Two distinct STLV-1 subtypes infecting Mandrillus sphinx follow the geographic distribution of their hosts

The mandrill (Mandrillus sphinx) has been shown to be infected with an STLV-1 closely related to HTLV-1. Two distinct STLV-1 subtypes (D and F) infect wild mandrills with high overall prevalence (27.0%) but are different with respect to their phylogenetic relationship and parallel to the mandrills' geographic range. The clustering of these new STLV-1mnd sequences with HTLV-1 subtype D and F suggests first, past simian-tohuman transmissions in Central Africa and second, that species barriers are easier to cross over than geographic barriers

Étude du fonctionnement hydrogéologique et modélisation de l’hydrosystème de Volvic : Prise en compte du rôle joué par la forêt

In order to take account of hydrological forest role at the catchment scale, a method for evapotranspiration computation in forest context has been developed and validated on the Volvic site. This method, easily transposable, allows simulating forest management scenarios impact on hydrosystems recharge.Functioning understanding of the Volvic volcanic hydrosystem has been improved, from recharge processes to outlet functioning. The complex geological structure of the Volvic site has been modeled based on data interpretations and using a geological genetic approach. Detailed hydrogeological functioning was studied in several key sectors. The hydrogeological functioning of the Volvic hydrosystem has been modeled using the MODCOU code. In order to take account of the physical processes observed in Volvic, several modeling units has been developed and coupled to the existing tool. This model allows simulating the Volvic outlet discharge since 1985. This modeling allows suggesting a new conceptualization of hydrogeological functioning. The conservative transport modeling (chloride, 18O) validates the transfer function modeling and the evaluated altitudinal variation of climatic parameters. Then contrasted climate change scenarios were simulated.The Volvic hydrosystem functioning model constitutes an operational tool but also a pilot contributing to scientific progress in forest hydrology or in order to evaluate climate change impact on small mountainous watershed.Dans l'objectif d'évaluer l'influence de la forêt sur l'hydrologie des bassins versant, une méthode de modélisation du bilan hydrique en milieu forestier a été développée et validée sur l'hydrosystème de Volvic. Cette méthode, facilement transposable, a permis de simuler l'impact hydrologique de scénarios de gestion forestière.La compréhension du fonctionnement de l'hydrosystème volcanique complexe de Volvic a été améliorée, depuis les processus de recharge jusqu'au fonctionnement des exutoires. La structure géologique complexe du site a été modélisée en utilisant l'ensemble des données disponibles et en mettant en œuvre une approche géologique génétique. Le fonctionnement hydrogéologique détaillé a ensuite pu être étudié dans plusieurs secteurs clés. L'hydrosystème de Volvic a été modélisé en utilisant le code MODCOU. Afin de prendre en compte les processus physiques spécifiques du site, des modules ont été développés et couplés à l'outil existant. Le modèle permet ainsi de simuler le débit à l'exutoire de l'aquifère. La modélisation et l'interprétation de données ont également permis de proposer un nouveau modèle conceptuel de fonctionnement hydrogéologique. La simulation du transport de traceurs tels que le chlorure et le 18O valide la fonction de transfert et les hypothèses retenues quant aux processus de recharge. Le modèle a ensuite été utilisé pour simuler des scénarios d'évolution climatique contrastés.Le modèle de fonctionnement l'hydrosystème de Volvic constitue ainsi un outil de gestion opérationnelle mais surtout un outil pilote permettant d'apporter des réponses à des questions scientifiques d'actualité relatives au rôle hydrologique de la forêt ou à l'impact du changement climatique à l'échelle de petits bassins versants de moyenne montagne

Hydrogeological functioning study and modeling of the Volvic hydrosystem taking into account the hydrological role of the forest

