The Stabilizing Role of Global Alliances in the Dynamics of Coalition Forming

Coalition forming is investigated among countries, which are coupled with short range interactions, under the influence of external fields produced by the existence of global alliances. The model rests on the natural model of coalition forming inspired from Statistical Physics, where instabilities are a consequence of decentralized maximization of the individual benefits of actors within their long horizon of rationality as the ability to envision a way through intermediate loosing states, to a better configuration. The effects of those external incentives on the interactions between countries and the eventual stabilization of coalitions are studied. The results shed a new light on the understanding of the complex phenomena of stabilization and fragmentation in the coalition dynamics and on the possibility to design stable coalitions. In addition to the formal implementation of the model, the phenomena is illustrated through some historical cases of conflicts in Western Europe.Comment: 19 pages, 12 figure

The haunted delimitation of subjectivity in the Work of Nicolas Abraham

Kinesin-like calmodulin binding protein (KCBP), a Kinesin-14 family motor protein, is involved in the structural organization of microtubules during mitosis and trichome morphogenesis in plants. The molecular mechanism of microtubule bundling by KCBP remains unknown. KCBP binding to microtubules is regulated by Ca(2+)-binding proteins that recognize its C-terminal regulatory domain. In this work, we have discovered a new function of the regulatory domain. We present a crystal structure of an Arabidopsis KCBP fragment showing that the C-terminal regulatory domain forms a dimerization interface for KCBP. This dimerization site is distinct from the dimerization interface within the N-terminal domain. Side chains of hydrophobic residues of the calmodulin binding helix of the regulatory domain form the C-terminal dimerization interface. Biochemical experiments show that another segment of the regulatory domain located beyond the dimerization interface, its negatively charged coil, is unexpectedly and absolutely required to stabilize the dimers. The strong microtubule bundling properties of KCBP are unaffected by deletion of the C-terminal regulatory domain. The slow minus-end directed motility of KCBP is also unchanged in vitro. Although the C-terminal domain is not essential for microtubule bundling, we suggest that KCBP may use its two independent dimerization interfaces to support different types of bundled microtubule structures in cells. Two distinct dimerization sites may provide a mechanism for microtubule rearrangement in response to Ca(2+) signaling since Ca(2+)- binding proteins can disengage KCBP dimers dependent on its C-terminal dimerization interface

Novel strong tissue specific promoter for gene expression in human germ cells

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Tissue specific promoters may be utilized for a variety of applications, including programmed gene expression in cell types, tissues and organs of interest, for developing different cell culture models or for use in gene therapy. We report a novel, tissue-specific promoter that was identified and engineered from the native upstream regulatory region of the human gene <it>NDUFV1 </it>containing an endogenous retroviral sequence.</p> <p>Results</p> <p>Among seven established human cell lines and five primary cultures, this modified <it>NDUFV1 </it>upstream sequence (mNUS) was active only in human undifferentiated germ-derived cells (lines Tera-1 and EP2102), where it demonstrated high promoter activity (~twice greater than that of the SV40 early promoter, and comparable to the routinely used cytomegaloviral promoter). To investigate the potential applicability of the mNUS promoter for biotechnological needs, a construct carrying a recombinant cytosine deaminase (RCD) suicide gene under the control of mNUS was tested in cell lines of different tissue origin. High cytotoxic effect of RCD with a cell-death rate ~60% was observed only in germ-derived cells (Tera-1), whereas no effect was seen in a somatic, kidney-derived control cell line (HEK293). In further experiments, we tested mNUS-driven expression of a hyperactive <it>Sleeping Beauty </it>transposase (SB100X). The mNUS-SB100X construct mediated stable transgene insertions exclusively in germ-derived cells, thereby providing further evidence of tissue-specificity of the mNUS promoter.</p> <p>Conclusions</p> <p>We conclude that mNUS may be used as an efficient promoter for tissue-specific gene expression in human germ-derived cells in many applications. Our data also suggest that the 91 bp-long sequence located exactly upstream <it>NDUFV1 </it>transcriptional start site plays a crucial role in the activity of this gene promoter <it>in vitro </it>in the majority of tested cell types (10/12), and an important role - in the rest two cell lines.</p

