2,064 research outputs found
Levels of radionuclide concentrations in benthic invertebrate species from the Balearic Islands, Western Mediterranean, during 2012–2018
Baseline levels of radionuclides in the marine environment of the Balearic Islands in Western Mediterranean have not been reported in literature. Because of their ecological role and acknowledged sensitivity to pollutants, herein, the activity concentrations of ²¹⁰Po, 40 K, 210 Pb, 90 Sr, and 234 Th were measured in two types of benthic invertebrate species (mussels and sea urchins) sampled during 2012–2018. The activity concentrations of ²¹⁰Po, ⁴⁰K, ²¹⁰Pb, and ²³⁴Th ranged from 38 ± 1 to 325 ± 11 Bq kg−¹ dry weight (d.w.), 220 ± 10 to 996 ± 46 Bq kg−¹ d.w., ND (lower than the limit of detection) to 55 ± 8 Bq kg−¹ d.w., and ND to 70 ± 15 Bq kg−¹ d.w., respectively. In all cases, no artificial ⁹⁰Sr activity was detected in the collected samples. The committed effective dose to humans was calculated to be in the range of 48–640 μSv year−¹
DNA methylation profiles and their relationship with cytogenetic status in adult acute myeloid leukemia
Background: Aberrant promoter DNA methylation has been shown to play a role in acute myeloid leukemia (AML) pathophysiology. However, further studies to discuss the prognostic value and the relationship of the epigenetic signatures with defined genomic rearrangements in acute myeloid leukemia are required. Methodology/Principal Findings: We carried out high-throughput methylation profiling on 116 de novo AML cases and we validated the significant biomarkers in an independent cohort of 244 AML cases. Methylation signatures were associated with the presence of a specific cytogenetic status. In normal karyotype cases, aberrant methylation of the promoter of DBC1 was validated as a predictor of the disease-free and overall survival. Furthermore, DBC1 expression was significantly silenced in the aberrantly methylated samples. Patients with chromosome rearrangements showed distinct methylation signatures. To establish the role of fusion proteins in the epigenetic profiles, 20 additional samples of human hematopoietic stem/progenitor cells (HSPC) transduced with common fusion genes were studied and compared with patient samples carrying the same rearrangements. The presence of MLL rearrangements in HSPC induced the methylation profile observed in the MLL-positive primary samples. In contrast, fusion genes such as AML1/ETO or CBFB/MYH11 failed to reproduce the epigenetic signature observed in the patients. Conclusions/Significance: Our study provides a comprehensive epigenetic profiling of AML, identifies new clinical markers for cases with a normal karyotype, and reveals relevant biological information related to the role of fusion proteins on the methylation signature
Reacción al carbón parcial (Tilletia indica) de variedades y líneas avanzadas de trigo cristalino: Reaction of durum wheat cultivars and advanced lines to partial bunt (Tilletia indica)
Veintitrés líneas avanzadas de trigo cristalino y las variedades CIRNO C2008 y Huatabampo Oro C2009 se evaluaron para resistencia a carbón parcial durante el 2013-2014 en el Campo Experimental Norman E. Borlaug. Las fechas de siembra fueron noviembre 21 y diciembre 3, 2013. Las inoculaciones se hicieron inyectando 1 mL de una suspensión de esporidios alantoides (10,000/mL) durante el embuche en 10 espigas por línea, bajo un un sistema de microaspersión. La cosecha y trilla de las espigas inoculadas se hicieron manualmente, y el conteo de granos infectados y sanos mediante inspección visual. El rango de infección para la primera fecha de siembra fue de 0 a 25.8%, con un