Dans l'objectif d'évaluer l'influence de la forêt sur l'hydrologie des bassins versant, une méthode de modélisation du bilan hydrique en milieu forestier a été développée et validée sur l'hydrosystème de Volvic. Cette méthode, facilement transposable, a permis de simuler l'impact hydrologique de scénarios de gestion forestière.La compréhension du fonctionnement de l'hydrosystème volcanique complexe de Volvic a été améliorée, depuis les processus de recharge jusqu'au fonctionnement des exutoires. La structure géologique complexe du site a été modélisée en utilisant l'ensemble des données disponibles et en mettant en œuvre une approche géologique génétique. Le fonctionnement hydrogéologique détaillé a ensuite pu être étudié dans plusieurs secteurs clés. L'hydrosystème de Volvic a été modélisé en utilisant le code MODCOU. Afin de prendre en compte les processus physiques spécifiques du site, des modules ont été développés et couplés à l'outil existant. Le modèle permet ainsi de simuler le débit à l'exutoire de l'aquifère. La modélisation et l'interprétation de données ont également permis de proposer un nouveau modèle conceptuel de fonctionnement hydrogéologique. La simulation du transport de traceurs tels que le chlorure et le 18O valide la fonction de transfert et les hypothèses retenues quant aux processus de recharge. Le modèle a ensuite été utilisé pour simuler des scénarios d'évolution climatique contrastés.Le modèle de fonctionnement l'hydrosystème de Volvic constitue ainsi un outil de gestion opérationnelle mais surtout un outil pilote permettant d'apporter des réponses à des questions scientifiques d'actualité relatives au rôle hydrologique de la forêt ou à l'impact du changement climatique à l'échelle de petits bassins versants de moyenne montagne.In order to take account of hydrological forest role at the catchment scale, a method for evapotranspiration computation in forest context has been developed and validated on the Volvic site. This method, easily transposable, allows simulating forest management scenarios impact on hydrosystems recharge.Functioning understanding of the Volvic volcanic hydrosystem has been improved, from recharge processes to outlet functioning. The complex geological structure of the Volvic site has been modeled based on data interpretations and using a geological genetic approach. Detailed hydrogeological functioning was studied in several key sectors. The hydrogeological functioning of the Volvic hydrosystem has been modeled using the MODCOU code. In order to take account of the physical processes observed in Volvic, several modeling units has been developed and coupled to the existing tool. This model allows simulating the Volvic outlet discharge since 1985. This modeling allows suggesting a new conceptualization of hydrogeological functioning. The conservative transport modeling (chloride, 18O) validates the transfer function modeling and the evaluated altitudinal variation of climatic parameters. Then contrasted climate change scenarios were simulated.The Volvic hydrosystem functioning model constitutes an operational tool but also a pilot contributing to scientific progress in forest hydrology or in order to evaluate climate change impact on small mountainous watershed

Étude du fonctionnement hydrogéologique et modélisation de l’hydrosystème de Volvic : Prise en compte du rôle joué par la forêt

