Analysis of breeding typologies and cattle performance in order to evaluate strategies for the development of bovine genetic resources in Mali

L'élevage représente une activité importante dans l'économie du Mali où la production bovine est destinée tant à la consommation interne qu’à l’exportation vers certains pays de la sous-région. Actuellement, l’élevage périurbain se développe autour des grandes villes, notamment de Bamako. Ainsi, dans le souci d’assurer une autosuffisance en lait et le développement de cette filière, l’État du Mali a encouragé la constitution d’un réseau de collecte et accompagné la construction d’unités de transformation du lait. A ces actions s’ajoutent l’importation de génisses et/ou de taureaux à haut potentiel laitier et la promotion de l’insémination artificielle (IA). Malgré ces efforts, le secteur laitier est confronté à des difficultés telles que la faible productivité des animaux, la faiblesse des investissements, l’insuffisance de ressources fourragères et la récurrence de problèmes sanitaires. Les présents travaux de thèse doctorale s’intéressent à deux systèmes d’élevage au Mali: la production laitière périurbaine autour de Bamako et l’élevage extensif bovin au Nord du Mali. Ils partagent les défis mentionnés plus haut mais diffèrent par l’implication des acteurs, l’orientation économique des productions et la disponibilité des intrants (infrastructures, ressources financières, alimentaires et vétérinaires). Ces différents contextes nécessitent des besoins distincts en matière de gestion des ressources génétiques. Dans l’objectif de compréhension et d’amélioration de ces systèmes, le présent travail se propose de caractériser les races bovines élevées au Mali en vue de leurs valorisations. Pour ce faire, deux entités géographiques ont été concernées par cette étude: - La zone périurbaine de Bamako dans le but de déterminer (i) la typologie des élevages bovins, (ii) les performances de production et de reproduction des animaux (iii) et les préférences relatives des éleveurs pour certains caractères phénotypiques guidant le choix des races. - La zone sahélienne au Nord du Mali afin (iv) d’évaluer les performances zootechniques de la race zébu Azawak afin d’envisager son éventuelle spécialisation en race locale laitière. Afin de caractériser l’élevage des bovins dans la zone périurbaine de Bamako en termes de motivations socio-économiques, de pratiques d’élevage et de gestion des ressources génétiques, une enquête a été conduite auprès de 52 exploitations. Dans cette étude, une Analyse en Composante Principale (ACP) et une Classification Ascendante Hiérarchique (CAH) ont permis de dégager trois groupes d’éleveurs selon les modes de conduite des troupeaux. Un premier groupe mène de petits élevages pastoraux (50% de l’échantillon). Il est principalement constitué d’élevages traditionnels recourant aux races locales. Près de 95% des éleveurs de ce groupe sont analphabètes et la grande majorité d’entre eux (90%) ne pratique pas d’autres activités économiques non agricoles. Les animaux sont élevés dans des parcs communautaires sans aucun suivi des services vétérinaires. Le deuxième groupe présente un profil intermédiaire avec un système agropastoral dominant (40% de l’échantillon). Une intensification de la production laitière caractérisée par l’utilisation de meilleures infrastructures (parc individuel), de l’IA et/ou du croisement, et le recours aux services vétérinaires (88,5% des éleveurs) sont observés dans ce groupe. L’objectif principal des éleveurs de ce groupe est la production laitière. Le troisième groupe est caractérisé par de grands troupeaux mobiles (10% de l’échantillon). Les éleveurs de ce groupe présentent une orientation plus économique de leurs activités, qui se caractérise par la recherche d’une production laitière, la pratique de l’embouche bovine, la vente d’animaux sur pieds et l’exportation vers d’autres pays. Dans le but d’approfondir cette étude typologique, une analyse zootechnique a été réalisée sur les pratiques d’élevage. Ainsi, une seconde étude a