Flora pteridofítica de la Marina Alta (Alacant)

A partir de material d'herbari i referències bibliogràfiques es revisa i actualitza el catàleg de pteridòfits de la comarca de la Marina Alta (Alacant). Asplenium trichomanes L. subsp. inexpectans Lovis constitueix novetat per a la flora del País Valencià.A partir de material de herbario y de la recopilación de referencias bibliograficas se revisa y actualiza el catálogo de pteridófitos de la Marina Alta (Alicante). Asplenium trichomanes L. subsp. inexpectans Lovis supone novedad para la flora del País Valenciano.On the basis of herbarium material and bibliographic references, we have made a revision of the catalogue of Pteridophyta from Marina Alta (SE Iberian Peninsula). Asplenium trichomanes L. subsp. inexpectans Lovis is recorded for the first time in the Valencian Communit

Investigations on birefringence effects in polymer optical fiber Bragg gratings

Step-index polymer optical fiber Bragg gratings (POFBGs) and microstructured polymer optical fiber Bragg gratings (mPOFBGs) present several attractive features, especially for sensing purposes. In comparison to FBGs written in silica fibers, they are more sensitive to temperature and pressure because of the larger thermo-optic coefficient and smaller Young's modulus of polymer materials. (M)POFBGs are most often photowritten in poly(methylmethacrylate) (PMMA) materials using a continuous-wave 325 nm HeCd laser. For the first time to the best of our knowledge, we study photoinduced birefringence effects in (m)POFBGs. To achieve this, highly reflective gratings were inscribed with the phase mask technique. They were then monitored in transmission with polarized light. For this, (m)POF sections a few cm in length containing the gratings were glued to angled silica fibers. Polarization dependent loss (PDL) and differential group delay (DGD) were computed from the Jones matrix eigenanalysis using an optical vector analyser. Maximum values exceeding several dB and a few picoseconds were obtained for the PDL and DGD, respectively. The response to lateral force was finally investigated. As it induces birefringence in addition to the photo-induced one, an increase of the PDL and DGD values were noticed. © 2014 Copyright SPIE

Improvements of the particle-in-cell code EUTERPE for petascaling machines

In the present work we report some performance measures and computational improvements recently carried out using the gyrokinetic code EUTERPE (Jost, 2000 [1] and Jost et al., 1999 [2]), which is based on the general particle-in-cell (PIC) method. The scalability of the code has been studied for up to sixty thousand processing elements and some steps towards a complete hybridization of the code were made. As a numerical example, non-linear simulations of Ion Temperature Gradient (ITG) instabilities have been carried out in screw-pinch geometry and the results are compared with earlier works. A parametric study of the influence of variables (step size of the time integrator, number of markers, grid size) on the quality of the simulation is presented.Fil: Sáez, Xavier. Barcelona Supercomputing Center - Centro Nacional de Supercomputacion; EspañaFil: Soba, Alejandro. Barcelona Supercomputing Center - Centro Nacional de Supercomputacion; España. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sánchez, Edilberto. No especifíca;Fil: Kleiber, Ralf. No especifíca;Fil: Castejón, Francisco. No especifíca;Fil: Cela, José M.. Barcelona Supercomputing Center - Centro Nacional de Supercomputacion; Españ

Flora pteridofítica de la Marina Alta (Alacant)

A partir de material d'herbari i referències bibliogràfiques es revisa i actualitza el catàleg de pteridòfits de la comarca de la Marina Alta (Alacant). Asplenium trichomanes L. subsp. inexpectans Lovis constitueix novetat per a la flora del País Valencià.A partir de material de herbario y de la recopilación de referencias bibliograficas se revisa y actualiza el catálogo de pteridófitos de la Marina Alta (Alicante). Asplenium trichomanes L. subsp. inexpectans Lovis supone novedad para la flora del País Valenciano.On the basis of herbarium material and bibliographic references, we have made a revision of the catalogue of Pteridophyta from Marina Alta (SE Iberian Peninsula). Asplenium trichomanes L. subsp. inexpectans Lovis is recorded for the first time in the Valencian Communit