In order to take account of hydrological forest role at the catchment scale, a method for evapotranspiration computation in forest context has been developed and validated on the Volvic site. This method, easily transposable, allows simulating forest management scenarios impact on hydrosystems recharge.Functioning understanding of the Volvic volcanic hydrosystem has been improved, from recharge processes to outlet functioning. The complex geological structure of the Volvic site has been modeled based on data interpretations and using a geological genetic approach. Detailed hydrogeological functioning was studied in several key sectors. The hydrogeological functioning of the Volvic hydrosystem has been modeled using the MODCOU code. In order to take account of the physical processes observed in Volvic, several modeling units has been developed and coupled to the existing tool. This model allows simulating the Volvic outlet discharge since 1985. This modeling allows suggesting a new conceptualization of hydrogeological functioning. The conservative transport modeling (chloride, 18O) validates the transfer function modeling and the evaluated altitudinal variation of climatic parameters. Then contrasted climate change scenarios were simulated.The Volvic hydrosystem functioning model constitutes an operational tool but also a pilot contributing to scientific progress in forest hydrology or in order to evaluate climate change impact on small mountainous watershed.Dans l'objectif d'évaluer l'influence de la forêt sur l'hydrologie des bassins versant, une méthode de modélisation du bilan hydrique en milieu forestier a été développée et validée sur l'hydrosystème de Volvic. Cette méthode, facilement transposable, a permis de simuler l'impact hydrologique de scénarios de gestion forestière.La compréhension du fonctionnement de l'hydrosystème volcanique complexe de Volvic a été améliorée, depuis les processus de recharge jusqu'au fonctionnement des exutoires. La structure géologique complexe du site a été modélisée en utilisant l'ensemble des données disponibles et en mettant en œuvre une approche géologique génétique. Le fonctionnement hydrogéologique détaillé a ensuite pu être étudié dans plusieurs secteurs clés. L'hydrosystème de Volvic a été modélisé en utilisant le code MODCOU. Afin de prendre en compte les processus physiques spécifiques du site, des modules ont été développés et couplés à l'outil existant. Le modèle permet ainsi de simuler le débit à l'exutoire de l'aquifère. La modélisation et l'interprétation de données ont également permis de proposer un nouveau modèle conceptuel de fonctionnement hydrogéologique. La simulation du transport de traceurs tels que le chlorure et le 18O valide la fonction de transfert et les hypothèses retenues quant aux processus de recharge. Le modèle a ensuite été utilisé pour simuler des scénarios d'évolution climatique contrastés.Le modèle de fonctionnement l'hydrosystème de Volvic constitue ainsi un outil de gestion opérationnelle mais surtout un outil pilote permettant d'apporter des réponses à des questions scientifiques d'actualité relatives au rôle hydrologique de la forêt ou à l'impact du changement climatique à l'échelle de petits bassins versants de moyenne montagne

Étude du fonctionnement hydrogéologique et modélisation de l’hydrosystème de Volvic : Prise en compte du rôle joué par la forêt

In order to take account of hydrological forest role at the catchment scale, a method for evapotranspiration computation in forest context has been developed and validated on the Volvic site. This method, easily transposable, allows simulating forest management scenarios impact on hydrosystems recharge.Functioning understanding of the Volvic volcanic hydrosystem has been improved, from recharge processes to outlet functioning. The complex geological structure of the Volvic site has been modeled based on data interpretations and using a geological genetic approach. Detailed hydrogeological functioning was studied in several key sectors. The hydrogeological functioning of the Volvic hydrosystem has been modeled using the MODCOU code. In order to take account of the physical processes observed in Volvic, several modeling units has been developed and coupled to the existing tool. This model allows simulating the Volvic outlet discharge since 1985. This modeling allows suggesting a new conceptualization of hydrogeological functioning. The conservative transport modeling (chloride, 18O) validates the transfer function modeling and the evaluated altitudinal variation of climatic parameters. Then contrasted climate change scenarios were simulated.The Volvic hydrosystem functioning model constitutes an operational tool but also a pilot contributing to scientific progress in forest hydrology or in order to evaluate climate change impact on small mountainous watershed.Dans l'objectif d'évaluer l'influence de la forêt sur l'hydrologie des bassins versant, une méthode de modélisation du bilan hydrique en milieu forestier a été développée et validée sur l'hydrosystème de Volvic. Cette méthode, facilement transposable, a permis de simuler l'impact hydrologique de scénarios de gestion forestière.La compréhension du fonctionnement de l'hydrosystème volcanique complexe de Volvic a été améliorée, depuis les processus de recharge jusqu'au fonctionnement des exutoires. La structure géologique complexe du site a été modélisée en utilisant l'ensemble des données disponibles et en mettant en œuvre une approche géologique génétique. Le fonctionnement hydrogéologique détaillé a ensuite pu être étudié dans plusieurs secteurs clés. L'hydrosystème de Volvic a été modélisé en utilisant le code MODCOU. Afin de prendre en compte les processus physiques spécifiques du site, des modules ont été développés et couplés à l'outil existant. Le modèle permet ainsi de simuler le débit à l'exutoire de l'aquifère. La modélisation et l'interprétation de données ont également permis de proposer un nouveau modèle conceptuel de fonctionnement hydrogéologique. La simulation du transport de traceurs tels que le chlorure et le 18O valide la fonction de transfert et les hypothèses retenues quant aux processus de recharge. Le modèle a ensuite été utilisé pour simuler des scénarios d'évolution climatique contrastés.Le modèle de fonctionnement l'hydrosystème de Volvic constitue ainsi un outil de gestion opérationnelle mais surtout un outil pilote permettant d'apporter des réponses à des questions scientifiques d'actualité relatives au rôle hydrologique de la forêt ou à l'impact du changement climatique à l'échelle de petits bassins versants de moyenne montagne

