AVALIAÇÃO QUALI-QUANTITATIVA DA ARBORIZAÇÃO NA PRAÇA AGOSTINHO NOHAMA, BAIRRO LAUZANE PAULISTA, SÃO PAULO – SP

A vegetação urbana influencia as condições climáticas e biológicas de determinado local, e podem trazer inúmeras contribuições ecológicas, econômicas e sociais. Portanto, objetivou-se avaliar quali-quantitativamente a arborização da Praça Agostinho Nohama, localizada na zona norte do município de São Paulo (SP), para garantir os benefícios proporcionados pelas áreas verdes. Para tanto, foram inventariados todos os indivíduos arbustivos e arbóreos com circunferência a altura do peito (CAP) ≥10 cm, e observaram-se características físicas, biológicas e fitossanitárias. Foram quantificados 333 indivíduos vivos, distribuídos em 85 espécies, pertencentes a 67 gêneros de 36 famílias. Há cultivo de espécies exóticas no local. Sobre as condições gerais dos espécimes amostrados, 289 indivíduos (85,3%) estão em bom estado de conservação, 39 (11,5%) necessitam de cuidados por apresentarem injúrias físicas e/ou biológicas e, 11 (3,2%) precisam ser removidos, por oferecerem risco aos seus frequentadores. A Praça apresenta importante papel ecológico, por interagir com líquens, insetos, epífitas e aves. A fim de contribuir com a diversidade regional e possibilitar atividades de educação ambiental, sugere-se um plantio das espécies nativas do complexo, Cantareira

Dietary fats significantly influence the survival of penumbral neurons in a permanent isquemic stroke rat model by modifying lipid mediators, inflammatory biomarkers, nos production, and redox-dependent apoptotic signals

Objective: Brain stroke is the third most important cause of death in developed countries. We studied the effect of different dietary lipids on the outcome of a permanent ischemic stroke rat model. Methods: Wistar rats were fed diets containing 7% commercial oils (S, soybean; O, olive; C, coconut; G, grape seed) for 35 d. Stroke was induced by permanent middle cerebral artery occlusion. Coronal slices from ischemic brains and sham-operated animals were supravitally stained. Penumbra and core volumes were calculated by image digitalization after 24, 48, and 72 h poststroke. Homogenates and mitochondrial fractions were prepared from different zones and analyzed by redox status, inflammatory markers, ceramide, and arachidonate content, phospholipase A2, NOS, and proteases. Results: Soybean (S) and G diets were mainly prooxidative and proinflammatory by increasing the liberation of arachidonate and its transformation into prostaglandins. O was protective in terms of redox homeostatic balance, minor increases in lipid and protein damage, conservation of reduced glutathione, protective activation of NOS in penumbra, and net ratio of anti-to proinflammatory cytokines. Apoptosis (caspase-3, milli- and microcalpains) was less activated by O than by any other diet. Conclusion: Dietary lipids modulate NOS and PLA2 activities, ceramide production, and glutathione import into the mitochondrial matrix, finally determining the activation of the two main protease systems involved in programmed cell death. Olive oil appears to be a biological source for the isolation of protective agents that block the expansion of brain core at the expense of penumbral neurons.Facultad de Ciencias MédicasInstituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plat

Dietary fats significantly influence the survival of penumbral neurons in a permanent isquemic stroke rat model by modifying lipid mediators, inflammatory biomarkers, nos production, and redox-dependent apoptotic signals

Objective: Brain stroke is the third most important cause of death in developed countries. We studied the effect of different dietary lipids on the outcome of a permanent ischemic stroke rat model. Methods: Wistar rats were fed diets containing 7% commercial oils (S, soybean; O, olive; C, coconut; G, grape seed) for 35 d. Stroke was induced by permanent middle cerebral artery occlusion. Coronal slices from ischemic brains and sham-operated animals were supravitally stained. Penumbra and core volumes were calculated by image digitalization after 24, 48, and 72 h poststroke. Homogenates and mitochondrial fractions were prepared from different zones and analyzed by redox status, inflammatory markers, ceramide, and arachidonate content, phospholipase A2, NOS, and proteases. Results: Soybean (S) and G diets were mainly prooxidative and proinflammatory by increasing the liberation of arachidonate and its transformation into prostaglandins. O was protective in terms of redox homeostatic balance, minor increases in lipid and protein damage, conservation of reduced glutathione, protective activation of NOS in penumbra, and net ratio of anti-to proinflammatory cytokines. Apoptosis (caspase-3, milli- and microcalpains) was less activated by O than by any other diet. Conclusion: Dietary lipids modulate NOS and PLA2 activities, ceramide production, and glutathione import into the mitochondrial matrix, finally determining the activation of the two main protease systems involved in programmed cell death. Olive oil appears to be a biological source for the isolation of protective agents that block the expansion of brain core at the expense of penumbral neurons.Facultad de Ciencias MédicasInstituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plat