été conduite dans la même zone entre janvier 2012 et décembre 2015 auprès des 17 éleveurs disposant d’un registre de suivi des activités d’élevage. Cette étude a permis de caractériser les performances de production et de reproduction des races bovines du système périurbain de Bamako. Les résultats ont montré une durée de l’intervalle entre les vêlages de 433 ± 115 jours pour les vaches de races locales Peul et Maure, contre 460 ± 80 jours pour les vaches issues de croisements avec les races exotiques. Cependant, la race locale zébu Azawak, dont le berceau se situe au nord du Mali, conduite dans les conditions d’élevage périurbaines, présente des performances de production inférieure à celles des autres races bovines locales. Sa production laitière par lactation a été de 636 ± 433 kg contre 681 ± 411 kg pour le zébu Peul. En vue de proposer une stratégie d’amélioration de la production laitière des races bovines au Mali, une troisième étude a été menée. Elle a permis d’estimer les valeurs que les éleveurs attribuent à différents critères d’élevage par la méthode d'analyse conjointe multi-attributs. Cette étude a concerné 120 éleveurs bovins dans la région périurbaine de Bamako. L'estimation économétrique de la fonction d'utilité des éleveurs a été réalisée à l’aide d’un modèle Logit conditionnel et la disposition à payer pour certains attributs a été calculée par le rapport entre chaque coefficient d’utilité des caractères et celle de l’unité monétaire. Le « consentement à payer » le plus élevé a été observé pour la race adaptée au système de production à faible niveaux d’intrants avec une valeur supplémentaire de 163€, composée de 70€ pour la forte résistance aux maladies, 69€ pour la faible demande alimentaire et 24€ pour une production laitière jugée supérieure. Pour investiguer davantage la possibilité pour le milieu périurbain d’opérer une sélection phénotypique sur une race pure de vache locale à tendance laitière (zébu Azawak), une autre enquête a été conduite dans cinq communes rurales du cercle de Ménaka en zone sahélienne du Mali. La collecte des données a porté sur 1129 animaux. L’âge au premier vêlage a été de 50 ± 11 mois avec un intervalle entre vêlages de 16 ± 4 mois. Afin de s’affranchir de l’usage de systèmes de pesée dans d’éventuels processus de sélection, des systèmes barymétriques ont été évalués. Les corrélations du poids avec le périmètre thoracique (r = 0,95) et la hauteur au garrot (r = 0,94) ont été les plus élevées. Des équations barymétriques ont été établies pour chaque catégorie animale (veau/velle, génisse/taurillon, vache/taureau) au moyen de régressions polynomiales du poids (y) sur le périmètre thoracique (x). Dans le cadre de la diffusion et du suivi des performances pondérales du zébu Azawak, cette mensuration mériterait d’être considérée à l’avenir. Cette étude a montré l’importance de l’élevage des bovins du type traditionnel dans ce milieu. Elle a caractérisé les performances de production et de reproduction de la race zébu Azawak. La compréhension des caractéristiques de ce système d’élevage permettra leur prise en compte au niveau des programmes d’amélioration génétique. Au regard des paramètres de reproduction intéressants du zébu Azawak, son introduction en milieu périurbain de Bamako pourrait servir de tremplin pour stimuler l’élevage bovin laitier surtout pour le type extensif traditionnel. En conclusion, l’ensemble des études permet d’avancer que le recours aux vaches croisées et/ou des races exotiques ne permet pas d’améliorer à elles seules la productivité des exploitations bovines au Mali. Il est dès lors nécessaire de développer une politique appropriée pour mieux planifier une stratégie adéquate d'amélioration de la production laitière par de croisements favorables à un développement durable de la production. La mise en place d’un schéma de croisement des races locales avec des races laitières étrangères impliquant tous les acteurs de la filière constituerait une stratégie possible à la gestion durable des races locales comme un pilier essentiel de ce schéma

