Olkiluoto biosphere description 2012

Posiva-raportti, tehtävänumero 721511

A distinctive DNA methylation pattern in insufficient sleep

Short sleep duration or insomnia may lead to an increased risk of various psychiatric and cardio-metabolic conditions. Since DNA methylation plays a critical role in the regulation of gene expression, studies of differentially methylated positions (DMPs) might be valuable for understanding the mechanisms underlying insomnia. We performed a cross-sectional genome-wide analysis of DNA methylation in relation to self-reported insufficient sleep in individuals from a community-based sample (79 men, aged 39.3 +/- 7.3), and in relation to shift work disorder in an occupational cohort (26 men, aged 44.9 +/- 9.0). The analysis of DNA methylation data revealed that genes corresponding to selected DMPs form a distinctive pathway: "Nervous System Development" (FDR P value <0.05). We found that 78% of the DMPs were hypomethylated in cases in both cohorts, suggesting that insufficient sleep may be associated with loss of DNA methylation. A karyoplot revealed clusters of DMPs at various chromosomal regions, including 12 DMPs on chromosome 17, previously associated with Smith-Magenis syndrome, a rare condition comprising disturbed sleep and inverse circadian rhythm. Our findings give novel insights into the DNA methylation patterns associated with sleep loss, possibly modifying processes related to neuroplasticity and neurodegeneration. Future prospective studies are needed to confirm the observed associations.Peer reviewe

Captaina : Integrated pronunciation practice and data collection portal

Peer reviewe

Common Genetic Variation Near Melatonin Receptor 1A Gene Linked to Job-Related Exhaustion in Shift Workers

Study Objectives: Tolerance to shift work varies; only some shift workers suffer from disturbed sleep, fatigue, and job-related exhaustion. Our aim was to explore molecular genetic risk factors for intolerance to shift work. Methods: We assessed intolerance to shift work with job-related exhaustion symptoms in shift workers using the emotional exhaustion subscale of the Maslach Burnout Inventory-General Survey, and carried out a genome-wide association study (GWAS) using Illumina's Human610-Quad BeadChip (n = 176). The most significant findings were further studied in three groups of Finnish shift workers (n = 577). We assessed methylation in blood cells with the Illumina HumanMethylation450K BeadChip, and examined gene expression levels in the publicly available eGWAS Mayo data. Results: The second strongest signal identified in the GWAS (p = 2.3 x 10E-6) was replicated in two of the replication studies with p Conclusions: These findings suggest that a variant near MTNR1A may be associated with job-related exhaustion in shift workers. The risk variant may exert its effect via epigenetic mechanisms, potentially leading to reduced melatonin signaling in the brain. These results could indicate a link between melatonin signaling, a key circadian regulatory mechanism, and tolerance to shift work.Peer reviewe

Environmental Stress Affects DNA Methylation of a CpG Rich Promoter Region of Serotonin Transporter Gene in a Nurse Cohort

Peer reviewe

Asuinympäristön viihtyvyyteen liittyvät preferenssit Laddering-menetelmällä tarkasteltuna