La renovación de la palabra en el bicentenario de la Argentina : los colores de la mirada lingüística

El libro reúne trabajos en los que se exponen resultados de investigaciones presentadas por investigadores de Argentina, Chile, Brasil, España, Italia y Alemania en el XII Congreso de la Sociedad Argentina de Lingüística (SAL), Bicentenario: la renovación de la palabra, realizado en Mendoza, Argentina, entre el 6 y el 9 de abril de 2010. Las temáticas abordadas en los 167 capítulos muestran las grandes líneas de investigación que se desarrollan fundamentalmente en nuestro país, pero también en los otros países mencionados arriba, y señalan además las áreas que recién se inician, con poca tradición en nuestro país y que deberían fomentarse. Los trabajos aquí publicados se enmarcan dentro de las siguientes disciplinas y/o campos de investigación: Fonología, Sintaxis, Semántica y Pragmática, Lingüística Cognitiva, Análisis del Discurso, Psicolingüística, Adquisición de la Lengua, Sociolingüística y Dialectología, Didáctica de la lengua, Lingüística Aplicada, Lingüística Computacional, Historia de la Lengua y la Lingüística, Lenguas Aborígenes, Filosofía del Lenguaje, Lexicología y Terminología

Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

Funder: NCI U24CA211006Abstract: The Cancer Genome Atlas (TCGA) and International Cancer Genome Consortium (ICGC) curated consensus somatic mutation calls using whole exome sequencing (WES) and whole genome sequencing (WGS), respectively. Here, as part of the ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium, which aggregated whole genome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumour types, we compare WES and WGS side-by-side from 746 TCGA samples, finding that ~80% of mutations overlap in covered exonic regions. We estimate that low variant allele fraction (VAF < 15%) and clonal heterogeneity contribute up to 68% of private WGS mutations and 71% of private WES mutations. We observe that ~30% of private WGS mutations trace to mutations identified by a single variant caller in WES consensus efforts. WGS captures both ~50% more variation in exonic regions and un-observed mutations in loci with variable GC-content. Together, our analysis highlights technological divergences between two reproducible somatic variant detection efforts

Taxonomia e diversidade de diatomáceas epifíticas nos reservatórios Iraí e Piraquara II, Região Metropolitana de Curitiba - PR