Modélisation et stabilisation des réseaux sociopolitiques - application à des coalitions de pays

The main subject of this thesis is a paradigm of instability and stabilization in coalition forming among countries as rational actors, presented through a Statistical Physics inspired model.This is an interdisciplinary work involving the fields of applied mathematics and sociophysics, as well as the political applications in the real cases from past and present. Applied to political,economic and social problems, the models can be used to analyze a wide variety of real cases -- international alliances, economic or business alliances, coalitions of political parties, socialnetworks, and organizational structures.In the first part of this thesis we present and analyze the coalition forming and the instability among rational actors coupled with pairwise static historical propensity bonds that have evolvedindependently. Such organization leads to discordant associations into coalitions and the instability as a consequence of decentralized maximization of the individual benefits gained fromjoining or leaving the coalitions. We define Natural Model of coalition forming and address the questions of instability and stabilization among actors possessing different levels of rationality. The framework presented here allows to analytically calculate the optimal and non-optimal stable configurations of actors' coalitions. We then investigate the coalition forming and the stabilization under the influence of externally-set opposing global alliances, which are represented in Global Alliance Model. The stabilization is produced through new cooperations based on the effect of polarization of several distinct interests shared by actors, which generates interest-based propensities and enables a planned coalition forming. We then investigate the effect of dissolution of a global alliancewhich, together with the competing alliance, has previously generated stable coalitions.A special section of the thesis is devoted to investigation and illustration of coalition forming in real historical cases. This part presents the analysis of unstable coalitions in Europe - cycling in the England-Spain-France conflicting triangle and creation of the Italian state, as well as of the remarkable historical cases of the Soviet global alliance collapse, of the recent internal conflict in Syria, and of the "paradoxical stability" in the Eurozone.In the second part of this thesis, we present a simulation of the coalition forming models. The simulation allows to follow graphically the coalition forming processes. We present the methodology used in the simulation, as well as its application in the illustration of coalition forming in the prototypes of real case systems. Given exact propensity values, which is fairly consideredto be the most difficult part of coalition forming modeling, the simulation tool can be used to predict optimal and non-optimal spontaneous stabilizations and globally motivated stabilities inreal cases.An independent part of the thesis is devoted to the subject of viability correction in dynamic network of actors. The model is a finite set of autonomous actors with states that evolveindependently and connected into a network via their connection operators, which evolve independently as well. The network is defined to be viable if a joint evolution satisfies the centralized scarcity constraints set by the environment. In order to restore the viability of these decentralized dynamics, we apply to the method of correction by viability multipliers used in Viability Theory, where the multipliers play the role of decentralizing prices. Standing apart from the main course of the thesis, the subject of viability correction in dynamic network of actors suggests an interesting theoretic dynamical generalization of coalition stabilization in our models inspired from Statistical Physics.2Le sujet principal de cette thèse est la présentation d'un paradigme théorique inspiré de la Physique Statistique pour décrire les dynamiques d'instabilité ainsi que les processus de stabilisation dans la formation de coalitions entre pays considérés comme des acteurs rationnels. Ce travail s'inscrit dans une logique interdisciplinaire impliquant les mathématiques appliquées et la sociophysique avec des applications à des cas réels choisis dans le passé et le présent. Le modèle, par sa formulation générique peut être également appliqué à des problèmes politiques, économiques et sociales pour considérer des alliances internationales, économiques ou commerciales, coalitions de partis politiques, les réseaux sociaux et les structures organisationnelles.Dans la première partie, la formation de coalitions et l'instabilité des acteurs rationnels couplés avec des liaisons par paires, est analysée. Les liaisons résultent de propensions historiques qui ont évolués indépendamment et lentement dans le temps et sont considérés comme statiques. Il en résulte des associations contradictoires qui créent des instabilités irréductibles dues à la maximisation décentralisée des avantages individuels.Nous définissons ainsi le Modèle Naturel de la formation de coalitions et abordons les questions de l'instabilité et de la stabilisation des acteurs possédant différents niveaux de rationalité. Le cadre choisi permet de calculer analytiquement les configurations stables de coalitions d'acteurs, aussi bien optimales que non non-optimales. Nous étudions ensuite le Modèle de l'Alliance Globale qui considère la formation de coalitions et leur stabilisation par l’existence d'alliances mondiales opposées qui se situent au dessus des pays. Ce sont des alliances qui sont la conséquence de ralliements individuels à une alliance globale pré-existante. La stabilisation est produite par de nouvelles coopérations entre pays voisins produites sous l'effet de polarisation d'intérêts communs des acteurs générés directement