Perinatal mortality by gestational week and size at birth in singleton pregnancies at and beyond term: a nationwide population-based cohort study

Background: Whether gestational age per se increases perinatal mortality in post-term pregnancy is unclear. We aimed at assessing gestational week specific perinatal mortality in small-for-gestational-age (SGA) and non-SGA term and post-term gestations, and specifically to evaluate whether the relation between post-term gestation and perinatal mortality differed before and after ultrasound was introduced as the standard method of gestational age estimation. Methods: A population-based cohort study, using data from the Medical Birth Registry of Norway (MBRN), 1967–2006, was designed. Singleton births at 37 through 44 gestational weeks (n = 1 855 682), excluding preeclampsia, diabetes and fetal anomalies, were included. Odds ratios (OR) with 95% confidence intervals (CI) for perinatal mortality and stillbirth in SGA and non-SGA births by gestational week were calculated. Results: SGA infants judged post-term by LMP had significantly higher perinatal mortality than post-term non-SGA infants at 40 weeks, independent of time period (highest during 1999–2006 [OR 9.8, 95% CI: 5.7-17.0]). When comparing years before (1967–1986) versus after (1987–2006) ultrasound was introduced, there was no decrease in the excess mortality for post-term SGA versus non-SGA births (ORs from 6.1 [95% CI: 5.2-7.1] to 6.7 [5.2-8.5]), while mortality at 40 weeks decreased significantly (ORs from 4.6, [4.0-5.3] to 3.2 [2.5-3.9]). When assessing stillbirth risk (1999–2006), more than 40% of SGA stillbirths (11/26) judged to be ≥41 weeks by LMP were shifted to lower gestational ages using ultrasound estimation. Conclusions: Mortality risk in post-term infants was strongly associated with growth restriction. Such infants may erroneously be judged younger than they are when using ultrasound estimation, so that the routine assessment for fetal wellbeing in the prolonged gestation may be given too late

Kysttorsken vår er sterkt truet

publishedVersio

Unge gutters tanker om maskulinitet og mannsroller: Hvordan det er å være ung gutt i dagens samfunn