Orientador : Dra. Thelma A. Veiga LudwigCoorientador : Dr. André Andrian PadialDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Botânica. Defesa: Curitiba, 12/08/2015Inclui referências : f. 93-112Resumo: Diatomáceas são algas microscópicas encontradas em praticamente todos os ambientes aquáticos e compreendem porção representativa da biomassa dos produtores primários nas regiões litorâneas dos corpos d'água. Caracterizam-se pela parede celular de natureza silícea denominada frústula, estrutura com ornamentações diversificadas utilizadas como base da taxonomia do grupo. Apesar da complexidade morfológica e taxonômica que existente em alguns gêneros, o conhecimento da flora diatomológica do país é de extrema relevância. A acurada identificação de espécies é fundamental, pois é crescente sua aplicabilidade no conhecimento da qualidade da água de corpos d'água. Inúmeras diatomáceas crescem sob condições químicas e físicas muito específicas e servem como poderosas bioindicadoras de características particulares das águas, especialmente em casos de eutrofização e acidificação ambiental. Constituem também, ferramenta para outros estudos em ecossistemas aquáticos, tais como avaliações da integridade ecológica, associando a estruturação da comunidade com as variáveis ambientais, espacial e/ou temporal, uma vez que estas algas respondem rapidamente às condições ambientais. A comunidade perifítica é particularmente sensível às variações ambientais naturais e aos efeitos da poluição antropogênica. O presente estudo teve como objetivos (i) a identificação de espécies de diatomáceas das comunidades perifíticas nos reservatórios Iraí e Piraquara II (com níveis de trofia diferente entre eles), localizados na região metropolitana de Curitiba, e (ii) a caracterização das variações da diversidade entre diferentes escalas espaciais e temporais. As amostras epifíticas foram coletadas no outono e na primavera de substratos naturais (macrófitas), em seis unidades amostrais (em tréplicas), totalizando 18 amostras em cada reservatório. Removido o biofilme dos caules de macrófitas em volume conhecido, as amostras foram oxidadas. Lâminas foram confeccionadas para identificação das diatomáceas e contagem de valvas. Após a contagem utilizando o índice de Rarefação em que o critério de parada foi estipulado em 20 campos sem nenhuma espécie nova registrada (assíntota) e calculadas as densidades das espécies, avaliaram-se a variação na densidade e riqueza, por meio do teste t, e a diferença na composição das comunidades, entre os reservatórios, através da PERMANOVA. Análise de coordenadas principais (PCoA) foi utilizada para visualização da variação das floras entre reservatórios e entre os períodos. Espécies indicadoras do ambiente foram identificadas através do IndVal. A diversidade total (gama) foi particionada em diversidade beta e alfa, utilizando Partição Aditiva, gerando componentes, alfa, beta 1, beta 2 e beta 3 para as diferentes escalas espaciais. Por fim, os componentes beta foram fracionados em turnover e aninhamento. Quanto à diatomoflórula, no reservatório do Iraí foram identificadas 132 táxons infragenéricos, distribuídas em 17 famílias e no Piraquara II, 132 táxons infragenéricos distribuídas em 22 famílias, totalizando 174 espécies determinadas, entre as quais 14 foram descritas como indicadoras para os reservatórios nos dois períodos. Espécies pioneiras para o estado do Paraná foram comentadas. Ocorreu variação espacial e temporal na diversidade de espécies nos dois reservatórios, indicando que estudos posteriores utilizem reservatórios como unidades amostrais. Os componentes, alfa e beta 3, foram maiores que o esperado para os dois reservatórios. A riqueza de espécies, baseada na diversidade beta, apresentou maior influência, de modo geral, de turnover do que de aninhamento. Este último mostrou maior relevância entre períodos (outono, inverno), apesar do turnover ter sido o principal componente da diversidade. Maior taxa de turnover do que de aninhamento tem importantes implicações práticas na estratégia de amostragem em reservatórios e sugerem que uma representação adequada da comunidade em reservatórios urbanos é alcançada somando duas circunstâncias, primeiro quando as amostragens contemplam diferentes setores dos reservatórios e segundo, quando os pontos de amostragem são amplamente amostrados (como as pseudoréplicas). Palavras-chave: Diversidade beta, perifíton, aninhamento, turnover.Abstract: Diatoms are microscopic algae found in almost all aquatic environments and include representative portion of the biomass of primary producers in coastal areas of water bodies. The diatoms is characterized by cell wall silícea denominated frustula, structure with diverse adornments used as the basis of the group's taxonomy. Despite the morphological and taxonomic complexity that exists in some genus the knowledge of diatomológica flora of the country is extremely important. Accurate identification of species is fundamental because is increasing its applicability in the knowledge of the quality of bodies of water. Numerous diatoms grow under very specific physical and chemical conditions and serve as powerful bioindicator particular characteristics of the water, especially in cases of eutrophication and environmental acidification. They are also tool for other studies in aquatic ecosystems, such as assessments of ecological integrity by linking community structure with environmental variables, spatial and / or temporal, as these algae respond quickly to environmental conditions. Periphyton is particularly sensitive to natural environmental variations and effects of anthropogenic pollution. This study aimed to (i) the identification of diatom species of periphyton communities in Irai and Piraquara II reservoir (with different trophic levels), located in the metropolitan region of Curitiba, and (ii) the characterization of variations diversity among different spatial and temporal scales. The epiphytic samples were collected in the fall and in the spring of natural substrates (weeds) in six sampling units (in rejoinders), totaling 18 samples in each reservoir. Removed the biofilm stems of weeds in known volume, the samples were oxidized. Slides were produced for identification of diatoms and valves count. After counting using Rarefaction index in which the stopping criterion was set at 20 fields with no additional species (asymptote) and calculated densities of species, assessed the variation in the density and richness, using the t test, and the difference in composition of communities, between the reservoirs through PERMANOVA. Principal coordinates analysis (PCoA) was used to visualize the change in floras between reservoirs and between periods. Environment indicator species were identified by IndVal. The overall diversity index (range) was partitioned into alpha and beta diversity using Partition Additive generating components, alpha, beta 1, beta 2 and beta 3 for different spatial scales. Finally, beta components were fractionated in turnover and nestedness. As for diatomoflórula in Iraí the reservoir were identified 132 taxa infrageneric, distributed in 17 families and Piraquara II, 132 infrageneric taxa distributed among 22 families, totaling 174 certain species, among which 14 were described as indicators for reservoirs in both periods. Pioneer species to the state of Paraná were commented. Occurred spatial and temporal variation in species diversity in both reservoirs, indicating that further studies using reservoir as sample units. The components, alpha and beta 3, were higher than expected for the two reservoirs. Species richness based on beta diversity, presented greater influence in general, turnover than nestedness. The latter showed greater relevance between periods (fall, winter), despite the turnover have been the main component of diversity. Higher turnover rate than nestedness has important practical implications for the sampling strategy in reservoirs and suggest that adequate representation of the community in urban reservoirs is achieved by adding two circumstances, first when the samples include different sectors of the reservoirs and second, when the points sampling are widely sampled (as pseudoréplicas). Keywords: Beta diversity, periphyton, nestedness, turnover

