Caracterización de G3BP1 como un nuevo factor de interacción con el IRES

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 31-03-2017Caracterización de G3BP1 como un nuevo factor de interacción con el IRES Los sitios de entrada interna al ribosoma (IRES) son regiones del RNA que actúan en cis. Fueron inicialmente caracterizados en el genoma de los picornavirus, y reclutan la maquinaria de traducción con la ayuda de factores de actuación en trans del IRES (ITAFs). Los ITAFs son proteínas de unión a RNA (RBP) que forman parte de complejos macromoleculares que determinan el destino del mRNA. La proteína 1 de unión al dominio SH3 de la GTPasa de Ras (G3BP1) pertenece a una familia de RBPs que acoplan la señalización de receptores asociados a tirosín quinasas con el metabolismo del mRNA. G3BP1 contiene en su extremo C-terminal dos motivos de unión a RNA, un motivo de reconocimiento de RNA (RRM) y un motivo rico en arginina-glicina (RGG). G3BP1 está localizada en gránulos de estrés (SGs) y contribuye a su ensamblaje. Los SGs son agregados citoplásmicos que contienen complejos de pre-iniciación detenidos; se ha propuesto que sirven como depósitos transitorios del mRNA durante la respuesta a estrés. En los últimos años se ha descrito que en células infectadas por picornavirus el ensamblaje y la función de SGs se modula a la vez que aumenta la eficiencia de replicación viral. G3BP1 se identificó unida al dominio 5 (d5) del IRES del virus de la fiebre aftosa (FMDV) en ensayos de riboproteómica. Utilizando ensayos de movilidad electroforética y de entrecruzamiento por luz UV hemos demostrado que G3BP1 interacciona con distintos dominios del IRES de FMDV. Mediante análisis mutacional se ha confirmado que el sitio preferente de unión se encuentra en la región de cadena sencilla del d5. G3BP1 también interaccionó con el IRES del virus de hepatitis C (HCV). Análisis funcionales de traducción in vivo e in vitro usando RNAs bi- y mono-cistrónicos han revelado que G3BP1 es un inhibidor de la traducción dependiente de IRES y dependiente de cap. Ensayos de co-precipitación demostraron que G3BP1 puede interaccionar con la proteína de unión al tramo de polipirimidinas (PTB) y con el factor de inicio de la traducción eucariótico 4B (eIF4B) de manera directa. Ambas proteínas son estimuladoras de la traducción dependiente de IRES. G3BP1 se proteoliza durante la infección por FMDV, originando un fragmento carboxilo-terminal (Ct) que presenta los motivos de unión a RNA y otro, amino-terminal (Nt). Solamente el fragmento Ct-G3BP1 interacciona de manera directa con las proteínas PTB y eIF4B. Sin embargo ambos fragmentos muestran la capacidad de inhibir la traducción dependiente de IRES y de cap, tanto in vivo como in vitro

Los medios comunitarios, un reto para la comunicación en el Ecuador

El Ecuador es un país con una escasa historia en medios comunitarios de comunicación, pues la mayoría de empresas comunicacionales están en manos de iniciativas privadas, con intereses económico-políticos. Desde la aparición de “Primicias de la Cultura de Quito” (1792), el primer periódico en tierras de lo que hoy es el Ecuador, los medios privados han dominado el panorama nacional, no así los medios comunitarios, que han tenido una presencia muy reducida, debido al estilo con el que se ha manejado la concesión de frecuencias en el país. Hasta enero de 2014 estaban registrados en el Consejo de Regulación y Desarrollo de la Comunicación 1146 medios de comunicación, de los cuales 1 048 eran privados, 63 públicos, 35 comunitarios y cinco agencias de noticias. Los datos de la auditoría de frecuencias realizada en el año 2009, revelan que en el Ecuador, más del 90% de las frecuencias de radio y televisión se encontraban en manos privadas y algunas de las personas naturales del sector privado concentraban hasta 54 frecuencias (Comisión de Auditoría Concesiones de Frecuencias de Radio y Televisión, 2009)

Nanostructured Channel for Improving Emission Efficiency of Hybrid Light-Emitting Field-Effect Transistors