A 3-D genetic approach to high-resolution geological modelling of the volcanic infill of a paleovalley system. Application to the Volvic catchment (Chaîne des Puys, France)

International audienceThe Volvic natural mineral water is catched in a complex volcanic aquifer located in the northern part of the "Chaine des Puys" volcanic system (Auvergne, France). In the watershed, water transits through scoria cones and basaltic to trachybasaltic lava flows. These aa lava flows, emitted by strombolian cones between 75,000 and 10,000 years ago, are emplaced in deep paleovalleys incised within the variscan crystalline bedrock. The volcanic infill is highly heterogeneous. In order to build a hydrogeological model of the watershed, a simple but robust methodology was developed to reconstruct the bedrock morphology and the volcanic infill in this paleovalley context. This methodology, based on the combination of genetic and geometric approaches, appears to be rather efficient to define both the substratum and the lava flows geometry. A 3D geological model is then proposed. It synthesizes the data from 99 boreholes logs, 2D geoelectric profiles, morphologic clues, datings and petrographic data. A genetic approach, integrating aa lava flow morphology and emplacement behaviour, was used to reconstruct the chronology of the volcanic events and lava flow emplacement from the upper part of the Domes plateau to the Limagne plain. The precision of the volcanic reconstruction is discussed: the main limitation of the methodology are related to the homogeneity of the petrographic and geochemical composition of the lava flows succession (except for the trachyandesitic Nugere lava), the spatially variable borehole density, the lack of a real petrographical and geological description on most of the available geological logs. Nevertheless, the developed methodology combining spatial and genetic approaches appears to be well adapted to constrain complex lava flow infill geometries in paleovalley context

