Atlas de correlación anatomía patológica y radiología. Experiencia en la Universidad de Málaga

Introducción: Con la introducción del Grado en la facultad de medicina de Málaga, se ha hecho necesaria la introducción de nuevas técnicas y herramientas docentes que ayuden al alumno a la mejora de su formación a través de la realización de horas prácticas. La integración de conocimientos ayuda al estudiante de medicina a tener una mejor formación. De lo expuesto nace la idea de crear una herramienta que permita integrar la enseñanza impartida en las asignaturas de Radiología y Anatomía Patológica. Ambas tienen como nexo en común su trascendencia en el diagnóstico de enfermedades basándose en el análisis de imágenes y estructuras que, en todo caso, se encuentran íntimamente relacionadas y además son complementarias en el diagnóstico. Material y método: El proyecto comenzó a realizarse durante el curso 2013-14. Consiste en una colección de casos que se presentan en la pantalla del ordenador secuencialmente, con el objeto de ofrecer al alumno un primer contacto con imágenes anatomopatológicas y su correlación con imágenes radiológicas y así proporcionar entrenamiento visual, tanto para distinguir las diferentes piezas anatomopatológicas,( micro y macroscópicas) como distintas modalidades de exploraciones radiológicas, No pretende ser una lección exhaustiva de anatomía patológica ni de radiología, sino una herramienta práctica para entrenar la percepción visual del usuario. ¿Cómo? Mostrando un número suficientemente amplio de casos para que el usuario vaya entrenándose a lo que tendrá que realizar en su formación médica. Resultados: Se han recogido 20 casos clínicos distintos (tumores de mama, colon, hueso, vejiga…) con sus respectivas imágenes anatomopatológicas y radiológicas. El formato de presentación de esta actividad es tipo atlas, en power-point, accesible a través del Campus Virtual. Lleva asociado un cuestionario de autoevaluación para que el alumno conozca el nivel de aprendizaje alcanzado y los conocimientos y habilidades que debe perfeccionar. El control y la evaluación de la actividad se llevarán a cabo mediante la valoración de los resultados de los alumnos y cuestionarios y encuestas realizadas antes y después de su realización. Conclusión: Se ha realizado una herramienta que permite no sólo al alumno de grado, sino también al médico en formación, facilitar su aprendizaje en especialidades distintas como son la anatomía patológica y el radiodiagnóstico, pero complementarias en el diagnóstico de patologías.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Estudio sobre la vegetación y la flora forestal de la provincia de Málaga

En portada: Trabajo que se publica como complemento al mapa forestal de la misma.Indices.Copia digital : Diputación de Málaga. Biblioteca Canovas del Castillo, 201

Nationwide trends of invasive pneumococcal disease in Spain (2009-2019) in children and adults during the pneumococcal conjugate vaccine era.

Introduction of pneumococcal conjugate vaccines (PCVs) has shown a marked reduction in the disease caused by vaccine serotypes in children providing herd protection to the elderly group. However, the emergence of non-vaccine serotypes is of great concern worldwide. This study includes national laboratory data from invasive pneumococcal disease (IPD) cases affecting pediatric and adult population during 2009-2019. The impact of implementing different vaccine strategies for immunocompetent adults comparing Spanish regions using PCV13 vs regions using PPV23 vaccine was also analyzed for 2017-2019. The overall reductions of IPD cases by PCV13 serotypes in children and adults were 88% and 59% respectively during 2009-2019 with a constant increase of serotype 8 in adults since 2015. IPD cases by additional serotypes covered by PPV23 increased from 20% in 2009 to 52% in 2019. In children, serotype 24F was the most frequent in 2019 whereas in adults, serotypes 3 and 8 accounted for 36% of IPD cases. Introduction of PCV13 or PPV23 in the adult calendar of certain Spanish regions reduced up to 25% and 11% respectively the IPD cases by PCV13 serotypes, showing a decrease of serotype 3 when PCV13 was used. Use of PCV13 in children has shown a clear impact in pneumococcal epidemiology reducing the burden of IPD in children but also in adults by herd protection although the increase of serotype 8 in adults is worrisome. Vaccination with PCV13 in immunocompetent adults seems to control IPD cases by PCV13 serotypes including serotype 3.This work was supported by Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (MINECO) [grant SAF2017-83388] and internal funding fromS

Subtipado molecular del cáncer de mama masculino con PAM50: Correlación con el subtipaje inmunohistoquímico y estudio de supervivencia.

