28 research outputs found
The malaria system microApp: A new, mobile device-based tool for malaria diagnosis
Background: Malaria is a public health problem that affects remote areas worldwide. Climate change has contributed to the problem by allowing for the survival of Anopheles in previously uninhabited areas. As such, several groups have made developing news systems for the automated diagnosis of malaria a priority.
Objective: The objective of this study was to develop a new, automated, mobile device-based diagnostic system for malaria. The system uses Giemsa-stained peripheral blood samples combined with light microscopy to identify the Plasmodium falciparum species in the ring stage of development.
Methods: The system uses image processing and artificial intelligence techniques as well as a known face detection algorithm to identify Plasmodium parasites. The algorithm is based on integral image and haar-like features concepts, and makes use of weak classifiers with adaptive boosting learning. The search scope of the learning algorithm is reduced in the preprocessing step by removing the background around blood cells.
Results: As a proof of concept experiment, the tool was used on 555 malaria-positive and 777 malaria-negative previously-made slides. The accuracy of the system was, on average, 91%, meaning that for every 100 parasite-infected samples, 91 were identified correctly.
Conclusions: Accessibility barriers of low-resource countries can be addressed with low-cost diagnostic tools. Our system, developed for mobile devices (mobile phones and tablets), addresses this by enabling access to health centers in remote communities, and importantly, not depending on extensive malaria expertise or expensive diagnostic detection equipment.Peer ReviewedPostprint (published version
Role of Three-Dimensional Magnetic Resonance Imaging in Pregnancy: What Is Known?
Las imágenes diagnósticas en el ámbito clínico resultan de gran utilidad para el médico, siendo una herramienta usada en diferentes áreas de la medicina como lo es la obstetricia. Actualmente, la resonancia magnética de tipo tridimensional nos proporciona información del cordón umbilical, la placenta, líquido amniótico y el útero. Por lo tanto, realizamos una búsqueda bibliográfica de artículos en inglés y español dando como resultados de cómo la resonancia magnética tridimensional permite observar las diferentes alteraciones, cambios anatómicos, entre otros. Por ello, podemos concluir que la resonancia magnética tridimensional se ha convertido en una valiosa técnica complementaria de la ecografía prenatal, caracterizada por la detección de anomalías del desarrollo fetal. Diagnostic images in the clinical field are very useful for the physician, being a tool used in different areas of medicine such as obstetrics. Currently, three-dimensional magnetic resonance imaging provides information about the umbilical cord, placenta, amniotic fluid and uterus. Therefore, we carried out a bibliographic search of articles in English and Spanish, giving as results how three-dimensional magnetic resonance imaging allows us to observe different alterations, anatomical changes, among others. Therefore, we can conclude that three-dimensional magnetic resonance imaging has become a valuable complementary technique to prenatal ultrasound, characterized by the detection of abnormalities of fetal development
Molecular characterization of imported and autochthonous dengue in northeastern spain
Dengue is the most significant arbovirus worldwide and a public health threat to nonendemic areas in which Aedes vectors are present. Autochthonous dengue transmission has been reported in several European countries in the last decade. Infected travelers from endemic regions arriving to areas colonized by Aedes albopictus in Europe need to be monitored in surveillance and control programs. We aimed to perform molecular characterization of RT-PCR-positive dengue cases detected in Catalonia, northeastern Spain, from 2013 to 2018. The basic demographic information and the geographical regions of importation were also analyzed. One-hundred four dengue cases were studied (103 imported infections and the first autochthonous case in our region). The dengue virus strains detected were serotyped and genotyped using molecular methods, and phylogenetic analyses were conducted. All four dengue serotypes were detected in travelers, including up to 10 different genotypes, reflecting the global circulation of dengue in endemic areas. The primary travel-related case of the 2018 autochthonous transmission was not identified, but the molecular analysis revealed dengue serotype 1, genotype I of Asian origin. Our results highlight the diversity of imported dengue virus strains and the role of molecular epidemiology in supporting arbovirus surveillance programs
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Genome-wide association study of Tourette Syndrome
