Change of tRNA identity leads to a divergent orthogonal histidyl-tRNA synthetase/tRNAHis pair

Mature tRNAHis has at its 5′-terminus an extra guanylate, designated as G−1. This is the major recognition element for histidyl-tRNA synthetase (HisRS) to permit acylation of tRNAHis with histidine. However, it was reported that tRNAHis of a subgroup of α-proteobacteria, including Caulobacter crescentus, lacks the critical G−1 residue. Here we show that recombinant C. crescentus HisRS allowed complete histidylation of a C. crescentus tRNAHis transcript (lacking G−1). The addition of G−1 did not improve aminoacylation by C. crescentus HisRS. However, mutations in the tRNAHis anticodon caused a drastic loss of in vitro histidylation, and mutations of bases A73 and U72 also reduced charging. Thus, the major recognition elements in C. crescentus tRNAHis are the anticodon, the discriminator base and U72, which are recognized by the divergent (based on sequence similarity) C. crescentus HisRS. Transplantation of these recognition elements into an Escherichia coli tRNAHis template, together with addition of base U20a, created a competent substrate for C. crescentus HisRS. These results illustrate how a conserved tRNA recognition pattern changed during evolution. The data also uncovered a divergent orthogonal HisRS/tRNAHis pair

Emerging Infectious Disease leads to Rapid Population Decline of Common British Birds

Emerging infectious diseases are increasingly cited as threats to wildlife, livestock and humans alike. They can threaten geographically isolated or critically endangered wildlife populations; however, relatively few studies have clearly demonstrated the extent to which emerging diseases can impact populations of common wildlife species. Here, we report the impact of an emerging protozoal disease on British populations of greenfinch Carduelis chloris and chaffinch Fringilla coelebs, two of the most common birds in Britain. Morphological and molecular analyses showed this to be due to Trichomonas gallinae. Trichomonosis emerged as a novel fatal disease of finches in Britain in 2005 and rapidly became epidemic within greenfinch, and to a lesser extent chaffinch, populations in 2006. By 2007, breeding populations of greenfinches and chaffinches in the geographic region of highest disease incidence had decreased by 35% and 21% respectively, representing mortality in excess of half a million birds. In contrast, declines were less pronounced or absent in these species in regions where the disease was found in intermediate or low incidence. Also, populations of dunnock Prunella modularis, which similarly feeds in gardens, but in which T. gallinae was rarely recorded, did not decline. This is the first trichomonosis epidemic reported in the scientific literature to negatively impact populations of free-ranging non-columbiform species, and such levels of mortality and decline due to an emerging infectious disease are unprecedented in British wild bird populations. This disease emergence event demonstrates the potential for a protozoan parasite to jump avian host taxonomic groups with dramatic effect over a short time period

Aggressiveness and biocontrol of Rosellinia bunodes in poplar.

Agressividade e biocontrole de Rosellinia bunodes em álamo. A roseliniose, causada pelo fungo Rosellinia bunodes, tem ganhado destaque devido a incidência em plantios comerciais de espécies florestais, como o álamo. Em razão da ausência de produtos fitossanitários registrados para esta cultura no Brasil, o controle cultural, muitas vezes ineficiente, torna-se a única opção para o controle desta doença. Na busca de soluções deste problema, o controle biológico vem de encontro com as necessidades da implantação de um sistema mais sustentável. Objetivou-se com este trabalho avaliar a agressividade de isolados de R. bunodes em álamo e a capacidade antagônica in vitro e in vivo de isolados de Trichoderma spp. no controle desse fitopatógeno. Para o ensaio de agressividade, mudas sadias de álamo foram plantadas em substrato inoculado com nove isolados de R. bunodes. Os testes de antagonismo em confrontação direta, produção de compostos voláteis e não voláteis foram realizados entre 30 isolados de Trichoderma spp. e o isolado R2 de R. bunodes. No teste in vivo, os tratamentos consistiram em diferentes datas de plantios das mudas em substrato infestado com o fungo antagonista e o fitopatógeno. Os isolados R2, R3, R3A, R6 e R8 de R. bunodes se mostraram mais agressivos que os demais. Dos 30 isolados de Trichoderma spp., doze podem ser considerados potenciais agentes de biocontrole, devido à alta capacidade competitiva e supressão do crescimento micelial de R. bunodes. O maior o tempo de exposição entre o patógeno e o agente antagonista no substrato apresentou a menor incidência da roseliniose em álamo.Made available in DSpace on 2019-09-03T19:08:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2019AlvaroFAgressiveness.pdf: 234791 bytes, checksum: 9f2d5c7837d9894222dd55ed0469febc (MD5) Previous issue date: 2019bitstream/item/201450/1/2019-Alvaro-F-Agressiveness.pd

Uso do Trichoderma em culturas florestais.