We report on the mechanism of enhancing the luminance and external quantum efficiency (EQE) by developing nanostructured channels in hybrid (organic/inorganic) light-emitting transistors (HLETs) that combine a solution-processed oxide and a polymer heterostructure. The heterostructure comprised two parts: (i) the zinc tin oxide/zinc oxide (ZTO/ZnO), with and without ZnO nanowires (NWs) grown on the top of the ZTO/ZnO stack, as the charge transport layer and (ii) a polymer Super Yellow (SY, also known as PDY-132) layer as the light-emitting layer. Device characterization shows that using NWs significantly improves luminance and EQE (≈1.1% @ 5000 cd m–2) compared to previously reported similar HLET devices that show EQE < 1%. The size and shape of the NWs were controlled through solution concentration and growth time, which also render NWs to have higher crystallinity. Notably, the size of the NWs was found to provide higher escape efficiency for emitted photons while offering lower contact resistance for charge injection, which resulted in the improved optical performance of HLETs. These results represent a significant step forward in enabling efficient and all-solution-processed HLET technology for lighting and display applications

Disfunción sexual en mujeres con esclerosis sistémica

Introducción: la disfunción sexual (DS) es común entre las mujeres con enfermedades crónicas, incluyendo esclerosis sistémica (ES). Se ha asociado con características como la duración de la enfermedad, dolor, disminución de la actividad funcional, entre otras. Desde nuestro conocimiento, aún no contamos con datos locales. Objetivos: evaluar la frecuencia de DS en mujeres con ES; describir las características sociodemográficas, clínicas y psicológicas asociadas con la DS en mujeres con ES. Materiales y métodos: estudio observacional, analítico y de corte transversal. Se incluyeron mujeres de entre 20 y 59 años con diagnóstico de ES, según los criterios de clasificación del European League Against Rheumatism/American College of Rheumatology (ACR/EULAR 2013). Se excluyeron pacientes con enfermedades crónicas no controladas, otras patologías reumatológicas autoinmunes, e inactividad sexual o patología genitourinaria no relacionadas a ES en las últimas 4 semanas. La DS se evaluó con la versión en español del cuestionario índice de función sexual femenina (Female sexual function index, FSFI). Resultados: se incluyeron 56 pacientes. El 78,57% presentó DS y 19,64% era sexualmente inactiva debido a la enfermedad. Escala visual análoga (EVA) de fatiga (coeficiente β: -0,08, IC 95%: -0,14 a -0,02; p<0,01), edad (coeficiente β: -0,23, IC 95%: -0,40 a -0,05; p=0,01) y fibromialgia (coeficiente β: -11,90, IC 95%: -17,98 a -5,82; p<0,01) mostraron una asociación significativa e independiente con DS en el análisis multivariado. Conclusiones: la DS es frecuente entre las mujeres con ES, y las pacientes más jóvenes, sin fibromialgia y con menor fatiga presentaron una mejor funcionalidad sexual

Nuevo Sistema Institucional de Evaluación una propuesta creativa adecuada

¿Cómo elaborar el Sistema Institucional de Evaluación de los colegios de Bogotá? En primer lugar, considero muy importante partir de los antecedentes derivados de los foros institucionales, locales y nacionales que sobre evaluación se han realizado en los últimos diez años. La actual propuesta está basada en las conclusiones y el trabajo que se ha desarrollado en el Colegio Aquileo Parra y otras instituciones educativas que han aportado ideas y luces para construir el SIE, y que pueden servir de base para ser mejorado

Persistance des inégalités de genre sur le marché du travail : le rôle des normes d'identité et de la structure occupationnelle

Cette thèse contribue à la littérature qui vise à comprendre les causes des inégalités hommes-femmes qui subsistent sur le marché du travail. Les deux premiers chapitres examinent le rôle des normes sociales. Le premier chapitre montre que dans le contexte d'un pays à revenu intermédiaire, l'Uruguay, la norme du soutien de famille masculin affecte non seulement l'offre de main-d'œuvre, mais aussi la qualité des emplois dans lesquels les femmes sont employées, alors que celle-ci conduit les hommes à s'auto-sélectionner dans des emplois formels mieux rémunérés. Le deuxième chapitre utilise des données de panel pour les couples américains et examine comment l'offre de travail à la naissance du premier enfant est conditionné par des gains relatifs au sein du couple. Nous constatons que les normes sociales associées au rôle de la mère influencent fortement les décisions relatives au marché du travail. Même les femmes qui étaient la principale source de revenue au sein du ménage avant leur premier enfant, réduisent considérablement leurs heures de travail et probabilité d'emploi, assumant plus que les hommes le garde d'enfants. Le troisième chapitre étudie l'effet du changement technologique sur l'écart salarial. En utilisant des données administratives pour l'Allemagne, on montre que les femmes ont été moins exposées à l'automatisation du travail et ont augmenté leur emploi dans des professions cognitives non routinières. Cependant, les gains salariaux des hommes ont été plus importants que ceux des femmes au sein des groupes cognitifs, ce qui explique pourquoi les changements technologiques n'ont pas entraîné de réductions plus importantes de l'écart salarial entre les sexes.This dissertation contributes to the literature that aims to understand the underlying causes of the persistent gender inequalities in the labor market. The two first chapters investigate the role of social norms in shaping the observed gender outcomes. The first chapter finds that in the context of a middle-income country like Uruguay, the male breadwinner norm affects not only the labor supply but also the quality of jobs in which women are employed, while they lead men to self-select into better-paid formal jobs. The second chapter uses panel data for US couples and investigates how labor supply responses to the birth of the first child are conditioned by relative earnings within the couple. We find that social norms associated to mother's role strongly shape labor market decisions. Even those women who were the main breadwinners in the household before having their first child, reduce their hours and employment probability dramatically, shouldering the childcare responsibilities more than men, which points towards a misallocation of resources. The third chapter studies the effect of technological change on the wage gap dynamics. Using administrative data for West Germany, I show that gender segregation across occupations has mostly benefited female workers, contributing to narrow the gender gap. This is explained because women have been less exposed to the automation of work and increased their employment in non-routine cognitive occupations. However, the wage gains for male workers have been larger than those for females within the cognitive groups, which explains why, technological change did not lead to greater reductions in the gender wage gap

Potentiel des écosystèmes microbiens fromagers pour la formation de peptides bioactifs, et effets dûs aux matrices laitières sur la survie des microorganismes d´intérêt fromager au cours de la digestion.