Tourette Syndrome (TS) is a developmental disorder that has one of the highest familial recurrence rates among neuropsychiatric diseases with complex inheritance. However, the identification of definitive TS susceptibility genes remains elusive. Here, we report the first genome-wide association study (GWAS) of TS in 1285 cases and 4964 ancestry-matched controls of European ancestry, including two European-derived population isolates, Ashkenazi Jews from North America and Israel, and French Canadians from Quebec, Canada. In a primary meta-analysis of GWAS data from these European ancestry samples, no markers achieved a genome-wide threshold of significance (p<5 × 10−8); the top signal was found in rs7868992 on chromosome 9q32 within COL27A1 (p=1.85 × 10−6). A secondary analysis including an additional 211 cases and 285 controls from two closely-related Latin-American population isolates from the Central Valley of Costa Rica and Antioquia, Colombia also identified rs7868992 as the top signal (p=3.6 × 10−7 for the combined sample of 1496 cases and 5249 controls following imputation with 1000 Genomes data). This study lays the groundwork for the eventual identification of common TS susceptibility variants in larger cohorts and helps to provide a more complete understanding of the full genetic architecture of this disorder
re-habitar El Carmen : Un proyecto sobre patrimonio contemporáneo
El proyecto _re-HABITAR suponía para el propio proceder de la institución un avance más allá del reconocimiento, registro, inventario o protección patrimonial de la arquitectura del siglo XX y del Movimiento Moderno para posicionarse en la acción preventiva y conservativa de ese legado contemporáneo. Para ello, la praxis patrimonial se aferraba a un modelo: el de la vivienda social en España en la segunda mitad del siglo XX; a un caso concreto: el de la barriada de Nuestra Señora del Carmen (Recasens Méndez-Queipo de Llano, 1958); y a un requisito fundamental: analizar un objeto vivo y en uso, aún con la presencia de quienes lo vivieron y usaron desde su origen
Partitioning the Heritability of Tourette Syndrome and Obsessive Compulsive Disorder Reveals Differences in Genetic Architecture
Partitioning the Heritability of Tourette Syndrome and Obsessive Compulsive Disorder Reveals Differences in Genetic Architecture
The direct estimation of heritability from genome-wide common variant data as implemented in the program Genome-wide Complex Trait Analysis (GCTA) has provided a means to quantify heritability attributable to all interrogated variants. We have quantified the variance in liability to disease explained
Implicación funcional de la mutación BMPR2-p.Ser987Phe en la etiología de la insuficiencia ovárica primaria no sindrómica
La insuficiencia ovárica primaria (IOP) es una enfermedad frecuente que se caracteriza por amenorrea antes de los 40 años y niveles elevados de gonadotropinas. En un estudio previo, efectuado mediante secuenciación de siguiente generación (NGS) en 70 genes candidatos, se identificó la mutación c.2960C>T (p.Ser987Phe) en el gen BMPR2. La mutación estaba localizada en el dominio C-terminal, lo que podría modificar su plegamiento y su interacción con otras proteínas. Por lo tanto, se evaluó el potencial efecto patogénico de la mutación BMPR2-p.Ser987Phe a nivel de la localización subcelular. Las formas silvestre y mutante de BMPR2, clonadas en fase con GFP en un plásmido de expresión, fueron transfectadas en las células CHO. Las células fueron tratadas con un marcador de localización del retículo endoplásmico (RE) y visualizadas en un microscopio de fluorescencia para su caracterización y conteo. El conteo celular permitió observar en las células transfectadas con la versión mutante, un aumento estadísticamente significativo de agregados localizados en el RE. La falta de biodisponibilidad potencial de BMPR2 en la membrana celular, debido a la retención proteica producida por la mutación p.Ser987Phe, podría perturbar las vías de señalización intracelular. Por lo tanto, se propuso una relación funcional entre la mutación c.2960C>T y la etiología de la IOP. Además, se realizó un tamizaje de las potenciales proteínas de interacción con BMPR2, mediante el ensayo de doble híbrido en levaduras (Y2H), utilizando una librería de ovario de ratón. Se identificaron cuatro proteínas con una muy alta probabilidad de interacción: Limk1, Ctnnd1, Fasn y Fn1
Implicación funcional de la mutación BMPR2-p.Ser987Phe en la etiología de la insuficiencia ovárica primaria no sindrómica
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Análisis fisicoquímicos de muestras ambientales, materias primas y alimentos e identificación de metales por espectroscopia de absorción atómica.
Tesis (Químico) -- Universidad de Cartagena. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Programa de Química, 2016La determinación de metales se realizó en un espectrofotómetro de absorción atómica (absorción y emisión). El equipo determinaba concentraciones de metales en las muestras y comparando con las normas establecidas se realizaba un informe y se entregaba el reporte. De igual forma se realizaba este procedimiento para las pruebas físico-químicas realizadas en muestras ambientales de materia prima y alimentos