Extended-spectrum β-lactamases, transferable quinolone resistance, and virulotyping in extra-intestinal E. coli in Uruguay

Introduction: To characterize extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) and plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) genes in Escherichia coli isolates obtained from extra-intestinal samples in three Uruguayan hospitals. Methodology: Fifty-five ESBL-producing E. coli isolates were studied. Virulence genes, ESBLs, and PMQR genes were detected by polymerase chain reaction. ESBL-producing isolates were compared by pulsed-field gel electrophoresis. Multi-locus sequence typing was also performed on 13 selected isolates. Results: Thirty-seven isolates harbored blaCTX-M-15 (67.3%), eight blaCTX-M-2 (14.6%), five blaCTX-M-14 (9.1%), three carried both blaCTX-M-2 and blaCTX-M-14, one blaCTX-M-9, and one blaCTX-M-8. Among the CTX-M-15 producers, 92% belonged to sequence types ST131 and ST405, and carried aac(6’)Ib-cr as well. Isolates harboring blaCTX-M-2, blaCTX-M-14, blaCTX-M-9, or blaCTX-M-8 were found to be genetically unrelated. Conclusions: The successful dissemination of CTX-M-15-producing E.coli isolates seems to be linked to the spreading of high-risk clones and horizontal gene transfer. A trade-off between carrying more antibiotic resistance and less virulence-related genes could partially account for the evolutionary advantages featured by successful clones.Fil: Vignoli, Rafael. Universidad de la República; UruguayFil: García Fulgueiras, Virginia. Universidad de la República; UruguayFil: Cordeiro, Nicolás F.. Universidad de la República; UruguayFil: Bado, Inés. Universidad de la República; UruguayFil: Seija, Verónica. Universidad de la República; Uruguay. Hospital Pasteur de Montevideo; UruguayFil: Aguerrebere, Paula. Universidad de la República; UruguayFil: Laguna, Gabriel. Universidad de la República; UruguayFil: Araújo, Lucía. Universidad de la República; UruguayFil: Bazet, Cristina. Universidad de la República; UruguayFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Chabalgoity Rodríguez, José Alejandro. Universidad de la República; Urugua

Primera detección de CMY-2 en Salmonella Heidelberg en Sudamérica

Salmonella enterica serovar Heidelberg ranks among the most prevalent causes of human salmonellosis in the United States and Canada, although it has been infrequently reported in South American and European countries. Most Salmonella infections are self-limiting; however, some invasive infections require antimicrobial therapy. In this work we characterized an oxyimino-cephalosporin resistant S. Heidelberg isolate recovered from an inpatient in a Buenos Aires hospital. CMY-2 was responsible for the ß-lactam resistance profile. S. Heidelberg contained a 97 kb plasmid belonging to the Inc N group harboring blaCMY-2. ISEcp1 was located upstream blaCMY-2 driving its expression and mobilization. The isolate belonged to sequence type 15 and virotyping revealed the presence of sopE gene. In this study we identified the first CMY-2 producing isolate of S. Heidelberg in Argentina and even in South America.Salmonella enterica serovar Heidelberg es uno de los principales agentes causantes de salmonelosis en humanos en Estados Unidos y Canadá, sin embargo, resulta infrecuente en los países de Sudamérica y Europa. En este trabajo se caracterizó un aislamiento de S. Heidelberg resistente a oximino-cefalosporinas recuperado de un paciente internado en un hospital de la Ciudad de Buenos Aires. Se evidenció la presencia de un plásmido de 97 kb perteneciente al grupo de incompatibilidad IncN, portador del gen blaCMY-2. ISEcp1 fue localizado corriente arriba de blaCMY-2, promoviendo su expresión y movilización. El aislamiento de S. Heidelberg correspondió al secuenciotipo 15 y en la virotipificación se detectó el gen sopE. En este trabajo describimos por primera vez la producción de CMY-2 en una cepa de S. Heidelberg en nuestro país y América Latina.Fil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Vignoli, Rafael. Universidad de la República; UruguayFil: Quinteros, Mirta. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas F. J. Muñiz; ArgentinaFil: Marino, Ricardo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas F. J. Muñiz; ArgentinaFil: Callejo, Raquel. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas F. J. Muñiz; ArgentinaFil: Betancor, Laura. Universidad de la República; UruguayFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Detección de enzimas 16S ARN metiltransferasas en enterobacterales resistentes a ceftriaxona, aislados de pollitos de un día