Administration d'applications réparties à grande échelle

L'administration d'une application est une tâche de plus en plus complexe et coûteuse en ressources humaines et matérielles. Nous nous intéressons dans cette thèse à l’administration dans un contexte de grande échelle. Dans ce contexte particulier, nous disposons généralement de plusieurs entités logicielles qui doivent être déployées et gérées sur une infrastructure matérielle de type grille composée de nombreuses machines géographiquement dispersées. L’administration sur ce type d’infrastructure pose de multiples problèmes d’expressivité liés à la description des éléments à administrer, de performance liés à la charge des processus d'administration et la répartition géographique des sites de la grille, d’hétérogénéité matérielle et logicielle, et de dynamicité (panne, coupure de lien réseau, etc.). Nos contributions portent essentiellement sur les problèmes précédemment cités. Un formalisme de description tenant compte du facteur d’échelle est proposé pour décrire l'infrastructure matérielle et logicielle. Nous proposons la répartition de la charge et la diminution du coût de l’administration en utilisant plusieurs systèmes d’administration et en personnalisant la phase d’installation du déploiement. Enfin nous proposons une gestion de l’hétérogénéité matérielle et logicielle. Le travail de cette thèse s’inscrit dans le cadre du projet TUNe. Nous proposons donc une application et une implantation de ces contributions au système TUNe afin de valider notre approche dans le cadre d'une expérimentation en vraie grandeur. ABSTRACT : Administration of distributed systems is a task increasingly complex and expensive. It consists in to carry out two main activities : deployment and management of application in the process of running. The activity of the deployment is subdivided into several activities : description of hardware and software, conguration, installation and starting the application. This thesis work focuses on large-scale administration which consists to deploy and manage a distributed legacy application composed of several thousands of software entities on physical infrastructure grid made up of hundreds or thousands of machines. The administration of this type of infrastructure creates many problems of expressiveness, performance, heterogeneity and dynamicity (breakdown of machine, network, ...). These problems are generally caused to the scale and geographical distribution of the sites (set of clusters). This thesis contributes to resolve the problems previously cited. Therefore, we propose higher-level descriptions formalisms to describe the structure of hardware and software infrastructures. To reduce the load and increase the performance of the administration, we propose to distribute the deployment system in a hierarchical way in order to distribute the load. The work of this thesis comes the scope of the TUNe (autonomic management system) project. Therefore, we propose to hierarchize TUNe in order to adapt in the context of large-scale administration. We showhow to describe the hierarchy of systems. We also show how to take into account the specicity of the hardware infrastructure at the time of deployment notably the topology, characteristics and types of machine. We dene a process langage allowing to describe the process installation which allow managers to dene thier own installation constraints, according to their needs and preferences. We explore the management of heterogeneity during deployment. Finaly our prototype is validated by an implementation and in the context of a real experimentation

Accroissement et diversification de l'offre de produits laitiers au Sénégal : la bataille industrielle du lait en poudre à Dakar et des minilaiteries à la conquête des marchés des villes secondaires

Les travaux d'analyse de l'évolution de l'offre de produits laitiers au Sénégal, entre 2000 et 2005, ont mis en évidence un certain cloisonnement géographique des marchés avec une tendance à la diversification de l'offre de produits sur le marché de Dakar. Cette évolution est liée à la croissance des importations de lait en poudre et au développement d'un tissu d'industries, et de petites et moyennes entreprises / industries. La bataille commerciale que se livrent les importateurs et transformateurs industriels révèle la croissance de la demande et l'enjeu économique du marché dakarois. La filière locale, caractérisée par un accroissement du nombre de petites unités de transformation, se développe surtout dans les régions. Cependant, le dynamisme de ce secteur échappe aux décideurs politiques à Dakar du fait du confinement des minilaiteries sur les marchés des villes secondaires où elles sont implantées. L'Etat a privilégié la couverture des besoins des consommateurs dakarois avec des tarifs douaniers particulièrement bas pour la poudre de lait transformée qui bénéficie, de plus, de subventions dans les pays producteurs. Ses interventions sur la filière locale, basées sur l'intensification (insémination artificielle), n'ont pas permis de lever les multiples contraintes (santé animale, alimentation, eau, gestion de la qualité, collecte du lait de brousse...). Il semble dès lors nécessaire dans l'élaboration des politiques laitières d'examiner la filière de manière plus globale et de favoriser une concertation avec l'ensemble des acteurs des deux sous-filières pour accroître l'impact des décisions politiques, notamment en termes de sécurité alimentaire et de lutte contre la pauvreté en milieu rural. (Résumé d'auteur