promedio de 4.9; tres líneas y la variedad CIRNO C2008 no presentaron granos infectados. El rango de infección para la segunda fue de 0 a 9.7%, con un promedio de 2.2, una línea no presentó granos infectados. La media de los tres porcentajes más altos de infección del testigo susceptible fue de 99%. Presentaron los porcentajes promedio más altos de infección de las dos fechas de siembra: la variedad Huatabampo Oro C2009 con 13.75 y la línea CHEN_1/TEZ/3/GUIL//CIT71/CII/4/SORA /PLATA_12/5/STOT//ALTAR84/ALD/6/SOMAT_3/PHAX_1//TILO_1/LOTUS_4/7/AJAIA _12/F3LOCAL(SEL.ETHIO.135.85)//PLATA_13/4/CHEN_1/TEZ/3/GUIL//CIT71/CII/5/SORA/2*PLATA_12// SOMAT_3 con 9.25. Doce líneas y la variedad CIRNO C2008 estuvieron en la categoría de infección 0.1-2.5%; la línea con el menor promedio de infección fue GERUFTEL-1/BELLAROI/9/CBC509CHILE/6/ECO/CMH76A.722//BIT/3/ ALTAR84/4/AJAIA_2/5/KJOVE_1/7/AJAIA_12/F3LOCAL(SEL.ETHIO.135.85)//PLATA_ 13/8/SOOTY_9/ RASCON_37//WODUCK/CHAM_3 con 0.10%. En la categoría de infección 2.6-5.0% hubo tres líneas, ocho en la categoría 5.1-10.0% y la variedad Huatabampo Oro C2009 en la categoría 10.1-30.0%. Las líneas dentro de la categoría de infección 0.1-5.0% se consideran como resistentes y poseen un alto potencial para ser usadas en mejoramiento como donadoras del carácter de resistencia a la enfermedad
Reacción a la punta negra (Alternaria spp.) de líneas avanzadas elite de trigo harinero en el ciclo 2013-2014: Reaction of elite advanced bread wheat lines to black point (Alternaria spp.) during the crop season 2013-2014
Cuarenta y seis líneas avanzadas elite de trigo harinero se evaluaron para resistencia a la punta negra durante el 2013-2014 en el Campo Experimental Norman E. Borlaug. Las fechas de siembra fueron noviembre 21, diciembre 3 y 11, 2013, usando aproximadamente 8 g de semilla para un surco de 0.7 m de largo en cama de dos hileras sin repeticiones. La cosecha se hizo a mano y la evaluación mediante inspección visual contando el número de granos sanos e infectados en diez espigas por línea para calcular el porcentaje de infección. El rango de infección para la primera fecha de siembra fue de 0 a 25%, con un promedio de 4.9; quince líneas no presentaron granos infectados; para la segunda fue de 0 a 32%, con un promedio de 11.1%; una línea no presentó granos infectados; y para tercera fue de 0 a 29.8%, con un promedio de 3.2% y quince líneas no presentaron granos infectados. WHEAR/ VIVITSI//WHEAR/3/PANDORA fue la única que no presentó granos infectados en ninguna de las fechas. Presentaron los porcentajes promedio más altos de infección en las tres fechas: PASTOR/3/VORONA/CNO79//KAUZ /4/MILAN/OTUS//ATTILA/3*BCN/5/MUNAL#1 con 17.13%, CROC_1/AE.SQUARROSA (205)//BORL95/3/PRL/SARA//TSI/VEE#5/4/FRET2/5/2*DANPHE#1 con 15.06, KIRITATI /2*WBLL1/3/TAM200/PASTOR//TOBA97/4/VILLAJUAREZF2009 con 14.91 y WAXWING /KRONSTADF2004//FRNCLN con 13.74%. Dentro de las categorías de infección en base al promedio de los datos de las tres fechas, siete líneas estuvieron en la categoría 0.1-2.5%, ocho en la de 2.6-5.0%, 23 en la de 5.1-10.0% y siete en la de 10.1-30%. El promedio general de infección del grupo de líneas fue de 6.43% con un rango de 0 a 17.1%, aunque algunas líneas presentaron porcentajes más altos de infección en las diferentes fechas como PASTOR/3/VORONA/CNO79//KAUZ/4/MILAN/OTUS//ATTILA /3*BCN/5/MUNAL#1 que presentó un máximo de 32% y CROC_1/AE.SQUARROSA (205)//BORL95/3/PRL/SARA//TSI/VEE#5/4/FRET2/5/2*DANPHE#1 29.8%
Slow oscillatory activity and levodopa-induced dyskinesias in Parkinson’s disease
The pathophysiology of levodopa-induced dyskinesias (LID) in Parkinson’s disease is not well understood.
