The E-ELT first light spectrograph HARMONI: capabilities and modes

Trabajo presentado en SPIE Astronomical Telescopes, celebrado en San Diego (California), del 26 de junio al 1 de julio de 2016HARMONI is the E-ELT's first light visible and near-infrared integral field spectrograph. It will provide four different spatial scales, ranging from coarse spaxels of 60 × 30 mas best suited for seeing limited observations, to 4 mas spaxels that Nyquist sample the diffraction limited point spread function of the E-ELT at near-infrared wavelengths. Each spaxel scale may be combined with eleven spectral settings, that provide a range of spectral resolving powers (R 3500, 7500 and 20000) and instantaneous wavelength coverage spanning the 0.5 - 2.4 ¿m wavelength range of the instrument. In autumn 2015, the HARMONI project started the Preliminary Design Phase, following signature of the contract to design, build, test and commission the instrument, signed between the European Southern Observatory and the UK Science and Technology Facilities Council. Crucially, the contract also includes the preliminary design of the HARMONI Laser Tomographic Adaptive Optics system. The instrument's technical specifications were finalized in the period leading up to contract signature. In this paper, we report on the first activity carried out during preliminary design, defining the baseline architecture for the system, and the trade-off studies leading up to the choice of baseline

The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance

INTRODUCTION Investment in Africa over the past year with regard to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) sequencing has led to a massive increase in the number of sequences, which, to date, exceeds 100,000 sequences generated to track the pandemic on the continent. These sequences have profoundly affected how public health officials in Africa have navigated the COVID-19 pandemic. RATIONALE We demonstrate how the first 100,000 SARS-CoV-2 sequences from Africa have helped monitor the epidemic on the continent, how genomic surveillance expanded over the course of the pandemic, and how we adapted our sequencing methods to deal with an evolving virus. Finally, we also examine how viral lineages have spread across the continent in a phylogeographic framework to gain insights into the underlying temporal and spatial transmission dynamics for several variants of concern (VOCs). RESULTS Our results indicate that the number of countries in Africa that can sequence the virus within their own borders is growing and that this is coupled with a shorter turnaround time from the time of sampling to sequence submission. Ongoing evolution necessitated the continual updating of primer sets, and, as a result, eight primer sets were designed in tandem with viral evolution and used to ensure effective sequencing of the virus. The pandemic unfolded through multiple waves of infection that were each driven by distinct genetic lineages, with B.1-like ancestral strains associated with the first pandemic wave of infections in 2020. Successive waves on the continent were fueled by different VOCs, with Alpha and Beta cocirculating in distinct spatial patterns during the second wave and Delta and Omicron affecting the whole continent during the third and fourth waves, respectively. Phylogeographic reconstruction points toward distinct differences in viral importation and exportation patterns associated with the Alpha, Beta, Delta, and Omicron variants and subvariants, when considering both Africa versus the rest of the world and viral dissemination within the continent. Our epidemiological and phylogenetic inferences therefore underscore the heterogeneous nature of the pandemic on the continent and highlight key insights and challenges, for instance, recognizing the limitations of low testing proportions. We also highlight the early warning capacity that genomic surveillance in Africa has had for the rest of the world with the detection of new lineages and variants, the most recent being the characterization of various Omicron subvariants. CONCLUSION Sustained investment for diagnostics and genomic surveillance in Africa is needed as the virus continues to evolve. This is important not only to help combat SARS-CoV-2 on the continent but also because it can be used as a platform to help address the many emerging and reemerging infectious disease threats in Africa. In particular, capacity building for local sequencing within countries or within the continent should be prioritized because this is generally associated with shorter turnaround times, providing the most benefit to local public health authorities tasked with pandemic response and mitigation and allowing for the fastest reaction to localized outbreaks. These investments are crucial for pandemic preparedness and response and will serve the health of the continent well into the 21st century

Organophosphate pesticide exposure during pregnancy and childhood and onset of juvenile delinquency by age 16 years: The CHAMACOS cohort.

