Improvement of TestH: a C Library for Generating Self-Similar Series and for Estimating the Hurst Parameter

The discovery of consistent dependencies between values in certain data series paved the way for the development of algorithms that could, somehow, classify the degree of self-similarity between values and derive considerations about the behavior of these series. This self-similarity metric is typically known as the Hurst Parameter, and allows the classification of the behavior of a data series as persistent, anti-persistent, or purely random. This discovery was highly relevant in the field of computer networks, inclusively helping companies to develop equipment and infrastructure that suit their needs more efficiently. The Hurst Parameter is relevant in many other fields, and it has been for exemple applied in the study of geologic phenomena [KTC07] or even on areas related with health sciencies[VAJ08, HPS+12]. There are several algorithms for estimating the Hurst Parameter [Hur51, Hig88, RPGC06], and each one of them has its strengths and weaknesses. The usage of these algorithms is sometimes difficult, motivating the creation of tools or libraries that provide them in a more user-friendly manner. Unfortunately, and despite of being an area that has been studied for decades, the tools available have limitations and do not implement all algorithms available in the literature. The work presented in this dissertation consists on the improvement of TestH, a library written in ANSI C for the study of self-similarity in time series, which was initially developed by Fernandes et al. [FNS+14]. These improvements are materialized as the addition of algorithms to estimate the Hurst Parameter and to generate self-similar sequences. Additionally, auxiliary functions were implemented, along with code refactoring, documentation of the application programming interface and the creation of a website for the project. This dissertation is mostly focused on the algorithms that were introduced in TestH, namely the Periodogram, the Higuchi method, the Hurst Exponent by Autocorrelation Function and the Detrended Fluctuation Analysis estimators, and the Davies and Hart method for generating selfsimilar sequences. In order to turn TestH into a robust and trustable library, several tests were performed comparing the results of these implementations with the values provided by similar tools. The overall results obtained in these tests are in line with expectations and the algorithms that are simultaneously implemented in TestH and in the other tools analyzed (for example, the Periodogram) returned very similar results, corroborating the belief that the methods were well implemented.A descoberta da dependência consistente entre valores em certas séries de dados, abriu caminho para o desenvolvimento de algoritmos que permitissem, de alguma forma, classificar o grau de auto-semelhança entre valores e tecer considerações sobre o comportamento da série. A esta estatística dá-se o nome de Parâmetro de Hurst, que permite analisar e classificar o comportamento de uma série de dados como persistente, antipersistente ou puramente aleatória. Esta descoberta tem sido bastante relevante na área das redes de computadores, onde serve, p.ex., de ajuda às empresas para desenvolverem equipamentos e infraestruturas adequadas às suas necessidades. Para além do elevado interesse que a referida área apresentou por esta métrica, existem outros campos ciêntificos onde algoritmos para estimar o Parâmetro de Hurst de sequências de valores estão a ser aplicados, como por exemplo no estudo de fenómenos geológicos [KTC07], bem como em fenómenos ligados às ciências da saúde [VAJ08, HPS+12]. Existem vários algoritmos para estimar o Parâmetro de Hurst [Hur51, Hig88, RPGC06], tendo cada um deles as suas virtudes e fraquezas. A utilização destes algoritmos é por vezes difícil, motivando a criação de ferramentas e bibliotecas que os congregam e disponibilizam de uma forma mais amigável ao utilizador. Infelizmente, e apesar de ser uma área que está a ser alvo de estudos há décadas, as ferramentas existentes, para além de não implementarem a totalidade dos algoritmos mais relevantes, apresentam ainda algumas limitações. Desta forma, o trabalho apresentado nesta dissertação consiste, principalmente, na melhoria da TestH, uma biblioteca escrita em ANSI C para o estudo de séries temporais auto-semelhantes, inicialmente desenvolvida por Fernandes et al. [FNS+14]. Estas melhorias materializam-se sobretudo na adição de algoritmos para estimar o Parâmetro de Hurst e gerar séries de dados auto-semelhantes. Adicionalmente foram introduzidas funções auxiliares, foi efetuada a refactorização do código, documentação das interfaces de programação e ainda a criação de um sítio web para divulgação do projeto. Esta dissertação dá enfase aos algoritmos de estimação do Parâmetro de Hurst e geração de séries auto-semelhantes. Relativamente à estimação, foram introduzidos na TestH, no âmbito deste trabalho, o Periodograma, o método de Higuchi, a estimação através da função de autocorrelação e o método de análise através da remoção das tendências. No que respeita à geração de séries, foi também introduzido o método de Davies e Hart. Com o objetivo de tornar a TestH robusta e credível, foram realizados vários testes, comparando os resultados destas implementações com os valores fornecidos por ferramentas semelhantes. Os resultados obtidos estão alinhados com o esperado e, inclusivamente, os algoritmos que se encontram implementados na TestH e restantes ferramentas analisadas (como por exemplo, o Periodograma), apresentaram valores bastante semelhantes entre si, corroborando a crença da correção da implementação dos vários métodos