Los aminoglucósidos son una alternativa para el tratamiento de infecciones por bacilos gramnegativos multirresistentes. Con su uso, surge la necesidad de vigilar su resistencia. Si bien los mecanismos más frecuentes son las modificaciones enzimáticas del antibiótico mediadas por fosfotransferasas, acetiltransferasas o nucleotidiltransferasas, la emergencia de metilasas del ARNr ribosomal (16S-RMTasas) confieren resistencia a todos los aminoglucósidos, amenazando la utilidad de este recurso. Nuestro objetivo fue la búsqueda de enzimas 16S-RMTasas en Enterobacterales resistentes a ceftriaxona (CRO-R) aislados de muestra fecales de pollitos de un día importados de Brasil.Trabajo publicado en Cagliada, Maria del Pilar Lilia y Galosi, Cecilia Mónica (comps.). I Congreso de Microbiología Veterinaria. Libro de resúmenes. La Plata: Facultad de Ciencias Veterinarias, 2021.Facultad de Ciencias Veterinaria

Caracterización de los mecanismos de resistencia a oximino-cefalosporinas en aislamientos de Escherichia coli procedentes de hisopados rectales caninos en Uruguay : Primer reporte

El sobreuso de antibióticos beta-lactámicos ha promovido la diseminación de mecanismos de resistencia como beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE), cefalosporinasas de clase C (AmpC) y carbapenemasas (CP) en humanos y animales. Se describen prevalencias de Escherichia coli (E. coli) resistentes a oximino- cefalosporinas en caninos entre 1 %-55 % asociado a BLEE, AmpC o CP. Nuestro objetivo fue caracterizar los mecanismos de resistencia a oximino-cefalosporinas en cepas de E. coli aisladas de hisopados rectales de caninos. Se estudiaron 200 caninos (Facultad de Veterinaria, Uruguay, 2019).Trabajo publicado en Cagliada, Maria del Pilar Lilia y Galosi, Cecilia Mónica (comps.). I Congreso de Microbiología Veterinaria. Libro de resúmenes. La Plata: Facultad de Ciencias Veterinarias, 2021.Facultad de Ciencias Veterinaria

First human isolate of Salmonella enterica serotype enteritidis harboring bla CTX-M-14in South America

We studied a clinical isolate of Salmonella enterica serotype Enteritidis showing resistance to oxyiminocephalosporins. PCR analysis confirmed the presence of bla CTX-M-14 linked to IS903 in a 95-kb IncI1 conjugative plasmid. Such a plasmid is maintained on account of the presence of a pndAC addiction system. Multilocus sequence typing (MLST) analysis indicated that the strain belongs to ST11. This is the first report of bla CTX-M-14 in Salmonella Enteritidis of human origin in South America. Copyright © 2012, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.CSIC (Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay); European Community (FP7-HEALTH-2007-223431); Ministerio de Ciencia e Innovación/Programa Bio-Fundamental (BFU2009-09200)Peer Reviewe

Genetic environment of CTX-M-2 in Klebsiella pneumoniae isolates from hospitalized patients in Uruguay