BackgroundThough prenatal organophosphate pesticide (OP) exposure has been associated with lower intellectual quotient and behavioral disorders in childhood, factors related to later delinquency, no research has directly evaluated the impact of OPs on delinquency.ObjectiveTo evaluate the association between prenatal and childhood OP exposure and juvenile delinquency in Mexican-American youth in the Center for Health Assessment of Mothers and Children of Salinas (CHAMACOS).MethodsWe measured dialkyl phosphate (DAPs) urinary metabolites of OPs in two prenatal maternal samples and in five child samples collected between six months and five years of age. Youth completed delinquency questionnaires at 16 years. We examined associations of prenatal and childhood DAPs with several delinquency outcomes (n = 313) using survival and generalized linear models.ResultsAlmost 60% of youth reported delinquent acts (mostly minor), and 8% reported a police arrest. We observed largely null results of prenatal or childhood DAP concentrations and delinquency outcomes, with some isolated associations. A ten-fold increase in maternal dimethylphosphate (DM) concentrations measured after 20 weeks gestation was associated with an earlier age of first delinquent act (Hazard Ratio = 1.38, 95% CI: 1.01, 1.88) and an increased Odds Ratio (OR) of having committed 1-3 or ≥4 delinquent acts, compared to the no delinquency reference group (OR = 1.77, 95% CI: 1.01-3.08 and 2.17, 95% CI: 1.13-4.17, respectively). Higher childhood diethylphosphate (DE) concentrations were associated with a later age of first delinquent act (HR: 0.67; 95% CI: 0.46-0.97).DiscussionWe did not find strong evidence of association between prenatal or childhood OP exposure and juvenile delinquency in the present cohort. There is an increasing literature that relates OP exposure to neurobehavioral impairments in childhood, and there is a need to understand long-term potential neurodevelopmental effects of early-life OP exposure

Modification of the electrostatic environment is tolerated in the oxyanion hole of the cysteine protease papain

NRC publication: Ye

Prenatal Exposure to Phthalates and the Development of Eczema Phenotypes in Male Children : Results from the EDEN Mother-Child Cohort Study

BACKGROUND: Contradictory results exist regarding the importance of early-life exposure to phthalates for development of childhood eczema. OBJECTIVES: We evaluated the association between maternal urinary concentrations of phthalate metabolites between the 24th and 28th week of gestation and occurrence of eczema in their sons up to 5 y of age, according to allergic sensitization as assessed by total immunoglobulin E (IgE) in a subsample of individuals. METHODS: Data on health outcomes and background factors were collected using five standardized annual questionnaires completed by parents at the children's ages of 1-5 y, and their associations with phthalate metabolite urinary concentrations were assessed in 604 mother son pairs with adjusted multiple logistic regression and Cox's survival model. Several eczema phenotypes were considered. Atopic status was assessed at 5 y of age in 293 boys through total IgE assessment. RESULTS: At 5 y of age, the prevalence of ever eczema was 30.4%. Metabolites of di-isobutyl phthalate, (DiBP) and di-isononyl phthalate (DiNP) were positively associated with early-onset (0-24 mo of age) eczema (15.7%) and late-onset (24-60 mo of age) eczema (14.7%). Applying the Cox's model showed a significant association of occurrence of eczema in the first 5 y of life with DiBP and DINP metabolites. Among IgE-sensitized boys, metabolites of di-n-butyl phthalate (DBP) and DiBP were significantly associated with ever eczema {hazard ratio (HR) = 1.67 [95% confidence, interval (CI): 1.10, 2.54], p = 0.01 and HR = 1.87 (95% CI: 1.01, 3.48), p = 0.04, respectively]. CONCLUSIONS: Occurrence of eczema in early childhood may be influenced by prenatal exposure to certain phthalates in boys. Further investigations are needed to confirm this observation

Note d’appui scientifique et technique de l’Anses relatif à la recommandation de valeurs biologiques pour la surveillance des expositions professionnelles concernant l’éthyl tert-butyl éther (CAS n° 637-92-3)

