Evolution of transcriptional enhancers and animal diversity

Deciphering the genetic bases that drive animal diversity is one of the major challenges of modern biology. Although four decades ago it was proposed that animal evolution was mainly driven by changes in cis-regulatory DNA elements controlling gene expression rather than in protein-coding sequences, only now are powerful bioinformatics and experimental approaches available to accelerate studies into how the evolution of transcriptional enhancers contributes to novel forms and functions. In the introduction to this Theme Issue, we start by defining the general properties of transcriptional enhancers, such as modularity and the coexistence of tight sequence conservation with transcription factor-binding site shuffling as different mechanisms that maintain the enhancer grammar over evolutionary time. We discuss past and current methods used to identify cell-type-specific enhancers and provide examples of how enhancers originate de novo, change and are lost in particular lineages. We then focus in the central part of this Theme Issue on analysing examples of how the molecular evolution of enhancers may change form and function. Throughout this introduction, we present the main findings of the articles, reviews and perspectives contributed to this Theme Issue that together illustrate some of the great advances and current frontiers in the field.Fil: Silva Junqueira de Souza, Flavio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Rubinstein, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentin

Public Policies and Innovation Ecosystem within the Technological Innovation Center of the Federal Institute Baiano: strategic analysis of actions, programs and projects

Innovation policies have been gaining ground in the Brazilian scenario, requiring a strategic look at innovation activities by organizations in the conception of technologies. The article aimed to analyze the actions, programs and projects that are driving the innovation ecosystem of the Technological Innovation Center of the Federal Institute of Bahia (NIT IF Baiano) with a view to strengthening Innovation Policies for local and regional development. The research had a qualitative, descriptive, exploratory approach, documentary research and content analysis. Several actions were found to foster innovation, the main ones being: scientific and technological dialogues, seminars. Thus, it was evidenced in this research that within the scope of IF Bahia the Innovation Policy for the management of Intellectual Property (IP) and Technology Transfer was recently regulated and, as a reflex, it was found that its IP indicators are retracted, for example the patents, trademarks and software. On the other hand, the scientific initiation programs received scholarships and the research projects developed managed to exceed the programmed goals. Finally, the NIT IF Baiano must remain supporting innovation policies to support the institutional Innovation Policy in order to leverage its technological indicators

Autocontenção e ativismo : a postura do Supremo Tribunal Federal diante de questões políticas

Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciência Política (IPOL), 2018.A presente pesquisa tem como objetivo analisar o posicionamento do colegiado de ministros do Supremo Tribunal Federal, quando este tem em frente questões consideradas políticas, e na medida em que se pressupõe a não existência de um posicionamento homogêneo entre os ministros, o intuito maior é depreender sob qual postura a Alta Corte brasileira está mais alinhada. Os posicionamentos em pauta são compreendidos através da dicotomia autocontenção/ativismo, dos quais são oriundos respectivamente da Doutrina da Political Question, corrente teórica derivada de uma espécie de ortodoxia do princípio da separação dos poderes, e do Neoconstitucionalismo, doutrina cuja finalidade é a maior eficácia do texto constitucional e que vislumbra maior importância ao Judiciário. Dessa forma, serão abordadas a origem de ambas essas doutrinas e as diferentes perspectivas sobre as “posturas” decorrentes destas. Não obstante, visando promover maior concretude ao trabalho, serão examinados alguns julgamentos do órgão cúpula do país (STF), que de maneira mais específica correspondem à Arguição de Descumprimento de Preceito Fundamenta 101 no caso da importação de pneus usados, e a Reclamação 11243 relacionada à extradição de Cesare Battisti, intentando assim, abstrair dos julgamentos qual a postura majoritária do Supremo quando se figura diante de determinadas questões.The objective of this research is to analyze the position of the Supremo Tribunal Federal' s collegiate ministerial, when it faces issues considered as political, and to the extent that it presupposes that there is no homogeneous position among the ministers, the main purpose is to understand under which position the Brazilian High Court is more aligned. Positions on the agenda are understood through the dichotomy of self-restraint / activism, from which they derive respectively from the Political Question Doctrine, a theoretical current derived from a kind of orthodoxy of the principle of separation of powers, and from Neoconstitutionalism, doctrine whose purpose is greater effectiveness of the constitutional text and that sees greater importance to the Judiciary. In this way, the origin of both these doctrines and the different perspectives on the "postures" arising from them will be addressed. Nevertheless, in order to promote greater concreteness to the work, some judgments of the country's top body (STF) will be examined, which more specifically correspond to the Arguição de Descumprimento de Preceito Fundamental 101 in the case of import of used tires, and the Reclamação 11243 related to the extradition of Cesare Battisti, thus trying to abstract from the judgments what was the majority position of the Supremo when it comes to certain issues