We have recorded local field potentials (LFP) from macroelectrodes implanted in the subthalamic nucleus
(STN) of 14 patients with Parkinson’s disease following surgical treatment with deep brain stimulation. Patients
were studied in the ‘Off’ medication state and in the ‘On’ motor state after administration of levodopa–
carbidopa (po) or apomorphine (sc) that elicited dyskinesias in 11 patients. The logarithm of the power
spectrum of the LFP in selected frequency bands (4–10, 11–30 and 60–80 Hz) was compared between the
‘Off’ and ‘On’ medication states. A peak in the 11–30 Hz band was recorded in the ‘Off’ medication state
and reduced by 45.2% (P < 0.001) in the ‘On’ state. The ‘On’ was also associated with an increment of 77. 6%
(P < 0.001) in the 4–10 Hz band in all patients who showed dyskinesias and of 17.8% (P < 0.001) in the 60–80 Hz
band in the majority of patients. When dyskinesias were only present in one limb (n = 2), the 4–10 Hz peak was
only recorded in the contralateralSTN. These findings suggest that the 4–10 Hz oscillation is associated with the
expression of LID in Parkinson’s disease
Reacción al carbón parcial (Tilletia indica) de líneas avanzadas de triticale (Triticosecale) en el ciclo agrícola 2015-2016: Reaction of triticale (Triticosecale) advanced lines to partial bunt (Tilletia indica) during the crop season 2015-2016
Veinte líneas avanzadas de triticale se evaluaron para resistencia a carbón parcial durante el ciclo agrícola otoño-invierno 2015-2016 en el Campo Experimental Norman E. Borlaug, en el Valle del Yaqui, Sonora, Mexico. Las fechas de siembra fueron noviembre 12 y 19, 2015. Se inyectó 1 mL de una suspensión de esporidios alantoides (10,000/mL) durante el embuche en diez espigas por línea. Se utilizó un sistema de microaspersión para proveer un ambiente húmedo en el área experimental. El testigo susceptible KBSUS se incluyó en la evaluación como referencia para el porcentaje de infección. La cosecha y trilla de las espigas inoculadas se hicieron manualmente, y el conteo de granos infectados y sanos y la evaluación mediante inspección visual. El rango de infección para la primera fecha de siembra fue de 0 a 7.5%, con un promedio de 1.3 y para la segunda fue de 0 a 2.0%, con un promedio de 0.4. Cinco líneas no presentaron granos infectados en ambas fechas, doce estuvieron en la categoría de infección de 0.1-2.5 y tres en la categoría 2.6-5.0%. La media de los tres porcentajes más altos de infección del testigo susceptible fue de 100%. Presentaron los porcentajes promedio más altos de infección de las dos fechas de siembra: BAT*2/BCN//CAAL/3/ERIZO_7/BAGAL_2//FARAS_1/6/ ARLIN_3/ALTAR84//SNP/2*BLANCO, RYE/4/DAHBI_6/3/ARDI_1/TOPO1419//ERIZO_ 9/5/YOGUI_3/ERIZO_11//ONA_2/POSS_1-2 con 2.57, LIRON_2/5/DISB5/3/SPHD/ PVN//YOGUI_6/4/KER_3/6/BULL_10/MANATI_1/7/ASNO/ARDI_3//ERIZO_7/3/VARSA_3/4/TESMO_1/MUSX 603//FAHAD_4/5/FAHAD_1/6/DAHBI//ONA_2/POSS_1-2 con 3.72 y 95T159/4/T1502_WG/MOLOC_4//RHINO_3/BULL_1-1/3/POLLMER_3/FOCA_2-1/5/ CAAL/3/T1494_WG//ERIZO_10/2*BULL_1-1 con 3.76%. Estas dos últimas líneas presentaron los porcentajes más altos de infección con 5.73 y 7.53%, respectivamente, en la primera fecha
Reacción a la punta negra (Alternaria spp.) de líneas avanzadas de trigo harinero (Triticum aestivum) en el ciclo agrícola 2015-2016: Reaction of bread wheat (Triticum aestivum) to black point (Alternaria spp.) during the crop season 2015-2016