Citation suggérée : Anses (2022). Note d’appui scientifique et technique relatif à la recommandation de valeurs biologiques pour la surveillance des expositions professionnelles concernant l’éthyl tert-butyl éther (ETBE) (CAS n° 637-92-3). (saisine 2019-SA-0214). Maisons-Alfort : Anses, 23 p.Dans le cadre du protocole d’accord entre l'Anses et le ministère du travail pour la mise en œuvre du programme de travail d'expertise scientifique en matière de valeurs limites atmosphériques et biologiques pour les expositions professionnelles (VLEP), établi en juillet 2018, la direction générale du travail (DGT) a saisi l’Anses pour qu’elle identifie des indicateursbiologiques d’exposition (IBE) et des valeurs biologiques pour le suivi des expositions professionnelles à l’éthyl tert-butyl éther (ETBE).La surveillance biologique et la métrologie atmosphérique sont deux approches complémentaires pour évaluer les niveaux d’exposition des professionnels à des substances chimiques. La surveillance biologique permet d’évaluer l’exposition d’un travailleur à un agent donné en intégrant toutes les voies de pénétration de l’agent chimique dans l’organisme (poumon, peau, tube digestif). Elle est plus particulièrement pertinente lorsque les substances ont un effet systémique et :- lorsque d’autres voies que l’inhalation contribuent largement à l’absorption ;- et/ou lorsque l’agent chimique considéré et/ou ses métabolites s’accumulent, en cas d’exposition répétée ;- et/ou lorsque les conditions de travail (port d’équipement de protection individuelle (EPI)) ou les facteurs interindividuels génèrent une variabilité importante des doses internes qui n’est pas prise en compte par la métrologie atmosphérique.Ces considérations conditionnent les approches privilégiées par le groupe de travail « Indicateurs biologiques d’exposition » (GT IBE) pour le choix des indicateurs biologiques d’effet et d’exposition et la construction des valeurs limites biologiques (VLB) et valeurs biologiques de référence (VBR).La dérivation des VLB repose sur la méthodologie décrite dans le document de référence pour l’élaboration de valeurs limites d’exposition à des agents chimiques en milieu professionnel (Anses, 2017). La VLB est définie comme la valeur limite des indicateurs biologiques pertinents pour une exposition à un agent chimique donné. Tout comme la VLEP-8h (Valeur Limite d’Exposition Professionnelle moyennée sur 8 heures) recommandée par l’Anses, elle vise à protéger des effets néfastes liés à l’exposition à moyen et long termes les travailleurs exposés à l’agent chimique considéré régulièrement et pendant la durée d’une vie de travail.En fonction des données disponibles, les valeurs limites biologiques recommandées n’ont pas la même signification :- si le corpus de données scientifiques est suffisant pour quantifier avec certitude une relation dose/réponse, les valeurs limites biologiques (VLB) seront construites sur la base de données sanitaires (absence d’effet pour les substances à seuil ouniveaux de risque pour les substances cancérogènes sans seuil) ;- en l’absence de telles données, pour les substances à seuil d’effet, la VLB sera calculée sur la base des relations entre l’exposition externe et l’IBE et correspondra à la concentration attendue de l’IBE lorsque le travailleur est exposé à la VLEP-8h.- pour les substances cancérogènes, en l’absence de données quantitatives suffisantes pour construire la VLB sur la base de données sanitaires, c’est sur celle d’un autre effet qu’une valeur limite biologique sera calculée (VLB pragmatique).Ces dernières valeurs ne garantissent généralement pas l’absence d’effets sanitaires, mais visent à limiter les expositions à ces substances sur les lieux de travail.Lorsque cela est possible, des valeurs biologiques de référence (VBR) peuvent être recommandées. Elles correspondent à des concentrations mesurées dans une population générale d’adultes dont les caractéristiques sont proches de celles de la population française.Ces VBR ne peuvent être considérées comme protectrices de l’apparition d’effets sanitaires ; elles permettent cependant une comparaison avec les concentrations d’indicateurs biologiques d’exposition mesurées chez des professionnels exposés. Ces valeurs sont particulièrement intéressantes dans les cas où il n’est pas possible d’élaborer une VLB (ANSES, 2017)

Note d’appui scientifique et technique de l’Anses relatif à la recommandation de valeurs biologiques pour la surveillance des expositions professionnelles concernant l’éthyl tert-butyl éther (CAS n° 637-92-3)