Extrapolations of the fusion performance in JET

n preparation of the forthcoming high power campaign with the reactor-relevant deuterium-tritium (DT) fuel mixture in the Joint European Torus (JET), significant efforts are being devoted to DT scenario extrapolation using computer modelling. We report on simulations aimed at optimizing external heating using neutral beam injection (NBI) and radiofrequency waves in the ion cyclotron range of frequencies (ICRF) for high DT fusion yield. Our results show that by increasing external heating power to the maximum power available, the fusion neutron rate can be enhanced by a factor of 4-5 with respect to the recent record values. The comparison of two ICRF schemes using different resonant ion species, i.e. 3He and H minority ions, shows that the 3He minority heating scenario achieves a higher fuel ion temperature but not necessarily a better fusion performance. Finally, we study the dependence of the performance of external heating on key experimental parameters

Citril finches during the winter: patterns of distribution, the role of pines and implications for the conservation of the species

El verderón serrano (Serinus citrinella) es una especie paleártica endémica que cría en zonas montañosas subalpinas de la Europa occidental templada. Esta especie parece que está sufriendo un gran declive en su área de distribución septentrional, principalmente en la Selva Negra y en el NE de los Alpes. Se han propuesto muchas razones para dicha disminución, pero todas ellas estaban relacionadas con los hábitats de cría. Dado que esta especie lleva a cabo una migración altitudinal, y que durante el invierno puede utilizar habitats muy distintos, se precisaría un buen conocimiento de los patrones de distribución y de los hábitats utilizados fuera del período reproductor, para poder establecer unas directrices de conservación y gestión adecuadas. Sin embargo, esta información es muy escasa. El propósito de este estudio es determinar el hábitat común utilizado por los verderones serranos en en nordeste de España durante el invierno, para analizar la idoneidad del habitat, y estudiar los movimientos, investigando el origen de la aves que invernan en Cataluña. La distribución se modelizó utilizando el análisis discriminante y la modelización de entropía máxima con los datos registrados desde 1972 al 2009 sobre la presencia de esta especie durante el invierno en Cataluña. Los resultados evidenciaron que la presencia de bosques abiertos mixtos de pino negral (Pinus nigra subsp. salzmanii) y pino silvestre o albar (Pinus sylvestris), con numerosas tierras de cultivo y plantas arvenses, en areas submediterráneas típicas en las que las temperaturas templadas de finales de invierno (días soleados) facilitan la apertura de las piñas, fueron las variables ecológicas y bioclimáticas claves responsables de la distribución del verderón serrano en invierno (valores AUC o área bajo la curva: datos de entrenamiento AUC = 0,955; datos del test AUC = 0,953). Analizamos las recuperaciones (N = 238) de 2.368 aves anilladas en las áreas de invernada y 12.648 aves anilladas en localizaciones subalpinas en los Pirineos adyacentes, desde 1977 al 2004. Los resultados de los datos de recuperación de anillas muestran que en el área de estudio se capturaron aves procedentes de muy diversas localizaciones dentro del área de distribución de la especie estudiada, incluyendo aves transpirenaicas procedentes de los Alpes. Ello enfatiza la gran movilidad de las poblaciones del verderón serrano hasta alcanzar las áreas de invernada. Desde el punto de vista de la conservación, la gran importancia de los pinos (principalmente del negral) para la distribución invernal de esta especie pone de manifiesto que cualquier amenaza para los pinos, especialmente los incendios forestales, tendrá grandes efectos adversos sobre las poblaciones del verderón serrano. Palabras clave: Verderón serrano, Invernada, Selección del hábitat, Idoneidad del hábitat, Desplazamientos, Conservación, Pino negral, Pino silvestre, Pino albar.El verderón serrano (Serinus citrinella) es una especie paleártica endémica que cría en zonas montañosas subalpinas de la Europa occidental templada. Esta especie parece que está sufriendo un gran declive en su área de distribución septentrional, principalmente en la Selva Negra y en el NE de los Alpes. Se han propuesto muchas razones para dicha disminución, pero todas ellas estaban relacionadas con los hábitats de cría. Dado que esta especie lleva a cabo una migración altitudinal, y que durante el invierno puede utilizar habitats muy distintos, se precisaría un buen conocimiento de los patrones de distribución y de los hábitats utilizados fuera del período reproductor, para poder establecer unas directrices de