Role of EGF mediated laminin y2 chain in uterine cervix carcinoma

Tese de mestrado em Biologia Molecular e Genética, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2017A carcinogénese é um processo complexo e gradual de transformação pelo qual as células normais originam células com potencial neoplásico. Durante este processo, as células cancerígenas adquirem características de malignidade, que resultam da acumulação de várias mutações genéticas e alterações epigenéticas, levando assim, à ativação de oncogenes e inativação de genes supressores de tumores. Essas caraterísticas são designadas de hallmarks do cancro, sendo que as principais são: autossuficiência em relação aos sinais de crescimento, insensibilidade aos sinais de anti-crescimento, resistência à apoptose, elevado potencial replicativo, aumento do potencial angiogénico, evasão ao controlo imunitário, reprogramação metabólica e capacidade de invasão tecidular e metastização. O microambiente que envolve células cancerígenas também atua neste processo como uma rede funcional, que inclui células normais, fatores mediadores e componentes da matriz extracelular. O carcinoma do colo útero é o quarto tipo de cancro mais comum em mulheres em todo o mundo, sendo diagnosticados anualmente 528 000 novos casos. Em 2012 ocorreram 266 000 mortes relacionadas com este tipo carcinoma. Em Portugal, a taxa de incidência e mortalidade é relativamente alta, sendo a incidência de 10,8 e a mortalidade de 4,9 (taxas por 100.000 indivíduos por ano). Existem vários tipos histológicos de cancro do colo do útero, no entanto, os dois tipos mais comuns são os adenocarcinomas e os carcinomas pavimento-celulares, que compreendem 75-90 e 10-25% de todos os casos, respetivamente. O vírus do papiloma humano (HPV- human papillomavirus) é transmitido sexualmente e está bem estabelecido o seu papel como agente etiológico de vários tipos de cancro na área anogenital, incluindo o cancro de colo do útero. Aproximadamente 70% dos cancros do colo do útero estão diretamente associados aos sorotipos HPV16 e HPV18. Os genes E6 e E7 dos HPV de alto risco são oncogenes que desregulam o controlo do ciclo celular, podendo originar a transformação maligna das células. A matriz extracelular (ECM – extracellular matrix) é um componente chave do microambiente tumoral, sendo que nos últimos anos foi reconhecido o seu papel no processo carcinogénico. A ECM é composta por uma rede complexa de macromoléculas como colagénios, lamininas, fibronectinas e proteoglicanos. A sua principal função é o suporte tecidular, no entanto, também participa no controlo de eventos celulares como proliferação celular, adesão, migração, invasão e apoptose. As lamininas são glicoproteínas extracelulares de elevado peso molecular, sendo um dos principais componentes estruturais dos filamentos de ancoragem presentes nas membranas basais (BM - basement membrane). Todas as lamininas são proteínas heterotriméricas, que contêm três cadeias, denominadas α, β e . Atualmente estão descritas 16 lamininas com diferentes propriedades que resultam da conjugação das diferentes subunidades. A sua expressão é altamente regulada durante o desenvolvimento e a sua distribuição é tecido-específica. A laminina-332 (anteriormente denominada laminina 5) é um subtipo de laminina específica das BM dos epitélios, sendo a sua forma trimérica constituída pelas cadeias α3, β3 e 2. Nos tecidos normais, a laminina-332 interage com as integrinas 31, 61 e 64. Esta interceção é muito importante na adesão celular e por essa razão também está envolvida na migração e a invasão celular. Atualmente, a importância da laminina-332 é um assunto de destaque em diversas revisões bibliográficas, onde foram descritas novas funções estruturais e reguladoras desta macromolécula em vários carcinomas. Os tumores epiteliais (carcinomas) muitas vezes secretam grandes quantidades de laminina-332 e frequentemente expressam o seu ligando, a integrina 64. O aumento da expressão da laminina-332 tem sido observado em vários tipos de cancro, tendo sido considerado um fator de mau prognóstico. Foi também relacionado com a capacidade invasiva de vários tumores, como o carcinoma do colo do útero. De facto, sabe-se que a laminina-332 pode ativar vias de sinalização, uma vez que, níveis elevados desta proteína podem estimular a ativação da proteína cinase ativada por mitogénio (MAPK -mitogen activated protein kinases) e da fosfatidilinositol 3-cinase (PI3K –phosphatidylinositide 3-kinase), levando assim a um aumento da capacidade proliferativa e invasiva das células e à estimulação do crescimento tumoral. A laminina γ2 humana (LAMC2) é produto da expressão do gene LAMC2 e, como as outras cadeias, possui duas variantes transcricionais, resultantes do splicing alternativo do exão terminal 3'. No entanto, esta é a cadeia que confere especificidade ao trímero da laminin-332. Vários estudos mostraram o aumento da expressão da LAMC2 em cancros humanos, incluindo adenocarcinomas de estômago, pâncreas, tiroide, língua, colo-retal, pulmão, colo do útero, esófago, cabeça e pescoço, pele e pulmão. Observou-se que a acumulação citoplasmática da LAMC2 ocorre frequentemente na frente invasiva dos tumores e está associada a uma diminuição da sobrevivência dos doentes, à recidiva e formação de metástases. Relativamente ao cancro do colo do útero, alguns estudos mostraram que existe uma elevada expressão da cadeia LAMC2 em lesões microinvasivas e invasivas. Apesar da expressão da cadeia LAMC2 ter sido descrita em adenocarcinoma e em carcinomas pavimento-celulares do colo do útero, a sua acumulação ocorre predominantemente nos carcinomas pavimento-celulares. A formação e remodelação da ECM são ativamente reguladas por proteólise, que contribui para a homeostase dos tecidos. Contudo, no contexto tumoral, podem ocorrer desequilíbrios na proteólise, levando assim, a um crescimento tumoral desregulado, remodelação do tecido, inflamação, invasão e metastização. As MMPs (matrix