A PESQUISA-FORMAÇÃO COMO DISPOSITIVO ESCOLAR PARA PENSAR A SAÚDE MENTAL DE ESTUDANTES NA PANDEMIA

The objective was to develop training in mental health in a public school to encourage debates on themes that involved conditions of protection and understanding of health risk. In addition to investigating the relational dynamics of meetings, which with the occurrence of the pandemic became virtual. The method took place through research-training, a type of scientific know-how that assumes subjectivity in the course of training as important and which is critically-politically centered. The group was composed of the school and academic community. The meetings took place monthly or bimonthly through online platforms, generating logbooks, drawings, photographs, poetry, among others. The evaluated results led to points of debate named as pandemic and common feelings, challenges and reflections from the pandemic and sharing of care strategies. The results pointed to new modes of subjectivation as a result of the pandemic in coping with the interposed reality, the worsening of the health situation of those who were already suffering from illness and the notion that the proposition of a group that gathers to elaborate the experience in a shared and cooperative is a possible health care strategy. The importance of the public school is reaffirmed as an institution that enables, through debate, the understanding of risk contexts and health protection for the purposes of training not only technical but also socio-emotional, ethical, aesthetic and political.El objetivo fue desarrollar una formación en salud mental en una escuela pública para fomentar debates sobre temas que involucraran condiciones de protección y comprensión del riesgo para la salud. Además de indagar en la dinámica relacional de los encuentros, que con la ocurrencia de la pandemia se tornaron virtuales. El método se llevó a cabo a través de la investigación-formación, un tipo de saber científico que asume la subjetividad en el curso de la formación como importante y que tiene un centro crítico-político. El grupo estuvo integrado por la comunidad escolar y académica. Los encuentros se realizaron mensual o bimestralmente a través de plataformas en línea, generando bitácoras, dibujos, fotografías, poesía, entre otros. Los resultados evaluados generaron puntos de debate denominados como pandemia y sentimientos comunes, desafíos y reflexiones a partir de la pandemia y compartir estrategias de cuidado. Los resultados apuntaron nuevos modos de subjetivación a partir de la pandemia en el enfrentamiento de la realidad interpuesta, el empeoramiento de la situación de salud de quienes ya padecían la enfermedad y la noción de que la proposición de un grupo que se reúne para elaborar la experiencia en forma compartida y cooperativa es una posible estrategia de atención a la salud. Se reafirma la importancia de la escuela pública como institución que posibilita, a través del debate, la comprensión de los contextos de riesgo y la protección de la salud con fines de formación no solo técnica sino también socioemocional, ética, estética y política.Objetivou-se desenvolver uma formação em saúde mental numa escola pública para fomentar debates sobre temáticas que envolvessem condições de proteção e entendimento sobre risco à saúde. Além de investigar a dinâmica relacional dos encontros, que com a ocorrência da pandemia passaram a ser virtuais. O método se deu através da pesquisa-formação, um tipo de saber-fazer científico que assume como importante a subjetividade no intercurso da formação e que centra-se crítico-políticamente. O grupo foi composto pela comunidade escolar e acadêmica. Os encontros ocorreram de forma mensal ou bimensal por plataformas on-line, gerando diários de bordo, desenhos, fotografias, poesias, entre outros. Os resultados avaliados conduziram para pontos de debate nomeados como pandemia e sentimentos em comum, desafios e reflexões a partir da pandemia e compartilhamento de estratégias de cuidado. Os resultados apontaram novos modos de subjetivação em decorrência da pandemia no enfrentamento a realidade interposta, o agravamento da situação de saúde de quem já estava em adoecimento e a noção de que a proposição de um grupo que se reune para elaborar a experiência de forma compartilhada e cooperativa é uma estratégia possível de cuidado em saúde. Reafirma-se a importância da escola pública como uma instituição que possibilita por meio do debate a compreensão de contextos de risco e proteção a saúde para fins de uma formação não só técnica mas, socioemocional, ética, estética e política