Citation suggérée : Anses (2022). Note d’appui scientifique et technique relatif à la recommandation de valeurs biologiques pour la surveillance des expositions professionnelles concernant l’éthyl tert-butyl éther (ETBE) (CAS n° 637-92-3). (saisine 2019-SA-0214). Maisons-Alfort : Anses, 23 p.Dans le cadre du protocole d’accord entre l'Anses et le ministère du travail pour la mise en œuvre du programme de travail d'expertise scientifique en matière de valeurs limites atmosphériques et biologiques pour les expositions professionnelles (VLEP), établi en juillet 2018, la direction générale du travail (DGT) a saisi l’Anses pour qu’elle identifie des indicateursbiologiques d’exposition (IBE) et des valeurs biologiques pour le suivi des expositions professionnelles à l’éthyl tert-butyl éther (ETBE).La surveillance biologique et la métrologie atmosphérique sont deux approches complémentaires pour évaluer les niveaux d’exposition des professionnels à des substances chimiques. La surveillance biologique permet d’évaluer l’exposition d’un travailleur à un agent donné en intégrant toutes les voies de pénétration de l’agent chimique dans l’organisme (poumon, peau, tube digestif). Elle est plus particulièrement pertinente lorsque les substances ont un effet systémique et :- lorsque d’autres voies que l’inhalation contribuent largement à l’absorption ;- et/ou lorsque l’agent chimique considéré et/ou ses métabolites s’accumulent, en cas d’exposition répétée ;- et/ou lorsque les conditions de travail (port d’équipement de protection individuelle (EPI)) ou les facteurs interindividuels génèrent une variabilité importante des doses internes qui n’est pas prise en compte par la métrologie atmosphérique.Ces considérations conditionnent les approches privilégiées par le groupe de travail « Indicateurs biologiques d’exposition » (GT IBE) pour le choix des indicateurs biologiques d’effet et d’exposition et la construction des valeurs limites biologiques (VLB) et valeurs biologiques de référence (VBR).La dérivation des VLB repose sur la méthodologie décrite dans le document de référence pour l’élaboration de valeurs limites d’exposition à des agents chimiques en milieu professionnel (Anses, 2017). La VLB est définie comme la valeur limite des indicateurs biologiques pertinents pour une exposition à un agent chimique donné. Tout comme la VLEP-8h (Valeur Limite d’Exposition Professionnelle moyennée sur 8 heures) recommandée par l’Anses, elle vise à protéger des effets néfastes liés à l’exposition à moyen et long termes les travailleurs exposés à l’agent chimique considéré régulièrement et pendant la durée d’une vie de travail.En fonction des données disponibles, les valeurs limites biologiques recommandées n’ont pas la même signification :- si le corpus de données scientifiques est suffisant pour quantifier avec certitude une relation dose/réponse, les valeurs limites biologiques (VLB) seront construites sur la base de données sanitaires (absence d’effet pour les substances à seuil ouniveaux de risque pour les substances cancérogènes sans seuil) ;- en l’absence de telles données, pour les substances à seuil d’effet, la VLB sera calculée sur la base des relations entre l’exposition externe et l’IBE et correspondra à la concentration attendue de l’IBE lorsque le travailleur est exposé à la VLEP-8h.- pour les substances cancérogènes, en l’absence de données quantitatives suffisantes pour construire la VLB sur la base de données sanitaires, c’est sur celle d’un autre effet qu’une valeur limite biologique sera calculée (VLB pragmatique).Ces dernières valeurs ne garantissent généralement pas l’absence d’effets sanitaires, mais visent à limiter les expositions à ces substances sur les lieux de travail.Lorsque cela est possible, des valeurs biologiques de référence (VBR) peuvent être recommandées. Elles correspondent à des concentrations mesurées dans une population générale d’adultes dont les caractéristiques sont proches de celles de la population française.Ces VBR ne peuvent être considérées comme protectrices de l’apparition d’effets sanitaires ; elles permettent cependant une comparaison avec les concentrations d’indicateurs biologiques d’exposition mesurées chez des professionnels exposés. Ces valeurs sont particulièrement intéressantes dans les cas où il n’est pas possible d’élaborer une VLB (ANSES, 2017)

Expertise collective : synthèse et conclusions relatives à l’expertise en vue de la fixation de valeurs limites d’exposition à des agents chimiques en milieu professionnel portant sur l’évaluation des indicateurs d’exposition et des recommandations de valeurs limites biologiques et de valeurs biologiques de référence pour le diméthylformamide (DMF) CAS n°68-12-2

Citation suggérée : Anses. (2022). Expertise collective : Synthèse et conclusions relatives à l’expertise en vue de la fixation de valeurs limites d’exposition à des agents chimiques en milieu professionnel portant sur l’évaluation des indicateurs d’exposition et des recommandations de valeurs limites biologiques et de valeurs biologiques de référence pour le diméthylformamide (DMF) CAS n°68-12-2). (saisine 2021-MPEX-0138). Maisons-Alfort : Anses, 65 p.Dans le cadre du programme de recherche européen HBM4EU regroupant une trentaine de pays, des valeurs guides pour la surveillance biologique (ou Human Biomonitoring Guidance Values (HBM-GVs)), sont recommandées pour la population générale et les travailleurs. Ces valeurs sont proposées pour des substances d’intérêt identifiées comme prioritaires. Le diméthylformamide (DMF) a fait l’objet de propositions de valeurs guides au sein du programme HBM4EU (cf. HBM4EU : Deliverable Report D5.9 - 3rd substance specific derivation of EU-wide health-based guidance values).La méthodologie appliquée dans le cadre du projet HBM4EU (Apel et al., 2020) pour l’identification des indicateurs biologiques d’exposition (IBE) d’intérêt et la proposition de valeurs biologiques pour les travailleurs est en partie fondée sur la méthodologie de l’Anses (Anses, 2017).Dans le cadre du protocole d’accord relatif à la mise en œuvre du programme de travail d'expertise scientifique en matière de valeurs limites atmosphériques et biologiques pour les expositions professionnelles établi en juillet 2018 entre l’Anses et la Direction générale du travail (DGT), l’Anses a été saisie afin de recommander des valeurs biologiques pour le DMF, ceci afin de mutualiser les ressources d’expertise engagées. Le présent document est établi pour répondre à cette saisine, sur la base de l’évaluation précédemment réalisée par des agents de l’Anses dans le cadre du programme de recherche HBM4EU pour la recommandation de valeurs biologiques pour le DMF en milieu de travail.La France dispose pour le DMF d’une valeur limite d’exposition professionnelle (VLEP) contraignante sur 8 heures (VLEP-8h) de 15 mg.m -3 (5 ppm) et d’une valeur limite court terme contraignante sur 15 minutes (ou VLCT-15min) de 30 mg.m -3 (10 ppm)