Oman asuinympäristön laadulla on tärkeä osa ihmisten elämässä. Kodin ja elinympäristön valinta on yksi elämän suuria valintoja. Jotta asukkaille voitaisiin tarjota heidän tarpeitaan vastaavia asuinalueita, on niitä voitava kehittää heidän tarpeidensa mukaisesti. Oikeansuuntainen kehittäminen onnistuu vain tunnistamalla ensin, mitä ominaisuuksia asuinalueilta odotetaan. Liiketaloudellisesti ajateltuna, asuinympäristöä voidaan pitää tuotteena ja asukasta tämän tuotteen kuluttajana. Kaikki hyvät tuotteet tarvitsevat tuotekehitystä. Suunnitelmallinen tuotekehitys perustuu luotettavaan tutkimustietoon. Tiedon saamiseksi tarvitaan tarkoitukseen soveltuvia tutkimusmenetelmiä. Tässä opinnäytetyössä käsitellään laadullisen tutkimusmenetelmän käyttöä asuinympäristötutkimuksessa. Tutkimusmenetelmänä on arvoketjumalliin perustuva Laddering-menetelmä, jonka soveltaminen asuinympäristön tutkimiseen on hyvin harvinaista. Tutkimuksen toteuttavat yhteistyössä Laurea-ammattikorkeakoulu, Teknillinen Korkeakoulu ja Valtion Teknillinen Tutkimuslaitos. Tutkimusprojektin nimi on Vocup (The Voice of Customers in the Construction and Development Process of Housing). Tämä opinnäytetyö on varsinaisen tutkimusprojektin pilottitutkimus. Esitys voidaan jakaa rakenteellisesti kolmeen osaan. Ensin esitellään projektin tausta ja toteuttajat. Loppuosa raportista on jaettu aineistonkeruu- ja aineistonkäsittelyosioihin Aineistonkeruuosiossa kerrotaan prosessiluonteisesti projektin aloittamisesta ja aineistonkeruun haasteista. Aineistonkäsittelyosiossa havainnollistetaan tutkimusmenetelmän toimintaa ja esitellään tutkimuksen tulokset. Lisäksi osion lopussa arvioidaan tutkimuksen onnistuneisuutta ja menetelmän käyttökelpoisuutta asuinympäristötutkimuksessa. Opinnäytetyössä esitetty prosessikuvaus ja tutkimusmenetelmän esittely on käyttökelpoinen opas vastaavan tutkimuksen suorittajalle. Opinnäytetyön tekijä on osallistunut tutkimusprosessin vaiheisiin ja kertoo työssä omista kokemuksistaan. Tutkimuksen ollessa varsin laaja ja pitkäkestoinen, sen lopullisia tuloksia ei päästä vielä käsittelemään tässä esityksessä. Työ toimii osittain myös ns. pilottina varsinaista tutkimusta varten.Residential development -survey by Laddering method The quality of the surroundings of an individual has an important role in the lives of people. Choosing a home and environment is generally one of the biggest choices in life. To ensure that people are to be offered residential developments which suit their needs, it is essential to build them according to residents’ needs. In order to develop areas appropriately, one has to recognise features which people pursue in searching for a satisfactory environment. From an economic point of view, living environments are considered as products. Residents are seen as consumers of those products. In the background of a well-planned product development there has to be reliable knowledge provided by a survey. In order to create that knowledge, an appropriate research method is needed. The objective of this thesis is to present use of qualitative research in a residential development survey. The method is the laddering method based on the means-end-chainvalue model. Using this method to study this subject is rare. The survey is performed cooperatively. Laurea University of Applied Sciences, Helsinki University of Technology and The Technical Research Centre of Finland are working together to improve the quality of residential developments. The name of the project is VOCUP (The Voice of Customers in the Construction and Development Process of Housing). The structure of this report consists of three parts. In the first part the background and the performers of the project are presented. The second and the third section of the report present the collection and processing of the data. The data collection section explains the starting of the project and the challenges in collecting data. In the data processing section the research method is presented, including the results of the research. In the end of this section also the success of the research is discussed as well as the function of the method in research on residential developments. This report functions as a pilot to a complete research project. The author of this thesis has participated in all parts of the research and reveals his own experiences. This is a description of the research method, data- collection and analysis. As the research is wide and longstanding, the final results are not examined in this report