O classicismo na fotografia de Luiz Carlos Felizardo

O artigo propõe uma análise formal das fotografias realizadas por Luiz Carlos Felizardo, fotógrafo gaúcho, estabelecendo paralelos entre seu trabalho e a pintura clássica. Para tanto, vale-se dos conceitos de classicismo definidos pelo historiador da arte Heinrich Wölfflin, procurando verificar a presença destes conceitos no trabalho de Felizardo

Extração de caracteristícas e reconhecimento automático de espécies florestais

Anais do VI Encontro de Iniciação Científica e II Encontro Anual de Iniciação ao Desenvolvimento Tecnológico e Inovação – EICTI 2017 - 04 a 06 de outubro de 2017 - temática Ciências Exatas e da TerraAs espécies florestais podem ser facilmente reconhecidas quando se encontram em seu habitat natural, porém depois que a árvore é extraída e cortada em tábuas, apenas um especialista é capaz de afirmar de qual espécie a referida tábua está relacionada. Com isso, a falta de fiscalização apropriada, pode fazer com que madeiras de uma determinada espécie sejam comercializadas como se pertencessem a outra, ou espécies mais valorizadas podem ser trocadas por outras de menor valor, podendo acarretar prejuízo ao comprador, até mesmo um problema ambiental, com o comércio de madeiras extraídas de espécies ilegais. Embora, as autoridades se esforcem cada vez mais para obter um controle nesse tipo de indústria, o controle apropriado para a comercialização dependeria de um grande número de especialistas. Entretanto, o orçamento do governo é geralmente limitado, não sendo assim possível. Nesse contexto, busca-se uma alternativa com menores custos, fazendo-se um estudo para o desenvolvimento de softwares que sejam capazes de reconhecer uma espécie florestal a partir da imagem capturada de uma madeira, auxiliando o ser humano no processo de classificaçãoUniversidade Federal da Integração Latino-Americana (Unila); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); Fundação Araucária; Parque Tecnológico Itaipu (PTI) e Companhia de Saneamento do Paraná (SANEPAR

Exaptation of transposable elements into novel cis-regulatory elements: is the evidence always strong?

Transposable elements (TEs) are mobile genetic sequences that can jump around the genome from one location to another, behaving as genomic parasites. TEs have been particularly effective in colonizing mammalian genomes, and such heavy TE load is expected to have conditioned genome evolution. Indeed, studies conducted both at the gene and genome levels have uncovered TE insertions that seem to have been co-opted-or exapted-by providing transcription factor binding sites (TFBSs) that serve as promoters and enhancers, leading to the hypothesis that TE exaptation is a major factor in the evolution of gene regulation. Here, we critically review the evidence for exaptation of TE-derived sequences as TFBSs, promoters, enhancers, and silencers/insulators both at the gene and genome levels. We classify the functional impact attributed to TE insertions into four categories of increasing complexity and argue that so far very few studies have conclusively demonstrated exaptation of TEs as transcriptional regulatory regions. We also contend that many genome-wide studies dealing with TE exaptation in recent lineages of mammals are still inconclusive and that the hypothesis of rapid transcriptional regulatory rewiring mediated by TE mobilization must be taken with caution. Finally, we suggest experimental approaches that may help attributing higher-order functions to candidate exapted TEs.Fil: Rubinstein, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; ArgentinaFil: Silva Junqueira de Souza, Flavio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; ArgentinaFil: Franchini, Lucia Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentin