Vírus influenza

Um dos registros mais antigos da gripe descrita como doença é de autoria de Hipócrates, em meados do ano 412 a.C. Desta forma, seu agente etiológico, o vírus influenza, tem circulação entre a população humana há muito tempo.  Entretanto, o primeiro isolamento do vírus influenza humano ocorreu somente em 1933, realizado por Smith, Andrewes e Laidlaw, pesquisadores do “National Institute for Medical Research” – Londres. Este vírus isolado foi considerado o primeiro vírus influenza humano e denominado de “influenza A”

Proposal of semi-nested polimerase chain reaction (PCR) for diagnosing and differentiating BK and JC virus

Objetivos: Implantar e otimizar a reação em cadeia da polimerase (PCR) semi-nested para pesquisa e diferenciação dos vírus BK e JC a partir de amostras clínicas armazenadas. Métodos: Foram testadas 9 amostras clínicas (urina e líquor). As amostras foram submetidas à PCR semi-nested, e foram testadas também com diferentes condições, visando a otimização da reação. Resultados: Primeiramente os controles positivos foram testados quanto à especificidade através de uma PCR direta, e os resultados obtidos confirmaram a especificidade. Quando testadas por PCR semi-nested, as amostras apresentaram os seguintes resultados: 100% (nove amostras) positivas para o vírus BK e 66,6% (seis amostras) positivas para o vírus JC. Conclusões: Otimizou-se a reação de PCR seminested, específica para a identificação dos poliomavírus, para assim atuar como uma ferramenta diagnóstica para melhor acompanhamento de pacientes imunocomprometidos.Aims: To implant and optimize the semi-nested polimerase chain reaction (PCR) to identify and differentiate BK and JC virus. Methods: Nine clinical (urine and liquor) samples have been tested with semi-nested PCR. In order to optimize this reaction, different conditions have been tested. Results: Specificity has been confirmed by using JC and BK positive controls. When tested with semi-nested PCR, the clinical samples showed the following results: 100% (nine samples) positive from BK virus, and 66.6% (six samples) positive from JC virus. Conclusions: The semi-nested PCR reaction, specific for identification of polyomavirus, was optimized for acting as a tool for better follow-up of immunocompromised patients

Viral epidemiology of respiratory infections among children at a tertiary hospital in Southern Brazil

Introduction: This study reports the pediatric epidemiology of respiratory syncytial virus (RSV), infl uenza (IF), parainfl uenza (PIV), and adenovirus (ADV) at Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Methods: Cases of infection, hospitalizations in intensive care units (ICUs), nosocomial infections, and lethality rates were collected from 2007 to 2010. Results: RSV accounted for most nosocomial infections. Intensive care units admission rates for ADV and RSV infections were highest in 2007 and 2010. During 2008-2009, H1N1 and ADV had the highest ICU admission rates. ADV had the highest fatality rate during 2007-2009. Conclusions: Each virus exhibited distinct behavior, causing hospitalization, outbreaks, or lethality

Tuberculous meningitis: evaluation of polymerase chain reaction (PCR) as a diagnostic tool – a pilot study.

Meningite é uma forma grave e potencialmente fatal de tuberculose. O diagnóstico envolve a detecção de bacilos álcool-ácido resistentes no líquido cefalorraquidiano por microscopia ou cultura. Entretanto, a dificuldade de detectar o organismo representa um desafio ao diagnóstico. O uso da reação em cadeia da polimerase (PCR) na abordagem diagnóstica de meningite causada por Mycobacterium tuberculosis (MTB) tem sido relatado como um método rápido e preciso, com diversos kits comerciais disponíveis. Como alternativa, algumas instituições vêm desenvolvendo testes in house com baixo custo. Em nossa instituição, usamos PCR in house para tuberculose. O desempenho de nossa PCR para o diagnóstico de meningite causada por MTB foi analisado em 148 pacientes consecutivos, usando a cultura do MBT como padrão-ouro. A sensibilidade da PCR no líquido cefalorraquidiano para o diagnóstico de meningite causada por MTB foi de 50%, especificidade de 98,6% e concordância coma cultura de 96% (kappa = 0,52). O desempenho de nossa PCR é semelhante ao obtido com os kits comerciais disponíveis.Meningitis is a severe and potentially fatal form of tuberculosis. The diagnostic workup involves detection of acid-fast bacilli in the cerebrospinal fluid by microscopy or culture. However the difficulty in detecting the organism poses a challenge to diagnosis. Use of polymerase chain reaction (PCR) in the diagnostic approach to Mycobacterium tuberculosis (MTB) meningitis has been reported as a fast and accurate method, with several commercial kits available. As an alternative, some institutions have been developing inexpensive in-house assays. In our institution, we use an in-house PCR for tuberculosis. The performance of our PCR for the diagnosis of MTB meningitis was analyzed in 148 consecutive patients, using MTB culture as the gold standard. Sensitivity of cerebrospinal fluid PCR for the diagnosis of MTB meningitis was 50%, specificity was 98.6%, and concordance with culture was 96% (kappa = 0.52). The performance of our PCR is similar to that obtained with the available commercial kits