Introducción: El cáncer de mama masculino es una enfermedad rara aún poco conocida, que principalmente corresponde a subtipo luminal usando la clasificación molecular subrogada a inmunohistoquímica. En este estudio, se evalúa por primera vez la correlación entre los subtipos moleculares basados en un panel inmunohistoquímico de seis marcadores y el obtenido mediante la firma PAM50 en el cáncer de mama masculino, así como la evolución clínica de los diferentes subtipos encontrados. Material y métodos: Se recogieron 67 muestras quirúrgicas de cáncer de mama masculino invasivo de cuatro diferentes Servicios de Anatomía Patológica. La tinción inmunohistoquímica se realizó sobre tissue-microarrays, con un panel de seis marcadores (RE, RP, Her2, Ki67, CK 5-6 y EGFR). Los subtipos de PAM50 se determinaron mediante nCounter Analysis System. Se estudió la asociación entre los subtipos obtenidos mediante inmunohistoquímica y los determinados por PAM50, así como la supervivencia global y la supervivencia libre de enfermedad en los diferentes subtipos de cada clasificación. Resultados: La distribución de los subtipos moleculares tumorales según PAM50 fue: 60% luminal B, 30% luminal A y 10% Her2-enriched. Sólo uno de los tumores Her2-enriched también fue detectado por inmunohistoquímica y tratado con trastuzumab. No se obtuvo ningún tumor de subtipo basal-like. Utilizando la clasificación inmunohistoquímica, 51% de los tumores fueron luminal B, 43% luminal A, 3,5% triple negativo y 1,5% Her2-positivo. Las características clínico-patológicas no difirieron significativamente entre los subtipos inmunohistoquímicos y PAM50. Se observó una supervivencia global menor en los tumores Her2-enriched comparados con los luminales. Conclusión: El cáncer de mama masculino es principalmente una enfermedad genómica luminal con un predominio del subtipo luminal B. Además, se observaron casos de pacientes Her2-negativos por inmunohistoquímica, pero de perfil Her2-enriched por PAM50, con peor evolución clínica comparado con el subtipo luminal, que podrían haberse beneficiado de terapia anti-Her2.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Gene expression analyses determine two different subpopulations in KIT-negative GIST-like (KNGL) patients

Introduction: there are limited findings available on KIT-negative GIST-like (KNGL) population. Also, KIT expression may be post-transcriptionally regulated by miRNA221 and miRNA222. Hence, the aim of this study is to characterize KNGL population, by differential gene expression, and to analyze miRNA221/222 expression and their prognostic value in KNGL patients. Methods: KIT, PDGFRA, DOG1, IGF1R, MIR221 and MIR222 expression levels were determined by qRT-PCR. We also analyzed KIT and PDGFRA mutations, DOG1 expression, by immunohistochemistry, along with clinical and pathological data. Disease-free survival (DFS) and overall survival (OS) differences were calculated using Log-rank test. Results: hierarchical cluster analyses from gene expression data identified two groups: group I had KIT, DOG1 and PDGFRA overexpression and IGF1R underexpression and group II had overexpression of IGF1R and low expression of KIT, DOG1 and PDGFRA. Group II had a significant worse OS (p = 0.013) in all the series, and showed a tendency for worse OS (p = 0.11), when analyzed only the localized cases. MiRNA222 expression was significantly lower in a control subset of KIT-positive GIST (p < 0.001). OS was significantly worse in KNGL cases with higher expression of MIR221 (p = 0.028) or MIR222 (p = 0.014). Conclusions: we identified two distinct KNGL subsets, with a different prognostic value. Increased levels of miRNA221/222, which are associated with worse OS, could explain the absence of KIT protein expression of most KNGL tumors

