Binding of the anticancer drug BI-2536 to human serum albumin. A spectroscopic and theoretical study

BI-2536 is a potent Polo-like kinase inhibitor which induces apoptosis in diverse human cancer cell lines. The binding affinity of BI-2536 for human serum albumin (HSA) protein may define its pharmacokinetic and pharmacodynamic profile. We have studied the binding of BI-2536 to HSA by means of different spectroscopic techniques and docking calculations. We have experimentally observed that the affinity of BI-2536 for HSA is higher than that of other common HSA binding drugs. Therefore, it can be postulated that the drug dose should be increased to achieve a certain concentration of free drug in plasma, although BI-2536 could also reach tumour tissues by uptaking HSA/BI-2536 complex. Only a single binding site on HSA has been observed for BI-2536 which seems to correspond to the subdomain IIA pocket. The formation of the HSA/BI-2536 complex is a spontaneous and entropy-driven process that does not cause a significant change of the secondary structure of the protein. Its endothermic character could be related to proton release. Thermodynamic analysis showed that the main protein-drug interactions are of the van der Waals type although the presence of amide and ether groups in BI-2536 could also allow H-bonding with some residues in the subdomain IIA pocket

Shedding light on the binding mechanism of kinase inhibitors BI-2536, Volasetib and Ro-3280 with their pharmacological target PLK1

In the present work, the interactions of the novel kinase inhibitors BI-2536, Volasetib (BI-6727) and Ro-3280 with the pharmacological target PLK1 have been studied by fluorescence spectroscopy and molecular dynamics calculations. High Stern-Volmer constants were found in fluorescence experiments suggesting the formation of stable protein-ligand complexes. In addition, it was observed that the binding constant between BI-2536 and PLK1 increases about 100-fold in presence of the phosphopeptide Cdc25C-p that docks to the polo box domain of the protein and releases the kinase domain. All the determined binding constants are higher for the kinase inhibitors than for their competitor for the active center (ATP) being BI-2536 and Volasertib the inhibitors that showed more affinity for PLK1. Calculated binding free energies confirmed the higher affinity of PLK1 for BI-2536 and Volasertib than for ATP. The higher affinity of the inhibitors to PLK1 compared to ATP was mainly attributed to stronger van der Waals interactions. Results may help with the challenge of designing and developing new kinase inhibitors more effective in clinical cancer therapy

Pengembangan Media Pembelajaran Fisika Berbasis Multimedia Interaktif Terintegrasi Dengan Lks Pokok Bahasan Hukum Newton Tentang Gerak Kelas X Sma/ma

Penelitian ini bertujuan untuk: (1) mengembangkan media pembelajaran fisika berbasis multimedia interaktif dengan menggunakan software adobe flash dan XML pada pokok bahasan Hukum Newton tentang gerak; (2) mengetahui kelayakan media pembelajaran fisika berbasis multimedia interaktif menggunakan software adobe flash dan XML pada pokok bahasan Hukum Newton tentang gerak yang dikembangkan; (3) mengetahui pencapaian hasil belajar siswa setelah mengikuti proses pembelajaran menggunakan media pembelajaran fisika berbasis multimedia interaktif terintegrasi dengan lembar kerja siswa hasil pengembangan. Penelitian ini merupakan penelitian dan pengembangan (R&D) yang mengacu pada model yang dikemukakan oleh Sugiyono. Kelayakan media divalidasi oleh ahli materi, ahli media dan praktisi. Subjek Ujicoba penelitian ini adalah siswa kelas X SMA N 3 Sukoharjo tahun akademik 2013/2014 sebanyak 43 siswa dengan rincian 10 siswa sebagai subjek ujicoba produk dan 33 siswa sebagai subjek ujicoba pemakaian. Berdasarkan hasil analisis data disimpulkan: (1) media pembelajaran fisika berbasis multimedia interaktif terintegrasi dengan lembar kerja siswa berhasil dikembangkan dengan menggunakan Software Adobe Flash dan XML dengan hasil produk dikemas dalam keping CD yang didalamnya berisi software utama media dan beberapa file pendukung dari media tersebut. Media disajikan dengan dua pembagian materi yaitu materi pembelajaran dan materi penjelasan yang diproteksi serta berisi bank soal yang dapat diupdate. Media pembelajaran dikembangkan dengan mengacu pada langkah yang diberikan oleh Sugiyono dan telah tervalidasi; (2) media pembelajaran fisika berbasis multimedia interaktif terintegrasi dengan lembar kerja siswa yang dikembangkan layak digunakan dengan kategori baik; (3) pencapaian hasil belajar peserta didik setelah mengikuti proses pembelajaran menggunakan media pembelajaran fisika berbasis multimedia interaktif terintegrasi dengan lembar kerja siswa mengalami peningkatan pada aspek pengetahuan

Descripción de la larva de Phyllophaga lenis (Coleoptera: Melolonthidae) en Santa Cruz Xoxocotlán, Oaxaca, México, con notas sobre su biología