This thesis was realized to respond to two particular objectives a) to determine the presence of bioactive peptides with activities as antioxidants and inhibitors of the angiotensin converting enzyme (ACE) in Mexican cheeses; and b), to observe the effect of composition and structure of dairy matrices in survival of dairy microorganism through digestion. Two Mexican cheeses were analyzed separately: Cotija cheeses ripened 6 months; and Fresh goat cheese (unripened) produced from raw and pasteurized milk. Studied cheeses had important antioxidant activity that was higher in fractions with smaller peptides. Young Cotija cheese had similar values than Fresh goat cheese. But activity increased throughout ripening (because of the production of soluble peptides). Milk pasteurization (Fresh goat cheeses) did not affect the antioxidant activity. This activity was correlated with the hydrophilic peptides. Also, both cheeses possess ACE inhibitor activity that was higher in Fresh goat cheese than in young Cotija cheese. This inhibitor activity was more correlated with the hydrophobic peptides. Pasteurization of Fresh goat cheeses increased the production of hydrophobic peptides. The release of bioactive peptides in cheeses has always been considered as dependent of the proteolysis caused by cheese microbiota. Some of these microorganisms are capable to survive digestion. It has been hypothesized that the presence of a food matrix could enhance their resistance through digestion.We measured the viability of three dairy microorganisms; Streptococcus thermophilus, Brevibacterium aurantiacum and Hafnia alvei during (in vitro and in vivo) digestion. Microorganisms were included in liquid and gel dairy matrices with and without fat: Skim milk (SM), whole milk (WM), rennet gel of skim milk (GSM) and rennet gel of whole milk (GWM). In vitro digestion was carried on with a dynamic digester (DIDGI) that simulated the stomach, duodenum and small intestine. Parameters of digestion were the same for all the matrices tested. The degradation of the dairy matrices through in vitro digestion was analyzed by electrophoreses and GC-Mass. Confocal laser scanning microscopy (CLSM) was performed to observe matrix microstructure.During in vitro digestion, the microorganisms had different survival rates; S. thermophilus was highly sensitive to gastric stress, and was not found in the duodenal compartment. B. auranticum was moderately sensitive to gastric stress but resistant to duodenal stress. H. alvei was highly resistant to both stresses. Despite its buffer capacity, we did not observe any effect of the dairy matrices on microorganisms survival. CLSM images, probed the effect of low pH on microorganisms survival. However our in vivo analyses failed to confirm in vitro observations and tested microorganisms were not detected.Cette thèse eu deux objectifs: A) Déterminer la présence de peptides bioactifs avec des activités antioxydantes ou inhibitrices d´enzyme de conversion de l'angiotensine (ECA) dans les fromages mexicains. B) Observer l'effet de la composition et de la structure de matrices laitières dans la survie des microorganismes laitières pendant la digestion. Les fromages ont été analysés séparément: fromage Cotija, affiné 6 mois et fromage de chèvre frais (non affiné) produit à partir de lait cru et pasteurisé. L´activité antioxydante a été plus élevé dans les fractions contenant des petits peptides. Le fromage Cotija jeune a donné des valeurs similaires au fromage de chèvre frais mais l'activité augmente pendant l´affinage (en raison de la production de peptides solubles). La pasteurisation n'a pas impacté l'activité antioxydante dans les fromages de chèvre frais. Cette activité a été corrélée avec les peptides hydrophiles. Les deux fromages ont une activité inhibitrice de l´ECA qui a été plus élevée dans le fromage de chèvre que dans le fromage Cotija jeune. Cette activité était corrélée avec les peptides hydrophobes. Les fromages de chèvre frais, fait avec du lait pasteurisés, ont une concentration en peptides hydrophobes plus élevé. La libération de peptides bioactifs dans le fromage a toujours été considérée comme dépendante de la protéolyse par action des microorganismes. Certains de ces microorganismes sont capables de survivre à la digestion et l'hypothèse que la présence d'une matrice alimentaire pourrait améliorer leur résistance pendant la digestion a été testée. Nous avons mesuré la viabilité des microorganismes; Streptococcus thermophilus, Brevibacterium aurantiacum et Hafnia alvei pendant la digestion (in vitro et in vivo). Les microorganismes ont été inclus dans des matrices laitières liquides et gélifiées avec et sans matière grasse: lait écrème (SM), lait entier (WM), gel présure de lait écrèmé (GSM) et gel présure de lait entier (GWM). La digestion in vitro a été réalisée sur un digesteur dynamique (DIDGI) qui simule l'estomac, le duodénum et l'intestin grêle. Les paramètres de la digestion ont été les mêmes pour toutes les matrices. La dégradation des matrices pendant digestion in vitro a été analysée par électrophorèse et GC-Mass. La microscopie confocale à balayage laser (CLSM) a été aussi réalisée pour observer la microstructure. Pendant la digestion in vitro, il a été montré que S. thermophilus était très sensible au stress gastrique, et n'a pas été trouvé dans le compartiment duodénale. B. auranticum était modérément sensible au stress gastrique, mais résistant au stress duodénale. H. alvei était très résistant aux deux stress, par contre aucun effet des matrices laitières n'a été observé. Les images de CLSM ont montré l'effet de l´acidité sur la survie des microorganismes. Mais les analyse in vivo n’ont pas réussi à confirmer les observations in vitro parce que les microorganismes testés ne sont pas détectés

Potential of cheese microorganisms ecosystems for the production of bioactive peptides, and effect of the dairy matrices in the survival of dairy microorganisms through digestion

