Cancer genomics paves the way to targeted therapy.

RESUMEN: La lucha contra el cáncer es aún un desafío mayor, con cerca de 14 millones de nuevos casos de cáncer al año y más de 8 millones de muertes anuales atribuidas al cáncer. Con la ayuda de múltiples servicios clínicos del HUMV y otras Instituciones, trabajamos para demostrar la hipótesis de que análisis integrados de genómica y secuenciación dirigida de alta profundidad en especímenes quirúrgicos de rutina puede generar datos firmes y relevantes sobre la complejidad molecular, composición subclonal, índice mutacional, firmas mutacionales y mutaciones precisas en genes con implicaciones terapéuticas; así generando una herramienta diagnóstica robusta que permita predecir sensibilidad a terapias específicas. In este proyecto, hemos podido demostrar que los estudios genómicos del cáncer demuestran dianas útiles para la intervención terapéutica y que la combinación de múltiples terapias inactivando rutas oncogénicas convergentes representa una opción plausible para pacientes con cáncer avanzado.ABSTRACT: Cancer is still a mayor challenge with something more than 14M new cases per year in the world and more of 8M patients dying yearly because of cancer. With the collaboration of multiple clinical services at the HUMV and other clinical institutions, we are working to demonstrate the hypothesis that genomics integrative analysis and high-depth targeted mutational analysis in routine cancer specimens may generate consistent, relevant data informing about molecular complexity, subclonal composition, mutational rate, mutational signatures and precise mutations in genes with therapeutic implications; thus generating a robust, solid, diagnostic tool that may allow to predict the sensitivity to specific therapies. In this project we have been able to demonstrate that cancer genome studies do demonstrate actionable targets, and that the combination of multiple therapies targeting convergent pathways represent a plausible option for advanced cancer patients

Cellular and humoral functional responses after BNT162b2 mRNA vaccination differ longitudinally between naive and subjects recovered from COVID-19

We have analyzed BNT162b2 vaccine-induced immune responses in naive subjects and individuals recovered from coronavirus disease 2019 (COVID-19), both soon after (14 days) and later after (almost 8 months) vaccination. Plasma spike (S)-specific immunoglobulins peak after one vaccine shot in individuals recovered from COVID-19, while a second dose is needed in naive subjects, although the latter group shows reduced levels all along the analyzed period. Despite how the neutralization capacity against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) mirrors this behavior early after vaccination, both groups show comparable neutralizing antibodies and S-specific B cell levels late post-vaccination. When studying cellular responses, naive individuals exhibit higher SARS-CoV-2-specific cytokine production, CD4+ T cell activation, and proliferation than do individuals recovered from COVID-19, with patent inverse correlations between humoral and cellular variables early post-vaccination. However, almost 8 months post-vaccination, SARS-CoV-2-specific responses are comparable between both groups. Our data indicate that a previous history of COVID-19 differentially determines the functional T and B cell-mediated responses to BNT162b2 vaccination over time.C.d.F., J.G.-P., and J.A. are supported by Instituto de Salud Carlos III (ISCII). We thank JM Ligos and Cytek Biosciences for their technical support. Research in E.L.-C.’s lab was supported by Fundación Familia Alonso, Santander Bank, Real Seguros, Fundación Mutua Madrileña, Fundación Uria, Fundación La Caixa, and Ayuntamiento de Madrid.S

Shared Oncogenic Pathways Implicated in Both Virus-Positive and UV-Induced Merkel Cell Carcinomas