par l’appartenance à l’alliance. Nous étudions ensuite l'effet de la dissolution d'une alliance globale lorsque l'alliance concurrente est préservée.Cette partie se termine une application du modèle à la formation de coalitions dans différents cas historiques tels que les conflits cycliques dans le triangle Angleterre-Espagne-France et la création de l'Etat d'Italie, l'effondrement de l'alliance Soviétique, le récent conflit interne en Syrie, et la "stabilité paradoxale" dans la Zone Euro.Dans la deuxième partie de cette thèse, nous présentons une simulation du modèle qui permet de suivre graphiquement les processus de la formation de coalitions. Nous présentons la méthodologie utilisée dans la simulation, ainsi qu'une application à des prototypes de systèmes de cas réels. Étant donné les valeurs de propension exactes, ce qui est la partie la plus difficile de la modélisation, la simulation peut être utilisée pour prédire des stabilisations spontanées, optimales et non-optimales, ainsi que des stabilités produites globalement.Une partie indépendante de la thèse est consacrée à la correction de la viabilité en réseau dynamique d'acteurs, ou le modèle est un ensemble fini d'acteurs autonomes. Les états évoluent indépendamment et sont connectés à un réseau via leurs opérateurs de connexion, qui évoluent eux-mêmes aussi indépendamment. Le réseau est défini comme étant viable si une évolution commune satisfait des contraintes centralisées de rareté imposées par l'environnement. Afin de rétablir la viabilité, nous appliquons la méthode de correction par des multiplicateurs de viabilité adoptée dans la Théorie de Viabilité, où les multiplicateurs jouent le rôle du prix de décentralisation. A l'écart du cours principal de la thèse, le sujet de correction de la viabilité en réseau dynamique d'acteurs suggère une généralisation dynamique théorique intéressante de stabilisation de coalitions dans nos modèles inspirés de Physique Statistique. 1 Le sujet principal de cette thèse est un paradigme de l'instabilité et de stabilisation dans la formation de coalitions entre les pays - des acteurs rationnelles, présenté par un modèle inspiré de Physique Statistique.Il s'agit d'un travail interdisciplinaire impliquant les domaines de mathématiques appliquées et sociophysics, ainsi que les applications politiques dans les cas réels du passé et du présent. Les modèles, appliquées à des problèmes politiques, économiques et sociales, peut être utilisé pour analyser une large variété de cas réels - alliances internationales, alliances économiques ou commerciales, coalitions de partis politiques, les réseaux sociaux et les structures organisationnelles.Dans la première partie, nous présentons et analysons la formation de coalitions et de l'instabilité des acteurs rationnels couplés avec des liaisons par paires de propensions historiques statiques, qui ont évolués indépendamment. Telle organisation provoque des associations discordants dans les coalitions et de l'instabilité qui est la suite de la maximisation décentralisée des avantages individuelles.Nous définissons le Modèle Naturel de la formation de coalitions et abordons les questions de l'instabilité et de la stabilisation des acteurs possédant différents niveaux de la rationalité. Le cadre présenté ici permet de calculer analytiquement les configurations stables de coalitions d'acteurs, optimales et non-optimales. Nous étudions ensuite la formation de coalitions et la stabilisation sous l'influence d'alliances mondiales extérieurs opposées, qui sont représentés dans le Modèle de l'Alliance Globale. La stabilisation est produit grace a des nouvelles coopérations produit sous l'effet de polarisation d' intérêts communs des acteurs, qui génère tendances fondées sur les intérêts et permet une formation prévu des coalitions. Nous étudions ensuite l'effet de la dissolution d'une alliance mondiale qui, ensemble avec l'alliance concurrente, a déjà généré des coalitions stables.Une section spéciale de la thèse est consacrée à l'étude et à l'illustration de la formation de coalitions dans des cas réels historiques. Cette partie présente l'analyse des coalitions instables en Europe – des conflits cycliques dans le triangle de Angleterre-Espagne-France et la création de l'Etat d'Italie, ainsi que les cas historiques remarquables de l'effondrement de l'alliance Soviétique, du conflit récent interne en Syrie, et de la "stabilité paradoxale" dans la Zone Euro.Dans la deuxième partie de cette thèse, nous présentons une simulation de notres modèles. La simulation permet de suivre graphiquement les processus de la formation de coalitions. Nous présentons la méthodologie utilisée dans la simulation, ainsi qu'une application à des prototypes de systèmes de cas réels. Étant donné les valeurs de propension exactes, ce qui est la partie la plus difficile de la modélisation, la simulation peut être utilisée pour prédire des stabilisations spontanées, optimales et non-optimales, et stabilité motivé globalement dans des cas réels.Une partie indépendante de la thèse est consacrée à la correction de la viabilité en réseau dynamique d'acteurs. Le modèle est un ensemble fini d'acteurs autonomes, les etats évoluent indépendamment sont connectés à un réseau via leur opérateurs de connexion, qui évoluent indépendamment aussi. Le réseau est défini comme étant viable si une évolution commune satisfait des contraintes centralisés de rareté imposées par l'environnement. Afin de rétablir la viabilité, nous appliquons la méthode de correction par des multiplicateurs de viabilité utilisés dans la Théorie de Viabilité, où les multiplicateurs jouent le rôle de la prix de décentralisation. A l'écart du cours principal de la thèse, le sujet de correction de la viabilité en réseau dynamique d'acteurs suggère une généralisation dynamique théorique intéressante de stabilisation de coalitions dans nos modèles inspirés de Physique Statistique

