Reconstructing transcriptional regulatory networks using data integration and text mining

Transcriptional Regulatory Networks (TRNs) are powerful tool for representing several interactions that occur within a cell. Recent studies have provided information to help researchers in the tasks of building and understanding these networks. One of the major sources of information to build TRNs is biomedical literature. However, due to the rapidly increasing number of scientific papers, it is quite difficult to analyse the large amount of papers that have been published about this subject. This fact has heightened the importance of Biomedical Text Mining approaches in this task. Also, owing to the lack of adequate standards, as the number of databases increases, several inconsistencies concerning gene and protein names and identifiers are common. In this work, we developed an integrated approach for the reconstruction of TRNs that retrieve the relevant information from important biological databases and insert it into a unique repository, named KREN. Also, we applied text mining techniques over this integrated repository to build TRNs. However, was necessary to create a dictionary of names and synonyms associated with these entities and also develop an approach that retrieves all the abstracts from the related scientific papers stored on PubMed, in order to create a corpora of data about genes. Furthermore, these tasks were integrated into @Note, a software system that allows to use some methods from the Biomedical Text Mining field, including an algorithms for Named Entity Recognition (NER), extraction of all relevant terms from publication abstracts, extraction relationships between biological entities (genes, proteins and transcription factors). And finally, extended this tool to allow the reconstruction Transcriptional Regulatory Networks through using scientific literature

Publicaciones sobre estudios fronterizos en Brasil 2000 a 2018 : un estudio sobre principales temáticas y periódicos

O objetivo central é caracterizar a publicação sobre Estudos Fronteiriços em periódicos, dando destaque para a diversidade de temas abordados. Extraiu-se dados bibliográficos de publicações da base de dados do Unbral Fronteiras, que possibilitaram a análise dos periódicos publicados e das palavras-chave pertencentes a temática Fronteira. Os artigos analisados pertencem à cinco periódicos: Revista Geopantanal, Geographia (UFF), Confins (Paris), Tempo da Ciência e Boletim Gaúcho de Geografia. Observou-se que alguns assuntos que apresentam maior frequência estão presentes em todas as revistas examinadas, como é o caso das palavras-chave “Brasil”, “Território” e “Identidade”, enquanto outros concentram-se em um periódico específico.The main objective is to characterize the journals publication on Border Studies, highlighting the diversity of themes. Extractions of bibliographic data in Unbral Fronteiras Portal allowed the analysis of the journals and keywords belonging to the Border thematic. The articles belong to five journals: Revista Geopantanal, Geographia (UFF), Confins (Paris), Tempo da Ciência and Boletim Gaúcho de Geografia. It was observed that some subjects are present in all journals examined, such as the keywords “Brasil”, “Território” (territory) and “Identidade” (identity), while others appear on a specific journal.El objetivo principal es caracterizar la publicación sobre Estudios Fronterizos en revistas, destacando la diversidad de temas. Examinó datos bibliográficos de publicaciones de la base de datos de Unbral Fronteiras, que permitieron el análisis de revistas publicadas y palabras clave pertenecientes a los Estudios Fronterizos. Los artículos analizados pertenecen a cinco revistas: Revista Geopantanal, Geographia (UFF), Confins (Paris), Tempo da Ciência y Boletim Gaúcho de Geografia. Se observó que algunos temas que son más frecuentes están presentes en todas las revistas examinadas, como las palabras clave “Brasil”, “Território” (territorio) e “Identidade” (identidad), mientras que otros ocurren en una revista específica

PUBLICAÇÕES SOBRE ESTUDOS FRONTEIRIÇOS NO BRASIL DE 2000 A 2018

O objetivo central é caracterizar a publicação sobre Estudos Fronteiriços em periódicos, dando destaque para a diversidade de temas abordados. Extraiu-se dados bibliográficos de publicações da base de dados do Unbral Fronteiras, que possibilitaram a análise dos periódicos publicados e das palavras-chave pertencentes a temática Fronteira. Os artigos analisados pertencem à cinco periódicos: Revista Geopantanal, Geographia (UFF), Confins (Paris), Tempo da Ciência e Boletim Gaúcho de Geografia. Observou-se que alguns assuntos que apresentam maior frequência estão presentes em todas as revistas examinadas, como é o caso das palavras-chave “Brasil”, “Território” e “Identidade”, enquanto outros concentram-se em um periódico específico