metalloproteinases) são a família de protéases mais relevante associada à carcinogénese. Estas enzimas estão descritas como moduladoras do microambiente tumoral, uma vez que tem um papel crucial na regulação da matriz extracelular e na regulação de vias de sinalização relevantes para a progressão tumoral. As gelatinases MMP2 e MMP9 são as MMPs mais proeminentemente envolvidas na degradação da BM e, consequentemente, estão envolvidas no desenvolvimento tumoral e na formação de metástases. A hidrólise da cadeia γ2 por MMPs parece estar relacionada com o aumento da migração e invasão celular em carcinomas, uma vez que o processamento da cadeia LAMC2 afeta a dinâmica da adesão celular. A hidrólise da cadeia LAMC2 tem sido associada à atividade da MMP2 em cancros da mama e do colo do útero. O fator de crescimento epidérmico (EGF-epidermal growth factor) compreende onze polipéptidos, que compartilham um domínio EGF conservado, sendo esta uma das famílias de fatores de crescimento mais relevantes na progressão tumoral. Os vários ligandos podem ser produzidos quer por células cancerígenas quer por células do estroma, e a sua ligação a recetores de cinase de tirosina, conhecidos como recetores do EGF (EGFRs), estimulam vias de sinalização intracelulares específicas. A ativação dos recetores cinase tirosina culminam na ativação as cascatas enzimáticas envolvidas no crescimento e na sobrevivência das células, sendo que as vias MAPK e PI3K são as mais ativadas. Em cancro, a maioria das mutações que afetam o EGFR são mutações nonsense que promovem a sua ativação constitutiva, tornando a sua ativação independente da presença do ligando-EGF. Contudo, os recetores EGFR e HER2 estão frequentemente sobre-expressos, podendo funcionar como oncogenes. No cancro do colo do útero, o EGFR parece ser o recetor do EGF mais relevante. O domínio III da laminina γ2 apresenta segmentos EGF-like, que podem interagir com os recetores de EGF, nomeadamente o EGFR, levado assim à ativação das cinases da via das MAPK. O principal objetivo deste trabalho foi esclarecer o papel da LAMC2 de laminina-332 na progressão mediada por EGF de carcinomas do colo uterino, utilizando modelos in vitro de carcinoma pavimento-celular (SiHa) e adenocarcinoma (HeLa). Para atingir este objetivo foram delineados 5 objetivos específicos no sentido de verificar: i) o efeito do EGF no ciclo celular e na proliferação; (ii) a relevância da estimulação pelo EGF na expressão da LAMA3, LAMB3, LAMC2, LAMC1 e da LAMC3; (iii) a importância da LAMC2 no efeito do EGF no ciclo celular, proliferação e migração/invasão; (iv) o efeito do knockdown da LAMC2 na expressão da LAMC1 e da LAMC3, e (v) os fatores de transcrição envolvidos na regulação da expressão da LAMC2 e da LAMC1, dependente de EGF. Para a primeira abordagem, foram usadas bases de dados com amostras de doentes, que confirmaram, como já tinha sido descrito por outros autores, que a LAMC2 é sobre-expressa em vários tipos de cancro, incluindo o cancro do colo do útero. De forma a validar o efeito do EGF nos modelos in vitro, foram feitos ensaios de ciclo celular. Estes resultados mostraram que ambas as linhas celulares são responsivas ao EGF, uma vez que proliferam mais após o estímulo. Além disso, os nossos resultados mostraram ainda que a estimulação com EGF resulta num encurtamento da duração da primeira fase do ciclo celular, G0/G1, levando ao aumento do número de células nas fases S+G2/M. Este facto é acompanhado pelo aumento concomitante dos níveis da ciclina D1. Verificou-se ainda, que o EGF também regula a expressão de LAMC2 nas duas linhas celulares (SiHa-carcinoma pavimento-celular e HeLa-adenocarcinoma). Os ensaios de imunoprecipitação da cromatina, deram-nos bons indícios de que o FOXM1 (em SiHa) e o STAT3 (em HeLa) são fundamentais na regulação de LAMC2 pelo EGF. De forma a compreender melhor o papel da LAMC2 no cancro do colo do útero, a expressão da LAMC2 foi silenciada com shRNA. Os ensaios de proliferação após o knockdown da LAMC2 mostraram que o EGF estimula a proliferação independentemente da LAMC2 nas células SiHa, mas curiosamente nas células HeLa, o efeito proliferativo do EGF é mais eficiente na ausência de LAMC2. Além disso, o silenciamento LAMC2 suprime a capacidade migratória e invasiva das células SiHa, mas não parece afetar a migração das células HeLa. Relativamente à atividade das MMPs, ambas MMP2 e 9 são reguladas pelo EGF e os níveis de atividade de MMP9 estão relacionados com os níveis de LAMC2, em ambas as linhas celulares. A atividade da MMP2 também é afetada pelos níveis da LAMC2, contudo, é afetada de forma oposta comparando ambas as linhas celulares. Nas células SiHa, o knockdown da LAMC2 diminui a atividade de MMP2, enquanto que nas células HeLa a atividade desta enzima é aumentada. Assim, parece que o fenótipo maligno dos carcinomas pavimento-celulares é mais depende da expressão da LAMC2 do que os adenocarcinomas. Além disso, o knockdown da LAMC2 resultou no aumento da transcrição da LAMC1 nas células SiHa. Em condições controlo, o mesmo resultado foi observado para a LAMC3, contudo, este efeito desaparecia após o estímulo com EGF. Portanto, devia às alterações mais significativas ocorrerem na regulação da LAMC1 esta foi a cadeia que apresentou mais interesse ao nível da carcinogénese. No entanto, nas linhas celulares wild type (WT) sob a influência de EGF os níveis da LAMC1 apenas aumentaram nas células HeLa. Isto sugere que esta cadeia pode desempenhar um papel no fenótipo maligno moderado em adenocarcinoma (perfil de baixa invasão) em microambientes ricos em EGF. Novamente, o EGF também desempenha um papel na expressão de LAMC1 em ambas as linhas celulares, que parece estar associado aos fatores de transcrição FOXM1 e STAT3. O real significado desta regulação há que ser estudado mais em pormenor. De forma a tentar entender o papel da LAMC1 em contexto tumoral analisámos as mesmas bases de dados. Observámos, contudo, que a associação entre a expressão de