Cette thèse eu deux objectifs: A) Déterminer la présence de peptides bioactifs avec des activités antioxydantes ou inhibitrices d´enzyme de conversion de l'angiotensine (ECA) dans les fromages mexicains. B) Observer l'effet de la composition et de la structure de matrices laitières dans la survie des microorganismes laitières pendant la digestion. Les fromages ont été analysés séparément: fromage Cotija, affiné 6 mois et fromage de chèvre frais (non affiné) produit à partir de lait cru et pasteurisé. L´activité antioxydante a été plus élevé dans les fractions contenant des petits peptides. Le fromage Cotija jeune a donné des valeurs similaires au fromage de chèvre frais mais l'activité augmente pendant l´affinage (en raison de la production de peptides solubles). La pasteurisation n'a pas impacté l'activité antioxydante dans les fromages de chèvre frais. Cette activité a été corrélée avec les peptides hydrophiles. Les deux fromages ont une activité inhibitrice de l´ECA qui a été plus élevée dans le fromage de chèvre que dans le fromage Cotija jeune. Cette activité était corrélée avec les peptides hydrophobes. Les fromages de chèvre frais, fait avec du lait pasteurisés, ont une concentration en peptides hydrophobes plus élevé. La libération de peptides bioactifs dans le fromage a toujours été considérée comme dépendante de la protéolyse par action des microorganismes. Certains de ces microorganismes sont capables de survivre à la digestion et l'hypothèse que la présence d'une matrice alimentaire pourrait améliorer leur résistance pendant la digestion a été testée. Nous avons mesuré la viabilité des microorganismes; Streptococcus thermophilus, Brevibacterium aurantiacum et Hafnia alvei pendant la digestion (in vitro et in vivo). Les microorganismes ont été inclus dans des matrices laitières liquides et gélifiées avec et sans matière grasse: lait écrème (SM), lait entier (WM), gel présure de lait écrèmé (GSM) et gel présure de lait entier (GWM). La digestion in vitro a été réalisée sur un digesteur dynamique (DIDGI) qui simule l'estomac, le duodénum et l'intestin grêle. Les paramètres de la digestion ont été les mêmes pour toutes les matrices. La dégradation des matrices pendant digestion in vitro a été analysée par électrophorèse et GC-Mass. La microscopie confocale à balayage laser (CLSM) a été aussi réalisée pour observer la microstructure. Pendant la digestion in vitro, il a été montré que S. thermophilus était très sensible au stress gastrique, et n'a pas été trouvé dans le compartiment duodénale. B. auranticum était modérément sensible au stress gastrique, mais résistant au stress duodénale. H. alvei était très résistant aux deux stress, par contre aucun effet des matrices laitières n'a été observé. Les images de CLSM ont montré l'effet de l´acidité sur la survie des microorganismes. Mais les analyse in vivo n’ont pas réussi à confirmer les observations in vitro parce que les microorganismes testés ne sont pas détectés.This thesis was realized to respond to two particular objectives a) to determine the presence of bioactive peptides with activities as antioxidants and inhibitors of the angiotensin converting enzyme (ACE) in Mexican cheeses; and b), to observe the effect of composition and structure of dairy matrices in survival of dairy microorganism through digestion. Two Mexican cheeses were analyzed separately: Cotija cheeses ripened 6 months; and Fresh goat cheese (unripened) produced from raw and pasteurized milk. Studied cheeses had important antioxidant activity that was higher in fractions with smaller peptides. Young Cotija cheese had similar values than Fresh goat cheese. But activity increased throughout ripening (because of the production of soluble peptides). Milk pasteurization (Fresh goat cheeses) did not affect the antioxidant activity. This activity was correlated with the hydrophilic peptides. Also, both cheeses possess ACE inhibitor activity that was higher in Fresh goat cheese than in young Cotija cheese. This inhibitor activity was more correlated with the hydrophobic peptides. Pasteurization of Fresh goat cheeses increased the production of hydrophobic peptides. The release of bioactive peptides in cheeses has always been considered as dependent of the proteolysis caused by cheese microbiota. Some of these microorganisms are capable to survive digestion. It has been hypothesized that the presence of a food matrix could enhance their resistance through digestion.We measured the viability of three dairy microorganisms; Streptococcus thermophilus, Brevibacterium aurantiacum and Hafnia alvei during (in vitro and in vivo) digestion. Microorganisms were included in liquid and gel dairy matrices with and without fat: Skim milk (SM), whole milk (WM), rennet gel of skim milk (GSM) and rennet gel of whole milk (GWM). In vitro digestion was carried on with a dynamic digester (DIDGI) that simulated the stomach, duodenum and small intestine. Parameters of digestion were the same for all the matrices tested. The degradation of the dairy matrices through in vitro digestion was analyzed by electrophoreses and GC-Mass. Confocal laser scanning microscopy (CLSM) was performed to observe matrix microstructure.During in vitro digestion, the microorganisms had different survival rates; S. thermophilus was highly sensitive to gastric stress, and was not found in the duodenal compartment. B. auranticum was moderately sensitive to gastric stress but resistant to duodenal stress. H. alvei was highly resistant to both stresses. Despite its buffer capacity, we did not observe any effect of the dairy matrices on microorganisms survival. CLSM images, probed the effect of low pH on microorganisms survival. However our in vivo analyses failed to confirm in vitro observations and tested microorganisms were not detected

