PRELI is a mitochondrial regulator of human primary T-helper cell apoptosis, STAT6, and Th2-cell differentiation

The identification of novel factors regulating human T helper (Th)–cell differentiation into functionally distinct Th1 and Th2 subsets is important for understanding the mechanisms behind human autoimmune and allergic diseases. We have identified a protein of relevant evolutionary and lymphoid interest (PRELI), a novel protein that induces oxidative stress and a mitochondrial apoptosis pathway in human primary Th cells. We also demonstrated that PRELI inhibits Th2-cell development and down-regulates signal transducer and activator of transcription 6 (STAT6), a key transcription factor driving Th2 differentiation. Our data suggest that calpain, an oxidative stress–induced cysteine protease, is involved in the PRELI-induced down-regulation of STAT6. Moreover, we observed that a strong T-cell receptor (TCR) stimulus induces expression of PRELI and inhibits Th2 development. Our results suggest that PRELI is involved in a mechanism wherein the strength of the TCR stimulus influences the polarization of Th cells. This study identifies PRELI as a novel factor influencing the human primary Th-cell death and differentiation

Inarijärven tilan kehittyminen vuosina 1960–2009

Inarijärvestä on olemassa kohtuullisen hyvin tutkimus- ja seurantatietoa usean vuosikymmenen ajalta, mikä antaa hyvät mahdollisuudet järven tilaa ja sen kehittymistä kuvaavien mittareiden kehittämiseen ja hyödyntämiseen. Työssä pyrittiin löytämään tutkimus- ja seuranta-aineistoon perustuvia mittareita, jotka kuvaavat monipuolisesti Inarijärven tilaa ja käyttöä, etenkin järven yleisiä hydrologisia ja meteorologisia olosuhteita ja niiden kehittymistä (ilmastonmuutos), järveen tulevaa kuormitusta ja veden laatua, virkistyskäyttöä, rantavyöhykkeen eliöyhteisöjen tilaa, kalakantoja ja kalastusta sekä säännöstelykäytäntöä ja säännöstelyn vaikutuksia. Tavoitteena oli kuvata myös eri muuttujien välisiä vuorovaikutuksia. 2000-luvulla toteutetulla Inarijärven vesiluonnon tilan kannalta aikaisempaa paremmalla säännöstelykäytännöllä on parannettu virkistyskäytön olosuhteita kesällä ja osittain vähennetty säännöstelyn aiheuttamia haittoja rantavyöhykkeen eliöstöön. Vesistön tilan ja käytön kannalta eniten myönteisiä muutoksia on tapahtunut kalakannoissa. Punalihaisten petokalojen saaliit, yksikkösaaliit ja saaliskalojen koko ovat suurentuneet 2000-luvulla hyvän muikkukannan ja tuloksellisten istutusten ansiosta. Inarijärven hydrologisissa mittareissa on havaittavissa merkkejä ilmaston lämpenemisestä. Julkaisu tarjoaa kattavan yhteenvedon Inarijärven tilasta ja sen kehittymisestä viime vuosikymmeninä. Raportin tuloksia voidaan hyödyntää mm. säännöstelykäytännön ja kalaston hoidon kehittämisessä sekä matkailussa, opetuksessa ja yleisessä viestinnässä. Tarkastelu tukee myös vesienhoitotyötä, koska se auttaa ymmärtämään biologisten laatutekijöiden tilaan vaikuttavia tekijöitä ja selittämään syitä järven ekologisen tilan kehityssuunnille. Työssä kehitettyä lähestymistapaa ja mittareita voidaan soveltuvin osin hyödyntää myös muissa vesistöissä