LAMC1 e cancro do colo do útero é muito controversa. Assim, esta tese fornece informações relevantes sobre o papel da dinâmica regulatória da expressão da cadeia LAMC2 pelo EGF, podendo explicar o fenótipo mais agressivo do carcinoma pavimento-celular do cancro do colo do útero. Além disso, também sugere que a expressão da LAMC1 pode ser um elemento chave na progressão do cancro do colo do útero. Portanto, novas perspetivas de investigação podem ser delineadas a partir dos nossos resultados, de forma a compreendermos melhor os mecanismos moleculares subjacentes às várias formas de progressão inerentes aos diferentes tipos histológicos do cancro.Carcinogenesis is a multistep transformation process of normal cells to a neoplastic state. The microenvironment that surrounds cancer cells also act on malignant transformation as a functional network. Uterine cervix carcinoma is the fourth most common malignancy in women worldwide, being diagnosed annually 528 000 new cases and 266 000 related-deaths were observed in 2012. In Portugal, the incidence and mortality rate are relatively high, being the incidence 10.8 and mortality 4.9 cases per 100,000 persons per year. There are several histological types of uterine cervix cancer, however the two most common are squamous cell carcinomas and adenocarcinomas, comprising 75–90 and 10–25 % of all cases, respectively. In last years, it has been given more importance to tumor microenvironment as an important factor in carcinogenesis and disease progression. Extracellular matrix (ECM) is a major component of microenvironment, being composed by a complex network of glycoproteins such as collagens, laminins, fibronectins and proteoglycans. Laminins are a group of large extracellular glycoproteins and a major constituent of the basement membrane (BM) compartment of ECM. Laminin-332 is a specific subtype of laminins in the BM, having a trimeric structure composed by α3, β3 and 2 chains. High levels of laminin-332 expression were found in several human cancers, being considered a poor prognosis factor and have been related to the invasive ability of several tumors, such as uterine cervix cancer. Furthermore, the cytoplasmic accumulation of 2 chain (LAMC2) has been implicated in uterine carcinoma progression and has been frequently found at the invasive front of tumors, being associated with a poor survival, recurrence, and metastasis. The proteolytic processing of LAMC2 chain affects the dynamics of cellular adhesion and expose the EGF-like repeats of this molecule. EGF is considered the main growth factor acting on uterine cervix cancer. This work aims to clarify the EGF mediated role of LAMC2 of laminin-332 in the progression of uterine cervix carcinomas, using in vitro models of squamous cell carcinoma (SiHa) and adenocarcinoma (HeLa). In order to achieve our aim, we defined five specific aims to verify: (i) the role of EGF in cell cycle and proliferation; (ii) the effect of EGF stimulation in the expression of LAMA3, LAMB3, LAMC2, LAMC1 and LAMC3; (iii) the role of LAMC2 in EGF effect in cell cycle, proliferation and migration/invasion; (iv) the effect of LAMC2 knockdown in the expression of LAMC1 and LAMC3, and (v) the transcription factors involved in EGF dependent regulation of LAMC2 and LAMC1 expression. The analyses of human cancer databases confirmed that LAMC2 is upregulated in several cancer types and its expression is also increased in uterine cervix cancer. The cell cycle analyses revealed that both cell lines are EGF-responsive, so we confirmed that EGF is a suitable growth factor to stimulate uterine cervix cancer cells. Our results showed that EGF stimulation results in a shortened duration of G0/G1 cell cycle phase and in an increased percentage of cells in S+G2/M phases, concomitant with increased cyclin D1 levels. It was also found that EGF regulates the expression of LAMC2 in both cell lines (squamous cell carcinoma and adenocarcinoma). Both FOXM1 (in SiHa) and STAT3 (in HeLa) seems to be crucial for LAMC2 regulation. To investigate the role of LAMC2 in uterine cervix carcinoma, it was performed a LAMC2 silencing through shRNA technology. LAMC2 knockdown showed that EGF stimulates proliferation independently of LAMC2 in SiHa cells, but interestingly in HeLa the pro-proliferative effect of EGF is more efficient in the absence of LAMC2. Moreover, the LAMC2 silencing suppresses SiHa ability to migrate and invade. The matrix metalloproteinases (MMPs) are the most relevant family of proteinases involved in extracellular matrix turnover, acting as tumor microenvironment modulators. The activity of MMP2 and 9 is regulated by EGF and the levels of activity of MMP9 is related to LAMC2 levels, in both cell lines. In SiHa, the MMP2 activity is most affected by LAMC2 knockdown, which results in a decrease of MMP2 activity. So, it seems that the malignant phenotype of squamous cell carcinoma relies more on LAMC2 than the malignant phenotype of adenocarcinoma. LAMC1 association with cancer is controversial, however, the LAMC2 knockdown induces the transcription of LAMC1 in SiHa at mRNA level. Under control conditions, the same result was observed for LAMC3, although it had a lower significance which disappeared with EGF treatment. In wild type (WT) cell lines upon EGF stimulus the protein levels of LAMC1 increases in HeLa not in SiHa. It seems that this laminin gene can play a role in an EGF rich microenvironment, conferring a mild malignant phenotype in adenocarcinoma (low invasive profile). Again, EGF also plays a role in LAMC1 expression in SiHa and HeLa cells and these regulation seems to be associated to FOXM1 and STAT3, though the real meaning of this action must be unraveled. We believe this thesis gives relevant insights on the role of regulatory dynamics of LAMC2 by EGF that accounts for the uterine cervix squamous cell carcinoma aggressive phenotype; and it also pointed LAMC1 as a putative key element in uterine cervix cancer progression