Merkel cell carcinoma (MCC) is a highly malignant neuroendocrine tumor of the skin whose molecular pathogenesis is not completely understood, despite the role that Merkel cell polyomavirus can play in 55e90% of cases. To study potential mechanisms driving this disease in clinically characterized cases, we searched for somatic mutations using whole-exome sequencing, and extrapolated our findings to study functional biomarkers reporting on the activity of the mutated pathways. Confirming previous results, Merkel cell polyomavirus-negative tumors had higher mutational loads with UV signatures and more frequent mutations in TP53 and RB compared with their Merkel cell polyomavirus-positive counterparts. Despite important genetic differences, the two Merkel cell carcinoma etiologies both exhibited nuclear accumulation of oncogenic transcription factors such as NFAT or nuclear factor of activated T cells (NFAT), P-CREB, and P-STAT3, indicating commonly deregulated pathogenic mechanisms with the potential to serve as targets for therapy. A multivariable analysis identified phosphorylated CRE-binding protein as an independent survival factor with respect to clinical variables and Merkel cell polyomavirus status in our cohort of Merkel cell carcinoma patients.This work was supported by grants from Instituto de Salud-Carlos III (ISCIII); cofinanced by the European Union; (FEDER) (PI12/00357), and a Ramón and Cajal research program (MINECO; RYC-2013-14097) to JPV, Asociación Española Contra el Cáncer and ISCIII grants (RD06/0020/0107, RD012/0036/0060) to MAP, and Coordinated Project of Excellence inter-Institutos de investigación acreditados institutes (ISCIII; PIE15/00081) to MAP. The Ramón and Cajal research program also supports IV. SD was supported by the Torres Quevedo subprogram (MICINN; PTQ-12-05391)

100 años investigando el mar. El IEO en su centenario (1914-2014).

Se trata de un libro que pretende divulgar a la sociedad las principales investigaciones multidisciplinares llevadas a cabo por el Instituto Español de Oceanografía durante su primer siglo de vida, y dar a conocer la historia del organismo, de su Sede Central y de los nueve centros oceanográficos repartidos por los litorales mediterráneo y atlántico, en la península y archipiélagos.Kongsberg 20

Recerca, universitat i empresa

Amb motiu de la creació del seu patronat-consell empresarial, l’EPSEB va organitzar, el 25 de febrer, a la sala d’actes de l'escola, un acte sobre Recerca, universitat i empresa, en el marc del qual la secretària d’Estat per a l’R+D+i, Carmen Vela, va impartir la conferència titulada El momento de la investigación en España, després de la qual es va obrir un torn de preguntes. Tot seguit es va realitzar una taula rodona sobre el tema Les relacions universitat-empresa empresa: nous escenaris, amb la participació de Dídac Ramírez, rector de la UB; Salvador Alemany, president del Consell Social de la UB; Ferran Sancho, rector de la UAB; Gabriel Masfurroll, president del Consell Social de la UAB; Esther Real, vicerectora de Transferència de Coneixement de la UPC, i Ramon Carbonell, president del Consell Social de la UPC. Presentada per Josep Manuel Basáñez, president de l'òrgan recentment constituït, va presentar i participar en la taula rodona, que va estar moderada per Lluís Recoder, i va comptar amb la participació del director de l’Escola, Francesc Jordana