An artificial intelligence approach to remotely assess pale lichen biomass

Although generally given little attention in vegetation studies, ground-dwelling (terricolous) lichens are major contributors to overall carbon and nitrogen cycling, albedo, biodiversity and biomass in many high-latitude ecosystems. Changes in biomass of mat-forming pale lichens have the potential to affect vegetation, fauna, climate and human activities including reindeer husbandry. Lichens have a complex spectral signature and terricolous lichens have limited growth height, often growing in mixtures with taller vegetation. This has, so far, prevented the development of remote sensing techniques to accurately assess lichen biomass, which would be a powerful tool in ecosystem and ecological research and rangeland management. We present a Landsat based remote sensing model developed using deep neural networks, trained with 8914 field records of lichen volume collected for > 20 years. In contrast to earlier proposed machine learning and regression methods for lichens, our model exploited the ability of neural networks to handle mixed spatial resolution input. We trained candidate models using input of 1 x 1 (30 x 30 m) and 3 x 3 Landsat pixels based on 7 reflective bands and 3 indices, combined with a 10 m spatial resolution digital elevation model. We normalised elevation data locally for each plot to remove the region-specific variation, while maintaining informative local variation in topography. The final model predicted lichen volume in an evaluation set (n = 159) reaching an R2 of 0.57. NDVI and elevation were the most important predictors, followed by the green band. Even with moderate tree cover density, the model was efficient, offering a considerable improvement compared to earlier methods based on specific reflectance. The model was in principle trained on data from Scandinavia, but when applied to sites in North America and Russia, the predictions of the model corresponded well with our visual interpretations of lichen abundance. We also accurately quantified a recent historic (35 years) change in lichen abundance in northern Norway. This new method enables further spatial and temporal studies of variation and changes in lichen biomass related to multiple research questions as well as rangeland management and economic and cultural ecosystem services. Combined with information on changes in drivers such as climate, land use and management, and air pollution, our model can be used to provide accurate estimates of ecosystem changes and to improve vegetation-climate models by including pale lichens.Peer reviewe

New national and regional biological records for Finland 7. Contributions to Bryophyta and Marchantiophyta

Three species of mosses (Bryophyta: Philonotis yezoana, Protobryum bryoides, Rhynchostegiummurale) and one of liverworts (Marchantiophyta: Moerckia flotoviana) are presented new for Finland.Timmia megapolitana, previously thought to be regionally extinct, is reported to being foundagain. New records in biogeographical provinces for 82 species of mosses and 34 species of liverwortsare listed. Finally, 8 occurrences in provinces are removed due to misidentifications ormissing specimens.</p

Biologian kenttäopetus yliopistoissa: yhteistyöllä uuteen nousuun

Kenttäkurssit ovat keskeinen osa biologian ja lähitieteiden opetusta yliopistoissa. Luonnossa tapahtuva opetus kehittää sekä ymmärrystä tieteenalan teoreettisista perusteista että ammatillisia käytännön taitoja. Kenttäkursseilla omat havainnot muodostuvat oppimisen perustaksi muiden oppimistapojen rinnalla. Vaikka kenttäopetuksen tarpeellisuudesta ollaan yksimielisiä, kenttäkursseja uhkaavat yliopistojen rahoituksen väheneminen ja tutkimusasemaverkoston karsiminen. Tässä kirjoituksessa pohdimme, kuinka uhkista huolimatta kenttäopetuksen määrää, laatua ja kustannustehokkuutta voidaan lisätä yliopistojen ja niiden tutkimusasemien välisellä yhteistyöllä.</p

New national and regional biological records for Finland 11. Contributions to Bryophyta and Marchantiophyta 10

Ten species of mosses (Bryophyta: Entosthodon obtusus, Entosthodon ulvinenii, Eurhynchiastrum diversifolium, Hedwigia emodica, Hedwigia mollis, Hygrohypnum styriacum, Plagiothecium rossicum, Polytrichum perigoniale, Tortella alpicola and Ulota intermedia) are presented as new for Finland. Cephalozia lacinulata, previously considered to be regionally extinct from Finland, is reported to being found again. New records in biogeographical provinces for 67 species of mosses and 34 species of liverworts are listed. Finally, 6 occurrences in provinces are removed due to misidentifications or missing specimens