Not Only Toxic but Repellent: What Can Organisms’ Responses Tell Us about Contamination and What Are the Ecological Consequences When They Flee from an Environment?

The APC was funded by the Spanish Ministry of Science and Innovation. C.V.M.A. received the Ramón y Cajal contract (RYC-2017-22324) from the Spanish Ministry of Science and Innovation. This study was performed within the framework of the projects: MultiCecotox project (i-COOP2019 program from CSIC: #COOPB20444) and BrEStress project (PID2019-105868RA-I00) and CaPETHaS project (Explora call: #CGL2017-92160-EXP)—both funded by the Spanish Ministry of Science and Innovation).The ability of aquatic organisms to sense the surrounding environment chemically and interpret such signals correctly is crucial for their ecological niche and survival. Although it is an oversimplification of the ecological interactions, we could consider that a significant part of the decisions taken by organisms are, to some extent, chemically driven. Accordingly, chemical contamination might interfere in the way organisms behave and interact with the environment. Just as any environmental factor, contamination can make a habitat less attractive or even unsuitable to accommodate life, conditioning to some degree the decision of organisms to stay in, or move from, an ecosystem. If we consider that contamination is not always spatially homogeneous and that many organisms can avoid it, the ability of contaminants to repel organisms should also be of concern. Thus, in this critical review, we have discussed the dual role of contamination: toxicity (disruption of the physiological and behavioral homeostasis) vs. repellency (contamination-driven changes in spatial distribution/habitat selection). The discussion is centered on methodologies (forced exposure against non-forced multi-compartmented exposure systems) and conceptual improvements (individual stress due to the toxic effects caused by a continuous exposure against contamination-driven spatial distribution). Finally, we propose an approach in which Stress and Landscape Ecology could be integrated with each other to improve our understanding of the threat contaminants represent to aquatic ecosystems.Spanish Ministry of Science and Innovation (RYC-2017-22324), (PID2019-105868RA-I00), (#CGL2017-92160-EXP)CSIC: #COOPB2044