MAJOR CHALLENGES AND PROPOSALS FOR HARMONIOUS MANAGEMENT AND PROTECTION OF WATER AND WOOD RESOURCES

Among the various environmental functions exercised by forests, protection of water resources deserves special attention to which several recent projects have contributed. Because forest cover is continuous, the intense biological activity of forest soils, silvicultural practices involving few chemical inputs, the water coming from forest-covered watersheds is of higher quality than that coming from other types of land use and at a low cost. Forestry activities may however generate localised or diffuse contaminations that should be prevented for which technical solutions are well known. However, procedures concerning the protection of catchment areas prove difficult to implement. Another financial incentive based on contract is currently being investigated. In quantitative terms, forests very significantly influence rainfall patterns, with two antagonistic effects: indeed, the forests reduces run-off and are conducive to water seepage into the aquifers, but they nonetheless intercept and transpire a significant portion of that rainfall. Depending on the architecture of forests and catchment areas, the overall quantitative balance, compared to other types of land uses, may be a surplus or a deficit in terms of the water resource. The digital modelling tool developed under the LIFE+ SEMEAU project provides a means of measuring this quantitative role of forests together with some qualitative effects (nitrates). This integrated approach has enable the Société des Eaux de Volvic to supplement its water protection policy in partnership with all the forest players in the catchment area. This project opens up prospects for technical improvement of “hydrological productivity” of forests. In areas subjected to heavy demographic or climatic pressures, this opportunity for mitigating tensions relating to the water resource is an additional goal for forest management. In this regard, it is desirable to review the funding mechanisms for water management so as to move them away from the generally curative measures and more towards the virtuous promotion of environmental amenitiesParmi les diverses fonctions environnementales exercées par la forêt, la protection de la ressource en eau mérite une attention particulière, que plusieurs projets récents ont permis de nourrir. Grâce à la pérennité du couvert, la forte activité biologique des sols forestiers, des pratiques sylvicoles peu consommatrices d’intrants chimiques, l’eau issue des bassins versants forestiers présente, à faible coût, une qualité supérieure à celle des autres types d’occupation du sol. L’activité forestière peut néanmoins générer des contaminations ponctuelles ou diffuses qu’il convient de prévenir. Les solutions techniques sont maîtrisées. En revanche, les procédures de protection des périmètres de captage se révèlent difficilement applicables. Une autre forme de dispositif financier basé sur la contractualisation est actuellement à l’étude. Sous l’angle quantitatif, la forêt influence très significativement le devenir des pluies, avec deux effets antagonistes : certes la forêt réduit le ruissellement et favorise l’infiltration des eaux vers les aquifères, mais encore elle intercepte et transpire une part significative des précipitations. Selon les configurations forestières et celles des bassins versants, le bilan global quantitatif, par rapport à d’autres types d’occupation du sol, peut être excédentaire ou déficitaire en termes de ressource en eau. L’outil de modélisation numérique développé dans le cadre du projet LIFE+ SEMEAU permet de quantifier ce rôle hydrologique quantitatif de la forêt, ainsi que certains effets qualitatifs (nitrates). Cette démarche intégrative a permis à la Société des Eaux de Volvic de compléter sa politique de protection des eaux en y associant tous les acteurs forestiers du bassin versant. Ce projet ouvre des perspectives techniques pour améliorer la « productivité hydrologique » forestière. Dans les zones sous forte tension démographique ou climatique, cette opportunité d’atténuation des tensions liées à la ressource en eau donnera à la gestion forestière une finalité complémentaire. Pour cela, il conviendra de réviser les modalités de financement de la gestion de l’eau en la réorientant, de priorités trop exclusivement curatives, vers une promotion vertueuse des aménité

Impact of Viral Factors on Very Early In Vivo Replication Profiles in Simian Immunodeficiency Virus SIVagm-Infected African Green Monkeys

To better understand which factors govern the levels of viral loads in early lentiviral infections of primates, we developed a model that allows distinguishing between the influences of host and viral factors on viremia. Herein we report that two species of African green monkeys (Chlorocebus sabaeus and C. pygerythrus) infected with their respective wild-type simian immunodeficiency virus SIVagm viruses (SIVagm.sab92018 and SIVagm.ver644) consistently showed reproducible differences in viremia during primary infection but not at later stages of infection. Cross-infections of SIVagm.sab92018 and SIVagm.ver644 into, respectively, C. pygerythrus and C. sabaeus revealed that the dynamics of viral replication during primary infection were dependent on the viral strain used for the infection but not on the host. Hence, the kinetics of SIVagm.sab92018 and SIVagm.ver644 were similar in both sabaeus and vervet animals, indicating that the difference in viremia levels between the two groups during the early phase of infection was not associated with the host. Coreceptor usage for these two strains showed a larger coreceptor repertoire for SIVagm.sab92018, which is able to efficiently use CXCR4 in addition to CCR5, than for SIVagm.ver644, which showed a classical CCR5 coreceptor usage pattern. These differences could not be explained by different charges of the V3 loop for SIVagm.sab92018 and for SIVagm.ver644. In conclusion, our study showed that the extent of virus replication during the primary infection is primarily dependent on viral determinants