Postponed access: the file will be accessible after 2019-05-31Denne studien undersøker hvordan unge gutter i to ulike utdanningssituasjoner gir mening til maskulinitet og mannsroller, og diskuterer hvordan det er å være gutt i dagens samfunn. I media er det rettet stort fokus på jenter og det presset de utsettes for, enten det er kroppspress eller prestasjonspress, der gutter er en mindre representert gruppe. Dette er bakgrunnen for at studien ble gjennomført. Gutter opplever gjerne det samme presset som jenter gjør, men på noe ulik måte. Formålet med studien er å bidra med et nyansert bilde av hvordan det er å være ung gutt i dagens samfunn, og dette kan arte seg forskjellig hos ulike grupper gutter. Den overordnede problemstillingen i oppgaven er: Hva tenker unge gutter om maskulinitet og mannsroller, og hva tenker de er mannsidealet? For å besvare denne problemstillingen har jeg gjennomført fire fokusgruppeintervjuer med gutter på studiespesialiserende og yrkesfaglig utdanning. Det å sammenligne studiespesialiserende og yrkesfaglige gutter ble gjort på bakgrunn av tanker om generelle forskjeller innad i studieretningene som kjønnsbalanse, hvilket arbeidsmarked de skal ut i, og at det er ulikheter dem i mellom når det kommer til sosial bakgrunn. Målet med studien har ikke vært teoritesting, men teorigenerering der dataanalysen er inspirert av grounded theory som tilnærming. Datamaterialet vil tolkes gjennom en tematisk analyse, hvor en får innblikk i hva informantene sier om og gir mening til oppgavens temaer. Det å vokse opp i dagens samfunn er ulikt fra hvordan det var å vokse opp for bare noen tiår siden. Sosiale medier bidrar til å skape felles idealer i samfunnet. Dette er noe som kommer til uttrykk i fokusgruppeintervjuene. Det er påfallende hvor like tanker de to gruppene har om de forskjellige temaene tatt opp i oppgaven, og informantene er sterkt influert av inntrykk de får gjennom sosiale medier. Til tross for dette er det flere forskjeller i hvordan de gir mening til temaene. Maskulinitet og mannsroller utspiller seg ulikt med tanke på hva informantene tenker om begrepene, og hva de ser for seg når de skal beskrive idealmannen. Studien viser at utdanningssituasjonen til de to gruppene spiller en sentral rolle i hvordan de gir mening til temaene, der det kom frem ulike krav til det å være mann i dagens samfunn. Kropp er et av gutters mest sentrale virkemiddel i uttrykking av maskulinitet og mannsroller. I de yrkesfaglige gruppene ble muskler ilagt mest vekt, og for dem, ble muskler sett på som et symbol på maskulinitet. I de studiespesialiserende gruppene er muskler mindre viktig, og en sunn kropp var et kroppsideal for dem. De tenkte at gutter ikke brydde seg nok, og at humor rundt kroppen, påførte gutter mindre følelse av press til å oppnå samfunnets kroppsideal. Skillelinjene mellom femininitet og maskulinitet synes å bli mindre i dagens samfunn, og alle gruppene tenkte at en gutt kan kombinere feminine og maskuline trekk. Til tross for dette finnes det indikasjoner på at guttene ønsker å oppfattes som maskuline heller enn feminine, og ønsket om å være mann fremkommer som et ideal. Hvordan en er mann, var det imidlertid litt forskjellige tanker rundt. De yrkesfaglige gruppene la stor vekt på tøffhet, barskhet, ureddhet og fysisk styrke, mens i de studiespesialiserende gruppene var ikke dette like fremtredende. De tenkte at ens samfunnsposisjon sier mer om den mannen en er. De verdsetter lederrollen som den fremste bæreren av maskulinitet, og mente at menn skulle velge mer prestisjefulle yrker, og utøve makt og dominans over andre mennesker. Det så de på som et klart tegn på maskulinitet, eller det å være en ekte mann. Oppgavens siste analysekapittel tar for seg menn i samfunnet, der fokuset ligger på sosiale medier og yrkeslivet. Sosiale medier er i følge informantene nesten hele grunnen til at det eksisterer kroppspress blant gutter. Det har vært hevdet at kjendiser kan bidra til uoppnåelige kroppsbilder, men en sammenligning med kjendiser er ikke noe informantene tenkte at gutter gjør. Den sosiale sammenligningen skjer mellom venner og bekjente, der det foreligger like egenskaper som gjør det meningsfullt å sammenligne. Det finnes indikasjoner på at gutter spesielt, er preget av prestasjonspress, der mannsrollen skal presteres. Er en venn flinkere innen et felt som er ansett som mannlig, vil det være konkurranse om å slå denne vennen. Det å være ypperst i noe som mann, er viktig, så lenge feltet ikke ansees som kvinnelig. Dette gikk igjen i begge gruppene. Når informantene diskuterte hvilke forskjeller de tror det er mellom yrkesfaglige og studiespesialiserende grupper, kom også forskjellene tidligere i oppgaven, tydeligere frem. For de yrkesfaglige gruppene vil muskler spille en rolle i deres arbeidshverdag, og derfor blir også muskler en stor del av hvordan de ser på det å være en mann. For de studiespesialiserende guttene er karakterer det som ansees som viktigst for dem, og kroppen har mindre å si for deres fremtid. De ser for seg en fremtid med yrker hvor makt og dominans er fremtredende. Studien bidrar til å se nærmere på hvordan gutter har det i dagens samfunn, og hvordan normer for maskulinitet og mannsroller er med på å prege hvordan de fremstiller seg selv. Guttene har selv uttalt at maskulinitet og mannsroller ikke er spesielt viktig for deres hverdag, men ut ifra svarene jeg har fått, er det mye som tyder på at dette fungerer som en underliggende faktor i hvordan de lever sine liv.SOS360MASV-SO

Redox regulation in Atlantic cod (Gadus morhua) embryos developing under normal and heat-stressed conditions

With regard to predicted oceanic warming, we studied the effects of heat stress on the redox system during embryonic development of Atlantic cod (Gadus morhua), with emphasis on the glutathione balance, activities of key antioxidant enzymes, and their mRNA levels. The embryos were incubated at optimal temperature for development (6 °C) or slightly above the threshold temperature (10 °C). The regulation of all the redox-related parameters measured at optimum development was highly dynamic and complex, indicating the importance of both maternal and zygotic contributions to maintaining redox equilibrium. Development at 10 °C caused a significantly higher mortality at the blastula and early gastrula stages, indicating severe stress. Measures of the glutathione redox couple showed a significantly more reduced state in embryos at 10 °C compared to 6 °C at the post-gastrula stages. Mean normalized expression of nrf2, trxred, g6pd, gclc, nox1, CuZnsod, and mt in embryos kept at 10 °C revealed stage-specific significantly reduced mRNA levels. Activities of antioxidant enzymes changed both during ontogenesis and in response to temperature, but did not correlate with mRNA levels. As the embryos need a tightly regulated redox environment to coordinate between growth and differentiation, these findings suggest that the altered redox balance might participate in inducing phenotypic changes caused by elevated temperature.publishedVersio