Le syndrome de la pince aorto-mésentérique chez l’enfant : à propos d’un cas primitive

Le syndrome de la pince aorto-mésentérique résulte de la compression du troisième duodénum entre l’artère mésentérique supérieure et l’aorte. Elle détermine un tableau d’occlusion intestinale haute aiguë ou chronique. Nous faisons une revue de la littérature à partir d’un cas de syndrome de la pince aorto- mésentérique. Il s’agit d’un nourrisson de 16 mois suivi pour des vomissements alimentaires évoluant  depuis l'âge de 03 mois et rebelles au traitement médical. Il s’agit de vomissements postprandiaux tardifs d’apparition intermittente, améliorés par la position de décubitus ventral. Le bilan radiologique  composé d’une radiographie de l’abdomen sans préparation, d’un transit oeso-gastroduodénal (TOGD) et d’un angioscanner a permis d’aboutir au diagnostic d'obstruction extrinsèque et incomplète du 3ème duodénum par la pince aorto-mésentérique. Une dérivation interne par duodéno-jéjunostomie sur anse en oméga a permis de contourner l’obstacle vasculaire avec des suites simples. Le TOGD de contrôle du 9ème jour postopératoire a montré une bonne perméabilité de l’anastomose duodéno-jéjunale. Les  vomissements ont disparu et on note un gain pondéral de 2 kg en 3 mois. Les vomissements chroniques chez le nourrisson sont d’étiologies variées. L’obstacle siégeant au 3ème duodénum est le plus souvent dû à une pince aorto-mésentérique. Malheureusement ce diagnostic est  rarement porté surtout en Afrique probablement du fait de l’insuffisance des moyens diagnostiques en  particulier dans les zones reculées. Le traitement peut être fait par les moyens chirurgicaux ou nutritionnels.Key words: Syndrome de la pince aorto-mésentérique, duodéno-jéjunostomie, artère mésentérique supérieure, enfan