As espécies florestais mais plantadas no Brasil são o eucalipto (Eucalyptus spp.), com quase seis milhões de hectares, distribuído em quase todo o Brasil, seguido do pínus (Pinus taeda e P. elliottii) com cerca de dois milhões de hectares, mais limitado à região Sul. Além destas espécies temos a seringueira (Hevea brasiliensis (Wild. ex. A. Juss) Mell. Arg.), com 229.000 ha, acácia-negra (Acacia mernsii Wild.), com 160.000 ha, paricá (Schizolobium amazonicum Huber ex Ducke), com 90.000 ha, teca (Tectona grandis L. f.;), com 87.000 ha e o álamo (Populus deltoides) com 4.200 ha. Temos também as espécies florestais não madeireiras como a erva-mate (Ilex paraguariensis A. St.- Hil.), com 98.000 ha (IBÁ, 2017) e a pupunheira (Bactris gasipaes Kunth. var. gasipaes Henderson), com 20.000 ha (Penteado Junior et al., 2014). Devido à importância socioeconômica que essas culturas apresentam, torna-se necessário maior atenção para seus problemas fitossanitários, a fim de que estes não venham a limitar seus cultivos no Brasil. Algumas doenças têm causado danos significativos e há poucas pesquisas na área florestal buscando estratégias alternativas de controle, especialmente com medidas de controle biológico. Assim, neste capítulo serão discutidos oito estudos de caso, com ênfase para o controle biológico utilizando Trichoderma em alguns patossistemas florestais, conforme segue: Rosellinia bunodes x álamo, Phytophthora palmivora x pupunheira, Armillaria sp. x pínus, Fusarium spp. x erva-mate, Lasiodiplodia theobromae x teca, Rhizoctonia solani x eucalipto, Cylindrocladium spp. x eucalipto e Fusarium spp. x sementes de pínus

Physiological characterization of Rosellinia bunodes and symptomatology of Rosellinia root rot in poplar seedlings.

O álamo (Populus deltoides) é uma espécie florestal que possui diversos problemas fitossanitários, como a ocorrência de manchas foliares, ferrugens e podridões radiculares. Desde 2010 tem-se verificado a morte de árvores em plantios comerciais no estado do Paraná, Brasil, ocasionados pelo fungo Rosellinia bunodes. Devido a carência de informações sobre este patossistema, objetivou-se com esse trabalho, realizar a caracterização fisiológica de isolados de R. bunodes e sintomatológica da roseliniose em álamo. Os experimentos foram conduzidos na Embrapa Florestas, localizada no município de Colombo (PR), Brasil. O crescimento micelial de nove isolados de R. bunodes foi avaliado em quatro meios de cultura (batata-dextrose-ágar, V8- ágar, cenoura-ágar e ágar-água) e sete temperaturas (8, 12, 16, 20, 24, 28 e 32 °C). A caracterização sintomatológica da roseliniose foi realizada em mudas de álamo, com aproximadamente seis meses de idade. As condições mais favoráveis ao crescimento micelial de R. bunodes foram observadas no meio de cultura batata-dextroseágar (BDA) a temperatura de 24 °C. Os sintomas e sinais do patógeno internamente ao caule mostraramse aparentes aos 7 dias após a inoculação (DAI); por outro lado, os sintomas de clorose associada a murcha tornaram-se visíveis apenas aos 14 DAI. Não foram observadas estruturas reprodutivas sexuadas e assexuadas de R. bunodes nas plantas inoculadas.Made available in DSpace on 2018-11-01T00:56:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018AlvaroRAPhysiological.pdf: 795592 bytes, checksum: ee722272ef9d9d38baf4fc6ebdcc81a3 (MD5) Previous issue date: 2018-10-31bitstream/item/185356/1/2018-Alvaro-RA-Physiological.pd