Se describe el tercer estadio larval de Phyllophaga lenis (Horn, 1887) con especímenes criados en laboratorio, cuyos progenitores fueron capturados en un campo agrícola de Santa Cruz Xoxocotlán, Oaxaca. Se incluyen las imágenes de los caracteres diagnósticos, notas sobre su biología y hábitos, comentarios acerca de las diferencias con otras especies mexicanas parecidas y una clave para separar las larvas de 15 especies de Phyllophaga en México

Fragility Curves for Thin-Walled Cold-Formed Steel Wall Frames Affected by Ground Settlements Due to Land Subsidence

Land subsidence phenomenon due to ground water withdrawal is a current problem in many places around the world, particularly in the shallows of Mexico. This causes ground differential settlements that affect structures, mainly dwellings and buildings based on reinforced concrete and masonry. Eventually, these structural materials do not exhibit an adequate performance beyond a certain level of angular distortion. This work presents the results about a study regarding the performance of thin-walled cold-formed steel wall frames with different sheathing systems affected by angular distortions simulating ground differential settlements due to land subsidence. The wall frames are composed by vertical (studs) and horizontal elements (tracks), with different sheathing systems: polystyrene, OSB, gypsum and calcium silicate. By means of experimental testing of wall frames subjected to monotonic lateral loads, the rotational stiffness was obtained for the wall frames with polystyrene. Likewise the rotational stiffness of the other wall frame systems was calculated based on the data provided by other author’s publications. On the other hand, by means of numerical simulation, all the wall frame systems were modeled in structural analysis software, calibrating them based on the rotational stiffness. Also, the moment-rotation curves were calculated for the studs and tracks based on the direct strength method. A non-linear static pull down analysis was performed producing several degrees of angular distortion simulating ground settlements for all the wall frames sheathing systems. With the data acquired fragility curves were calculated according three levels of damage for the wall frames with different sheathing system

A Resonant Ring Topology Approach to Power Line Communication Systems within Photovoltaic Plants

Within this study, single-cable propagation facilitated by PV strings’ wiring characteristics is considered for an adapted design of PLC electronics. We propose to close the communications signal path, resulting in a ring topology where a resonance condition could be implemented. A PLC topology using the resulting circular closed-loop path of a PV series string as its physical communication support is designed and leveraged for practical use. When the path length or the number of transceivers is changed, the resonance properties that come with the circular path as the physical support are affected but are shown to be preserved with the application of automatic adjustable tuning. This automatic tuning guarantees that the resonance improves propagation parameters and reverts the system to its optimal values at the chosen carrier frequency.This study was supported by the Universidad of Valladolid with the predoctoral contracts of 2020 cofunded by Santander Bank. This study was supported by the Universidad of Valladolid with ERASMUS+ KA-107. Partial funding for open access charge: Universidad de Málag

Caracterización del sistema de secreción de tipo VI en Rhizobium etli Mim1

La simbiosis rizobio-leguminosa es altamente específica. La translocación de proteínas denominadas efectores desde el citoplasma bacteriano a la célula vegetal es un elemento relacionado con dicha especificidad. Los efectores pueden ser translocados a través de diferentes sistemas de secreción. El análisis de genomas de rizobios ha permitido identificar en algunos la presencia de sistemas de secreción de tipo VI (T6SS). El T6SS tiene como componente principal una nanoestructura similar a las que utilizan los bacteriófagos1 para inyectar su ADN y que las bacterias usan para secretar proteínas. Los genes implicados en la formación de T6SS están agrupados y los que codifican para componentes estructurales del sistema presentan mayor grado de conservación entre rizobios y frente a otras bacterias en comparación a los genes que codifican para efectores y reguladores del sistema. En nuestro grupo se está estudiando el T6SS de Rhizobium etli bv mimosae Mim12 aislada de nódulos de Mimosa affinis y capaz de nodular además Phaseolus vulgaris y Leucaena leucocephala. La cepa Mim1 contiene una agrupación de 28 genes en el plásmido f no simbiótico, relacionados con la formación de un T6SS, presentando una organización similar a la descrita en Agrobacterium tumefaciens C583 que consiste en dos operones divergentes. Se ha descrito para varios microorganismos que cuando el T6SS está activo, las proteínas Hcp y VgrG que forman parte del aparato de secreción pueden detectarse en el medio extracelular3. Los genes que codifican proteínas estructurales en las dos bacterias presentan una gran similitud, así Hcp muestra un 94% de identidad entre ambas permitiendo que los anticuerpos que detectan Hcp de Agrobacterium3 también reaccionen con Hcp de Mim1. Utilizando anticuerpos contra Hcp de Agrobacterium se ha identificado esta proteína en el medio extracelular de cultivos de Mim1 en fase estacionaria y débilmente en fase exponencial. También se ha demostrado su presencia en nódulos de judía y en cultivos crecidos en presencia de exudados de L. leucocephala, P. vulgaris y Pisum sativum. Además, con el fin de conocer en qué condiciones se activa el T6SS de Mim1, se analizó una región de ADN presumiblemente promotora comprendida entre las dos agrupaciones de genes orientados de forma divergente de Mim1. Esta región se fusionó transcripcionalmente a un gen b-gal delator sin promotor del vector pMP220 en las dos posibles orientaciones, una de las orientaciones (P1) controlaría la expresión de genes como hcp y posibles efectores y la otra (P2) de otros genes estructurales. Los resultados mostraron que ambas orientaciones se expresaban a altas DO600 (0,8-1) aunque los valores de P1 fueron entre dos y tres veces superiores a los de P2. Sin embargo a bajas DO600 (0,1-0,2) la actividad de P1 ser redujo a la mitad y la de P2 a niveles del control sin promotor. Con el objetivo de conocer el papel del T6SS en simbiosis se han realizado 3 mutantes que afectan a genes estructurales del T6SS de Mim1, uno en el gen hcp, otro en tssM y el tercero es una deleción de todos los genes presumiblemente dependientes de P2. Se examinó el fenotipo producido en P. vulgaris y L. leucocephala y se observó que los tres mutantes produjeron nódulos blancos y plantas con un porte similar a plantas no inoculadas, con menor tamaño que las inoculadas con la cepa parental y con un color más amarillento. En este trabajo se ha mostrado por primera vez que la presencia de un T6SS en rizobios tiene un efecto beneficioso en la simbiosis con varios hospedadores. En estos momentos se esta trabajando en la caracterización de posibles efectores. Referencias. 1. Records AR. 2011 The type VI secretion system: a multipurpose delivery sustem with a phage-like machinery. Mol Plant Microbe Interact 24: 751-757. 2. Rogel MA et al. 2014. Genomic basis of symbiovar mimosae in Rhizobium etli. BMC Genomics 15: 575 3. Wu, HY et al. 2012. Acid-induced type VI secretion system is regulated by ExoR-ChvG/Chv