Development of a Novel NGS Methodology for Ultrasensitive Circulating Tumor DNA Detection as a Tool for Early-Stage Breast Cancer Diagnosis

Breast cancer (BC) is the most prevalent cancer in women. While usually detected when localized, invasive procedures are still required for diagnosis. Herein, we developed a novel ultrasensitive pipeline to detect circulating tumor DNA (ctDNA) in a series of 75 plasma samples from localized BC patients prior to any medical intervention. We first performed a tumor-informed analysis to correlate the mutations found in tumor tissue and plasma. Disregarding the tumor data next, we developed an approach to detect tumor mutations in plasma. We observed a mutation concordance between the tumor and plasma of 29.50% with a sensitivity down to 0.03% in mutant variant allele frequency (VAF). We detected mutations in 33.78% of the samples, identifying eight patients with plasma-only mutations. Altogether, we determined a specificity of 86.36% and a positive predictive value of 88.46% for BC detection. We demonstrated an association between higher ctDNA median VAF and higher tumor grade, multiple plasma mutations with a likelihood of relapse and more frequent TP53 plasma mutations in hormone receptor-negative tumors. Overall, we have developed a unique ultra-sensitive sequencing workflow with a technology not previously employed in early BC, paving the way for its application in BC screening.Comino-Mendez’s contract is funded by the Spanish Association Against Cancer Scientific Foundation (AECC). This study was supported by the “Consejería de Salud y Familias—Junta de Andalucía” (PI-0291-2019), “Fundación Unicaja” is funding Alba-Bernal’s contract and the Andalusia-Roche Network in Precision Medical Oncology Quirós-Ortega’s contract. Carbajosa-Antona’s contract is funded by the “Ayudas María Zambrano para la atracción de talento internacional—Universidad de Málaga”. Partial funding for open access charge: Universidad de Málag

A DNA damage repair gene-associated signature predicts responses of patients with advanced soft-tissue sarcoma to treatment with trabectedin

Predictive biomarkers of trabectedin represent an unmet need in advanced soft-tissue sarcomas (STS). DNA damage repair (DDR) genes, involved in homologous recombination or nucleotide excision repair, had been previously described as biomarkers of trabectedin resistance or sensitivity, respectively. The majority of these studies only focused on specific factors (ERCC1, ERCC5, and BRCA1) and did not evaluate several other DDR-related genes that could have a relevant role for trabectedin efficacy. In this retrospective translational study, 118 genes involved in DDR were evaluated to determine, by transcriptomics, a predictive gene signature of trabectedin efficacy. A six-gene predictive signature of trabectedin efficacy was built in a series of 139 tumor samples from patients with advanced STS. Patients in the high-risk gene signature group showed a significantly worse progression-free survival compared with patients in the low-risk group (2.1 vs 6.0 months, respectively). Differential gene expression analysis defined new potential predictive biomarkers of trabectedin sensitivity (PARP3 and CCNH) or resistance (DNAJB11 and PARP1). Our study identified a new gene signature that significantly predicts patients with higher probability to respond to treatment with trabectedin. Targeting some genes of this signature emerges as a potential strategy to enhance trabectedin efficacy.This study was funded by the Spanish Group for Research on Sarcoma (GEIS) and partially by PharmaMar. The authors would like to thank the GEIS data center for data management. The authors also thank the donors and the Hospital Universitario Virgen del Rocío—Instituto de Biomedicina de Sevilla Biobank (Andalusian Public Health System Biobank and ISCIII-Red de Biobancos PT17/0015/0041) for part of the human specimens used in this study. David S. Moura is recipient of a Sara Borrell postdoctoral fellowship funded by the National Institute of Health Carlos III (ISCIII) (CD20/00155)

THOR is a targetable epigenetic biomarker with clinical implications in breast cancer