A SEGREGAÇÃO COMO CONTEÚDO DA NOVA MORFOLOGIA URBANA DE BOA VISTA – RR

Esse artigo é resultante de parte dos objetivos propostos para entendermos as novas formas do tecido urbano de Boa Vista, no que se refere às diferenças espaciais e demográficas nas quatro zonas urbanas dessa capital. Buscamos verificar por que há uma exagerada concentração populacional em uma única zona urbana assim como, as condições sócio-econômicas do povo que vive nessa cidade. Atentamos que a segregação é conseqüência de diferentes processos determinantes que atuam ao longo do século XX e princípio do século XXI. Palavras-chave: segregação, morfologia urbana, Boa Vista. ABSTRACT This article is the result of part a research which aims to understand the new forms of the urban tissue in Boa Vista, due to the space and demographic differences in the four urban zones of this capital. We search to verify why an exaggerated population concentration takes place only in the urban zone as well as the social economic conditions of people who live in this city. We attempt that the segregation is consequence of different determinative processes that act throughout XX Century and the beginning of XXI Century. Keywords: segregation, urban morphology, Boa Vista. DOI: 10.5654/actageo2009.0306.000

A SEGREGAÇÃO COMO CONTEÚDO DA NOVA MORFOLOGIA URBANA DE BOA VISTA – RR

Esse artigo é resultante de parte dos objetivos propostos para entendermos as novas formas do tecido urbano de Boa Vista, no que se refere às diferenças espaciais e demográficas nas quatro zonas urbanas dessa capital. Buscamos verificar por que há uma exagerada concentração populacional em uma única zona urbana assim como, as condições sócio-econômicas do povo que vive nessa cidade. Atentamos que a segregação é conseqüência de diferentes processos determinantes que atuam ao longo do século XX e princípio do século XXI. Palavras-chave: segregação, morfologia urbana, Boa Vista. ABSTRACT This article is the result of part a research which aims to understand the new forms of the urban tissue in Boa Vista, due to the space and demographic differences in the four urban zones of this capital. We search to verify why an exaggerated population concentration takes place only in the urban zone as well as the social economic conditions of people who live in this city. We attempt that the segregation is consequence of different determinative processes that act throughout XX Century and the beginning of XXI Century. Keywords: segregation, urban morphology, Boa Vista. DOI: 10.5654/actageo2009.0306.000

Uma experiência vivida com estudantes do ensino médio: reflexões sobre Educação Financeira à luz da Educação Matemática Crítica

Esse artigo busca compartilhar com a comunidade de educadores matemáticos, algumas reflexões a respeito da Educação Financeira que temos praticado e pesquisado de forma colaborativa no contexto da Educação Básica. Para tanto, relatamos uma experiência desenvolvida com alunos do segundo ano do Ensino Médio de uma escola pública da cidade do Rio de Janeiro, na qual puderam refletir a respeito das compras por meio do uso de cartões de crédito, com ênfase na matemática em ação no cálculo dos juros de refinanciamento. Essa atividade serviu de pano de fundo às nossas reflexões, a partir das quais pudemos tanto descortinar possibilidades como considerar incertezas relevantes ao desenvolvimento da Educação Financeira que temos praticado e pesquisado, segundo as preocupações da Educação Matemática Crítica

Utilização do software matlab no desenvolvimento de um algoritmo para análise de estruturas reticuladas através do método dos deslocamentos / The use of matlab software to develop an algorithm to analyze reticulated structures using the displacement method

O desenvolvimento de ferramentas computacionais que facilitam a obtenção de esforços e deslocamentos em modelos estruturais foi fundamental para o desenvolvimento da engenharia moderna. Estruturas reticuladas, em especial os pórticos planos, elementos geralmente utilizados para representar simplificadamente estruturas tridimensionais, são modelos coplanares constituídos de nós e barras que os ligam, e são sujeitos a cargas verticais e horizontais em seu plano. O presente trabalho apresenta a implementação de um algoritmo para análise de pórticos planos utilizando o software MATLAB. O algoritmo consiste na introdução de dados que caracterizem a estrutura e os carregamentos atuantes na mesma, confecção da matriz de rigidez dos sistemas de coordenadas globais e locais, matriz de incidência cinemática, geração de vetores de forças, cálculo de esforços e reações e, finalmente, a saída de dados após o pós-processamento do programa. Foram realizadas algumas simulações a fim de analisar a consistências dos resultados obtidos e posteriormente comparados com outros softwares existentes para validação desses resultados