Characterization of type VI secretion systems (T6SS) of endosymbionts from mimosa or lupine

The T6SS is a nanosyringe that injects proteins into prokaryotic or eukaryotic cells, and it is encoded in the genomes of more than 25% of Gram-negative bacteria (1). We are studying the T6SS of Rhizobium etli Mim1 and Bradyrhizobium sp. LmicA16, symbionts of Phaseolus vulgaris/Leucaena leucocephala and Lupinus micranthus/Lupinus angustifolius/Spartium junceum, respectively. R. etli Mim1 contains a T6SS gene cluster organized in two divergent operons. When the T6SS is active, Hcp, a constituent of the secretory apparatus, can be detected in the extracellular medium (2). Hcp has been immunologically detected in the supernatant of Mim1 cultures. This protein was also detected in bean nodule extracts and in cultures grown in the presence of different legumes exudates. The putative divergent promoters located between the two T6SS gene clusters were analysed by ?- gal fusions. The results showed high levels of expression of the two promoters at high OD and low values at lower ODs. Mutants affected in structural genes induced white nodules with P. vulgaris and L. leucocephala. On the other hand, mutagenesis of T6SS structural genes from LmicA16 strain produced different symbiotic phenotypes. An LmicA16 tssC mutant showed reduced levels of nitrogen fixation on L. micranthus, whereas the same mutant induced the formation of few white, non-fixing nodules on L. angustifolius and S. junceum. (1) Ho et al. (2013) Cell Host Microbe 15:9-21. (2) Wu et al. (2012) PLoS Pathog. 8:1-18 Funded by grants BIO2013-43040-P (MINECO), CGL2011-26932 (MICINN) and AL16-PID-06 (UPM)

Crecimiento y características metabólicas diferenciadas de bovinos de razas con alto engrasamiento en un sistema de producción español

La producción de carne de vacuno con grasa altamente infiltrada tiene gran valor en el mercado mundial, debido a su excelente calidad y características organolépticas. Este tipo de carne puede obtenerse en su máxima calidad, de la raza wagyu (de origen japonés), de su cruce con la raza angus (wangus) o de la raza angus en pureza o en cruces con otras razas europeas (cruce comercial). La raza wagyu y sus cruces han sido poco estudiadas en sistemas de producción europeos y, por tanto, es difícil saber su comportamiento productivo y su eficiencia económica, comparada con razas europeas. El objetivo de este estudio fue comparar el crecimiento y las características metabólicas (diferenciadas en wagyu; Piao da C. et al., 2015) de animales wagyu (WY), wangus (WN) y cruces comerciales (CC) en las primeras etapas de su crecimiento

Fases finales del crecimiento y características metabólicas en bovinos de raza Wagyu y cruzados con Angus (Wangus) en un sistema de producción español

La raza wagyu (WY) se caracteriza por dar lugar a una carne con un alto grado de infiltración, de alta calidad (Shahrai et al. 2020) y de alto interés en el mercado mundial. Carne más engrasada que la tradicional en bovino también se origina en animales de raza Angus, aunque ambas razas presentan ritmos de crecimientos y calidad de la carne diferenciadas (Radunz et al. 2009; Shahrai et al. 2020). El cruce de la raza Angus con Wagyu (wangus, WN) es, por lo tanto, de interés productivo. Sin embargo, hay pocos estudios sobre las características productivas de animales WY y WN en sistemas de producción españoles. Por tanto, el objetivo de este estudio fue evaluar el crecimiento y las características metabólicas de WY y WN en la fase final del engorde