Global alliances effect in coalition forming

Coalition forming is investigated among countries, which are coupled with short range interactions, under the influence of externally-set opposing global alliances. The model extends a recent Natural Model of coalition forming inspired from Statistical Physics, where instabilities are a consequence of decentralized maximization of the individual benefits of actors. In contrast to physics where spins can only evaluate the immediate cost/benefit of a flip of orientation, countries have a long horizon of rationality, which associates with the ability to envision a way up to a better configuration even at the cost of passing through intermediate loosing states. The stabilizing effect is produced through polarization by the global alliances of either a particular unique global interest factor or multiple simultaneous ones. This model provides a versatile theoretical tool for the analysis of real cases and design of novel strategies. Such analysis is provided for several real cases including the Eurozone. The results shed a new light on the understanding of the complex phenomena of planned stabilization in the coalition forming

Dissolution of a Global Alliance:War or Peace

This work investigates the effect of the dissolution of a global alliance in a collective of individual countries where the alliance, together with its antagonist counterpart, has previously generated stable coalitions. The model rests on the global alliance model of coalition forming inspired from Statistical Physics. Instabilities are a consequence of primary bond based interactions among rational actors and the stabilization is due to new interactions produced by the opposing global alliances. The stability consequences of the dissolution of one of them keeping the other one active are formally investigated with- in the confines of the model. Two landmark historical cases—the collapse of the Soviet Union and recent Syrian internal conflict—are reviewed. The results shed a new light on the understanding of the complex phenomenon of fragmentation, which may follow the dissolution of a stabilizing alliance

Global alliances effect in coalition forming

Coalition forming is investigated among countries, which are coupled with short range interactions, under the influence of externally-set opposing global alliances. The model extends a recent Natural Model of coalition forming inspired from Statistical Physics, where instabilities are a consequence of decentralized maximization of the individual benefits of actors. In contrast to physics where spins can only evaluate the immediate cost/benefit of a flip of orientation, countries have a long horizon of rationality, which associates with the ability to envision a way up to a better configuration even at the cost of passing through intermediate loosing states. The stabilizing effect is produced through polarization by the global alliances of either a particular unique global interest factor or multiple simultaneous ones. This model provides a versatile theoretical tool for the analysis of real cases and design of novel strategies. Such analysis is provided for several real cases including the Eurozone. The results shed a new light on the understanding of the complex phenomena of planned stabilization in the coalition forming