration between California Polytechnic State University and Stanford University, and today it is an accessible and widely used by educational institutions and the private sector for the development of small satellites. As these small satellites are unmanned, the Telemetry Tracking and Remote Control (TT&C) system is one of the most critical to the mission, as their failure results in its premature end. This work presents a study of the main concepts related to the TT&C system, especially with regard to minimum power and transmission speed to ensure correct and complete transmission of payload data. Posteriorly, using the concepts presented, a set of needs is elaborated for its good functioning and good integration with the other systems of a CubeSat

Blockchain e Sistemas de Reputação em Redes Veiculares: Uma Revisão Sistemática

Vehicular networks form an important pillar of current IntelligentTransportation Systems. Due to its specific characteristics, thesenetworks have been using reputation systems and or trust modelsto ensure security and trustworthiness. In addition, blockchainis a valuable technology that enables the development of thesesystems, addressing privacy, anonymity, and access control issues.This work aims to describe the results of the systematic literaturereviewon blockchain-based reputation systems.We compared someselected works and highlighted the adopted techniques and themain challenges

RELAÇÃO ENTRE O DISCLOSURE DE RISCOS CLIMÁTICOS E O RETORNO ANORMAL DAS EMPRESAS BRASILEIRAS

Objetivou-se nesta pesquisa investigar a relação entre o disclosure de riscos climáticos e o retorno anormal do preço das ações de empresas listadas na BM&FBovespa. Foram coletados os dados de 64 empresas listadas na BM&FBovespa que divulgam relatórios de sustentabilidade de acordo com as diretrizes do Global Reporting Iniciative, GRI, referente ao ano de 2012. Utilizou-se a análise de conteúdo para identificar as sentenças sobre riscos climáticos. Observou-se um total de 1992 sentenças sobre riscos climáticos, mudanças climáticas, aquecimento global e riscos e oportunidade associados a essas mudanças. A regressão multivariada foi usada para verificar o impacto do disclosure de riscos climáticos sobre o retorno anormal do preço das ações.  Pelos achados não foi encontrada nenhuma relação estatisticamente significativa entre a divulgação de riscos climáticos e o retorno anormal do preço das ações (p-valor = 0,547). De acordo com a teoria dos stakeholders a preocupação com o meio ambiente levaria ao acréscimo do valor da empresa, no entanto, esta relação dos gastos ambientais e o desempenho econômico-financeiro das corporações não foi comprovada nesta investigação, com os modelos econométricos e o tipo de amostra usados