conservación y gestión adecuadas. Sin embargo, esta información es muy escasa. El propósito de este estudio es determinar el hábitat común utilizado por los verderones serranos en en nordeste de España durante el invierno, para analizar la idoneidad del habitat, y estudiar los movimientos, investigando el origen de la aves que invernan en Cataluña. La distribución se modelizó utilizando el análisis discriminante y la modelización de entropía máxima con los datos registrados desde 1972 al 2009 sobre la presencia de esta especie durante el invierno en Cataluña. Los resultados evidenciaron que la presencia de bosques abiertos mixtos de pino negral (Pinus nigra subsp. salzmanii) y pino silvestre o albar (Pinus sylvestris), con numerosas tierras de cultivo y plantas arvenses, en areas submediterráneas típicas en las que las temperaturas templadas de finales de invierno (días soleados) facilitan la apertura de las piñas, fueron las variables ecológicas y bioclimáticas claves responsables de la distribución del verderón serrano en invierno (valores AUC o área bajo la curva: datos de entrenamiento AUC = 0,955; datos del test AUC = 0,953). Analizamos las recuperaciones (N = 238) de 2.368 aves anilladas en las áreas de invernada y 12.648 aves anilladas en localizaciones subalpinas en los Pirineos adyacentes, desde 1977 al 2004. Los resultados de los datos de recuperación de anillas muestran que en el área de estudio se capturaron aves procedentes de muy diversas localizaciones dentro del área de distribución de la especie estudiada, incluyendo aves transpirenaicas procedentes de los Alpes. Ello enfatiza la gran movilidad de las poblaciones del verderón serrano hasta alcanzar las áreas de invernada. Desde el punto de vista de la conservación, la gran importancia de los pinos (principalmente del negral) para la distribución invernal de esta especie pone de manifiesto que cualquier amenaza para los pinos, especialmente los incendios forestales, tendrá grandes efectos adversos sobre las poblaciones del verderón serrano. Palabras clave: Verderón serrano, Invernada, Selección del hábitat, Idoneidad del hábitat, Desplazamientos, Conservación, Pino negral, Pino silvestre, Pino albar.The Citril finch Serinus citrinella is a Paleartic endemic species that breeds in the subalpine mountain zones of western temperate Europe. The species seems to be suffering a serious decline in its northern range, mainly in the Black Forest and the NE of the Alps. Numerous reasons have been provided for this decline, but all of them have been related to breeding habitats. Given that the species undergoes an altitudinal migration and that during winter it may use very different habitats, a sound knowledge of the distribution patterns and habitats used outside the breeding period is needed to conduct adequate conservation policies and management. This information, however, is largely lacking. The aim of this paper was to determine the current habitat used by Citril finches in north–eastern Spain during the winter, to analyse habitat suitability and to study movements, by investigating the origin of birds that overwinter in Catalonia. Citril finch distribution was modelled using both discriminant analysis and maximum entropy modelling, on the basis of species occurrences during winter in Catalonia (data from 1972–2009). Results showed that the presence of two tree species, Black pine (Pinus nigra subsp. salzmanii) and Scots pine (Pinus sylvestris), both as part of mixed open forests, and the presence of abundant farmland and arvensic plants —the two vegetation units located in a typical sub¬mediterranean context, where the warm temperatures (sunny days) in late winter permit the cones to open—, were the ecological and bioclimatic variables that explain the distribution model. All these variables in tandem seem to be the key for the current potential distribution of the Citril finch in winter (AUCscores: training data AUC= 0.955; test data AUC = 0.953). We analyzed recoveries (N = 238) of 2,368birds ringed at wintering grounds and 12,648 birds ringed at subalpine localities in the adjacent Pyrenees from 1977–2004. We found that in the study area, we recovered ringed birds from many different locations from across the distributional range of the species, including trans–Pyrenean birds from the Alps. This stresses the high mobility of Citril finch populations to reach wintering areas. From a conservation point of view, the high importance of pines (mainly Black pine) for the wintering distribution of the species stresses that any threat on pines, especially forest fires, will have acute detrimental effects for Citril finch populations. Key words: Citril finch, Wintering, Habitat selection, Habitat suitability, Movements, Conservation, Black pine, Scots pine