Arthropathies Microcristallines: à Propos de 150 cas a Sénégal

Objectif : Les arthropathies microcristallines sont classiquement considérées comme rares en Afrique sub-saharienne où la majorité des études porte sur la goutte. L’objectif de notre étude était de déterminer le profil épidémiologique des cas d’arthropathies microcristallines dans le service de rhumatologie du CHU Aristide Le Dantec. Matériel et méthodes : Il s’agit d’une étude rétrospective menée entre janvier 2002 et décembre 2016 dans le service de rhumatologie du CHU Aristide Le Dantec de Dakar. Nous avions inclus tous les dossiers des patients diagnostiqués pour arthropathies microcristallines selon les critères en vigueur. Résultats : Nous avons colligées 150 cas d’arthropathies microcristallines : 106 cas de gouttes, 37 cas de chondrocalcinose articulaire et 7 cas de rhumatisme apatitique. L’âge moyen des patients était de 58,12 ± 14,12 ans avec des extrêmes entre 31 et 91 ans. Quatre-vingt-douze (86,79%) patients atteints de goutte étaient des hommes et trente et un patients (83,8%) atteints de CCA étaient des femmes. Le délai diagnostique moyen des patients atteints d’arthropathies microcristallines était de 10,71±8,07 ans. La présentation clinique des arthropathies microcristallines était polyarticulaire (63 ; 42%), oligoarticulaire (48 ; 32%) et monoarticulaire (35 ; 23,3%) des cas. Les genoux et les chevilles étaient les articulations les plus touchées avec respectivement 40,7 et 20,7% des cas. L’hyperuricémie était constante et était associée à des facteurs de risque métabolique tel que l’obésité et la dyslipidémie avec respectivement 39,62 et 37,74 % des cas.  Conclusion : L’incidence de cette affection semble être en augmentation dans notre étude où elle est dominée, comme en Occident par la goutte. Le diagnostic des arthropathies microcristallines était tardif et sa présentation clinique et radiologique sévère. Cette sévérité est attribuable en partie au retard diagnostic ce qui est similaire aux formes rapportées chez le noir africain.   Objective: Microcrystalline arthropathies are classically considered rare in sub-Saharan Africa where the majority of studies focus on gout. The objective of our study was to determine the epidemiological profile of cases of microcrystalline arthropathy in the rheumatology department of the University Hospital of Dakar. Material and methods: This is a retrospective study conducted between January 2002 and December 2016 in the rheumatology department of Aristide Le Dantec University Hospital of Dakar. Microcrystalline arthropathies were diagnosed according to current criteria. Results: We collected 150 cases of microcrystalline arthropathies: 106 cases of gout, 37 cases of articular chondrocalcinosis and 7 cases of apatitic rheumatism. The average age of patients was 58.12 ± 14.12 years with extremes between 31 and 91 years. Ninety-two (86.79%) patients with gout were male and thirty-one (83.8%) patients with CCA were female. The average diagnostic delay of patients with microcrystalline arthropathies was 10.71 ± 8.07 years. The clinical presentation of microcrystalline arthropathies was polyarticular (63; 42%), oligoarticular (48; 32%) and monoarticular (35; 23.3%) of the cases. The knees and ankles were the most affected joints with respectively 40.7 and 20.7% of cases. Hyperuricemia was constant and was associated with metabolic risk factors such as obesity and dyslipidemia with respectively 39.62 and 37.74% of cases. Conclusion: The incidence of this condition seems to be increasing in our study where it is dominated, as in the West, by gout. The diagnosis of microcrystalline arthropathies was late and its clinical and radiological presentation severe. This severity is partly attributable to the delayed diagnosis, which is similar to the forms reported in black Africans

Les accidents de cyclomoteurs: mécanismes lésionnels et aspects anatomo-cliniques

Le but de notre étude est de décrire les mécanismes lésionnels et les aspects anatomo-cliniques des  traumatismes par accident de cyclomoteur. C'est une étude transversale menée au niveau du Centre  Hospitalier Régional de Kaffrine sur une période de 12 mois. Elle portait sur les patients admis au service d'accueil pour accident de la voie publique impliquant un cyclomoteur. Il s'agissait de 129 patients (112  hommes et de 17 femmes). L'âge moyen était de 30,5 ans. Soixante-treize patients étaient conducteurs de cyclomoteur, 31 piétons et 25 passagers arrière. Le mécanisme le plus fréquent était une chute de moto. Les lésions prédominaient au niveau des membres. Les accidents de cyclomoteur sont un problème de santé publique.Key words: Cyclomoteur, lésion, mécanisme, cliniqu

Muscular variations in the gluteal region, the posterior compartment of the thigh and the Popliteal fossa: Report of 4 cases

During a study of the sciatic nerve by anatomical dissection in the anatomy laboratory of the Faculty of Medicine and Odontostomatology (FMOS) of Bamako, 4 cases of muscle variations were observed in three male cadavers. The first case was the presence of an accessory femoral biceps muscle that originated on the fascia that covered the short head of the femoral biceps and ended on the head of the fibula joining the common tendon formed by the long and short head of the femoral biceps. The second case was the presence of an aberrant digastric muscle in the gluteal region and in the posterior compartment of the thigh. He had two bellies; the upper belly, considered as a piriform muscle accessory; the lower belly, considered a third head of the biceps femoral muscle; these two bellies were connected by a long tendon. The other two cases were the presence of third head of the gastrocnemius. These two cases were seen bilaterally in a cadaver. The anatomical variations of the hamstring muscles are rare and their knowledge is needed by radiologists and surgeons. The most common cause of popliteal artery entrapment syndrome is the presence of a third head of the gastrocnemius muscle