Veintiún líneas avanzadas de trigo harinero y las variedades comerciales Borlaug 100, Ónavas F2009, Roelfs F2007 y Villa Juárez F2009 se evaluaron para resistencia a la punta negra durante el 2015-2016 en el Campo Experimental Norman E. Borlaug en el Valle del Yaqui, Sonora, México. Las fechas de siembra fueron noviembre 12 y 19, 2015, usando aproximadamente 8 g de semilla para un surco de 0.7 m de largo en cama de dos hileras sin repeticiones. La cosecha se hizo a mano y la evaluación mediante inspección visual contando el número de granos sanos e infectados en 10 espigas por línea/variedad para calcular el porcentaje de infección. El rango de infección para la primera fecha de siembra fue de 0 a 15.9%, con un promedio de 3.8; dos líneas no presentaron granos infectados; para la segunda fue de 0 a 8.0%, con un promedio de 1.8%; ocho líneas no presentaron granos infectados. SAUAL/MUTUS/4/KACHU#1// WBLL1*2/KUKUNA/3/BRBT1*2/ KIRITATI fue la única que no presentó granos infectados en ninguna de las fechas. Presentaron los porcentajes promedio más altos de infección: SOKOLL*2/3/BABAX/LR42//BABAX con 9.7%, ND643/2*WBLL1/5/PRL/2*PASTOR/4/ CHOIX/STAR/3/HE1/3*CNO79//2*SERI/6/PRL/2*PASTOR/4/CHOIX/STAR/3/HE1/3* CNO79//2*SERI con 7.9, Ónavas F2009 con 7.4 y BABAX/LR42//BABAX/3/ER2000/4/2* MUNAL con 6.5%. Dentro de las categorías de infección en base al promedio de los datos de las dos fechas, una línea no presentó granos infectados, doce líneas y Borlaug 100, Roelfs F2007 y Villa Juárez F2009 estuvieron en la categoría 0.1-2.5%, cinco líneas en la de 2.6-5.0% y tres líneas y Ónavas F2009 en la de 5.1-10.0%. El promedio general de infección del grupo de líneas y variedades fue de 2.8% con un rango de 0 a 9.7%, aunque algunas líneas presentaron porcentajes más altos de infección en las diferentes fechas como ND643/2*WBLL1/5/PRL/2*PASTOR/4/CHOIX/STAR/3/HE1/3*CNO79//2*SERI/6/ PRL/2*PASTOR/4/CHOIX/STAR/3/HE1/3*CNO79//2*SERI que presentó un máximo de 15.9%, Ónavas F2009 con 11.6% y SOKOLL*2/3/BABAX/LR42//BABAX con 11.4%, las tres en la primera fecha
Evaluation of antimicrobial and antifungal activity of hydroethanolic extracts of in vitro and ex vitro seedlings of Dionaea muscipula J. Ellis
Objective: To assess the antibacterial and antifungal activity of hydroethanolic extracts of Dionaea muscipula J. Ellis against model bacteria and fungi of agricultural importance.
Design/Methodology/Approach: In vitro plants of D. muscipula were propagated and acclimatized for three months. The antibacterial activity of the hydroethanolic extracts against Escherichia coli and Bacillus cereus and the antifungal activity against Aspergillus niger, Fusarium oxysporum and Pseudocercospora fijiensis were evaluated. An analysis of variance (ANOVA) was performed to compare the means obtained with a Tukey test (p?0.05).
Results: The hydroethanolic extracts of D. muscipula in vitro and acclimatized showed a bacteriostatic activity against the bacteria E. coli (65.20 and 69.78% inhibition) and B. cereus (91.75 and 92.61% inhibition) and an antifungal activity against the fungus P. fijiensis of 7.56 and 14.21% of inhibition, respectively.
Study Limitations/Implications: The hydroethanolic extracts of D. muscipula in vitro and acclimatized did not show antifungal activity against A. niger and F. oxysporum.
Findings/Conclusions: The hydroethanolic extracts of D. muscipula in vitro and acclimatized showed a bacteriostatic activity against the bacteria E. coli and B. cereus and antifungal activity against the fungus P. fijiensis.Objective: To evaluate the antibacterial and antifungal activity of hydroethanolic extracts of Dionaea muscipula J. Ellis against bacteria models and fungi of agricultural importance.