Anaerobic biodegradability of leachate from MSW intermediate landfill

Anaerobic digestion has been used for decades to treat leachate from municipal solid waste landfills.Due to the characteristics of this kind of effluent, the biodegradability results have not been as satisfactory as could be hoped. Consequently, this area has long been a focus of study. This paper contributes to knowledge of the characteristics of biodegradability of this kind of waste effluent, through application to a real case. Biodegradation performance was studied in depth using a range of physicochemical parameters and the amount of methane produced by various volumetric ratios of substrate: inoculum between 2:50 and 50:50 at 35 ºC and atmospheric pressure by using anaerobic batch tests in 500 mL bottles. It has been observed an optimal situation for the ratios between 16:50 and 24:50 ratios with values of biodegradability COT 45% and 35% in COD. For smaller proportions it has detected the completion of the lack of readily biodegradable substrate. For higher proportions it is considered that the ammoniacal nitrogen has had an inhibiting effect on the anaerobic  process

El verderón serrano en invierno: patrones de distribución, el papel de los pinos e implicaciones para la conservación de la especie

The Citril finch Serinus citrinella is a Paleartic endemic species that breeds in the subalpine mountain zones of western temperate Europe. The species seems to be suffering a serious decline in its northern range, mainly in the Black Forest and the NE of the Alps. Numerous reasons have been provided for this decline, but all of them have been related to breeding habitats. Given that the species undergoes an altitudinal migration and that during winter it may use very different habitats, a sound knowledge of the distribution patterns and habitats used outside the breeding period is needed to conduct adequate conservation policies and management. This information, however, is largely lacking. The aim of this paper was to determine the current habitat used by Citril finches in north–eastern Spain during the winter, to analyse habitat suitability and to study movements, by investigating the origin of birds that overwinter in Catalonia. Citril finch distribution was modelled using both discriminant analysis and maximum entropy modelling, on the basis of species occurrences during winter in Catalonia (data from 1972–2009).El verderón serrano (Serinus citrinella) es una especie paleártica endémica que cría en zonas montañosas subalpinas de la Europa occidental templada. Esta especie parece que está sufriendo un gran declive en su área de distribución septentrional, principalmente en la Selva Negra y en el NE de los Alpes. Se han propuesto muchas razones para dicha disminución, pero todas ellas estaban relacionadas con los hábitats de cría. Dado que esta especie lleva a cabo una migración altitudinal, y que durante el invierno puede utilizar habitats muy distintos, se precisaría un buen conocimiento de los patrones de distribución y de los hábitats utilizados fuera del período reproductor, para poder establecer unas directrices de conservación y gestión adecuadas. Sin embargo, esta información es muy escasa. El propósito de este estudio es determinar el hábitat común utilizado por los verderones serranos en en nordeste de España durante el invierno, para analizar la idoneidad del habitat, y estudiar los movimientos, investigando el origen de la aves que invernan en Cataluña. La distribución se modelizó utilizando el análisis discriminante y la modelización de entropía máxima con los datos registrados desde 1972 al 2009 sobre la presencia de esta especie durante el invierno en Cataluña. Los resultados evidenciaron que la presencia de bosques abiertos mixtos de pino negral (Pinus nigra subsp. salzmanii) y pino silvestre o albar (Pinus sylvestris), con numerosas tierras de cultivo y plantas arvenses, en areas submediterráneas típicas en las que las temperaturas templadas de finales de invierno (días soleados) facilitan la apertura de las piñas, fueron las variables ecológicas y bioclimáticas claves responsables de la distribución del verderón serrano en invierno (valores AUC o área bajo la curva: datos de entrenamiento AUC = 0,955; datos del test AUC = 0,953). Analizamos las recuperaciones (N = 238) de 2.368 aves anilladas en las áreas de invernada y 12.648 aves anilladas en localizaciones subalpinas en los Pirineos adyacentes, desde 1977 al 2004. Los resultados de los datos de recuperación de anillas muestran que en el área de estudio se capturaron aves procedentes de muy diversas localizaciones dentro del área de distribución de la especie estudiada, incluyendo aves transpirenaicas procedentes de los Alpes. Ello enfatiza la gran movilidad de las poblaciones del verderón serrano hasta alcanzar las áreas de invernada. Desde el punto de vista de la conservación, la gran importancia de los pinos (principalmente del negral) para la distribución invernal de esta especie pone de manifiesto que cualquier amenaza para los pinos, especialmente los incendios forestales, tendrá grandes efectos adversos sobre las poblaciones del verderón serrano.This work was supported by grants from the Ministerio de Ciencia e Innovación (CGL 2009–10652)