Clasificación de la economía colombiana entre actividades transables y no transables

En este documento se desarrolla, a partir de los bienes y servicios de las cuentas nacionales, una clasificación de la economía colombiana entre sectores transable y no transable de acuerdo con el grado de orientación a la importación o exportación y con la relación entre los movimientos de sus precios y la tasa de cambio. La metodología ofrece varias ventajas respecto a los métodos de clasificación tradicionales: (i) mayor representatividad del conjunto de bienes y servicios de la economía, (ii) mayor precisión en la estimación del tamaño de cada sector y (iii) un criterio de selección más objetivo. A partir de la clasificación de los productos entre sectores transable y no transable se construyen indicadores de precios para estos sectores (y para los bienes y servicios importados y exportados) con base en los índices de precios del productor, al consumidor y otros indicadores de precios sectoriales. Se presentan dos aplicaciones de estos índices a la economía colombiana: la construcción de un índice de términos de intercambio y de un indicador de tasa de cambio real.Transable, no transable, PIB, índices de precios.

Metodologia de análise de blocos de motores

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Mecânica.A indústria automobilística atual tem se preocupado muito em projetar motores que atendam à legislação criada para controlar o nível de emissão de poluentes. Desde então, a busca por motores de alto desempenho, com baixo consumo e reduzida emissão de poluentes é uma necessidade. Considerado um dos componentes mais importantes, e que agrega maior peso ao motor, o bloco tem sido o alvo principal de pesquisas na busca por motores mais eficientes. Os motores Diesel, que trabalham com elevadas taxas de compressão, necessitam de uma estrutura bastante rígida para suportar os esforços gerados durante a combustão dos gases. Seu rendimento e nível de emissões poderiam ser melhores com a utilização de maiores picos de pressão. Segundo alguns trabalhos, a utilização de materiais alternativos, como o ferro fundido vermicular ou CGI (Compacted Graphite Iron), tem possibilitado projetar motores com maiores pressões de combustão e/ou redução significativa de espessuras de parede, devido às suas melhores propriedades mecânicas quando comparadas às do ferro fundido cinzento. Neste trabalho, avalia-se o comportamento estrutural de um bloco de motor Diesel, submetido à ação de forças oriundas da montagem do cabeçote e das capas de mancal, pressão dos gases de combustão e forças de inércia, utilizando critérios de falha tradicionais (Tensão, deslocamentos e fadiga). As tensões e deslocamentos são determinados através de um modelo numérico constituído por ¼ do bloco. Os resultados são gerados por um software que utiliza o método dos elementos finitos (I-DEAS). A geometria deformada é utilizada para se estudar a ovalização nos cilindros e mancais, determinando-se a folga mínima final nestas regiões. Avalia-se também a utilização do ferro fundido vermicular para a obtenção de blocos de motores Diesel, onde são necessárias altas pressões de combustão, através de uma simulação sob uma pressão de combustão acima de 20 MPa. Nesta última, os coeficientes de segurança ainda são bastante elevados, mas a ovalização dos mancais pode comprometer a lubrificação

Nas margens do silêncio: João Cabral de ponta a ponta, de Antonio Carlos Secchin

Resenha da obra João Cabral de ponta a ponta, de Antonio Carlos Secchin (Pernambuco: Cepe Editora, 2020).Resenha da obra João Cabral de ponta a ponta, de Antonio Carlos Secchin (Pernambuco: Cepe Editora, 2020)