Klebsiella pneumoniae clinical strains, K96005 and K13, isolated from hospitalized patients in Uruguay, during 1996 and 2003, respectively. The genomic surroundings of blaCTX-M-2 were characterized by PCR-mapping and DNA sequencing. Our results show that blaCTX-M-2 is included in a complex class-1 integron (InK13), associated with an orf513 in both isolates. The genetic array of the integron, aac(6’)-Ib, blaCTX-M-2, orfD (gene cassette region), associated with an orf513-blaCTX-M-2, seems to be widely disseminated over the Río de la Plata region.Se estudiaron las cepas de Klebsiella pneumoniae K96005 y K13, productoras de la b-lactamasa de espectro extendido CTX-M-2, aisladas durante 1996 y 2003, respectivamente, de pacientes hospitalizados en Uruguay. Se realizó la caracterización del entorno génico del gen blaCTX-M-2 mediante mapeo por PCR y secuenciación de los amplicones. Los resultados revelan que en ambos aislamientos el gen codificante de dicha enzima se encuentra en un integrón complejo de clase 1, asociado a la presencia de orf513. El integrón identificado, cuyo arreglo de genes es aac(6’)-Ib, blaOXA-2, orfD, asociados a orf513-blaCTX-M-2, parece estar ampliamente diseminado en la región del Río de la Plata.Peer reviewe

Radioresistance of Adenine to Cosmic Rays

International audienceThe presence of nucleobases in carbonaceous meteorites on Earth is an indication of the existence of this class of molecules in outer space. However, space is permeated by ionizing radiation, which can have damaging effects on these molecules. Adenine is a purine nucleobase that amalgamates important biomolecules such as DNA, RNA, and ATP. Adenine has a unique importance in biochemistry and therefore life. The aim of this work was to study the effects of cosmic ray analogues on solid adenine and estimate its survival when exposed to corpuscular radiation.Adenine films were irradiated at GANIL (Caen, France) and GSI (Darmstadt, Germany) by 820 MeV Kr33+, 190 MeV Ca10+, 92 MeV Xe23+, and 12 MeV C4+ ion beams at low temperature. The evolution of adenine molecules under heavy ion irradiation was studied by IR absorption spectroscopy as a function of projectile fluence.It was found that the adenine destruction cross section (σd) follows an electronic stopping power (Se) power law under the form: CSen; C is a constant, and the exponential n is a dimensionless quantity. Using the equation above to fit our results, we determined σd = 4 × 10−17Se1.17, with Se in kiloelectronvolts per micrometer (keV μm−1). New IR absorption bands arise under irradiation of adenine and can be attributed to HCN, CN-, C2H4N4, CH3CN, and (CH3)3CNC.These findings may help to understand the stability and chemistry related to complex organic molecules in space. The half-life of solid adenine exposed to the simulated interstellar medium cosmic ray flux was estimated as (10 ± 8) × 106 years. Key Words: Heavy ions—Infrared spectroscopy—Astrochemistry—Cosmic rays—Nucleobases—Adenine. Astrobiology 17, 298–308

Surveillance of antibiotic resistance evolution and detection of class 1 and 2 integrons in human isolates of multi-resistant Salmonella Typhimurium obtained in Uruguay between 1976 and 2000.

[Objectives] To study the evolution of antibiotic resistance in isolates of Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhimurium (Salmonella Typhimurium) obtained in Uruguay between the years 1976 and 2000, and to determine the incidence of class 1 and 2 integrons in the multiresistant isolates.[Methods] We studied 258 strains of Salmonella Typhimurium from various sources, isolated between 1976 and 2000. We determined the evolution of antibiotic resistance and the distribution of class 1 and 2 integrons in all isolates by means of disk diffusion assays and PCR.[Results] During the period 1989—2000 resistance to streptomycin was 56.8%, tetracycline 13.6%, sulfonamides 11.2%, and ampicillin 7.2%. Resistance to gentamicin, kanamycin, chloramphenicol, and nalidixic acid were lower than 5%; no resistance was detected to fluoroquinolones, oxyiminocephalosporins, and amikacin. These results show a dramatic decrease with respect to values found in the period 1976—1988. In this period, resistance to streptomycin was 63.2%, tetracycline 36.8%, sulfonamides 32.3%, and ampicillin 27.8%. Throughout the two periods, 29 multi-resistantPeer reviewe