Design/Methodology/Approach: In vitro plants of D. muscipula were propagated and acclimatized for three months. The antibacterial activity of the hydroethanolic extracts against Escherichia coli and Bacillus cereus was evaluated, and the antifungal activity against Aspergillus niger, Fusarium oxysporum and Pseudocercospora fijiensis. Analysis of variance (ANOVA) was carried out to compare the means obtained with Tukey’s test (p≤0.05).
Results: The hydroethanolic extracts of in vitro and acclimatized D. muscipula presented bacteriostatic activity against the bacteria E. coli (65.20 and 69.78 % of inhibition) and B. cereus (91.75 and 92.61 % of inhibition), and antifungal activity against the fungus P. fijiensis of 7.56 and 14.21 % of inhibition, respectively.
Study Limitations/Implications: The hydroethanolic extracts of in vitro and acclimatized D. muscipula did not show antifungal activity against A. niger and F. oxysporum.
Findings/Conclusions: The hydroethanolic extracts of in vitro and acclimatized D. muscipula presented bacteriostatic activity against bacteria E. coli and B. cereus and antifungal activity against the fungus P. fijiensis
Implementation of a PCR-based strategy to control an outbreak by Serratia marcescens in a Neonatal Intensive Care Unit
© The Author(s) 2023. Open Access This article is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License, which permits use, sharing, adaptation, distribution and reproduction in any medium or format, as long as you give appropriate credit to the original author(s) and the source, provide a link to the Creative Commons licence, and indicate if changes were made. The images or other third party material in this article are included in the article's Creative Commons licence, unless indicated otherwise in a credit line to the material. If material is not included in the article's Creative Commons licence and your intended use is not permitted by statutory regulation or exceeds the permitted use, you will need to obtain permission directly from the copyright holder. To view a copy of this licence, visit http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/. The Creative Commons Public Domain Dedication waiver (http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/) applies to the data made available in this article, unless otherwise stated in a credit line to the data.[Objectives] To evaluate the clinical and epidemiological impact of a new molecular surveillance strategy based on qPCR to control an outbreak by Serratia marcescens in a Neonatal Intensive Care Unit (NICU).[Methods] We design a specific qPCR for the detection of S. marcescens in rectal swabs of patients admitted to a NICU. We divided the surveillance study into two periods: (a) the pre-PCR, from the outbreak declaration to the qPCR introduction, and (b) the PCR period, from the introduction of the qPCR until the outbreak was solved. In all cases, S. marcescens isolates were recovered and their clonal relationship was analysed by PFGE. Control measures were implemented during the outbreak. Finally, the number of bloodstream infections (BSI) was investigated in order to evaluate the clinical impact of this molecular strategy.[Results] Nineteen patients colonized/infected by S. marcescens were detected in the pre-PCR period (October 2020–April 2021). On the contrary, after the PCR implementation, 16 new patients were detected. The PFGE revealed 24 different pulsotypes belonging to 7 different clonal groups, that were not overlapping at the same time. Regarding the clinical impact, 18 months after the qPCR implementation, no more outbreaks by S. marcescens have been declared in the NICU of our hospital, and only 1 episode of BSI has occurred, compared with 11 BSI episodes declared previously to the outbreak control.[Conclusions] The implementation of this qPCR strategy has proved to be a useful tool to control the nosocomial spread of S. marcescens in the NICU.A.R-V. and GM-G are supported by the Subprograma Juan Rodés, Instituto de Salud Carlos III, Subdirección General de Redes y Centros de Investigación Cooperativa, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, Spain (JR20/00023 and JR19/00039, respectively). JMOR is supported by the Subprograma Sara Borrell, Instituto de Salud Carlos III, Subdirección General de Redes y Centros de Investigación Cooperativa, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, Spain (CD21/00098).Peer reviewe
Metodologías colaborativas a través de las tecnologías: hacia una evaluación equitativa.
Presentación de buenas prácticas metodológicas en el área de tecnología educativa, transferidas por el Grupo de investigación consolidado GTEA, Universidad de Málaga (SEJ-462
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