Registo de dados indelével

Tese de mestrado em Engenharia Informática (Arquitetura, Sistemas e Redes de Computadores), apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2013A análise forense de computadores lida com a recolha de provas digitais de vários tipos de dispositivos eletrónicos. Esta ciência está diretamente ligada à captura, análise e reconstrução¸ ao de atividades do sistema a fim de averiguar, a posteriori, o método do atacante ou uma possível avaria. Os logs são uma parte importante de qualquer sistema computacional seguro, uma vez que registam a sua atividade. Com esse registo temos uma boa visão de todo sistema. Quando a última barreira de segurança é ultrapassada e ocorre um ataque ou há uma falha de um componente, os registos são um dos poucos recursos para entender o que se sucedeu. Por outro lado, os logs encontram-se entre os alvos preferidos de alguém que quer penetrar num sistema, por dois motivos: em primeiro lugar, os logs têm pistas importantes sobre o sistema em causa e a sua segurança. Por outro lado, ao adulterá-los, é possível impedir que um administrador veja a sua atividade no sistema [33]. O objetivo deste trabalho é criar um sistema de logs centralizado para sistemas distribuídos, utilizando um modelo de faltas híbrido. Visto do exterior, o sistema é composto apenas por uma máquina, contudo no seu interior está uma estrutura complexa, replicada e tolerante a faltas. Este sistema garante segurança para os logs em trânsito e em repouso. Por forma a que o sistema permaneça correto a longo termo, são utilizadas técnicas como a recuperação pró-ativa e reativa e para não se perderem os logs já armazenados, utiliza-se um disco Write Once Read Many (WORM). Para que a informação dos logs permaneça secreta, o sistema perde o controlo sobre o conteúdo dos logs, isto é, quando um log dá entrada no sistema é cifrado com recurso a um esquema de chave pública e só o detentor da chave privada poderá aceder ao seu conteúdo. Normalmente, o detentor dessa chave privada é o administrador ou uma entidade de auditoria.Forensic analysis of computers deals with the collection of digital evidence of several types of electronic devices. This science is directly linked to the capture, analysis, and reconstruction of system activities which investigate, a posteriori, the hacker’s method or a possible system failure. Logs are an important part of any secure computer system because they record the activity performed by and in the system, allowing one to obtain a good view of the whole system and its individual parts. For instance, when the last barrier of the system has been broken and an attack has happened or if there has been a failure in one component of a large-scale system, logs are one of the few resources through which one can know what occurred. Logs are also one of the most wanted targets for someone who wants to penetrate in a system for two reasons: first, logs have important clues about the system and their safety; second, to prevent an administrator to see their activity on the system [33]. The objective of this work is to create a centralized logging system for distributed systems using a hybrid fault model. From an outsider’s point of view, the system is just a machine, however in its inside there is a complex, replicated and fault tolerant structure. This structure provides a robust log system which secures the logs in transit and at rest. To ensure that the system keeps its long-term correctness it may be used proactive and reactive recovery. To avoid losing logs it will be used a Write Once Read Many (WORM) disk. In order to guarantee that the logs’ information remains secret, the system loses control over the content of the logs, i.e., when a log enters the system it is encrypted using a public key and only the private key owner can access its content. Usually, the owner of this private key is the administrator or an audit entity