Anales de Edafología y Agrobiología Tomo 41 Número 7-8

Suelos. Empleo de mpleo del coeficiente de correlacion para la seleccion de caracteristicas en taxonomia numerica de suelos, por F. Monturiol Rodríguez y. L. Alcala Del Olmo B.-- Modelos dinamicos en el estudio de la genesis del suelo p o r J. E. Garcia Hernandez.-- A computer-based soil evaluation system for assessing soil productivity p o r D. de la Rosa.-- Relaciones fisico-quimicas y espectrales del suelo p o r Jose L. Labrandero.-- procesos de alteracion; genesis y estabilidad mineral de suelos volcanicos (volcan de piedrabuena, ciudad real) II. caracteres fisicos y fisico-quimicos p o r Martín De Vidales, J. L., Sanz, J., Casas, J., Rodríguez Sanchidrian, J. Y, Guerra Delgado, A.-- Significado de la presencia de horizontes bt en suelos de las facies de madrid. aproximacion para explicar el contenido de arcilla en este tipo de horizontes p o r Jimenez Ballesta, R. Martin De Vidales. J. L. y Garcia Gimenez, R.-- Actividad enzima tica y microbiana en diversos andosoles de tenerife p o r J. M. Lozano, P. T. C. Carvalho Y F. Velasco.-- Estudio de la variabilidad de poblaciones de nema todos fitoparasitos de limonero. l. tylenchulus semipenetrans Cobb por Ortuño Martinez, A.Hernansaez Rabay, A., Gomez Gomez, J. y Abrisqueta Garcia, J. M.-- Estudio climatico de la hoja topografica 1:50.000 905 de linares (Jaen) p o r G. Delgado y J. Aguilar.-- Estudio del sistema SI(oh)4-AI+ -Mg2+ -Na+ -h20 a temperatura y presion ordinarias. l. precipit acion de silicio, aluminio y magnesio por Reyes, M., Huertas, F., Linares, J. y Reyes, E. -- Estudio del sistema SI(oh)4-AI+ -Mg2+ -Na+ -h20 a temperatura y presion ordinarias. II. Composicion quimica y mineralogica de los precipitados, por Reyes, M., Huertas, F., Linares, J. y Reyes, E.-- Fertilidad. estudio comparativo sobre nitrificaciones en un suelo de regadio frente a uno de secano por F. Gallardo-Lara. A. Molina-Diaz Y E. Esteban-Velasco.-- Consideraciones sobre la utilizacion de la tecnica extractiv a de burriel y hernando para la evaluacion del p asimilable en suelos por J. A. Díez.—Nutrición y Fisiología Vegetal. Balance nutriente evolutivo: aplicaciones por O. Carpena Artes y R. O. Carpena Ruiz.-- Estudio de algunos aspectos ecofisiologicos en el analisis de la produccion de grano en los cultivos de cebada (gen. Hordeum l) II. Efecto del nitrogeno y del azufre por via foliar por L. F. Garcia Del Moral, J. M. Ramos y L. Recalde-Manrique y L. Recalde Martinez.- Evolucion de la fraccion organica y mineral de un pastizal de la marisma del guadalquivir. ii. fraccion organica de la vegetación por Hernandez, J. M., Barroso, M., Chaves, M. y Murillo, J. M.-- Evolucion de la fraccion organica y mineral de una pradera halofita de la marisma del guadalquivir. III. relaciones fisiológicas Por Barroso, M., Hernandez, J. M., Murillo, J. M. Y Chaves, M.-- Ordenacion automatica de comunidades de pastizal. un ejemplo de su validez con la eliminacion de las especies menos abundantes por A. Puerto Martin, M. Rico Rodriguez, B. Redondo Prieto y J. M. Gomez Gutierrez.-- Produccion y extraccion de bioelementos en pastizales naturales y especies pratenses cultivadas por B. García Criado. A. Garcia Ciudad, M. I. Montalvo Hernandez y L. Garcia Criado.-- Precocidad en tomate para consumo en fresco por J. Cuartero Y F. Nuez.-- Estudio de la nutricion del cultivo del haba (Vicia faba L.) por Eduardo Esteban Velasco. Francisco Gallardo-Lara y Josefa Robles Fernandez.-- Relaciones proteinas y lipidos con niveles de bioelementos edaficos en semillas de leguminosas por Ortuño Martinez, A. Hernansaez Rabay, A. Y Abrisqueta Garcia. J. M.-- Influencia del pretratamiento de semillas de girasol con boro sobre la germinacion y primeras fases de desarrollo de la planta por Jimenez. F. y Aguilar, A.-- Determinacion de la variedad de patata (solanum tuberosum l.) por analisis electroforetico de las proteinas del tuberculo. por J. Lopez-Gorgé, A. Chueca y M. Vilchez.-- Cambios metabolicos durante el proceso de maduracion de la uva (vitis vinifera, l. var. palomino) en la zona del marco de jerez de la frontera (cadiz) por L. Catalina, C. Mazuelos, R. Romero Y R. Sarmiento.-- Datos nomenclaturales y ecologicos sobre taxones españoles del genero satureja (labiatae) por Salvador Rivas-Martinez.—Trabajos recapitulativos.-- La Rizosfera: Interacciones Microbio-Planta por J. M. Barea y C. Azcon-Aguilar.-- MÉtodos de a tomizacion electrotermica en espectrofotometria de absorcion atomica revisión por M. D. Mingorance y M. Lachica.—Notas.Peer reviewe

100 años investigando el mar. El IEO en su centenario (1914-2014).

Se trata de un libro que pretende divulgar a la sociedad las principales investigaciones multidisciplinares llevadas a cabo por el Instituto Español de Oceanografía durante su primer siglo de vida, y dar a conocer la historia del organismo, de su Sede Central y de los nueve centros oceanográficos repartidos por los litorales mediterráneo y atlántico, en la península y archipiélagos.Kongsberg 200Postprin