Dietary fats significantly influence the survival of penumbral neurons in a rat model of chronic ischemic by modifying lipid mediators, inflammatory biomarkers, NOS production, and redox-dependent apoptotic signals

Objective: Brain stroke is the third most important cause of death in developed countries. We studied the effect of different dietary lipids on the outcome of a permanent ischemic stroke rat model. Methods: Wistar rats were fed diets containing 7% commercial oils (S, soybean; O, olive; C, coconut; G, grape seed) for 35 d. Stroke was induced by permanent middle cerebral artery occlusion. Coronal slices from ischemic brains and sham-operated animals were supravitally stained. Penumbra and core volumes were calculated by image digitalization after 24, 48, and 72 h poststroke. Homogenates and mitochondrial fractions were prepared from different zones and analyzed by redox status, inflammatory markers, ceramide, and arachidonate content, phospholipase A2, NOS, and proteases. Results: Soybean (S) and G diets were mainly prooxidative and proinflammatory by increasing the liberation of arachidonate and its transformation into prostaglandins. O was protective in terms of redox homeostatic balance, minor increases in lipid and protein damage, conservation of reduced glutathione, protective activation of NOS in penumbra, and net ratio of anti-to proinflammatory cytokines. Apoptosis (caspase-3, milli- and microcalpains) was less activated by O than by any other diet. Conclusion: Dietary lipids modulate NOS and PLA2 activities, ceramide production, and glutathione import into the mitochondrial matrix, finally determining the activation of the two main protease systems involved in programmed cell death. Olive oil appears to be a biological source for the isolation of protective agents that block the expansion of brain core at the expense of penumbral neurons.Fil: Lausada, Natalia Raquel. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Cs.medicas. Laboratorio de Transplante de Organos; ArgentinaFil: Arnal, Nathalie. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Astiz, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Marin, Maria Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Lofeudo, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Stringa, Pablo Luis. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Cs.medicas. Laboratorio de Transplante de Organos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Tacconi, Maria Josefa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Tacconi, Irma Nelva. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Cs.medicas. Laboratorio de Transplante de Organos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Hurtado, Graciela Elisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Cristalli de Piñero, Norma. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Pallanza, Maria Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Illara, Maria Eva. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; ArgentinaFil: Bozzarello, Enrique Gustavo. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Infraestructura; ArgentinaFil: Cristalli, Diana Olga. Hospital San Roque. Servicio de Neurolog ıa; ArgentinaFil: Marra, Carlos Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata; Argentin