Ensaios catalíticos e modelação da oligomerização de olefinas leves

Mestrado em Engenharia QuímicaNos últimos anos tem-se observado um aumento da procura de diesel, comparativamente com a gasolina. A produção de gasolina aumentou à custa do aparecimento das unidades de FCC. Deparando com este facto, a produção de diesel tem de acompanhar a sua crescente procura, e essa reposta encontra-se precisamente nestas unidades de FCC. Aquando a formação de gasolina nestas unidades, um dos subprodutos gerados em maior quantidade é a corrente de olefinas leves. As olefinas, na presença de um catalisador, e sujeitas a alta pressão e temperatura formam produtos de elevado valor comercial na gama do diesel. Nesta dissertação foi estudada, precisamente, a oligomerização de olefinas leves através de ensaios catalíticos. O processo consiste na combinação no mesmo reator, de um catalisador zeolítico a 200 com uma alimentação de buteno, acompanhado de um caudal de inerte para diluição do reagente. A oligomerização do 1-buteno permite obter produtos na gama diesel C10 a C20. A instalação experimental foi montada no início da dissertação. Antes da sua utilização, sucessivas correcções a nível de fugas, durante vários ciclos de aquecimento, tiveram de ser efectuadas de modo a deixá-la operacional. Foi utilizada para activação do catalisador, calibração do GC e para a realização da oligomerização de 1-buteno. Foi utilizado o catalisador zeolítico H-ZSM-5 comercial (Zeolyst CBV 3024E com uma razão Si/Al=15). Este catalisador devido à sua microporosidade e estrutura permite a ocorrência de selectividade de forma, que favorece a formação de produtos lineares. A instalação foi testada e foram efectuadas experiências a alta pressão (30 bar), tendo sido possível obter produtos na gama do diesel. Estes produtos foram identificados por cromatografia gasosa com um detector FID acoplado. Um modelo de equilíbrio e cinética foi estudado e programado de modo a prever o comportamento da reacção através da variação do tempo adimensional de reacção, pressão, temperatura e da alimentação.In past years it has been observed an increase demand of diesel compared to gasoline. The production of gasoline has increased significantly after the installation of FCC units. During gasoline production, light olefins are obtained as side product. These light olefins, in the presence of a catalyst and submitted to high temperature and pressure, form high commercial products in diesel range. In this work, 1-butene oligomerization via zeolite catalysis was studied. The process can be conducted in a reactor with an acid catalyst at 200 with 1-butene diluted in nitrogen (feed) to form products in diesel range (C10-C20). The experimental set-up was assembled at the beginning of the thesis. Before use, successive leak tests, consisting of heating-cooling cycles, have been performed to leave the equipment operational. The installation is able to carry out the catalyst activation and 1-butene oligomerization. With respect to the catalyst, commercial H-ZSM-5 (Zeolyst CBV 3024E, Si/Al=15) has been used. This catalyst due its microporosity and its structure provides shape selectivity, which favours the formation of more linear products. The installation was tested and several runs were performed at high pressure (30 bar), which allowed to obtain diesel range products. Their identification was accomplished by gas chromatography with FID detector. The modeling of literature data was studied in order to predict the reaction behaviour for distinct sets of reaction time, pressure, temperature and feed concentration

The Brazilian Economy Position on the Investment Development Path

The hypothesis that inward and outward FDI positions of a country are related to the level and structure of economic development in relation to other economies, was first showed by Dunning (1979. The IDP suggests that countries tend to pass through five main development stages and that these phases can be classified according to the propensity of countries to host and/or invest abroad. This article attempts to measure the position of Brazil in the IDP. The investment by Brazilian firms abroad, in relation to emerging countries, was the first until 90s. However, Brazil's outward FDI increased substantially from 2000. In 2006 the Outward FDI exceeded inward FDI for the first time in the history of the country. Nowadays, the Brazilian economy seems to be in phase 2 and give signs of entry to stage 3, and some signs of evolution to phases 4 and 5. This paper intends to measure the Brazilian economy position on IDP especially between emerging countries context and the importance of a new stage of Brazilian economy: the systematic internationalization of domestic firms. This paper has the following structure: an evolution of FDI in recent years; after that we explain the phases of Investment Developmet Path Theory and measure de Brazilian economy position on IDP. Finally, the final considerations are related

Cell Senescence, Multiple Organelle Dysfunction and Atherosclerosis

Our research is supported by national funds through FCT- Fundação para a Ciência e Tecnologia and by PROGRAMAS DE ATIVIDADES CONJUNTAS (PAC) grant numbers PTDC/MED-PAT/29395/2017 and N◦3/SAICT/2015. ARAM is supported by the CEECIND/01006/2017, funded by FCT.Atherosclerosis is an age-related disorder associated with long-term exposure to cardiovascular risk factors. The asymptomatic progression of atherosclerotic plaques leads to major cardiovascular diseases (CVD), including acute myocardial infarctions or cerebral ischemic strokes in some cases. Senescence, a biological process associated with progressive structural and functional deterioration of cells, tissues and organs, is intricately linked to age-related diseases. Cell senescence involves coordinated modifications in cellular compartments and has been demonstrated to contribute to different stages of atheroma development. Senescence-based therapeutic strategies are currently being pursued to treat and prevent CVD in humans in the near-future. In addition, distinct experimental settings allowed researchers to unravel potential approaches to regulate anti-apoptotic pathways, facilitate excessive senescent cell clearance and eventually reverse atherogenesis to improve cardiovascular function. However, a deeper knowledge is required to fully understand cellular senescence, to clarify senescence and atherogenesis intertwining, allowing researchers to establish more effective treatments and to reduce the cardiovascular disorders' burden. Here, we present an objective review of the key senescence-related alterations of the major intracellular organelles and analyze the role of relevant cell types for senescence and atherogenesis. In this context, we provide an updated analysis of therapeutic approaches, including clinically relevant experiments using senolytic drugs to counteract atherosclerosis.publishersversionpublishe