Integrating protein structural dynamics and evolutionary analysis with Bio3D

Abstract Background Popular bioinformatics approaches for studying protein functional dynamics include comparisons of crystallographic structures, molecular dynamics simulations and normal mode analysis. However, determining how observed displacements and predicted motions from these traditionally separate analyses relate to each other, as well as to the evolution of sequence, structure and function within large protein families, remains a considerable challenge. This is in part due to the general lack of tools that integrate information of molecular structure, dynamics and evolution. Results Here, we describe the integration of new methodologies for evolutionary sequence, structure and simulation analysis into the Bio3D package. This major update includes unique high-throughput normal mode analysis for examining and contrasting the dynamics of related proteins with non-identical sequences and structures, as well as new methods for quantifying dynamical couplings and their residue-wise dissection from correlation network analysis. These new methodologies are integrated with major biomolecular databases as well as established methods for evolutionary sequence and comparative structural analysis. New functionality for directly comparing results derived from normal modes, molecular dynamics and principal component analysis of heterogeneous experimental structure distributions is also included. We demonstrate these integrated capabilities with example applications to dihydrofolate reductase and heterotrimeric G-protein families along with a discussion of the mechanistic insight provided in each case. Conclusions The integration of structural dynamics and evolutionary analysis in Bio3D enables researchers to go beyond a prediction of single protein dynamics to investigate dynamical features across large protein families. The Bio3D package is distributed with full source code and extensive documentation as a platform independent R package under a GPL2 license from http://thegrantlab.org/bio3d/ .http://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/109747/1/12859_2014_Article_399.pd

The first mitochondrial 5-methylcytosine map in a non-model teleost (Oreochromis niloticus) reveals extensive strand-specific and non-CpG methylation

DNA methylation is one of the main epigenetic mechanisms that regulate gene expression in a manner that depends on the genomic context and varies considerably across taxa. This DNA modification was first found in nuclear genomes of eukaryote several decades ago and it has also been described in mitochondrial DNA. It has recently been shown that mitochondrial DNA is extensively methylated in mammals and other vertebrates. Our current knowledge of mitochondrial DNA methylation in fish is very limited, especially in non-model teleosts. In this study, using whole-genome bisulfite sequencing, we determined methylation patterns within non-CpG (CH) and CpG (CG) contexts in the mitochondrial genome of Nile tilapia, a non-model teleost of high economic importance. Our results demonstrate the presence of mitochondrial DNA methylation in this species predominantly within a non-CpG context, similarly to mammals. We found a strand-specific distribution of methylation, in which highly methylated cytosines were located on the minus strand. The D-loop region had the highest mean methylation level among all mitochondrial loci. Our data provide new insights into the potential role of epigenetic mechanisms in regulating metabolic flexibility of mitochondria in fish, with implications in various biological processes, such as growth and development.publishedVersio

Earlier or delayed seasonal broodstock spawning changes nutritional status and metabolic programming of growth for next-generation Atlantic salmon

Atlantic salmon (Salmo salar) breeding companies depend on changing light, temperature and feeding regimes to achieve new generations outside the natural spawning season. However, there have been few conducted trials reported that have studied whether this shift affects important traits. We test whether an induced shift of two months earlier or two months later than normal spawning season affects the nutritional status (folate, methionine, vitamin B12, vitamin B6, free amino acids, N-metabolites and lipids) in broodstock liver and muscle and whether this affects the levels of the same nutrients in the offspring. The results showed significant seasonal differences in the Cahill cycle (glucose-alanine cycle), 1C metabolism and for free amino acids catabolized in the citric acid cycle all which are important for embryonic growth The broodstock nutritional status was reflected in the eggs. Nutritional status of broodstock liver and muscle and newly fertilized eggs showed two general scenarios: Advanced spawning period did not obtain optimal deposition of nutrients in the eggs. Delayed spawning broodstock displayed a metabolic profile which indicated that it had enhanced catabolization of muscle protein which led to accumulation of aminogroups from muscle breakdown to such a degree that these amino groups were increased in the eggs. The total body weight at start-feeding stage revealed best growth for both the normal and late spawning compared to early spawning. We show here that environmental alterations in broodstock husbandry influence the nutrient status of the next generation via nutritional and metabolic programming. This is an important concept which needs more careful awareness as the metabolism compensate and regulate the energy between catabolism and anabolism through the early stages of cell divisions which give rise to changes in permanent traits for the next generation.publishedVersio