Contribution to the evaluation of the internal variation on acheulean industries : case study of Garba I (Melka Kunture, Ethiopie)

Ce travail de recherche, axé sur le matériel du site de Garba I (Melka Kunture, Ethiopie), explore la variation interne des productions lithiques de la période Acheuléenne, en tenant compte de l’état technique des pièces et du niveau de savoir-faire des tailleurs. À partir d’une analyse qualitative des pièces, elle montre l’impact que ces facteurs individuels peuvent avoir dans l’apparence des pièces, et leur importance pour une bonne compréhension des intentions sous-jacentes à la taille. En conséquence, ce travail a été structuré pour intégrer aux mieux ce concepts en fonction des caractéristiques du matériel, le but ultime étant de saisir les comportements des hominiens qui ont occupé le territoire de Melka Kunture, à l’époque de Garba I, tant aux niveau des techniques employées que de l’organisation des activités. Les résultats de l’étude mettent en évidence une forte standardisation dans la production des pièces bifaciales, et une maîtrise remarquable de la percussion conchoïdale, selon deux techniques, appliquées au façonnage, qui dépassent l’explication d’un simple processus de réduction, amenant à une forme non intentionnelle, par gestes stéréotypés. Ce travail nous a également permis d’identifier un procédé technique particulier (le coup du tranchet), à valeur de marqueur culturel, et de relever l’importance du petit outillage retouché et des outils de percussion, et encore d’entrevoir de possibles liens entre les industries acheuléennes et le Middle Stone Age. Ce travail se décline en trois parties : 1) état de la question sur l’Acheuléen africain et les différentes approches employées pour son étude ; 2) contexte régional et macro-régional ; 3) contexte de déposition des vestiges, chronologie, et état de conservation ; 4) méthodologie utilisée pour l’étude ; 5) discussion des résultats et remise en contexte.This research focuses on the analysis of Acheulean lithic material from the site of Garba I (Melka Kunture, Ethiopia). Specifically, this study explores internal variability in the technical repertoires that underlie the production of lithic artefacts at the site, by considering the technical stages involved in their manufacture and the knappers’ technological savoir-faire (know-how). Through this qualitative approach it becomes possible to assess the influence of individual factors on the morphology of the tools, and their relative importance for understanding the intentions that underlie the knapping. This study integrates these concepts based on the characteristics of the assemblage; the ultimate goal being to understand the behaviour of the hominins that occupied Melka Kunture at the time of Garba I, both in terms of the techniques employed and the organisation of the activites. The results highlight the highly standardised nature of bifacial artefacts at the site, and the knappers’ remarkable control over conchoïdal percussion using two particular techniques, applied during their façonnage, which cannot be explained as simple reduction processes that create unintended forms through stereotypical knapping gestures. The identification in the assemblage of a specific technical procedure (the coup de tranchet) that has value as a cultural marker, as well as an important component of small retouched tools and percussive implements, suggests potential links between the Acheulean and Middle Stone Age industries.This work is divided into three parts: 1) current issues about the African Acheulean and the approaches previously employed to study it; 2) the regional context; 3) the depositional context of the archaeological materials at Garba I, their chronology and state of preservation; 4) methodology employed in this study, and; 5) discussion of the results and their significance in the context of the African Acheulean