Otsonin käyttö karieksen pysäytyshoidossa

Tässä opinnäytetyössä selvitettiin kirjallisuuskatsauksen avulla otsonihoidon vaikutuksia hammaskarieksen pysäytyshoidossa sekä potilaiden asenteita otsonihoitoa kohtaan. Tavoitteena oli luoda tiivis yhteenveto, josta sekä suun terveydenhuollon ammattilaiset että potilaat voivat saada perustietoa otsonihoidosta ja sen tehokkuudesta karieksen pysäytyshoidossa. Opinnäytetyön teoreettisissa lähtökohdissa tarkastellaan karieksen etiologiaa ja siihen liittyviä käsitteitä sekä esitellään karieksen perinteiset hoitomuodot, joiden rinnalla voidaan käyttää otsonihoitoa. Osiossa esitetään myös karieksen hallinnan kokonaisvaltaista hoitoa ohjaava malli, suuhygienistin rooli hoitoprosessissa sekä perustiedot otsonista ja otsonihoidosta. Opinnäytetyö etenee esittelemällä opinnäytetyön toteuttamisen prosessin ja päättyy otsonihoidosta tehtyjen tutkimusten ja tutkimustulosten esittelyyn sekä analyysiin. Tutkimusten etsimiseen käytettiin sekä manuaalista hakua että sähköisiä tietokantoja, kuten CINAHL, Medic, Google Scholar, Medline ja Cochrane. Aineistolle asetettiin erilaisia kriteerejä ja niistä valittiin ainoastaan ehdot täyttävät tutkimukset. Tutkimusten hakemisessa käytettiin hakusanoina esim. seuraavia virkkeitä: Ozone therapy in dentistry ja Ozone therapy in treating caries. Kirjallisuuskatsaukseen löytyi 13 hakukriteerit täyttävää tutkimusta, joista kaikki ovat ulkomailla toteutettuja. Analyysimenetelmänä käytettiin luokittelua, jossa tulokset esitetään vastauksina tutkimuskysymyksiin. Tulosten mukaan otsonihoito on tehokas hoitomenetelmä ja lisäapu karieksen perinteisten pysäytyshoitokeinojen rinnalle. Lähes kaikki katsauksessa mukana olleet tutkimukset osoittavat otsonihoitojen pysäyttävän tai kääntävän hampaan kovakudoksen liukenemisen takaisin ehjäksi kudokseksi. Myös potilaiden asenteet otsonihoitoja kohtaan ovat myönteisiä. Lisätutkimuksia tarvitaan kuitenkin otsonihoitojen tehokkuudesta karieksen pysäyttämisessä pidemmällä aikavälillä. Myös otsonihoitojen kustannustehokkuus perinteisten hoitomuotojen rinnalla vaatii lisäselvityksiä.The purpose of this thesis was to assess the ozone treatment effectivity to arrest or re-verse the progression of dental caries as well to assess the patients’ attitude to the method. The aim was to produce information for all of the oral health care professionals and patients about the ozone treatment and its effictivity in arresting or reversing the progression of caries. The theoretical frame introduces the etiology of dental caries and the related concepts as well presents the traditional treating methods which can be supported with the ozone treatment. This part also contains the guiding model of arresting and reversing the caries, the role of a dental hygienist in caries management and the basics of ozone and the ozone treatment. The thesis continues with the presentation of the process of the thesis composition and finishes with the presentation of ozone treatment studies, study results and analysis. The thesis was implemented as a literature study. The included studies were looked up manually from electronic databases (CINAHL, Medic, Google Scholar, Medline and Cochrane). The exact criteria were set for all of the searches and only the studies which met the criteria were chosen. The studies were searched with using keywords, e.g. Ozone therapy in dentistry and Ozone therapy in treating caries. All together there were 13 studies which met the criteria; all of these were foreign. The material was analysed using the classification method where all of the results were presented as answers for the research questions. The results of the literature analysis prove that the ozone treatment is effective to arrest or reverse the progression of dental caries and would be a useful method alongside with the traditional caries treatment. Almost all of the analysed studies showed ozone’s ability to arrest the demineralization of tooth enamel and switch the process back to remineralization phase. According to the results the patients have also a high acceptance of this treatment regime using ozone. Still further research about long-term effects and cost-effectiveness of ozone treatment is needed

Pohjoisen ruton muuttuminen ajan kuluessa : perunan tyvi- ja märkämätä

vo