NEGÓCIOS COM IMPACTO SOCIAL: CARACTERÍSTICAS, MODELOS E MÉTRICAS DE AVALIÇÃO

Setting a business in the twenty-first century? As organizations face a wear scenario and scarcity of natural resources? Working in a marked social inequality reality? Businesses tend to be more committed to the social? All businesses would present social impact? What would a business with social impact? The answer to these questions would be: A business with "adequate" impacts? In what sense? Suitable for what kind of competition, what kind of market, what kind of customer, at what time, in what context? This study, descriptive theory, sought to verify and discuss the main concepts and definitions of business with social impact, relating them to the theme of innovation. The main results can be seen that there are several social business characteristics, advances in business valuation metrics with social impact, but the studies are very recent in the national spotlight, with some international prospects for a prosperous future, to work on organizations and scienceEl establecimiento de un negocio en el siglo XXI? Las organizaciones se enfrentan al desgaste escenario y la escasez de los recursos naturales? Trabajando en una realidad social marcada desigualdad? Las empresas tendencia a ser más comprometidos con lo social? Todas las empresas tendrían un impacto presentes social? ¿Cuál sería el impacto en el negocio con la social? La respuesta a estas preguntas sería: Una empresa con impactos "adecuadas"? ¿En qué sentido? Adecuado para qué tipo de competencia, qué tipo de mercado, qué tipo de cliente, en qué momento, en qué contexto? Este estudio, teoría descriptiva, trató de verificar y discutir los principales conceptos y definiciones de impacto en el negocio con sociales, las cuales se refieren al tema de la innovación. Los principales resultados se pueden ver Que hay negocios sociales Varias características, avances en medidas de valoración de negocios con impacto social, pero los estudios son muy recientes en el centro de atención nacional, con algunas perspectivas internacionales para un futuro próspero, para trabajar en las organizaciones y la cienciaComo definir um negócio no século XXI? Como as organizações enfrentarão um cenário de desgaste e escassez dos recursos naturais? Como trabalhar numa realidade de desigualdade social acentuada? Tenderiam os negócios a serem mais comprometidos com o social? Todos os negócios apresentariam impacto social? O que seria um negócio com impacto social? A resposta para essas perguntas seria: Um negócio com impactos “adequados”? Em que sentido? Adequado a qual tipo de competição, a qual tipo de mercado, a qual tipo de cliente, em qual momento, em qual contexto? O presente estudo, teórico descritivo, buscou verificar e discutir os principais conceitos e definições sobre negócios com impacto social, relacionando-os com a temática da inovação. Como principais resultados, pode-se verificar que existem várias características de negócios sociais, avanços sobre métricas de avaliação dos negócios com impacto social, mas os estudos são muito recentes em destaque nacional, com algumas perspectivas internacionais para um futuro próspero, a ser trabalho nas organizações e ciência

Tentativas reincidentes de autoextermínio em paciente com múltiplos transtornos psiquiátricos: entraves a um bom diagnóstico

The aim was to report the care of a patient with possible psychiatric disorders and a history of suicide attempts, in addition to evaluating diagnostic and therapeutic methods that can be used. Thus, this is a descriptive, critical-reflective and qualitative study, of the experience report type, carried out in a philanthropic hospital in the city of Caratinga, in the State of Minas Gerais. Data were collected through anamnesis and medical records of a 39-year-old female patient with major depression and bipolar affective disorder, with a history of several attempts at self-extermination. In this sense, the importance of an adequate diagnosis was evidenced in order to improve the patient's quality of life, as well as to avoid failures that harm her psychic condition. In addition, it was identified as essential the follow-up of a professional in the area who can offer appropriate support for the multiple psychiatric disorders reported.Objetivou-se relatar o atendimento à uma paciente com possíveis transtornos psiquiátricos e histórico de uma sorte de tentativas de suicídio, além de avaliar métodos de diagnósticos e terapêuticas que podem ser empregados. Destarte, trata-se de um estudo descritivo, crítico-reflexivo e qualitativo, do tipo relato de experiência, realizado em um hospital de caráter filantrópico na cidade de Caratinga, no Estado de Minas Gerais. Os dados foram coletados através de anamnese e do prontuário de uma paciente do sexo feminino, de 39 anos, com depressão maior e transtorno afetivo bipolar, com história de diversas tentativas de autoextermínio. Nesse sentido, evidenciou-se a importância de um diagnóstico adequado para que haja melhoria da qualidade de vida da paciente, bem como evitar falhas que prejudiquem sua condição psíquica. Ademais, identificou-se como essencial o acompanhamento de um profissional da área que possa oferecer suporte apropriado para os múltiplos transtornos psiquiátricos relatados