Genome Wide Meta-Analysis identifies common genetic signatures shared by heart function and Alzheimer’s disease

Genètica de malalties; Medicina molecularGenética de enfermedades; Medicina molecularDisease genetics; Molecular medicineEchocardiography has become an indispensable tool for the study of heart performance, improving the monitoring of individuals with cardiac diseases. Diverse genetic factors associated with echocardiographic measures have been previously reported. The impact of several apoptotic genes in heart development identified in experimental models prompted us to assess their potential association with human cardiac function. This study aimed at investigating the possible association of variants of apoptotic genes with echocardiographic traits and to identify new genetic markers associated with cardiac function. Genome wide data from different studies were obtained from public repositories. After quality control and imputation, a meta-analysis of individual association study results was performed. Our results confirmed the role of caspases and other apoptosis related genes with cardiac phenotypes. Moreover, enrichment analysis showed an over-representation of genes, including some apoptotic regulators, associated with Alzheimer’s disease. We further explored this unexpected observation which was confirmed by genetic correlation analyses. Our findings show the association of apoptotic gene variants with echocardiographic indicators of heart function and reveal a novel potential genetic link between echocardiographic measures in healthy populations and cognitive decline later on in life. These findings may have important implications for preventative strategies combating Alzheimer’s disease

Persistent resistance to HIV-1 infection in CD4 T cells from exposed uninfected Vietnamese individuals is mediated by entry and post-entry blocks

BACKGROUND: We have previously reported that CD4 T cells from some exposed uninfected (EU) Vietnamese intravenous drug users are relatively resistant to HIV infection in vitro. Here, we further characterized the restriction of viral replication in CD4 T cells from five EUs and assessed its persistence in serial samples. RESULTS: CD4 T cells and/or PBMC sampled during a period of between 2 and 6 years were challenged with replication-competent HIV-1 and other retroviral particles pseudotyped with envelope proteins of various tropisms. CCR5 expression and function in resistant CD4 T cells was evaluated. The step at which HIV-1 replication is restricted was investigated by real-time PCR quantification of HIV-1 reverse transcripts. We identified three patterns of durable HIV-1 restriction in EU CD4 T cells. CD4 T cells from four of the five EU subjects were resistant to HIV-1 R5 infection. In two cases this resistance was associated with low CCR5 surface expression, which was itself associated with heterozygous CCR5 mutations. In the other two cases, CD4 T cells were resistant to HIV-1 R5 infection despite normal CCR5 expression and signaling function, and normal β-chemokine secretion upon CD4 T cell activation. Instead, restriction appeared to be due to enhanced CD4 T cell sensitivity to β-chemokines in these two subjects. In the fifth EU subject the restriction involved post-entry steps of viral replication and affected not only HIV-1 but also other lentiviruses. The restriction was not overcome by a high viral inoculum, suggesting that it was not mediated by a saturable inhibitory factor. CONCLUSION: Various constitutive mechanisms of CD4 T cell resistance to HIV-1 infection, affecting entry or post-entry steps of viral replication, are associated with resistance to HIV-1 in subjects who remain uninfected despite long-term high-risk behavior