Breast cancer (BC) is the most frequently diagnosed cancer and a leading cause of death among women worldwide. Early BC is potentially curable, but the mortality rates still observed among BC patients demon‑ strate the urgent need of novel and more efective diagnostic and therapeutic options. Limitless self-renewal is a hallmark of cancer, governed by telomere maintenance. In around 95% of BC cases, this process is achieved by telom‑ erase reactivation through upregulation of the human telomerase reverse transcriptase (hTERT). The hypermethylation of a specifc region within the hTERT promoter, termed TERT hypermethylated oncological region (THOR) has been associated with increased hTERT expression in cancer. However, its biological role and clinical potential in BC have never been studied to the best of our knowledge. Therefore, we aimed to investigate the role of THOR as a biomarker and explore the functional impact of THOR methylation status in hTERT upregulation in BC.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Estudio de factores predictivos de respuesta patológica a quimioterapia neoadyuvante en el cáncer de mama receptores hormonales positivos HER2 negativo

Se trata de un estudio de casos de carcinomas de mama con escasa información respecto a los factores que determinan la repuesta a quimioterapia neoadyuvante. Un elevado nivel de proliferación y el estado de receptores hormonales han mostrado ser predictivos de dicha respuesta.La quimioterapia neoadyuvante (QTN) se utiliza cada vez más para conseguir una reducción tumoral que permita una cirugía conservadora y, mediante el grado de respuesta patológica tumoral, determinar el pronóstico de las pacientes. Los datos anatomopatológicos proporcionados por la biopsia previa al tratamiento (BAG), podrían ser determinantes para conocer el grado de respuesta y estar relacionados con la evolución de la enfermedad. El objetivo del estudio es, determinar el valor predictivo de respuesta, basado en variables anatomopatológicas de la BAG, en una cohorte de 220 casos de mujeres con cáncer de mama fenotipo RE positivo y HER2 negativo, tratadas de 3 a 6 meses con antraciclina/taxanos, en 4 hospitales de Andalucía, desde el año 2003 al año 2014. El tamaño previo tumoral, el grado histológico, RE (receptores de estrógenos), RP (receptores de progesterona), nivel de proliferación (Ki67) y subtipo molecular subrrogado inmunohistoquímico, fueron evaluados en la BAG, y se compararon con el grado de respuesta a QTN en la pieza quirúrgica (sistemas de Miller y Payne [MyP] y RCB) valorado por un observador. Resultados: En nuestro estudio, los tumores con inmunoexpresión de RE 50% (p<0,05). Además, responden mejor al tratamiento los carcinoma con subtipo luminal B que los luminal A (p=0,04). Conclusiones: Además de un elevado nivel de proliferación, el estado de receptores de estrógenos y progesterona también influye en la respuesta a QTN en carcinoma de mama Her2 negativo, respondiendo mejor los pacientes con expresión hormonal baja. Probablemente relacionado con lo anterior, las pacientes con subtipo luminal B, mostratron una mejor respuesta.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Viaje virtual por San Martín de la Vega

Material no publicadoEste trabajo, que realiza un viaje virtual por San Martín de la Vega, obtuvo el primer premio en el X Certamen de Materiales Curriculares de 2002, organizado por la Consejería de Educación de la Comunidad de Madrid. Presenta un programa multimedia con carácter interactivo relativo a la localidad y desarrolla los objetivos de las áreas de Conocimiento del Medio y de Lengua. La elaboración del material se debe a que el cien por cien del alumnado pertenece a familias que han llegado a esta localidad hace menos de 10 años y por tanto desconocen el pueblo y su cultura; y a que se va a instalar un aula de informática en el centro. El material se presenta en un CD con un archivo autoejecutable que contiene las páginas de información acerca del pueblo, la historia, la leyenda, los alimentos y la localidad y sobre el que el alumno puede trabajar con cierto grado de interactividad. Otro CD con actividades de evaluación con el que se pretende evaluar el logro de los objetivos planteados. Las actividades vienen en paquetes autoejecutables independientes lo que permite evaluar los distintos apartados. Se aportan también fichas de instrucciones de uso de las actividades de evaluación para cada tema y un CD con el proyecto original y fotos de San Martín de la Vega.MadridES